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内容服务构成了一个简单的API提供对Reactome知识库的访问。Reactome的信息由生物学专家撰写，由Reactome编辑人员维护，并广泛交叉引用其他资源，如NCBI, Ensembl, UniProt, UCSC Genome Browser, HapMap, KEGG(基因和化合物)，ChEBI, PubMed和GO。它还包含推断的同源反应超过20个非人类物种，包括小鼠，大鼠，鸡，河豚鱼，蠕虫，苍蝇，酵母，大米，拟南芥和大肠杆菌。此外，内容服务提供了从PSICQUIC集成的分子交互访问。
内容服务基于具象状态传输(Representational State Transfer, REST)协议。这消除了对复杂客户机的需求，并使服务更简单、更轻量级、更灵活，因此，与SOAP/WSDL对应的服务相比，更容易集成到第三方软件中。
这API包括根据其功能分类的一组方法。例如，扩展路径组揭示了一组方法，这些方法提供了关于路径的特定信息，如所包含的Events或参与的PhysicalEntities。所有方法都指定为GET或POST请求。GET和POST是不可互换的。展开特定的方法提供有关其输入和输出参数的更多信息，以及供用户尝试的简单测试用例。此外，用户还可以使用任何命令行客户端，如w或卷曲访问方法。
值得一提的是要有效地使用此API，用户需要了解反应数据模型和架构。
开始
让我们从最基本的例子之一开始;检索数据库的版本。它可以通过查询“/ data / database / version”方法来解决：
curl -X GET——header 'Accept: text/plain' '//www.joaskin.com/ContentService/data/database/version'
响应将是一个“文本/平原”文件，其中包含释放的数量。
检索反应的信息Mad1结合着丝粒哪个标识符是r - hsa - 141409，查询如下：
curl -X GET——header 'Accept: application/json' '//www.joaskin.com/ContentService/data/query/R-HSA-141409'
响应有“Application / JSON”格式：
{DBID：141409，DisplayName：“Mad1绑定Kinetochore”，STID：“R-HSA-141409”，创建：{DBID：143430，DisplayName：“Yen，T，2004-05-05 00:00:00”，DateTime：“2004-05-05 05：00：00.0”，schemaclass：“instanceedit”}，修改：{dbid：1591212，displayName：“Matthews，L，2011-09-08”，DateTime：“2011-09-0821：45：40.0“，schemaclass：”instanceedit“}，isindisease：false，Isinferred：false，名称：[”mad1绑定Kinetochore“，speciesname：”homo sapiens“，撰写：[143430]，村：[{dbid：70101，DisplayName：“cytosol”，加入：“0005829”，DatabaseName：“Go”，定义：“不含细胞器的细胞质的一部分，但含有其他颗粒物质，例如蛋白质复合物。”，名称：“cytosol”，URL：“http://www.ebi.ac.uk/ego/quickgo?mode=display&entry=go:0005829”，schemaclass：“EntityCompartment”}“，LentratureReference：[{DBID：143441，DisplayName：“有丝分裂检查点蛋白HSMAD1和HSMAD2与相互间的核孔隙络合物相关”，标题：“有丝分裂检查点蛋白HSMAD1和HSMAD2与核心复合物相互关联”，Journal：“J Cell SCI”，页面：“953-63”，PubMedidentier：11181178，卷：114，年：2001，URL：“http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmmmed/11181178“，schemaclass：”Lentratureference“}]，物种：[{dbid：48887，displayname：”homo sapiens“，名称：[”homo sapiens“，“H。SAPIens“，”HS“，”人类“，”人“]，TAXID：”9606“，Schemaclass：”物种“}”，求和：[{DBID：143355，DisplayName：“”，文本：“MAD1的协会通过Kinetochore是MAD2介导的信号的第一步，来自缺陷的KINetochores的信号的信号。“，Schemaclass：”Summation“}]，输入：[{DBID：141433，DisplayName：”Mad1L1 [Cytosol]“，STID：“R-HSA-141433”，名称：[Mad1L1“，”HSMAD1“，”HomaD1“，SpeciesName：”Homo Sapiens“，FoodedByEvent：[141409]，EndoOrtoding：718，ReferenceType：”ReferenceGeneProduct“，StartCoording：1，Schemaclass：”EntityWithAccesseSequence“}，{DBID：141398，DisplayName：”Kinetochore Complex [cytosol]“，STID：”R-HSA-141398“，名称：[”Kinetochore Complex“，SpeciesName：”Homo Sapiens“，CoffedByevent：[141409]，Schemaclass：“genomeencodentity”}]，输出：[{dbid：141441，displayname：“mad1：Kinetochore综合体[cytosol]”，stid：“r-hsa-141441”，名称：[“Mad1：Kinetochore Complex”]，SpeciesName：“Homo Sapiens”，生产了Event: [ 141409 ], hasComponent: [ ], schemaClass: "Complex" } ], schemaClass: "Reaction" }
在前面的结果中，有几个json字段键，如dbId、displayName、stId、name、compartment、literatureReference等。如果我们只对特定字段感兴趣，例如隔间，查询将如下所示:
curl -x get - header'接受：text / plain''https://reacontome.org/contentservice/data/query/r-hsa-141409/compartment'
在这种情况下，因为舱室是一个对象，结果将是第一个列是对象的标识符的tsv文件，第二列是对象的displeteName，第三列是对象的模式游标：
70101细胞溶溶胶实体零件
如果查询属性是一个原始类型:
curl -X GET——header 'Accept: text/plain' '//www.joaskin.com/ContentService/data/query/R-HSA-141409/displayName'
然后返回的值是它在一个“文本/普通”响应中的内容:
Mad1结合着丝粒
作为本节的最后一个例子，让我们看看如何检索前面例子中使用的反应的参与分子。为此，我们调用getParticipatingPhysicalEntitiesAPI中的方法：
curl -X GET——header 'Accept: application/json' '//www.joaskin.com/ContentService/data/event/R-HSA-141409/participatingPhysicalEntities'
响应有“Application / JSON”格式：
[{dbid：141398，displayName：“Kinetochore综合体[cytosol]”，stid：“r-hsa-141398”，名称：[“Kinetochore Complex”，SpeciesName：“Homo Sapiens”，Schemaclass：“GenomeenCodentity”}，{dbid：141433，displayname：“mad1l1 [cytosol]”，stid：“r-hsa-141433”，名称：[“mad1l1”，“hsmad1”，speciesname：“homo sapiens”，endooration：718，引用：“参考资料“，StartCoording：1，Schemaclass：”EntityWithAccesseDequence“}，{DBID：141441，DisplayName：”Mad1：Kinetochore Complex [cytosol]“，STID：”R-HSA-141441“，名称：[”Mad1：Kinetochore Complex“]，speciassname：“homo sapiens”，hascomponent：[]，schemaclass：“复杂的”}“
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