CDKN2A基因由外显子1 -、外显子1 -、外显子2和外显子3组成，从基因的近端到远端。CDKN2A基因位点有两个启动子。位于外显子1 β和1 α之间的启动子调控p16INK4A mRNA的转录，该mRNA由外显子1 α、外显子2和外显子3组成(仅部分翻译)，编码周期蛋白依赖的激酶抑制剂p16INK4A(也称为CDKN2A isoform 1, p16, INK4A, CDKN2A, CDK4I或MTS-1)。位于外显子1 β上游的启动子调控p14-ARF mRNA的转录，该基因由外显子1 β、外显子2(部分翻译)和外显子3(未翻译)组成。p14ARF mRNA被翻译成与p16INK4A mRNA不同的阅读框，并产生肿瘤抑制因子ARF(也称为p14ARF或CDKN2A亚型4)，这是MDM2 E3泛素连接酶介导的TP53 (p53)降解的抑制因子。
野生型p16INK4A能够与CDK4或CDK6形成复合物，并阻止由CDK4或CDK6和d型细胞周期蛋白(CCND)组成的催化活性CDK复合物的形成。因此，p16INK4A阻止了rb1受体细胞中DNA复制启动所需的rb家族蛋白的过度磷酸化。p16INK4A的表达在强烈的致癌信号应答中增加，导致细胞衰老加速(程序性细胞周期阻滞)。过度增殖后，包括体内致癌基因突变激活后，p16INK4A的表达也增加。p16INK4A分子经常发生在癌症的功能丧失,通常通过损失p16INK4A分子蛋白表达的启动子甲基化或CDKN2A基因缺失(梅洛et al . 1995年,赫尔曼et al . 1995年,Gonzalez-Zulueta et al . 1995年,黄et al . 1997年,Witkiewicz等。2011年,日本岛et al . 2011年,Tamayo-Orrego et al . 2016年)。CDKN2A位点的错义、无意义和移码突变也可以通过表达非功能性替代突变或截断蛋白损害p16INK4A的功能(Kamb et al. 1994, Bartsch et al. 1995, Castellano et al. 1997)。有报道称，在家族性黑色素瘤中，种系内含子CDKN2A突变可产生异常剪接位点，并导致p16INK4A非功能性剪接变体的表达(Harland et al. 2001, Harland et al. 2005)。据报道，在家族性黑色素瘤中，编码p16INK4A的5'UTR区域的CDKN2A基因突变创造了一个新的翻译起始密码子，并减少了野生型开始密码子的翻译(Liu et al. 1999)。然而，在CDKN2A基因的非编码区突变是罕见的(Pollock et al. 2001)。
基于细胞培养研究，p16INK4A缺陷使得癌前细胞和癌变细胞在致癌信号胁迫下延迟或逃避衰老(Ruas et al. 1999, Haferkamp et al. 2008, Rayess et al. 2012, Jeanblanc et al. 2012, LaPak and Burd 2014, Sharpless and Sherr 2015)。由于缺乏特异性的生物标志物和各种衰老触发器之间的相互关联，很难确定致癌基因在体内诱导衰老的作用，因此很难确定p16INK4A在体内的作用(Baek和Ryeom 2017, Sharpless和Sherr 2015综述)。
CDKN2A基因座的基因组缺失影响p14ARF，除非它们局限于外显子1 α。p14ARF启动子在癌症中也可以被高甲基化，导致p14ARF表达缺失。CDKN2A基因外显子2发生的一些错义突变影响p14ARF蛋白序列。然而，p14ARF突变体通常比p16INK4A突变体的功能受损更小。大多数功能测试p14ARF突变体检测突变的作用在MDM2绑定和TP53-mediated CDKN1A转录(p21),以及sub-nuclear p14ARF定位(张和熊1999年,施密特et al . 1999年,Eischen et al . 1999年,Pinyol et al . 2000年,博斯特罗姆et al . 2001年,劳德et al . 2006年)。尽管如此，在癌症中检测到的p14ARF突变蛋白可能对p14ARF的功能有显著影响的研究尚不充分(Itahana和Zhang 2008, Dominguez-Brauer et al. 2010)。