在DNA中核苷酸损伤修复的三个主要途径中，基础切除修复（BER）涉及最多的单个酶活性。这是许多单独的糖基酶的结果，每种单独的糖基酶识别和除去来自DNA的特定修饰的碱基。BER负责修复最普遍的DNA病变类型，氧化受损的DNA碱基，其由于由正常线粒体代谢或由电离辐射，脂质过氧化或活化的吞噬细胞产生的氧化自由基而产生的反应性氧物种而产生的。BER是由一种DNA糖基酶引发的两步过程，其识别出特异性修饰的碱并除去碱基通过糖糖键的催化切割，留下脱脂部位而不会破坏磷酸糖DNA骨架。随后，通过一系列酶切割骨架的一系列酶来解析脱脂位点，插入替代残基，并将DNA股线连接。根据单核苷酸替代途径或多核苷酸贴剂替代途径可能发生，这取决于甲糖磷酸盐残留物的结构。在人体细胞中发现的糖基酶识别“外来加合物”，而不是标准功能改性，例如DNA甲基化（Lindahl和Wood 1999，Sokhansanj等，2002）。