一些DNA修复基因中含有p53应答元件，其转录受到TP53 (p53)的正调控。tp53介导的调控可能保证了基因毒性胁迫下DNA修复基因蛋白水平的提高。

TP53直接刺激参与DNA错配修复的几个基因的转录，包括MSH2 (Scherer et al. 2000, Warnick et al. 2001)、PMS2和MLH1 (Chen and Sadowski 2005)。TP53还直接刺激DDB2的转录，参与核苷酸切除修复(Tan and Chu 2002)，以及FANCC，参与修复DNA链间交联的Fanconi贫血通路(Liebetrau et al. 1997)。其他能够影响DNA修复功能的p53靶点包括RRM2B (Kuo et al. 2012)、XPC (Fitch et al. 2003)、GADD45A (Amundson et al. 2002)、CDKN1A (Cazzalini et al. 2010)和PCNA (Xu and Morris 1999)。有趣的是，一些DNA修复基因对p53激活的反应已经在人类细胞中得到证实，但对同源小鼠基因却没有发现(Jegga等人2008年，Tan和Chu 2002年)。与核苷酸切除修复(NER)和错配修复(MMR)的正调控相反，p53可以通过下调内切酶APEX1 (APE1)，与SP1协同作用，负调控碱基切除修复(BER) (Poletto et al. 2016)。

一些DNA修复基因的表达是在TP53的间接控制下，通过TP53介导的cyclin K (CCNK)表达(Mori et al. 2002)。CCNK是CDK12和CDK13的激活细胞周期素(Blazek et al. 2013)。CCNK和CDK12的复合物结合并磷酸化RNA聚合酶II亚基POLR2A的c端结构域，这对于长DNA修复基因的高效转录是必要的，包括BRCA1, ATR, FANCD2, FANCI, ATM, MDC1, CHEK1和RAD51D。受CCNK和CDK12复合物调控转录的基因主要参与DNA双链断裂的修复和/或Fanconi贫血通路(Blazek et al. 2011, Cheng et al. 2012, Bosken et al. 2014, Bartkowiak and Greenleaf 2015, Ekumi et al. 2015)。