哺乳动物DNA错配修复(MMR)基因(MLH1, PMS2, MSH2和MSH6)的缺陷表现为复制和修复过程中的微卫星不稳定性和保真度降低。MMR蛋白相互作用，在错配修复通路中执行步骤。这些蛋白质的缺陷变异与非息肉病结直肠癌有关。MutS蛋白被认为直接接触双链DNA，沿着基因组DNA扫描不匹配，类似于“滑动钳”，直到它们遇到含有不匹配的碱基对。MutS蛋白与包括其他MLH和MutL在内的多种蛋白相互作用，后者与MLH蛋白以及RPA、EXO1、RFC、可能还有HMGB1等特征不太明确的蛋白具有明显的氨基酸识别和结构相似性。

在突变体功能方面，MSH2/MutSaplha异源二聚体被认为主要修复单碱基替换和1 bp插入缺失突变，而MSH2/MutSbeta被认为主要修复1-4 bp插入缺失突变。MLH和MutL异质二聚体蛋白与MutS蛋白的异质二聚体相互作用，帮助催化不同的功能。MLH1: mutla是主要的复合物，在被认为与癌症预防相关的机制中与MutS α和β复合物相互作用。最近的研究表明，MLH1:MLH3也可能参与其中一些过程，但在所有机制的测试中，其程度低于MLH1:PMS2。