SARS-CoV-2

新功能。为了应对Covid-19大流行,反应是快速跟踪与Covid-19疾病地图组合作的人冠状病毒感染途径的注释。反应释放74特征SARS-COV-2(Covid-19)感染途径。要生成此途径,我们从计算上产生的粗略草稿开始我们的正向过程过程来自先前手工策划、同行评审的Reactome SARS- cov -1(人类SARS冠状病毒)感染途径。然后,Reactome策划人员审查了SARS-CoV-2 (COVID-19)感染途径事件和实体草案,并使用已发表的SARS-CoV-2实验数据进行策划。在最终确定之前,最终形成的SARS-CoV-2感染途径由外部专家进行同行评审。目前的途径包括101个反应,涉及489个分子实体(279个蛋白质,12个rna和198个其他),并被227篇论文引用。在Reactome的未来版本中,我们将扩展对该途径的注释,指出调节感染步骤的药物和其他化合物,并添加将感染途径步骤与宿主免疫过程和决定对病毒感染反应的其他人类生物学方面联系起来的分子事件。该加速注释项目得到了美国国家人类基因组研究所(National Human Genome Research Institute)最近获得的补充拨款U41 HG003751-13S1的支持。

新的和更新的途径。74版中具有新的或修改的途径的其他主题包括疾病(缺陷ripk1介导的调节坏死)和编程的细胞死亡(RIPK1-mediated监管坏死)。

新的和更新的插图。已添加或修改具有嵌入式导航功能的插图新陈代谢的疾病SARS-COV感染ABC Transporter疾病与表面活性剂新陈代谢相关的疾病细胞反应对压力的疾病DNA修复的疾病有丝分裂细胞周期疾病神经元系统的疾病生长因子受体和第二信使信号转导的疾病发展生物学障碍跨膜转运蛋白的病症通过TGF-β受体复合物在癌症中的信号传导, 和SLC运输障碍。现在可以使用新的静态插图补充级联ρGTPase周期SARS-COV-2感染, 和Toll样受体瀑布

感谢我们的贡献者。我们的外部作者是安德烈塞内夫 - 里贝罗和o你的外部审稿人是Marcio Luis Acencio,Najoua Lalaoui.詹姆斯M墨菲

注释统计。反应包括13,416人体反应组织成2441年涉及11的途径,110.蛋白质和修饰形式的蛋白质编码10,922不同的人类基因,12,976个络合物,1,854个小分子和428种药物。这些注释得到了32,297号支持文献引用。我们将这些反应预测到79,190矫形蛋白质,创造18,46215个非人类物种的同源途径。版本74有注释2,624衍生自328蛋白的蛋白质变体(突变蛋白质)及其翻译后修饰的形式,其已用于注释疾病特异性反应和途径。

工具和数据。我们的服务和软件工具专为生物学家,生物信息管理员和软件开发人员设计。途径数据可用于在我们的中查看途径浏览器,分析你自己的数据集,到下载,并通过我们的方式访问我们的内容分析服务。这ReactomeFiviz应用程序对于Cytoscape提供了用于寻找与癌症和其他类型的疾病相关的途径和网络模式的工具。

文档和培训。访问我们的网上用户指南访问实验数据的文档支持路径分析。这开发人员的区域提供有关我们的软件,工具和Web服务的详细文档。可以找到培训和学习材料这里

关于Reactome项目。反应是在安大略省癌症研究所,俄勒冈州康涅狄格大学,纽约大学朗涅狄格医疗中心和欧洲生物信息学院的癌症研究所研究所之间的合作。从创意公共域(CC0 1.0 Universal)许可证下,反应的注释文件和源自反弹的交互数据分布。Creative Commons attication 4.0 International(CC Boy 4.0)许可证将适用于所有软件和代码,数据库数据转储和路径插图(增强的高级图),图标库,艺术和品牌材料。在反应上有全新和更新内容的描述网站

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