Reactome项目为我们的用户提供了一套工具，通过它来执行基于路径和网络的数据分析网站和ReactomeFIViz，基于功能交互(FI)网络Cytoscape应用程序。

Reactome FI网络是建立在Reactome中经过筛选的途径之上的，补充了来自其他途径数据库的筛选途径，例如KEGG通路和黑豹通路．然后，利用机器学习将这些经过筛选的路径相互作用与来自筛选和高通量来源的基因-基因相互作用进行集成，生成一组可靠的高概率功能相互作用。

最近，我们发布了2018版的Reactome FI网络。为了构建该网络，我们改进了朴素贝叶斯分类器的训练，提高了召回率。因此，SwissProt覆盖蛋白从12441个增加到13469个(增加8.3%)，基因间功能互作总数从241,338个增加到262,321个(增加8.7%)。我们将其归因于由于召回率的提高而导致的预测FIs数量的增加。

此外，ReactomeFIViz应用程序(版本7.2.0)现在支持2018年版本的FI网络，并包含更新的ReactomeFIViz路径数据集(版本67)。新的ReactomeFIViz应用程序可以在Cytoscape软件中下载，或者直接从Cytoscape应用商店．的用户指南提供使用ReactomeFI网络和ReactomeFIViz应用程序的说明。