bioax途径由Reactome数据库中的“REG3A结合细菌磷脂”转化而来。 从左到右 REG3A结合细菌磷脂 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp 从Reactome中的EntitySet转换而来 同系物的REG3A (38 - 175) Reactome DB_ID: 9931303 A0A0G2K1E4 REG3A (38 - 175) Reactome DB_ID: 9931297 细胞外区域 基因本体论 去:0005576 UniProt: A0A0G2K1E4 鼠形 NCBI分类法 10116 UniProt A0A0G2K1E4 38 平等的 175 平等的 Reactome数据库ID Release 77 9931297 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9931297 Reactome r -优化- 6801352 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-RNO-6801352.1 Reactome //www.joaskin.com Reg3g REG3A (38 - 175) P42854 Reactome DB_ID: 9931301 UniProt: P42854 Reg3g UniProt P42854 38 平等的 175 平等的 Reactome数据库ID Release 77 9931301 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9931301 Reactome r -优化- 6801352 - 2 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-RNO-6801352-2.1 Reactome数据库ID Release 77 9931303 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9931303 Reactome r -优化- 6801352 - 3 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-RNO-6801352-3.1 阴离子磷脂:微生物细胞表面 Reactome DB_ID: 8931784 等离子体膜 基因本体论 去:0005886 微生物细胞表面 Reactome DB_ID: 8879165 Reactome数据库ID Release 77 8879165 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8879165 Reactome r - - 8879165 2 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-8879165.2 ChEBI 23367 额外的信息 心肌梗死 小姐:0361 1 阴离子磷脂 阴离子磷脂 Reactome DB_ID: 1462049 阴离子磷脂(ChEBI: 62643) 阴离子磷脂 磷脂阴离子 阴离子磷脂 磷脂阴离子 ChEBI CHEBI: 62643 Reactome数据库ID Release 77 1462049 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=1462049 Reactome r - - 1462049 4 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-1462049.4 1 Reactome数据库ID Release 77 8931784 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8931784 Reactome r - - 8931784 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-8931784.1 REG3A(38 - 175):阴离子磷脂 Reactome DB_ID: 9931305 1 1 Reactome数据库ID Release 77 9931305 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9931305 Reactome r -优化- 6801804 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-RNO-6801804.1 Reactome数据库ID Release 77 9931331 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9931331 Reactome r -优化- 6801776 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-RNO-6801776.1 通过x射线衍射和电子显微镜对人类REG3A的结构研究表明,REG3A与细菌膜磷脂结合,通过形成六聚体膜渗透孔杀死细菌(Mukherjee S et al. 2014)。 24256734 Pubmed 2014 抗菌膜攻击的孔形成肠c型凝集素 穆克吉,Sohini 郑,回族 Derebe Mehabaw G Callenberg,基思米 Partch,嘉莉L 罗林斯,达西 先知,丹尼尔·C Rizo,约瑟 主观能动性,迈克尔 江,秋兴 Hooper,罗拉V 自然505:103-7 从电子注释推断 证据的代码 生态:0000203