BioPAX途径由Reactome数据库中“通过模板切换合成SARS-CoV-2负链亚基因组mrna”转化而来。 左到右 2.7.7.48 SARS-COV-2负的合成链的模板切换亚基因组的mRNA 这一COVID-19事件是由对SARS-CoV-1数据的计算推断(参见//www.joaskin.com/documentation/inferred-events)和人工处理组合而成的，如对总体SARS-CoV-2感染途径的总结所述。

SARS-CoV-1编码八个亚基因组rna, mRNA2至mRNA9。mRNA1对应于基因组RNA。根据冠状病毒RNA转录的模板开关模型，亚基因组RNA的5'端和3'端是相同的(Snijder et al. 2003, Thiel et al. 2003, Yount et al. 2003)。因此，与此相一致的是，在与SARS-CoV-1密切相关的小鼠肝炎病毒(MHV)研究中，基因组正链RNA首先被转录为负意义(负链)亚基因组mrna，然后作为合成正链亚基因组mrna的模板。负意义病毒rna的数量要比正意义病毒rna的数量少得多(Irigoyen et al. 2016)。每个亚基因组RNA都包含一个与基因组leader相同的leader转录调节序列(leader transcription regulatory sequence, TRS)，在负链合成过程中通过聚合酶“跳跃”被附加到机体转录调节序列(body transcription regulatory sequence, TRS)上。在每个ORF上游发现约10个核苷酸富含au的基序，这些基序在其中一个亚基因组长度的mrna中注定会变成5'近端。3'和5' uts可能通过RNA-RNA和/或rna -蛋白质+蛋白质-蛋白质相互作用来促进冠状病毒基因组的循环，使延长的负链处于有利于leader-body连接的拓扑结构中。宿主蛋白PABP与冠状病毒3' poly(A) tail结合，并与宿主蛋白eIF-4G相互作用，eIF-4G是与mRNA帽结构结合的三亚基复合物的组成部分，可能促进冠状病毒基因组的循环。结合冠状病毒5'UTR的两种病毒蛋白，N蛋白和nsp1，可能在模板转换中发挥作用。 The poly(A) tail is necessary for the initiation of minus-strand RNA synthesis at the 3' end of genomic RNA. For review, please refer to Sawicki et al. 2007 and Yang and Leibowitz 2015. 著作：奥尔利克-Milacic，Marija的，2020年8月12日 回顾:Acencio, Marcio Luis, 2020-09-09 编辑日期:Orlic-Milacic, Marija, 2020-08-18 国家结核控制规划 核苷三磷酸 反应DB_ID：6806881 胞质 基因本体论 去:0005829 三磷酸核苷(ChEBI: 17326) 核苷三磷酸 核苷三磷酸酯 国家结核控制规划 ChEBI CHEBI: 17326 反应数据库ID版本77 6806881 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6806881 Reactome r - - 6806881 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-all-6806881.3 Reactome //www.joaskin.com SARS-CoV-2 gRNA:清债信托公司 Reactome DB_ID：9694458 双膜囊泡病毒工厂外膜 基因本体论 GO：0062243 RTC. 反应DB_ID：9694302 nsp16: nsp10 反弹DB_ID：9694416 pp1ab-nsp16 2'-O-甲基 Reactome DB_ID: 9694647 UniProt: P0DTD1-1代表 代表 1A-1B 疏水结构域(HD)可以介导复制复合物的膜关联，从而改变宿主细胞膜的结构。PTM是一种特殊的酶，通过自身的蛋白酶在体内裂解产生成熟的蛋白质。3CL-PRO和PL-PRO蛋白酶是自催化的。MI.SCELLANEOUS Variant B.1.1.7 is also called Variant Of Concern (VOC) 202012/01, Variant Under Investigation (VUI) 202012/01, or 20B/501Y.V1.SIMILARITY Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family. 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 NCBI分类学 2697049 UniProt同种型 P0DTD1-1 6799 平等的 7096 平等的 反应数据库ID版本77 9694647 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694647 Reactome R-COV-9694647 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694647.1 1 从Reactome中的EntitySet转换而来 nsp10 PP1A-NSP1，PP1AB-NSP10 非结构蛋白10 Reactome DB_ID：9694358 PP1A-NS10 pp1a-nsp10 非结构蛋白10 Reactome DB_ID: 9681983 复制酶多蛋白1a 复制酶多蛋白1 pp1a 疏水结构域(HD)可以介导复制复合物的膜关联，从而改变宿主细胞膜的结构。PTM是一种特殊的酶，通过自身的蛋白酶在体内裂解产生成熟的蛋白质。3CL-PRO和PL-PRO蛋白酶是自催化的。多态性变体B.1.1.7也被称为关注变体(VOC) 202012/01，被调查变体(VUI) 202012/01，或20B/501 . v1。属于冠状病毒多蛋白1ab家族。 uniprot. P0DTC1 4254 平等的 4392 平等的 反应数据库ID版本77 9681983 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9681983 Reactome R-COV-9681983 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9681983.1 pp1ab-NS10 pp1ab-nsp10 非结构蛋白10 Reactome DB_ID：9694372 4254 平等的 4392 平等的 反应数据库ID版本77 9694372 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694372 Reactome r - x - 9694372 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694372.1 反应数据库ID版本77 9694358 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9694358 Reactome r - x - 9694358 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694358.1 1 反应数据库ID版本77 9694416 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694416 Reactome r - x - 9694416 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694416.1 复合体 cpx - 5688 附加信息 MI. MI：0361 1 nsp7的：nsp8：nsp12：nsp14：nsp10：nsp13：nsp15 Reactome DB_ID: 9694740 NSP7：NSP8：NSP12：NSP14：NSP10：NSP13 Reactome DB_ID: 9694717 nsp7: nsp8: nsp12: nsp14: nsp10 Reactome DB_ID：9694597 NSP10：NSP14 Reactome DB_ID: 9694688 1 pp1ab-nsp14 pp1ab-prExo 校对exoribonuclease Guanine-N7甲基转移酶 反应DB_ID：9694537 5926 平等的 6452 平等的 反应数据库ID版本77 9694537 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694537 Reactome r - x - 9694537 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾邮件中连接到此实例的网页：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-cov -9694537.1 1 反应数据库ID版本77 9694688 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9694688 Reactome r - x - 9694688 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694688.1 复合体 cpx - 5692 1 nsp7：nsp8：nsp12 Reactome DB_ID: 9691364 从Reactome中的EntitySet转换而来 nsp8. Reactome DB_ID: 9691351 pp1a-ns8 pp1a-nsp8 非strucutral蛋白8 Reactome DB_ID: 9681992 3943 平等的 4140. 平等的 反应数据库ID版本77 9681992 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9681992 Reactome R-COV-9681992 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9681992.1 pp1ab-ns8 pp1ab-nsp8 非结构性蛋白8 Reactome DB_ID：9682052 UniProt: P0DTD1代表 代表 1A-1B 疏水结构域(HD)可以介导复制复合物的膜关联，从而改变宿主细胞膜的结构。PTM是一种特殊的酶，通过自身的蛋白酶在体内裂解产生成熟的蛋白质。3CL-PRO和PL-PRO蛋白酶是自催化的。MI.SCELLANEOUS Variant B.1.1.7 is also called Variant Of Concern (VOC) 202012/01, Variant Under Investigation (VUI) 202012/01, or 20B/501Y.V1.SIMILARITY Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family. uniprot. P0DTD1 3943 平等的 4140. 平等的 反应数据库ID版本77 9682052 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9682052 Reactome r - x - 9682052 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9682052.1 反应数据库ID版本77 9691351 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9691351 Reactome R-COV-9691351 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9691351.1 1 nsp7: nsp8 Reactome DB_ID: 9691348 1 从Reactome中的EntitySet转换而来 nsp7. Reactome DB_ID: 9691334 pp1a-ns7 pp1a-nsp7 非strucutral蛋白7 Reactome DB_ID: 9681995 3860 平等的 3942 平等的 反应数据库ID版本77 9681995 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9681995 Reactome r - x - 9681995 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9681995.1 pp1ab-ns7 pp1ab-nsp7 非结构性蛋白7 Reactome DB_ID：9682061 3860 平等的 3942 平等的 反应数据库ID版本77 9682061 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9682061 Reactome r - x - 9682061 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9682061.1 反应数据库ID版本77 9691334 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9691334 Reactome R-COV-9691334 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9691334.1 1 反应数据库ID版本77 9691348 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9691348 Reactome R-COV-9691348 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾邮件中连接到此实例的网页：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-cov -9691348.1 复合体 cpx - 5690 1 pp1ab-nsp12 pp1ab-RdRNP RNA定向的RNA聚合酶 Reactome DB_ID：9682057 4393 平等的 5324 平等的 反应数据库ID版本77 9682057 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9682057 Reactome r - x - 9682057 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9682057.1 1 反应数据库ID版本77 9691364 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9691364 Reactome R-COV-9691364 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9691364.1 复合体 cpx - 5742 1 反应数据库ID版本77 9694597. 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9694597 Reactome r - x - 9694597 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694597.1 1 螺旋酶 pp1ab-nsp13 pp1ab-helicase Reactome DB_ID: 9694642 5325 平等的 5925 平等的 反应数据库ID版本77 9694642 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694642 Reactome R-COV-9694642 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694642.1 2 反应数据库ID版本77 9694717 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694717 Reactome R-COV-9694717 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694717.1 1 nsp15六聚物 Reactome DB_ID：9694570 pp1ab-nsp15 pp1ab-UEndo Uridylate-specific内切核糖核酸酶 Reactome DB_ID：9694335 6453 平等的 6798 平等的 反应数据库ID版本77 9694335 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9694335 Reactome r - x - 9694335 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694335.1 6. 反应数据库ID版本77 9694570 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中：http：//www.reaconome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9694570 Reactome r - x - 9694570 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694570.1 复合体 cpx - 5689 1 反应数据库ID版本77 9694740 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694740 Reactome R-COV-9694740 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694740.1 1 nsp3: nsp4: nsp6 Reactome DB_ID: 9694728 nsp3：nsp4. 反应DB_ID：9694366 从Reactome中的EntitySet转换而来 nsp3. 反应DB_ID：9694470 pp1a-ns3 pp1a-nsp3 非strucutral蛋白3 Reactome DB_ID: 9694720 N-糖基化残基 国防部 国防部:00006 819 平等的 2763 平等的 反应数据库ID版本77 9694720 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694720 Reactome R-COV-9694720 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694720.1 P0DTD1 pp1ab-nsp3 Reactome DB_ID：9694430 819 平等的 2763 平等的 反应数据库ID版本77 9694430 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694430 Reactome r - x - 9694430 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694430.1 反应数据库ID版本77 9694470. 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9694470 Reactome r - x - 9694470 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694470.1 1 从Reactome中的EntitySet转换而来 NSP4. 反应DB_ID：9694481 pp1a-ns4 pp1a-nsp4 非strucutral蛋白4 Reactome DB_ID: 9694767 2871 平等的 2764 平等的 3263 平等的 反应数据库ID版本77 9694767 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694767 Reactome R-COV-9694767 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页：http：//www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-cov -9694767.1 P0DTD1 pp1ab-nsp4 Reactome DB_ID: 9694607 2764 平等的 3263 平等的 反应数据库ID版本77 9694607 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694607 Reactome R-COV-9694607 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694607.1 反应数据库ID版本77 9694481. 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9694481 Reactome r - x - 9694481 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694481.1 1 反应数据库ID版本77 9694366. 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9694366 Reactome r - x - 9694366 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694366.1 1 从Reactome中的EntitySet转换而来 NSP6. 反应DB_ID：9694770 P0DTC1 pp1a-nsp6 Reactome DB_ID: 9694615 3570 平等的 3859 平等的 反应数据库ID版本77 9694615 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694615 Reactome R-COV-9694615 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694615.1 P0DTD1 pp1ab-nsp6 反应DB_ID：9694777 3570 平等的 3859 平等的 反应数据库ID版本77 9694777 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694777 Reactome r - x - 9694777 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694777.1 反应数据库ID版本77 9694770 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694770 Reactome R-COV-9694770 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694770.1 1 反应数据库ID版本77 9694728 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694728 Reactome R-COV-9694728 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694728.1 复合体 cpx - 5691 1 反应数据库ID版本77 9694302 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694302 Reactome r - x - 9694302 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694302.1 1 MN908947.3. M7G（5'）PPPAM-CAPPED，聚腺苷酸化SARS-COV-2基因组RNA（加股） Reactome DB_ID：9694393 NCBI核苷酸:MN908947.3 SARS冠状病毒，全基因组 SARS CORONAVIRUS，完全基因组 NCBI核苷酸 MN908947.3. 1 平等的 5'-端(n7 -甲基5'-三磷酸鸟苷)-(2'- o-甲基腺苷)(2 -)残基 ChEBI CHEBI: 143976 29903 平等的 保利(A) ChEBI CHEBI：8756 1 平等的 29903 平等的 反应数据库ID版本77 9694393 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694393 Reactome r - x - 9694393 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-cov -9694393.1 ChEBI 17851 ChEBI 133969. ChEBI 143976 ChEBI 8756. 1 反应数据库ID版本77 9694458 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9694458 Reactome r - x - 9694458 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694458.1 PPI. 焦 diphosphoric酸 焦磷酸 二磷酸 Reactome DB_ID：111294 diphosphoric酸(ChEBI: 29888) diphosphoric酸 ChEBI CHEBI: 29888 反应数据库ID版本77 111294 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=111294 Reactome r-all-111294 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-111294.3 复合 C00013 SARS-CoV-2负链亚基因组mrna:RTC Reactome DB_ID：9713652 1 从Reactome中的EntitySet转换而来 SARS-COV-2减去股线亚基组织mRNA Reactome DB_ID: 9694501 MN908947.3. mRNA2减去股线 Reactome DB_ID：9694347 -29903年 平等的 -21563年 平等的 反应数据库ID版本77 9694347 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反垃圾中：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9694347 Reactome r - x - 9694347 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694347.1 MN908947.3. mRNA3负链 Reactome DB_ID: 9694753 -29903年 平等的 -25393年 平等的 反应数据库ID版本77 9694753 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694753 Reactome R-COV-9694753 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-cov -9694753.1 MN908947.3. mRNA4负链 Reactome DB_ID: 9694755 -29903年 平等的 -26245 平等的 反应数据库ID版本77 9694755 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694755 Reactome R-COV-9694755 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694755.1 MN908947.3. mRNA5负链 Reactome DB_ID: 9694621 -29903年 平等的 -26523年 平等的 反应数据库ID版本77 9694621 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694621 Reactome R-COV-9694621 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-cov -9694621.1 MN908947.3. mRNA6减去股线 Reactome DB_ID: 9694511 -29903年 平等的 -27202年 平等的 反应数据库ID版本77 9694511 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694511 Reactome R-COV-9694511 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页：http：//www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-cov -9694511.1.1 MN908947.3. mRNA7a减去股线 Reactome DB_ID: 9694629 -29903年 平等的 -27394 平等的 反应数据库ID版本77 9694629 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694629 Reactome R-COV-9694629 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694629.1 mRNA7b负链 Reactome DB_ID: 9697259 -29903年 平等的 -27756年 平等的 反应数据库ID版本77 9697259 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9697259 Reactome R-COV-9697259 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9697259.1 MN908947.3. mRNA8负链 Reactome DB_ID：9694588 -29903年 平等的 -27894年 平等的 反应数据库ID版本77 9694588 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9694588 Reactome r - x - 9694588 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694588.1 MN908947.3. mRNA9负链 反弹DB_ID：9694550 -29903年 平等的 -28274 平等的 反应数据库ID版本77 9694550 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694550 Reactome r - x - 9694550 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694550.1 反应数据库ID版本77 9694501 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694501 Reactome R-COV-9694501 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694501.1 1 反应数据库ID版本77 9713652 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9713652 Reactome r - x - 9713652 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-cov -9713652.1 激活 activeUnit：＃蛋白7 基因本体论 去:0003968 细胞功能的基因本体论术语 MI. MI：0355 相同的催化剂活性 反应数据库ID版本77 9694330 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到Reactome：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id = 9694330 反应数据库ID版本77 9694344 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome：http：//www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9694344 Reactome R-HSA-9694344 2 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-9694344.2 12927536. Pubmed 2003 sars -冠状病毒的基因组和蛋白质组的独特和保守的特征，一个早期从冠状病毒2组谱系分离出来 Snijder, Eric J Bredenbeek Peter J Dobbe，杰西卡Ç 泰尔，沃尔克 Ziebuhr,约翰 胡桐，利奥L M 关,易 罗扎诺夫，米哈伊尔 Spaan，威利缩略词 Gorbalenya,亚历山大E J.Mol。BIOL。331：991-1004 26919232 Pubmed 2016 通过RNA测序和核糖体图谱冠状病毒基因表达的高分辨率分析 Irigoyen，Nerea 弗斯,安德鲁·E 琼斯,约书亚D 钟,贝蒂Y-W Siddell，司徒g ^ 布里尔利，伊恩 PLOS PARCOG。12：e1005473 14569023 Pubmed 2003 反向遗传学与严重急性呼吸综合征冠状病毒的全长感染性cDNA 扬特博伊德 柯蒂斯,Kristopher M 弗里茨,伊丽莎白 汉斯莱,丽莎E Jahrling，作者：Peter B 普伦蒂斯,Erik 丹尼森,马克。R Geisbert托马斯·W 气压,拉尔夫年代 Proc。国家的。学会科学。美国100:12995 - 3000 12917450 Pubmed 2003 SARS冠状病毒基因组表达的机制和酶 泰尔，沃尔克 伊万诺夫,康斯坦丁 Putics，Ákos. Hertzig,托拜厄斯 斯海勒，芭芭拉 拜耳，宋佳 魏ß桦树,Benedikt Snijder, Eric J 拉本瑙，霍尔格 杜尔，汉斯·威廉 Gorbalenya,亚历山大E Ziebuhr,约翰 J. Gen. Virol, 84:2305-2315 16928755 Pubmed 2007 冠状病毒转录的当代观点 斯坦利·Sawicki G Sawicki，多萝西娅大号 Siddell，司徒g ^ j .微生物学报。81:20-9 25736566 Pubmed 2015 冠状病毒基因组3'和5'末端的结构和功能 杨董 莱博维茨，朱利安大号 病毒206:120-33》 激活 反应数据库ID版本77 9694608 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694608 n tetramer. Reactome DB_ID: 9694702 SUMO1-K62-ADPR-P-11S，2T-metR95,177-N 79176180183184188194201202206年SUMO1-K62-ADPr-p-S23 T198,205-metR95,177-N Reactome DB_ID: 9729340 UniProt: P0DTC9 N N 功能包正链RNA病毒基因组进入螺旋ribonucleocapsid (RNP)和病毒粒子组装期间起着基本的作用通过其与病毒基因组的交互和膜蛋白m中发挥着重要作用增强subgenomic病毒RNA转录的效率以及病毒复制(通过相似)。可能通过结合宿主smad3调控转化生长因子- β信号(通过相似性)。亚基Homooligomer。单体形式和低聚形式都与RNA相互作用。与蛋白m相互作用与蛋白e相互作用可能与宿主HNRNPA1结合。与NSP3交互;这种相互作用作用于在感染的非常早期阶段将基因组与新翻译的复制酶-转录酶复合物连接(通过相似性)。可能与宿主SMAD3相互作用(相似)。天车ADP-ribosylated。adp核糖基化在感染过程中保留在病毒粒子中。PTM在丝氨酸和苏氨酸残基上的磷酸化。多态性变体B.1.1.7也被称为关注变体(VOC) 202012/01，被调查变体(VUI) 202012/01，或20B/501 . v1。属于乙型冠状病毒核衣壳蛋白家族。 uniprot. P0DTC9 61. 平等的 SUMO化赖氨酸 国防部 国防部:01149 腺苷diphosphoribosyl（ADP-核糖基）修饰的残基 国防部 MOD：00752 188 平等的 O-phospho-L-serine 国防部 国防部:00046 206. 平等的 176. 平等的 180 平等的 184 平等的 194 平等的 198 平等的 O-phospho-L-threonine 国防部 国防部:00047 202. 平等的 201. 平等的 205. 平等的 23. 平等的 79 平等的 183 平等的 95 平等的 omega-N-methyl-L-arginine 国防部 国防部:00078 177. 平等的 2 平等的 422 平等的 反应数据库ID版本77 9729340 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9729340 Reactome r - x - 9729340 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9729340.1 4. 反应数据库ID版本77 9694702 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome：//www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9694702 Reactome R-COV-9694702 2 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-COV-9694702.2 复合体 cpx - 5686