从反应组数据库中的“有缺陷的NTHL1底物结合”转换而来的BioPAX途径。
缺陷NTHL1衬底结合
已描述并与癌症相关的几种不同突变导致NTHL1蛋白质的突变。NTHL1 Q90TER(NTH11 GLN90 *)截断突变体由非义义突变产生,其用止芯密码子取代谷氨酰胺90的密码子。NTHL1 Q90TER尚未在蛋白质水平上进行研究,但预计缺乏DNA结合结构域和糖基酶结构域,因此导致基本切除修复(BER)相关的DNA糖基酶功能的完全丧失。纯合或化合物杂合种种系N0 Q90TER突变导致癌症综合征(NTH11相关肿瘤综合征),其涉及腺瘤性息肉病,结直肠癌乳腺癌和多种其他类型的癌症和良性肿瘤(Weren等,2015年,Rivera等,2015,Grolleman等人2019)。除了NTHL1 Q90Ter外,没有七种其他截断变体已经在NTHL1相关肿瘤综合征的患者中鉴定出NTHL1 A79FS(NTHL1 ALA79FS),NTHL1 Y130TER(NTHL1 TYR130 *),NTHL1W182TER(NTHL1 TRP182 *),NTHL1c。709 + 1g> a,nthl1 i245fs(nthl1 ile245fs),nthl1 w260ter(nthl1 trp269 *),nthl1 q287ter(nthl1 gln287 *)(Rivera等,2015,Broderick等,2017,Grolleman等人2019)。
作者:Orlic Milacic,Marija,2018-12-13
综述:Kuiper,Roland P,2019-01-14
评论:Doetsch, Paul W, 2019-01-31
审查:里维拉马球,芭芭拉,2019-02-19
审查:De Voer,Richarda M,2019-02-21
编辑:Orlic-Milacic,Marija,2019-01-17
从左到右
缺陷的NTHL1截断突变体不结合胞嘧啶乙二醇(Cg)
NTHL1 Q90TER(NTHL1 Q90 *)截断突变体(WEREN等,2015)缺乏DNA结合结构域和糖基酶结构域,因此预计不能识别和结合受损的DNA,包括含有含胞苷乙二醇(CG)的受损DNA,但虽然这尚未经过实验测试。NTHL1 Q287TER(NTHL1 Q287 *)截断突变体(BRODERICK等人2017)缺乏DNA结合结构域的一部分,包括谷氨酰胺残留Q287,对于基材识别很重要(Robey-Bond等,2017),预计将无法识别和结合受损的DNA,包括含有胞嘧啶二醇(CG)的受损DNA,但这尚未经过实验测试。
作者:Orlic Milacic,Marija,2018-12-13
综述:Kuiper,Roland P,2019-01-14
评论:Doetsch, Paul W, 2019-01-31
审查:里维拉马球,芭芭拉,2019-02-19
审查:De Voer,Richarda M,2019-02-21
编辑:Orlic-Milacic,Marija,2019-01-17
从Reactome中的EntitySet转换而来
nthl1截断突变体
反应DB_ID:9630217
NTHL1 Q287*
NTHL1 Q287TER
NTHL1 Gln287Ter
NTHL1 Gln287 *
反应DB_ID:9630213
核浆
基因本体论
GO:0005654
UniProt:P78549 NTHL1
nthl1.
NTH1
OCTS3
双功能DNA n -糖基化酶与相关的apurinic/apyrimidinic (AP)裂解酶功能,催化碱基切除修复(BER)的第一步,这是修复DNA氧化损伤的主要修复途径。DNA n -糖基化酶活性通过劈开n -糖苷键从DNA中释放受损的DNA碱基,留下AP位点。AP裂解酶活性通过β消除将磷酸二酯键3'裂解到AP位点。主要识别和修复嘧啶的氧化碱损伤。还具有8-oxo-7,8-二氢鸟嘌呤(8-oxoG) DNA糖化酶活性。优先作用于DNA损伤相反的鸟嘌呤残基。能够处理核小体中的病变而不需要或诱导核小体破坏。APE1取代DNA中n -糖基化酶产生的AP位点上的NTHL1,从而增加DNA n -糖基化酶活性的更替。解AP酶活性由YBX1刺激。亚单位与YBX1相互作用。组织特异性广泛表达,在心脏中表达最高,在肺和肝脏中表达最低。DEVELOPMENTAL STAGE Expression levels are regulated during the cell cycle with increased levels during early and mid S-phase.SIMILARITY Belongs to the Nth/MutY family.
智人
NCBI分类学
9606
uniprot.
P78549
31.
相等的
286
相等的
Reactome数据库ID版本77
9630213
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9630213
反应途径
R-HSA-9630213
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-9630213.1
反应途径
//www.joaskin.com
nthl1 q90 *
NTHL1 Q90TER
nthl1 gln90ter.
NTHL1 Gln90*
反应数据库ID:9629974
31.
相等的
89
相等的
Reactome数据库ID版本77
9629974
数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9629974
反应途径
r - hsa - 9629974
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-9629974.1
Reactome数据库ID版本77
9630217
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9630217
反应途径
R-HSA-9630217
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa-9630217.1
CG-DSDNA
含有胞嘧啶乙二醇的双链DNA
反应数据库ID:110178
Reactome数据库ID版本77
110178
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=110178
反应途径
R-HSA-110178
2
Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa-110178.2
车比
16991.
附加信息
心肌梗死
MI:0361
Reactome数据库ID版本77
9630047
数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9630047
反应途径
r - hsa - 9630047
1
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-9630047.1
27713038
Pubmed
2017
最近提出的大肠癌易感基因变异在家族和患者分析中的验证——一项系统综述
彼得·布罗德里克
多宾斯,莎拉E
乔布,丹尼尔
金纳斯利,本
邓洛普,马尔科姆G
汤姆林森,伊恩
霍尔斯顿,理查德S
胃肠病学152:75-77.E4
25938944
Pubmed
2015
碱基切除修复基因NTHL1的种系纯合突变导致腺瘤性息肉病和结直肠癌
你不是被抢劫了吗
李腾堡(Marjolijn J L
Kets,C Marleen
De Voer,Richarda M
Verwiel, Eugène T P
Spruijt,Liesbeth
温蒂·A·G·范·泽尔斯特·斯塔姆
Jongmans Marjolijn C
吉利森,基督徒
Hehir-Kwa,Jayne Y.
Hoischen,亚历山大
Shendure,周杰伦
博伊尔,埃文A
伊芙琳·J·坎平
Nagtegaal,虹膜D
上衣,Bastiaan B J
纳根加斯特,福克M
格尔斯·范凯塞尔,广告
van Krieken,J Han J M
柯伊伯,罗兰P
HOOGERBRUGGE,Nicoline.
纳特。吉内特。47:668-71
28292631
Pubmed
2017
以保守氨基酸残基为靶点检测NTHL1同源基因的活性
Robey-Bond,Susan M
本森,梅雷迪斯A
禁止雷诺斯,拉米罗
邦德,杰弗里P
华莱士,苏珊S
DNA修复(Amst.)53:43-51
从左到右
缺陷的NTHL1截断突变体不结合二氢尿嘧啶(DHU)
nthl1 q90ter(nthl1 q90 *)截断突变体(Weren等,2015)缺乏DNA结合结构域和糖基酶结构域,因此预计无法识别和结合受损的DNA,包括含有Dihydracil(DHU)的受损DNA,但虽然这一点尚未经过实验测试。NTHL1 Q287TER(NTHL1 Q287 *)截断突变体(BRODERICK等人2017)缺乏DNA结合结构域的一部分,包括谷氨酰胺残留Q287,对于基材识别很重要(Robey-Bond等,2017),预计将无法识别并结合受损的DNA,包括含有Dihydracil(DHU)的受损DNA,但这尚未经过实验测试。
作者:Orlic Milacic,Marija,2018-12-13
综述:Kuiper,Roland P,2019-01-14
评论:Doetsch, Paul W, 2019-01-31
审查:里维拉马球,芭芭拉,2019-02-19
审查:De Voer,Richarda M,2019-02-21
编辑:Orlic-Milacic,Marija,2019-01-17
DHU-dsDNA
含有二氢尿嘧啶的双链DNA
反应数据库ID:110180
Reactome数据库ID版本77
110180
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=110180
反应途径
R-HSA-110180
2
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-110180.2
车比
16991.
Reactome数据库ID版本77
9630045.
数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9630045
反应途径
r - hsa - 9630045
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-9630045.1
从左到右
缺陷NTHL1截断突变体不结合甲脒嘧啶(FapyA)
NTHL1 Q90TER(NTHL1 Q90*)截短突变体(Wernet等人,2015)缺乏DNA结合域和糖基化酶域,因此预计无法识别和结合受损DNA,包括含有甲酰胺嘧啶(FapyA)的受损DNA,尽管这尚未经实验测试。NTHL1 Q287TER(NTHL1 Q287*)截短突变体(Broderick等人,2017年)缺乏一部分DNA结合域,包括谷氨酰胺残基Q287,这对底物识别很重要(Robey Bond等人,2017年),预计无法识别和结合受损DNA,包括含甲酰胺嘧啶(FapyA)的受损DNA,尽管这还没有经过实验测试。
作者:Orlic Milacic,Marija,2018-12-13
综述:Kuiper,Roland P,2019-01-14
评论:Doetsch, Paul W, 2019-01-31
审查:里维拉马球,芭芭拉,2019-02-19
审查:De Voer,Richarda M,2019-02-21
编辑:Orlic-Milacic,Marija,2019-01-17
Fapea-dsdna.
含4,6-二氨基-5-甲酰胺基嘧啶的双链DNA
反应DB_ID:5643990
Reactome数据库ID版本77
5643990
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5643990
反应途径
r - hsa - 5643990
2
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-5643990.2
车比
16991.
Reactome数据库ID版本77
9630044
数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9630044
反应途径
r - hsa - 9630044
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-9630044.1
从左到右
有缺陷的NTHL1截断突变体不结合胸腺嘧啶乙二醇(Tg)
NTHL1 Q90TER(NTHL1 Q90*)截短突变体(Wernet等人,2015)缺乏DNA结合域和糖基化酶域,因此预计无法识别和结合受损DNA,包括含有胸腺嘧啶乙二醇(Tg)的受损DNA,尽管尚未进行实验测试。NTHL1 Q287TER(NTHL1 Q287*)截短突变体(Broderick等人,2017年)缺乏一部分DNA结合域,包括谷氨酰胺残基Q287,这对底物识别很重要(Robey Bond等人,2017年),预计无法识别和结合受损DNA,包括含胸腺嘧啶乙二醇(Tg)的受损DNA,尽管这还没有经过实验测试。
作者:Orlic Milacic,Marija,2018-12-13
综述:Kuiper,Roland P,2019-01-14
评论:Doetsch, Paul W, 2019-01-31
审查:里维拉马球,芭芭拉,2019-02-19
审查:De Voer,Richarda M,2019-02-21
编辑:Orlic-Milacic,Marija,2019-01-17
Tg双链DNA
含有胸腺嘧啶乙二醇的双链DNA
反应数据库ID:110176
Reactome数据库ID版本77
110176
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=110176
反应途径
R-HSA-110176
2
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-110176.2
车比
16991.
Reactome数据库ID版本77
9630043
数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=9630043
反应途径
r - hsa - 9630043
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa -9630043.1
Reactome数据库ID版本77
9630222
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9630222
反应途径
R-HSA-9630222
1
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-9630222.1
26559593
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患有多个原发性肿瘤的女性中的双胞胎NTHL1突变
Rivera,Barbara.
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福克斯,威廉D
心血管病。j .地中海。373:1985-6
30753826.
Pubmed
2019
突变特征分析显示NTHL1缺陷导致多肿瘤表型
格罗曼,朱迪丝·E
De Voer,Richarda M
曾,Fadwa
尼尔森Maartje
你不是被抢劫了吗
幕,克莱尔
李腾堡(Marjolijn J L
vos,janet r
十布罗克,新西威尔士州
诺埃尔。F。C。米兰达
柯伊伯,Renske
伊芙琳·J·坎平
詹森,埃里克·A·M
vink-börger,m elisa
Popp,Isabell.
郎,阿洛伊斯
施皮尔,伊莎贝尔
Huneburg,罗伯特
詹姆斯,保罗
李娜
斯坦尼诺娃,玛丽娅
琳赛,海伦
Cockburn,大卫
斯帕西克·博斯科维奇,奥利维拉
克莱登宁,马克
甜,凯文
卡佩拉,加布里埃尔
Sjursen, Wenche
Høberg-vetti,Hildegunn
Jongmans Marjolijn C
Neveling,Kornelia
格尔斯·范凯塞尔,广告
莫罗,汉斯
他,弗雷德里克J
Sijmons,Rolf H.
Schackert,汉斯·K
克拉拉鲁伊斯庞特酒店
达格马拉迪默斯卡
卢宾斯基,J
Rivera,Barbara.
福克斯,威廉D
汤姆林森,伊恩·P
山谷,劳拉
布坎南,丹尼尔·D
肯里克,苏
阿德莱尔,朱利安
迪莫夫斯基,Aleksandar J
坎贝尔,IG.
阿雷茨,斯特凡
辛德勒,德特勒夫
范·韦泽尔,汤姆
HOOGERBRUGGE,Nicoline.
柯伊伯,罗兰P
癌细胞35:256-266.E5