BioPAX途径由Reactome数据库中的“mRNA Capping”转化而来。
信使rna限制
目前研究的所有真核生物pre- mrna的5'端均转化为cap结构。帽被认为影响了第一个内含子的剪接,并被细胞核中的“帽结合”蛋白CBP80和CBP20结合。帽对翻译起始非常重要,它还通过蛋白质与poly(A)端相互作用,导致mRNA的循环,从而促进多轮翻译。帽对mRNA的稳定性也很重要,保护其免受5'到3'核酸酶的侵袭,并且是mRNA输出到细胞质所必需的。
在初期转录本上通常发生非常迅速的capping反应;在RNA聚合酶II只合成了几个核苷酸之后。该capping反应涉及到新生转录本的5'端由RNA 5'-三磷酸酶转化为二磷酸,随后mRNA guanylytransferase添加一个单磷酸鸟苷,形成一个5'-5'-三磷酸键。然后2'- o -甲基转移酶将其甲基化。
从左到右
限制复杂地层
在DNA模板上合成的初期转录本的5'端后不久,capping酶就会与RNA聚合酶II的c端结构域和Spt5结合,形成capping复合物(Heidemann et al. 2013, Buratowski 2009, Schoenberg and Maquat 2009)。
作者:Buratowski, S, 2003-10-15 15:18:41
编辑:Gopinathrao, G, 0000-00-00 00:00
脱氧核糖核酸
脱氧核糖核酸
Reactome DB_ID: 29428
核浆
基因本体论
GO:0005654
Reactome数据库ID Release 77
29428
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反应途径
R-ALL-29428
1
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反应途径
//www.joaskin.com
ChEBI
4705.
额外的信息
心肌梗死
小姐:0361
新生前预体转录物
Reactome DB_ID: 72084
Reactome数据库ID Release 77
72084
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=72084
反应途径
r - - 72084
2
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ChEBI
33697
CE:Pol II CTD:Spt5 complex
反应DB_ID:77061
RNA聚合酶II(磷酸化):TFIIF复合物
Reactome DB_ID: 113404
TFIIF
Reactome DB_ID: 109631
GTF2F1
转录起始因子IIF,亚基
TFIIF-alpha
转录起始因子RAP74
Reactome DB_ID:65565
UniProt: P35269 GTF2F1
GTF2F1
RAP74
TFIIF是一种通用的转录起始因子,与RNA聚合酶II结合,并与TFIIB合作将其招募到起始复合物中。它促进了α和β亚基的转录elongation.SUBUNIT异源二聚体。化与GTF2F2,CTDP1,TAF6 / TAFII80和URI1。化与GTF2B(经由C-末端和通过乙酰化形式优先);这种相互作用可防止GTF2F2 GTF2B的结合(搜索PubMed:8662660,PUBMED:12931194)酪蛋白激酶II状kinases.SIMILARITY柳炳祥李海林上调由TAF1响应于肠道病毒71(EV71)infection.PTM磷酸化在Ser和其他残余物和属于TFIIFα亚基family.CAUTION据报道,在Ser-385和Thr-389蛋白激酶活性和自磷酸化。
智人
NCBI分类法
9606
UniProt
P35269
2
相等的
517
相等的
Reactome数据库ID Release 77
65565
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反应途径
r - hsa - 65565
1
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1
GTF2F2
转录起始因子IIF, β亚基
TFIIF-beta
转录起始因子RAP30
Reactome DB_ID:65567
UniProt: P13984 GTF2F2
GTF2F2
RAP30
TFIIF是一种通用的转录起始因子,与RNA聚合酶II结合,并与TFIIB合作将其招募到起始复合物中。它促进转录伸长。这个亚基显示atp依赖的dna解旋酶活性。亚基亚基和亚基的异源二聚体。与HTATSF1和GPBP1相互作用(通过相似性)。与URI1交互。与GTF2B相互作用(通过n端);这种相互作用在GTF2F1存在时受到抑制(PubMed:8504927, PubMed:8662660)。相似性属于TFIIF亚基家族。
UniProt
P13984
2
相等的
249
相等的
Reactome数据库ID Release 77
65567
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反应途径
r - hsa - 65567
1
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1
Reactome数据库ID Release 77
109631
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=109631
反应途径
r - hsa - 109631
1
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ComplexPortal
CPX-79
1
RNA聚合酶II全酶复合物(磷酸化)
Reactome DB_ID: 113716
RPB7
POLR2G
dna定向RNA聚合酶II 19 kDa多肽
Reactome DB_ID:63517
UniProt: P62487 POLR2G
POLR2G
RPB7
功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶II的组成部分,它合成mRNA前体和许多功能非编码RNA。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。它由相互相对移动的可移动元素组成。RPB7是RPB4亚复合物的一部分,它与位于钳位元件底部的由RPB1、RPB2和RPB6组成的口袋结合。RBP4-RPB7亚复合体似乎通过RPB7封闭的构象锁定钳位,从而阻止双链DNA进入活性位点裂隙。RPB4-RPB7亚复合体结合单链DNA和RNA(通过相似性)。结合RNA。亚单位RNA聚合酶II (Pol II)复合物的组成部分,由12个亚单位组成。RPB4和RPB7形成一个从10亚基Pol II核心复合物突出的亚复合物。属于真核生物RPB7/RPC8 RNA聚合酶亚基家族。
UniProt
P62487
1
相等的
172
相等的
Reactome数据库ID Release 77
63517
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反应途径
r - hsa - 63517
1
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1
POLR2K
dna定向RNA聚合酶I, II和III 7.0 kDa多肽
ABC10α
RPB7.0.
RPB10alpha
RPABC4
Reactome DB_ID: 63537
UniProt的:P53803 POLR2K
POLR2K
功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶I、II和III的共同组分,分别合成核糖体RNA前体、mRNA前体和许多功能性非编码RNA,以及小RNA,如5S rRNA和tRNAs。亚单位RNA聚合酶I (Pol I)、RNA聚合酶II (Pol II)和RNA聚合酶III (Pol III)复合物的组成,分别由至少13、12和17个亚单位组成。属于古菌RpoP/真核生物RPC10 RNA聚合酶亚基家族。
UniProt
P53803
1
相等的
58
相等的
Reactome数据库ID Release 77
63537
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反应途径
r - hsa - 63537
1
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1
XAP4
POLR2E
HSRPABC1.
dna定向RNA聚合酶II 23 kDa多肽(EC 2.7.7.6) (RPB25) (XAP4) (RPB5)
dna定向RNA聚合酶II 23 kDa多肽
RPB25
RPB5
RPABC1
Reactome DB_ID: 83713
UniProt: P19388 POLR2E
POLR2E
功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。其合成核糖体RNA前体,mRNA的前体和多官能的非编码RNA,和小RNA,如分别5S rRNA和tRNA的,RNA聚合酶I,II和III的共同组件。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。Pols是由相互相对移动的可移动元素组成的。在聚合酶II,POLR2E / RPB5是围绕中心大间隙的下颚的一部分,并认为抢传入DNA模板。似乎是在这个过程中(通过相似性)的主要部分的RNA的.SUBUNIT元器件聚合酶I(聚合酶I),RNA聚合酶II(POL II)和RNA聚合酶III(POL III)配合物由至少13,12和17个亚基,分别(通过相似性)。在RNA聚合酶II,此亚基的存在比其他亚基摩尔过量2倍。化与URI1.SUBUNIT(微生物感染)用相互作用蛋白HBV X.SIMILARITY属于古细菌RpoH /真核RNA RPB5聚合酶亚基家族。
UniProt
P19388
1
相等的
210
相等的
Reactome数据库ID Release 77
83713
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反应途径
r - hsa - 83713
1
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1
RPB2
POLR2B
dna定向RNA聚合酶II 140 kDa多肽
RNA聚合酶II亚基2
Reactome DB_ID:63504
UniProt: P30876 POLR2B
POLR2B
功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。第二RNA的最大组成部分聚合酶II,其合成的mRNA前体和许多功能的非编码RNA。建议作出贡献的聚合酶的催化活性,并与大亚基一起形成聚合酶活性中心。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。它由相互相对移动的可移动元素组成。RPB2是与中央大裂,夹紧元件,其移动到打开和关闭的裂口和,被认为是抓住传入DNA模板(通过相似性)的RNA的.SUBUNIT元器件聚合酶II钳口芯元件的一部分(POLII)配合物组成的12个亚单位。化与WDR82。与三磷酸核糖核苷与RNA的MEN1.MISCELLANEOUS的结合相互作用聚合酶II转录复合物可能涉及一个两步机制。最初的结合似乎在进入(E)的网站出现,并涉及两个最大的RNA聚合酶II亚基的三个保守天冬氨酸残基(通过相似)的协调镁离子.SIMILARITY属于RNA聚合酶β链的家庭。
UniProt
P30876
1
相等的
1174
相等的
Reactome数据库ID Release 77
63504
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=63504
反应途径
R-HSA-63504
1
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1
RPB6
POLR2F
HSRPABC2.
DNA定向RNA聚合酶II 14.4 KDA多肽(EC 2.7.7.6)(RPB6)(RPB14.4)
DNA定向RNA聚合酶II 14.4 kda多肽
RPB14.4
RPABC2
Reactome DB_ID: 83714
UNIPROT:P61218 POLR2F
POLR2F
POLRF
功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶I、II和III的常见组分,分别合成核糖体RNA前体、mRNA前体和许多功能性非编码RNA,以及小RNA,如5S rRNA和tRNAs。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。Pols是由相互相对移动的可移动元素组成的。在Pol II中,POLR2F/RPB6是钳位元件的一部分,与RPB1和RPB2的部分组成一个口袋,RPB4-RPB7亚复合物与之结合(通过相似性)。亚单位RNA聚合酶I (Pol I)、RNA聚合酶II (Pol II)和RNA聚合酶III (Pol III)复合物的组成,分别由至少13、12和17个亚单位组成。属于古菌RpoK/真核生物RPB6 RNA聚合酶亚基家族。
UniProt
P61218
2
相等的
127
相等的
Reactome数据库ID Release 77
83714
数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=83714
反应途径
r - hsa - 83714
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-83714.1
1
RPB1
P-S5-POLR2A
RNA聚合酶II(Ser5磷酸化)最大亚基
dna定向RNA聚合酶II最大亚基
Reactome DB_ID: 77100
UniProt: P24928 POLR2A
POLR2A
POLR2
功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA的最大和催化组分聚合酶II,其合成的mRNA的前体和多官能的非编码RNA。形成与第二大亚基聚合酶活性中心在一起。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。它由相互相对移动的可移动元素组成。RPB1是与中央大裂,夹紧元件,其移动到打开和关闭的裂口和,被认为是抓住传入DNA模板夹爪的芯元件的一部分。在转录的开始,启动子的一个单链DNA模板链被定位聚合酶II的中心有效位点裂口内。从RPB1桥接螺旋发出并穿过催化位点附近的裂口,并且被认为通过作为棘轮,以促进RNA聚合酶II的易位该移动通过活性位点的RNA-DNA杂交通过在每一步从直到弯曲的构象切换核苷酸添加。在转录延伸,RNA聚合酶II移动模板上的成绩单伸长。 Elongation is influenced by the phosphorylation status of the C-terminal domain (CTD) of Pol II largest subunit (RPB1), which serves as a platform for assembly of factors that regulate transcription initiation, elongation, termination and mRNA processing. Regulation of gene expression levels depends on the balance between methylation and acetylation levels of tha CTD-lysines (By similarity). Initiation or early elongation steps of transcription of growth-factors-induced immediate early genes are regulated by the acetylation status of the CTD (PubMed:24207025). Methylation and dimethylation have a repressive effect on target genes expression (By similarity).FUNCTION (Microbial infection) Acts as an RNA-dependent RNA polymerase when associated with small delta antigen of Hepatitis delta virus, acting both as a replicate and transcriptase for the viral RNA circular genome.SUBUNIT Component of the RNA polymerase II (Pol II) complex consisting of 12 subunits. Component of a complex which is at least composed of HTATSF1/Tat-SF1, the P-TEFb complex components CDK9 and CCNT1, RNA polymerase II, SUPT5H, and NCL/nucleolin. The large PER complex involved in the repression of transcriptional termination is composed of at least PER2, CDK9, DDX5, DHX9, NCBP1 and POLR2A (active). Interacts (via the C-terminal domain (CTD)) with U2AF2; recruits PRPF19 and the Prp19 complex to the pre-mRNA and may couple transcription to pre-mRNA splicing. Interacts (via the C-terminal domain (CTD)) with SMN1/SMN2; recruits SMN1/SMN2 to RNA Pol II elongation complexes. Interacts via the phosphorylated C-terminal domain with WDR82 and with SETD1A and SETD1B only in the presence of WDR82. When phosphorylated at 'Ser-5', interacts with MEN1; the unphosphorylated form, or phosphorylated at 'Ser-2' does not interact. When phosphorylated at 'Ser-2', interacts with SUPT6H (via SH2 domain). Interacts with RECQL5 and TCEA1; binding of RECQL5 prevents TCEA1 binding. The phosphorylated C-terminal domain interacts with FNBP3 and SYNCRIP. Interacts with ATF7IP. Interacts with DDX5. Interacts with WWP2. Interacts with SETX. Interacts (phosphorylated) with PIH1D1. Interacts (via the C-terminal domain (CTD)) with TDRD3. Interacts with PRMT5. Interacts with XRN2. Interacts with SAFB/SAFB1. Interacts with CCNL1. Interacts with CCNL2, MYO1C, PAF1 and SFRS19. Interacts (via C-terminus) with CMTR1, CTDSP1 and SCAF8. Interacts (via the C-terminal domain (CTD)) with CCNT2 (PubMed:15563843). Interacts with FUS. Interacts with MCM3AP isoform GANP (PubMed:23652018). Interacts with kinase SRPK2; the interaction occurs during the co-transcriptional formation of inappropriate R-loops (PubMed:28076779).SUBUNIT (Microbial infection) Interacts with herpes simplex virus 1 protein ICP22; this interaction causes loss of CTD 'Ser-2' phosphorylation from pol II engaged in transcription (PubMed:23029222).DOMAIN The C-terminal domain (CTD) serves as a platform for assembly of factors that regulate transcription initiation, elongation, termination and mRNA processing.PTM The tandem heptapeptide repeats in the C-terminal domain (CTD) can be highly phosphorylated (PubMed:28076779). The phosphorylation activates Pol II. Phosphorylation occurs mainly at residues 'Ser-2' and 'Ser-5' of the heptapeptide repeat and is mediated, at least, by CDK7 and CDK9. CDK7 phosphorylation of POLR2A associated with DNA promotes transcription initiation by triggering dissociation from DNA. Phosphorylation also takes place at 'Ser-7' of the heptapeptide repeat, which is required for efficient transcription of snRNA genes and processing of the transcripts. The phosphorylation state is believed to result from the balanced action of site-specific CTD kinases and phosphatases, and a 'CTD code' that specifies the position of Pol II within the transcription cycle has been proposed. Dephosphorylated by the protein phosphatase CTDSP1.PTM Among tandem heptapeptide repeats of the C-terminal domain (CTD) some do not match the Y-S-P-T-S-P-S consensus, the seventh serine residue 'Ser-7' being replaced by a lysine. 'Lys-7' in these non-consensus heptapeptide repeats can be alternatively acetylated, methylated and dimethylated. EP300 is one of the enzyme able to acetylate 'Lys-7'. Acetylation at 'Lys-7' of non-consensus heptapeptide repeats is associated with 'Ser-2' phosphorylation and active transcription. Regulates initiation or early elongation steps of transcription specially for inducible genes.PTM Methylated at Arg-1810 prior to transcription initiation when the CTD is hypophosphorylated, phosphorylation at Ser-1805 and Ser-1808 preventing this methylation. Symmetrically or asymmetrically dimethylated at Arg-1810 by PRMT5 and CARM1 respectively. Symmetric or asymmetric dimethylation modulates interactions with CTD-binding proteins like SMN1/SMN2 and TDRD3. SMN1/SMN2 interacts preferentially with the symmetrically dimethylated form while TDRD3 interacts with the asymmetric form. Through the recruitment of SMN1/SMN2, symmetric dimethylation is required for resolving RNA-DNA hybrids created by RNA polymerase II, that form R-loop in transcription terminal regions, an important step in proper transcription termination. CTD dimethylation may also facilitate the expression of select RNAs. Among tandem heptapeptide repeats of the C-terminal domain (CTD) some do not match the Y-S-P-T-S-P-S consensus, the seventh serine residue 'Ser-7' being replaced by a lysine. 'Lys-7' in these non-consensus heptapeptide repeats can be alternatively acetylated, methylated, dimethylated and trimethylated. Methylation occurs in the earliest transcription stages and precedes or is concomitant to 'Ser-5' and 'Ser-7' phosphorylation. Dimethylation and trimehtylation at 'Lys-7' of non-consensus heptapeptide repeats are exclusively associated with phosphorylated CTD.PTM Ubiquitinated by WWP2 leading to proteasomal degradation (By similarity). Following UV treatment, the elongating form of RNA polymerase II (RNA pol IIo) is ubiquitinated on UV damage sites without leading to degradation: ubiquitination is facilitated by KIAA1530/UVSSA and promotes RNA pol IIo backtracking to allow access to the nucleotide excision repair machinery.MISCELLANEOUS The binding of ribonucleoside triphosphate to the RNA polymerase II transcribing complex probably involves a two-step mechanism. The initial binding seems to occur at the entry (E) site and involves a magnesium ion temporarily coordinated by three conserved aspartate residues of the two largest RNA Pol II subunits. The ribonucleoside triphosphate is transferred by a rotation to the nucleotide addition (A) site for pairing with the template DNA. The catalytic A site involves three conserved aspartate residues of the RNA Pol II largest subunit which permanently coordinate a second magnesium ion.SIMILARITY Belongs to the RNA polymerase beta' chain family.
UniProt
P24928
5
相等的
O-phospho-L-serine
国防部
国防部:00046
1
相等的
1970
相等的
Reactome数据库ID Release 77
77100
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77100
反应途径
r - hsa - 77100
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-77100.1
1
RPB9
POLR2I
dna定向RNA聚合酶II 14.5 kDa多肽
RPB14.5
Reactome DB_ID:63525
UniProt: P36954 POLR2I
POLR2I
功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶II的组成部分,它合成mRNA前体和许多功能非编码RNA。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。它由相互相对移动的可移动元素组成。RPB9是包围中央大裂缝的上颌的一部分,被认为是用来抓取进入的DNA模板(基于相似性)。亚单位RNA聚合酶II (Pol II)复合物的组成部分,由12个亚单位组成。属于古菌RpoM/真核生物RPA12/RPB9/RPC11 RNA聚合酶家族。
UniProt
P36954
1
相等的
125
相等的
Reactome数据库ID Release 77
63525
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=63525
反应途径
r - hsa - 63525
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-63525.1
1
RPB8
POLR2H
dna定向RNA聚合酶I, II和III 17.1 kDa多肽
RPB17
RPABC3
Reactome DB_ID: 63523
UniProt: P52434 POLR2H
POLR2H
功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。其合成核糖体RNA前体,mRNA的前体和多官能的非编码RNA,和小RNA,如分别5S rRNA和tRNA的,RNA聚合酶I,II和III的共同组件。亚单位RNA聚合酶I (Pol I)、RNA聚合酶II (Pol II)和RNA聚合酶III (Pol III)复合物的组成,分别由至少13、12和17个亚单位组成。直接与POLR2A交互。属于真核生物RPB8 RNA聚合酶亚基家族。
UniProt
P52434
2
相等的
150
相等的
Reactome数据库ID Release 77
63523
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=63523
反应途径
r - hsa - 63523
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的网页连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa-63523.1
1
RPB3
POLR2C
DNA定向RNA聚合酶II 33 kDa多肽
RNA聚合酶II亚基3
RPB33
RPB31
Reactome DB_ID:63506
UniProt的:P19387 POLR2C
POLR2C
A-152E5.7
功能依赖于DNA的RNA聚合酶使用四种核糖核苷三磷酸作为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶II的组成部分,合成mRNA前体和许多功能性非编码RNA。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。它由相对移动的可移动元素组成。RPB3是具有中央大裂口的核心元件的一部分,钳位元件移动以打开和关闭裂口(通过相似性)。RNA聚合酶II(Pol II)复合物的亚单位成分,由12个亚单位组成。RPB11/POLR2J和RPB3/POLR2C亚基相互作用。相似性属于古细菌RpoD/真核生物RPB3 RNA聚合酶亚基家族。
UniProt
P19387
2
相等的
275
相等的
Reactome数据库ID Release 77
63506
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=63506
反应途径
R-HSA-63506
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-63506.1
1
RPB11
POLR2J
dna定向RNA聚合酶II 13.3 kDa多肽
Reactome DB_ID: 63531
UniProt: P52435 POLR2J
POLR2J
POLR2J1
功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶II的组成部分,它合成mRNA前体和许多功能非编码RNA。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。它由相互相对移动的可移动元素组成。RPB11是具有中央大裂缝的核心元素的一部分(通过相似性)。亚单位RNA聚合酶II (Pol II)复合物的组成部分,由12个亚单位组成。与AATF交互。组织特异性广泛表达。在心脏和骨骼肌中有高表达。属于古菌RpoL/真核生物RPB11/RPC19 RNA聚合酶亚基家族。
UniProt
P52435
1
相等的
117
相等的
Reactome数据库ID Release 77
63531
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反应途径
R-HSA-63531
1
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1
RPB4
POLR2D
DNA定向的RNA聚合酶II16 kda多肽
Reactome DB_ID:63508
UniProt: O15514 POLR2D
POLR2D
功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶II的组成部分,它合成mRNA前体和许多功能非编码RNA。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。它由相互相对移动的可移动元素组成。RPB4是RPB7亚复合物的一部分,它与位于钳位元件底部的由RPB1、RPB2和RPB6组成的口袋结合。RBP4-RPB7亚复合体似乎通过RPB7封闭的构象锁定钳位,从而阻止双链DNA进入活性位点裂隙。RPB4-RPB7亚复合体结合单链DNA和RNA(通过相似性)。亚单位RNA聚合酶II (Pol II)复合物的组成部分,由12个亚单位组成。RPB4和RPB7形成一个从10亚基Pol II核心复合物突出的亚复合物。属于真核生物RPB4 RNA聚合酶亚基家族。
UniProt
O15514
1
相等的
142
相等的
Reactome数据库ID Release 77
63508
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反应途径
R-HSA-63508
1
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1
RPB10
POLR2L
HSRPABC5.
DNA指导的RNA聚合酶II 7.6 kDa多肽(EC 2.7.7.6)(RPB10)(RPB7.6)
dna定向RNA聚合酶II 7.6 kDa多肽
RPB7.6
RPABC5
Reactome DB_ID: 83715
UniProt: P62875 POLR2L
POLR2L
功能依赖于DNA的RNA聚合酶使用四种核糖核苷三磷酸作为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶I、II和III的共同成分,分别合成核糖体RNA前体、mRNA前体和许多功能性非编码RNA,以及小RNA,如5S rRNA和tRNA。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。POL由相对移动的移动元件组成。在Pol II中,POLR2L/RBP10是具有中央大裂口的核心元件的一部分(通过相似性)。RNA聚合酶I(Pol I)、RNA聚合酶II(Pol II)和RNA聚合酶III(Pol III)复合物的亚单位成分至少由13、12和17个亚单位组成,相似性分别属于古细菌RpoN/真核生物RPB10 RNA聚合酶亚单位家族。
UniProt
P62875
1
相等的
67
相等的
Reactome数据库ID Release 77
83715
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反应途径
r - hsa - 83715
1
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1
Reactome数据库ID Release 77
113716
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反应途径
R-HSA-113716
1
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1
Reactome数据库ID Release 77
113404
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反应途径
r - hsa - 113404
1
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1
模板DNA: 30nt杂交转录本
反应数据库ID:111260
Reactome数据库ID Release 77
111260
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=111260
反应途径
r - - 111260
2
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ChEBI
61120
1
RNMT
RNA (guanine-7)甲基转移酶
反应DB_ID:77060
UNIPROT:O43148 RNMT
RNMT
KIAA0398
MRNA封端的甲基转移酶RNMT的功能催化亚基:RAMAC络合物,将添加的鸟嘌呤的N7位置甲基化至MRNA的5'-Cap结构(PubMed:9790902,Pubmed:9705270,PubMed:10347220,PubMed:11114884,PubMed:1111488422099306,PubMed:27422871)。结合含有5'-末端GPPPC的RNA(PubMed:11114884)。动力测定法通过拉姆克(Pubmed:27422871)激活甲基转移酶活性.Subunit与Importinα相互作用,导致刺激RNA结合和甲基转移酶活性(PubMed:11114884)。其核定位需要与Importinα和β的相互作用,响应RangTP分离,允许RNMT-Importinα结合RNA基材(PubMed:11114884)。与聚合酶II和RNGTT的伸长形式相互作用(PUBMED:9705270)。与RAMAC相互作用,该相互作用显着增强了RNA结合和帽甲基转移酶活性(PUBMED:22099306,REF.14)。广泛表达的特异性。脂肪酸属于I类样SAM结合甲基转移酶超家族。mRNA帽0甲基转移酶系列。
UniProt
O43148
1
相等的
476
相等的
Reactome数据库ID Release 77
77060
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77060
反应途径
r - hsa - 77060
1
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1
TFIIH
Reactome DB_ID: 109634
ERCC3
XPB蛋白质
ERCC-3
TFIIH基础转录因子复合物解旋酶XPB亚基(EC 3.61 .-)(基础转录因子2 89 kDa亚基)(BTF2-p89) (TFIIH 89 kDa亚基)(DNA修复蛋白补体XP-B细胞)(着色干皮病B组补体蛋白)(DNA切除修复蛋白ERCC-3)
TFIIH基础转录因子复合物解旋酶XPB亚基
基本转录因子2 89 kDa亚基
BTF2-p89
TFIIH 89 kDa亚单位
补充XP-B细胞的dna修复蛋白
着色性干皮病B组补充蛋白
DNA切除修复蛋白ERCC-3
Reactome DB_ID: 67439
UniProt: P19447 ERCC3
ERCC3
XPB
XPBC
功能ATP依赖性3'-5'DNA螺旋酶,一般转录和DNA修复因子IIH(TFIIH)核心复合物的组分,其涉及受损DNA的一般和转录偶联的核苷酸切除修复(NER),当络合时通过RNA聚合酶II的RNA转录CAK。在NER中,TFIIH通过打开病变周围的DNA,使受损的寡核苷酸被切除,并由新的DNA片段取代。DNA开口需要XPB / ERCC3但不是其旋光酶活性的ATP酶活性。在转录中,TFIIH在转录启动中具有重要作用(PubMed:8157004,PubMed:30894545)。当建立预发起复合物(PIC)时,启动子开放和启动子逃逸需要TFIIH(PubMed:8157004)。XPB / ERCC3的ATP依赖性螺旋酶活性是启动子开放和启动子逃生所必需的。通过激酶模块CAK的RNA聚合酶II的最大亚基(CTD)的C-末端尾(CTD)控制转录的启动。由XPB / ERCC3,XPD / ERCC2,GTF2H1组成的7-亚基TFIIH核心复合物的组分。,GTF2H2,GTF2H3,GTF2H4和GTF2H5,在NER中有效。核心复合物与由CCNH / Cyclin H,CDK7和MNAT1组成的3分亚次CDK激活激酶(CAK)模块,以形成转录中的10分亚亚单次全酶(Holo-TFIIH)(PubMed:9852112)。与PUF60进行互动(PubMed:10882074,PubMed:11239393)。 Interacts with ATF7IP (PubMed:19106100). Interacts with KAT2A; leading to KAT2A recruitment to promoters and acetylation of histones (PubMed:30894545).SUBUNIT (Microbial infection) Interacts with Epstein-Barr virus EBNA2.SIMILARITY Belongs to the helicase family. RAD25/XPB subfamily.
UniProt
P19447.
1
相等的
782
相等的
Reactome数据库ID Release 77
67439
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反应途径
r - hsa - 67439
1
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1
GTF2H3
BTF2-p34 (TFIIH组件)
TFIIH基础转录因子复合体p34亚基(基础转录因子2 34 kDa亚基)(BTF2-p34)(一般转录因子IIH多肽3)
TFIIH基础转录因子复合P34亚基
基本转录因子2 34 kDa亚基
BTF2-P34
一般转录因子IIH多肽3
Reactome DB_ID:65916
UNIPROT:Q13889 GTF2H3
GTF2H3
一般转录和DNA修复因子IIH(TFIIH)核心复合物的功能成分,参与受损DNA的一般和转录耦合核苷酸切除修复(NER),当与CAK复合时,参与RNA聚合酶II的RNA转录。在NER中,TFIIH通过打开病变周围的DNA来切除受损的寡核苷酸并用新的DNA片段替换。在转录中,TFIIH在转录起始中起着重要作用。当启动前复合物(PIC)建立后,启动子开放和启动子逃逸需要TFIIH。激酶模块CAK对RNA聚合酶II最大亚单位的C末端尾部(CTD)的磷酸化控制转录的启动。含有TFIID的RNA聚合酶II预启动复合物的亚单位部分,由TBP和至少GTF2A1、GTF2A2、GTF2E1、GTF2E2、GTF2F1、GTF2H2、GTF2H3、GTF2H4、GTF2H5、GTF2B组成,TCEA1、ERCC2、ERCC3、TAF1、TAF2、TAF3、TAF4、TAF5、TAF6、TAF7、TAF8、TAF9、TAF10、TAF11、TAF12和TAF13(PubMed:27193682)。由XPB/ERCC3、XPD/ERCC2、GTF2H1、GTF2H2、GTF2H3、GTF2H4和GTF2H5组成的7-亚单位TFIIH核心复合物的组分,其在NER中具有活性。核心复合物与由CCNH/细胞周期蛋白H、CDK7和MNAT1组成的3-亚单位CDK激活激酶(CAK)模块结合,形成转录活性的10-亚单位全酶(holo-TFIIH)(PubMed:9852112)。与RARA互动;这种相互作用需要“Ser-369”上的RARA事先磷酸化,然后增强RARA与CDK7的相互作用(通过相似性)。相似性属于TFB4家族。
UniProt
Q13889
1
相等的
308
相等的
Reactome数据库ID Release 77
65916
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反应途径
R-HSA-65916
1
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1
GTF2H1
TFIIH基础转录因子复合物p62亚基
基本转录因子62 kDa亚基
BTF2-P62
一般转录因子IIH多肽1
Reactome DB_ID:65912
UniProt的:P32780 GTF2H1
GTF2H1
BTF2
功能一般转录和DNA修复因子IIH (TFIIH)核心复合物的组成部分,参与受损DNA的一般和转录偶联核苷酸切除修复(NER),当与CAK复合物时,在RNA转录中通过RNA聚合酶II进行。在NER中,TFIIH通过打开病变周围的DNA,使受损的寡核苷酸被切除,并由新的DNA片段取代。在转录中,TFIIH在转录起始中具有重要作用。当预起始复合物(PIC)建立后,启动子开启和逃逸需要TFIIH。通过激酶模块CAK的RNA聚合酶II的最大亚基(CTD)的C-末端尾(CTD)控制转录的启动。由XPB / ERCC3,XPD / ERCC2,GTF2H1组成的7-亚基TFIIH核心复合物的组分。,GTF2H2,GTF2H3,GTF2H4和GTF2H5,在NER中有效。核心复合物与由CCNH/cyclin H、CDK7和MNAT1组成的3亚基cdk激活激酶(CAK)模块结合,形成10亚基全酶(holo-TFIIH),激活转录。与puf60互动。类似于TFB1家族的灵活性。
UniProt
P32780
1
相等的
548
相等的
Reactome数据库ID Release 77
65912
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反应途径
R-HSA-65912
1
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1
GTF2H4
BTF2-p52(TFIIH组件)
TFIIH基本转录因子复合物p52亚基(基本转录因子52kda亚基)(BTF2-p52)(一般转录因子IIH多肽4)
TFIIH基础转录因子复合物p52亚基
基本转录因子52 kDa亚基
BTF2-P52
一般转录因子IIH多肽4
Reactome DB_ID:65918
UniProt的:Q92759 GTF2H4
GTF2H4
功能一般转录和DNA修复因子IIH (TFIIH)核心复合物的组成部分,参与受损DNA的一般和转录偶联核苷酸切除修复(NER),当与CAK复合物时,在RNA转录中通过RNA聚合酶II进行。在NER中,TFIIH通过打开病变周围的DNA,使受损的寡核苷酸被切除,并由新的DNA片段取代。在转录中,TFIIH在转录起始中具有重要作用。当预起始复合物(PIC)建立后,启动子开启和逃逸需要TFIIH。通过激酶模块CAK的RNA聚合酶II的最大亚基(CTD)的C-末端尾(CTD)控制转录的启动。由XPB / ERCC3,XPD / ERCC2,GTF2H1组成的7-亚基TFIIH核心复合物的组分。,GTF2H2,GTF2H3,GTF2H4和GTF2H5,在NER中有效。核心复合物与由CCNH / Cyclin H,CDK7和MNAT1组成的3分亚基CDK激活激酶(CAK)模块,以形成有活性在转录中的10分亚单位的全酶(Holo-TFIIH)。Piemareity属于TFB2家族。
UniProt
Q92759
1
相等的
462
相等的
Reactome数据库ID Release 77
65918
数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=65918
反应途径
R-HSA-65918
1
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1
TTDA
GTF2H5
一般转录因子IIH亚基5
TFB5直接同源
一般转录因子IIH多肽5
TFIIH基础转录因子复合物TTD-A亚基
Reactome DB_ID: 5688446
UniProt:Q6ZYL4 GTF2H5
GTF2H5
C6orf175
TTDA
功能一般转录和DNA修复因子IIH (TFIIH)核心复合物的组成部分,参与受损DNA的一般和转录偶联核苷酸切除修复(NER),当与CAK复合物时,在RNA转录中通过RNA聚合酶II进行。在NER中,TFIIH通过打开病变周围的DNA,使受损的寡核苷酸被切除,并由新的DNA片段取代。在转录中,TFIIH在转录起始中具有重要作用。当预起始复合物(PIC)建立后,启动子开启和逃逸需要TFIIH。激酶模块CAK对RNA聚合酶II最大亚基c端尾部(CTD)的磷酸化控制转录的起始。对于TFIIH复合物的稳定性和细胞中正常水平的TFIIH的存在是必要的。亚单位TFIIH核心复合物由XPB/ERCC3、XPD/ERCC2、GTF2H1、GTF2H2、GTF2H3、GTF2H4、GTF2H5组成的7亚单位组成,在NER中有活性。核心复合物与由CCNH/cyclin H、CDK7和MNAT1组成的3亚基cdk激活激酶(CAK)模块结合,形成10亚基全酶(holo-TFIIH),激活转录。属于TFB5家族。
UniProt
Q6ZYL4
1
相等的
71
相等的
Reactome数据库ID Release 77
5688446
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5688446
反应途径
r - hsa - 5688446
1
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1
CXPD
ERCC2
XPD蛋白质
ERCC2 / CXPD
TFIIH基转录因子复合物解旋酶亚基(EC 3.61 .-) (DNA修复蛋白补体XP-D细胞)(着色干皮病D组补体蛋白)(CXPD) (DNA切除修复蛋白ERCC-2)
TFIIH基础转录因子复杂螺旋酶亚基
补充XP-D细胞的dna修复蛋白
着色性干皮病D组补体蛋白
DNA切除修复蛋白ERCC-2
Reactome DB_ID: 67443
UniProt: P18074 ERCC2
ERCC2
XPD
XPDC
atp依赖的5'-3' DNA解旋酶,是一般转录和DNA修复因子IIH (TFIIH)核心复合物的组成部分,参与受损DNA的一般和转录偶联核苷酸切除修复(NER),当与CAK复合物时,在RNA转录中由RNA聚合酶II进行。在NER中,TFIIH通过打开病变周围的DNA,使受损的寡核苷酸被切除,并由新的DNA片段取代。XPD/ERCC2的解旋酶活性依赖于atp,这是DNA开放所必需的。在转录中,TFIIH在转录起始中具有重要作用。当预起始复合物(PIC)建立后,启动子开启和逃逸需要TFIIH。激酶模块CAK对RNA聚合酶II最大亚基c端尾部(CTD)的磷酸化控制转录的起始。XPD/ERCC2的作用是在CAK和核心- tfiih复合物之间形成一座桥。参与维生素d受体活性的调节。作为有丝分裂纺锤体相关的MMXD复合体的一部分,它在染色体分离中发挥作用。可能在衰老过程中发挥作用,并可能在皮肤癌的产生中发挥作用。SUBUNIT Component of the 7-subunit TFIIH core complex composed of XPB/ERCC3, XPD/ERCC2, GTF2H1, GTF2H2, GTF2H3, GTF2H4 and GTF2H5, which is active in NER. The core complex associates with the 3-subunit CDK-activating kinase (CAK) module composed of CCNH/cyclin H, CDK7 and MNAT1 to form the 10-subunit holoenzyme (holo-TFIIH) active in transcription. The interaction with GTF2H2 results in the stimulation of the 5'-->3' helicase activity (PubMed:9771713, PubMed:9852112). Component of the MMXD complex, which includes CIAO1, ERCC2, CIAO2B, MMS19 and SLC25A5 (PubMed:20797633). Interacts with CIAO1 and CIAO2B; the interaction WITH CIAO2B is direct (PubMed:23891004). Interacts with ATF7IP (PubMed:19106100). Interacts directly with MMS19 (PubMed:23585563).SUBUNIT (Microbial infection) Interacts with Epstein-Barr virus EBNA2.PTM ISGylated.SIMILARITY Belongs to the helicase family. RAD3/XPD subfamily.
UniProt
P18074
1
相等的
760
相等的
Reactome数据库ID Release 77
67443
数据库标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=67443
反应途径
r - hsa - 67443
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-67443.1
1
GTF2H2
BTF2-p44 (TFIIH组件)
TFIIH基础转录因子复合体p44亚基(基础转录因子2 44kda亚基)(BTF2-p44)(一般转录因子IIH多肽2)
TFIIH基础转录因子复合物p44亚基
基本转录因子2 44kda亚基
BTF2-P44
一般转录因子IIH多肽2
Reactome DB_ID:65914
UniProt: Q13888 GTF2H2
GTF2H2
BTF2P44
功能一般转录和DNA修复因子IIH (TFIIH)核心复合物的组成部分,参与受损DNA的一般和转录偶联核苷酸切除修复(NER),当与CAK复合物时,在RNA转录中通过RNA聚合酶II进行。在NER中,TFIIH通过打开病变周围的DNA,使受损的寡核苷酸被切除,并由新的DNA片段取代。在转录中,TFIIH在转录起始中具有重要作用。当预起始复合物(PIC)建立后,启动子开启和逃逸需要TFIIH。激酶模块CAK对RNA聚合酶II最大亚基c端尾部(CTD)的磷酸化控制转录的起始。GTF2H2的n端与XPD相互作用并调控XPD,而RNAP II成功从启动子逃逸需要一个完整的c端。亚单位含tfiid的RNA聚合酶II预起始复合物的组成部分,由TBP和至少GTF2A1、GTF2A2、GTF2E1、GTF2E2、GTF2F1、GTF2H2、GTF2H3、GTF2H4、GTF2H5、GTF2B、TCEA1、ERCC2和ERCC3组成(PubMed:27193682)。TFIIH核心复合物7亚基组成,由XPB/ERCC3、XPD/ERCC2、GTF2H1、GTF2H2、GTF2H3、GTF2H4、GTF2H5组成,在NER中有活性。核心复合物与由CCNH/cyclin H、CDK7和MNAT1组成的3亚基cdk激活激酶(CAK)模块结合,形成10亚基全酶(holo-TFIIH),在转录中活跃(PubMed:9852112, PubMed:11319235)。与XPB, XPD, GTF2H1和GTF2H3相互作用(PubMed:11319235)。SUBUNIT (Microbial infection) Interacts with varicella-zoster virus IE63 protein.TISSUE SPECIFICITY Widely expressed, with higher expression in skeletal muscle.SIMILARITY Belongs to the GTF2H2 family.
UniProt
Q13888
1
相等的
395
相等的
Reactome数据库ID Release 77
65914
数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=65914
反应途径
R-HSA-65914
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-65914.1
1
CAK.
Reactome DB_ID: 69221
CAK.
CDK7
Cdk7
细胞分裂蛋白激酶7(EC2.7.1.-)(CDK激活激酶)(CAK)(TFIIH)(基础转录因子复合物激酶亚基)(39kDa蛋白激酶)(p39MO15)(STK1)(CAK1)
细胞分裂蛋白激酶7
CDK-activating激酶
TFIIH基础转录因子复杂激酶亚基
39 kda蛋白激酶
P39 Mo15
STK1
CAK1
Reactome DB_ID: 69218
UniProt:P50613 CDK7
CDK7
CAK.
CAK1
CDKN7
MO15.
STK1
丝氨酸/苏氨酸激酶参与细胞周期控制和RNA聚合酶ii介导的RNA转录。细胞周期蛋白依赖性激酶(CDKs)通过与细胞周期蛋白的结合而被激活,并介导细胞周期的进程。每个不同的复合物控制着细胞周期中两个后续阶段之间的特定过渡。在G2-M转变过程中,需要CDK1/cyclin-B的激活和复合物的形成,以及在G1-S转变过程中CDK2/cyclin的激活(但不需要复合物的形成)。CDK7是cdk激活激酶(CAK)复合物的催化亚基。磷酸化SPT5/SUPT5H, SF1/NR5A1, POLR2A, p53/TP53, CDK1, CDK2, CDK4, CDK6和CDK11B/CDK11。CAK通过苏氨酸磷酸化激活周期蛋白相关激酶CDK1、CDK2、CDK4和CDK6,从而调节细胞周期进程。与核心tfiih基转录因子结合的CAK通过其大亚基(POLR2A)的重复c末端结构域(CTD)的丝氨酸磷酸化激活RNA聚合酶II,使其从启动子中逃逸并延长转录本的长度。与DNA复合物中POLR2A的磷酸化通过触发与DNA的分离来促进转录起始。它的表达和活性在整个细胞周期中是恒定的。 Upon DNA damage, triggers p53/TP53 activation by phosphorylation, but is inactivated in turn by p53/TP53; this feedback loop may lead to an arrest of the cell cycle and of the transcription, helping in cell recovery, or to apoptosis. Required for DNA-bound peptides-mediated transcription and cellular growth inhibition.ACTIVITY REGULATION Inactivated by phosphorylation. Repressed by roscovitine (seliciclib, CYC202), R547 (Ro-4584820) and SNS-032 (BMS-387032). The association of p53/TP53 to the CAK complex in response to DNA damage reduces kinase activity toward CDK2 and RNA polymerase II repetitive C-terminal domain (CTD), thus stopping cell cycle progression. The inactivation by roscovitine promotes caspase-mediated apoptosis in leukemic cells.SUBUNIT Associates primarily with cyclin-H (CCNH) and MAT1 to form the CAK complex. CAK can further associate with the core-TFIIH to form the TFIIH basal transcription factor; this complex is sensitive to UV light. The CAK complex binds to p53/TP53 in response to DNA damage. Interacts with CDK2, SF1/NR5A1, PUF60 and PRKCI.TISSUE SPECIFICITY Ubiquitous.INDUCTION Repressed by DNA-bound peptides.PTM Phosphorylation of Ser-164 during mitosis inactivates the enzyme. Phosphorylation of Thr-170 is required for activity. Phosphorylated at Ser-164 and Thr-170 by CDK2.SIMILARITY Belongs to the protein kinase superfamily. CMGC Ser/Thr protein kinase family. CDC2/CDKX subfamily.
UniProt
P50613
1
相等的
346
相等的
Reactome数据库ID Release 77
69218
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=69218
反应途径
r - hsa - 69218
2
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1
p37
CCNH
Cyclin H.
MO15相关蛋白
意思是
Reactome DB_ID: 69220
UniProt: P51946 CCNH
CCNH
FUNCTION调控对CDK7,所述CDK激活激酶(CAK)酶复合物的催化亚基。CAK通过苏氨酸磷酸化激活周期蛋白相关激酶CDK1、CDK2、CDK4和CDK6。与核心tfiih基转录因子结合的CAK通过其大亚基(POLR2A)的重复c末端结构域(CTD)的丝氨酸磷酸化激活RNA聚合酶II,使其从启动子中逃逸并延长转录本的长度。在细胞周期控制和由RNA RNA的转录所涉及聚合酶II。其表达和活性在整个主要与CDK7和MAT1细胞cycle.SUBUNIT Associates的恒定以形成CAK复杂。CAK可以进一步与核心TFIIH结合以形成TFIIH基础转录factor.SIMILARITY属于细胞周期蛋白家族。细胞周期蛋白Ç亚科。
UniProt
P51946
1
相等的
323
相等的
Reactome数据库ID Release 77
69220
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反应途径
R-HSA-69220
2
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1
p36
MNAT1
MAT1
cdk激活激酶装配因子MAT1 (RING finger蛋白MAT1) (Menage a trois) (CDK7/cyclin H组装因子)(p36) (p35) (cyclin G1相互作用蛋白)
cdk激活激酶组装因子MAT1
环指蛋白MAT1
三角恋
CDK7/细胞周期蛋白H组装因子
p35区域
细胞周期蛋白G1相互作用蛋白
Reactome DB_ID:59012
UniProt: P51948 MNAT1
MNAT1
CAP35
MAT1
RNF66
稳定细胞周期蛋白H-CDK7复合物,形成有功能的cdk激活激酶(CAK)酶复合物。CAK通过苏氨酸磷酸化激活周期蛋白相关激酶CDK1、CDK2、CDK4和CDK6。与核心tfiih基转录因子结合的CAK通过其大亚基(POLR2A)的重复c末端结构域(CTD)的丝氨酸磷酸化激活RNA聚合酶II,使其从启动子中逃逸并延长转录本的长度。在细胞周期控制和由RNA RNA的转录所涉及聚合酶II。亚单位主要与CDK7和细胞周期蛋白H结合形成CAK复合物。CAK可进一步与core-TFIIH结合形成TFIIH基础转录因子。组织特异性在结肠和睾丸最高。中度水平见于胸腺、前列腺、卵巢和小肠。在脾脏和白细胞中含量最低。
UniProt
P51948
1
相等的
309
相等的
Reactome数据库ID Release 77
59012
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反应途径
R-HSA-59012
1
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1
Reactome数据库ID Release 77
69221
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反应途径
R-HSA-69221
1
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ComplexPortal
cpx - 578
1
Reactome数据库ID Release 77
109634
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反应途径
r - hsa - 109634
1
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1
SUPT5H
p-SUPT5H
转录延伸因子SPT5
SPT5H_HUMAN
Reactome DB_ID: 3009372
UniProt: O00267 SUPT5H
SUPT5H
SPT5
SPT5H
DRB敏感诱导因子复合物(DSIF复合物)的组成部分,通过RNA聚合酶II调控mRNA的加工和转录伸长。DSIF通过刺激RNGTT/CAP1A的mRNA guanyltransferase活性正调控mRNA capping。DSIF还与负延伸因子复合物(nef复合物)协同作用,增强启动子近端位点的转录暂停。转录暂停可能促进延伸能力RNA聚合酶II复合体的组装。DSIF和nef通过抑制转录延伸因子TFIIS/S-II促进暂停。TFIIS/S-II在转录暂停位点与RNA聚合酶II结合,刺激酶的弱固有核酸酶活性。通过RNA聚合酶II切割被阻断的转录本,可促进从新的3'端恢复转录,并可能允许通过自然暂停位点重复尝试转录。DSIF也能正向调节转录伸长,是HIV-1核转录激活因子Tat有效激活转录伸长所必需的。DSIF作用于抑制来自HIV-1 LTR的转录本的转录暂停,并阻止终止序列上HIV-1转录本的过早释放。亚单位与SUPT4H1相互作用形成DSIF。DSIF与正转录延伸因子b复合物(P-TEFb复合物)相互作用,该复合物由CDK9和cyclin-T (CCNT1或CCNT2)组成。 DSIF interacts with RNA polymerase II, and this interaction is reduced by phosphorylation of the C-terminal domain (CTD) of POLR2A by P-TEFb. DSIF also interacts with the NELF complex, which is composed of NELFA, NELFB, NELFD and NELFE, and this interaction occurs following prior binding of DSIF to RNA polymerase II. DSIF also interacts with PRMT1/HRMT1L2, HTATSF1/TATSF1, RNGTT/CAP1A, PRMT5/SKB1, SUPT6H, and can interact with PIN1. Component of a complex which is at least composed of HTATSF1/Tat-SF1, the P-TEFb complex components CDK9 and CCNT1, RNA polymerase II, SUPT5H, and NCL/nucleolin. Interacts with MCM3AP isoform GANP (PubMed:23652018).TISSUE SPECIFICITY Ubiquitously expressed.PTM Methylated by PRMT1/HRMT1L2 and PRMT5/SKB1. Methylation negatively regulates interaction with P-TEFb and RNA polymerase II.PTM Phosphorylated by CDK7 and CDK9. Phosphorylation by P-TEFb alleviates transcriptional pausing and can stimulate transcriptional elongation from the HIV-1 LTR. P-TEFb dependent phosphorylation is stimulated by the HIV-1 Tat protein. Phosphorylation may also stimulate interaction with PIN1. Bulk phosphorylation occurs predominantly in mitosis.SIMILARITY Belongs to the SPT5 family.
UniProt
O00267
磷酸化残留
国防部
MOD:00696
1
相等的
1087
相等的
Reactome数据库ID Release 77
3009372
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反应途径
r - hsa - 3009372
1
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1
HCE
RNGTT
信使rna限制酶
(HCE) (HCAP1)(包括:多核苷酸5'-三磷酸酶(EC 3.1.3.33) (mRNA 5'-三磷酸酶)(TPase);mRNA guanylytransferase (EC 2.7.7.50) (GTP——RNA guanylytransferase) (GTase)
HCAP1
多核苷酸5 ' -三磷酸酶
信使rna 5 '三磷酸酶
TPase
信使rna guanylyltransferase
三磷酸鸟苷——RNA guanylyltransferase
GTase
Reactome DB_ID: 72081
UniProt: O60942 RNGTT
RNGTT
CAP1A
功能双功能mRNA capping酶,n端RNA 5'-三磷酸酶活性,c端mRNA guanylytransferase活性。催化帽形成的前两个步骤:从新生mRNA的5'-三磷酸端去除-磷酸生成二磷酸端,并将GTP的gmp部分转移到5'-二磷酸端。亚基与POLR2A相互作用(通过c端);这提高了鸟苷转移酶的活性。结合(通过GTase结构域)到RNA聚合酶II的伸长磷酸化形式;可与磷酸化的POLR2A c端结构域直接相互作用,也可通过结合RNA间接相互作用(相似性)。与SUPT5H和RNMT相互作用。与HIV-1 Tat相互作用。亚单位(微生物感染)与HIV-1 Tat相互作用。Isoform 1和Isoform 4(在较小程度上)在大脑、小脑、甲状腺、肺、心脏、肝脏、肾脏、脾脏、大肠、睾丸、皮肤和肌肉中表达。由于GTase结构域的破坏,亚型2到亚型4缺乏mRNA 5'-鸟苷转移酶活性。n端截面的相似性;属于蛋白质酪氨酸磷酸酶家族的非受体类。c端截面相似; belongs to the eukaryotic GTase family.
UniProt
O60942
1
相等的
597
相等的
Reactome数据库ID Release 77
72081
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反应途径
r - hsa - 72081
1
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1
Reactome数据库ID Release 77
77061
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反应途径
r - hsa - 77061
1
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限制复杂(初始)
反应DB_ID:77063
1
1
1
Reactome数据库ID Release 77
77063
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反应途径
r - hsa - 77063
1
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Reactome数据库ID Release 77
77077
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反应途径
r - hsa - 77077
3.
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22982363
Pubmed
2013
转录过程中RNA聚合酶II CTD的动态磷酸化模式
Heidemann,马丁
Hintermair,科琳娜
喂,克尔斯滕
艾克,德克
Biochim。Biophys。Acta 1829:55 - 62
19729311
Pubmed
2009
重新封盖该消息
勋伯格,Daniel R
Maquat,Lynne E
趋势生物化学。SCI。34:435-42
24354960
Pubmed
2014
帽结合复合物(CBC)
Gonatopoulos-Pournatzis,托马斯
Cowling,维多利亚H.
物化学。j . 457:231-42
19941815
Pubmed
2009
通过RNA聚合酶II CTD周期进程
Buratowski,斯蒂芬
摩尔。细胞36:541-6
从左到右
3.1.3.33
初始转录本的5'端被capping酶水解
盖帽复合体形成后,盖帽酶的RNA三磷酸酶活性将新生mRNA转录本的5'端磷酸基水解为二磷酸。
哺乳动物capping酶的RNA三磷酸酶(RTP)结构域是包括蛋白酪氨酸磷酸酶、一些脂质磷酸酶和几种核酸磷酸酶在内的磷酸酶超家族成员。这个家族使用保守的亲核半胱氨酸残基攻击目标磷酸。瞬时磷酸半胱氨酸酶中间体被水解以再生酶活性部位。值得注意的是,虽然高级真核capping酶使用类似ptp的三磷酸酶结构域,但酵母三磷酸酶是完全不同的一类酶。酵母rtp是金属依赖的磷酸酶。RNA 5'-三磷酸酶(RTP)催化的第一反应可以表示为:pppN(pN)n + GTP -> ppN(pN)n + Pi;(n = 20 - 25) < P >
作者:Buratowski, S, 2003-10-15 15:18:41
π
正磷酸盐
磷酸氢
磷酸
无机磷酸盐
Reactome DB_ID: 113550
hydrogenphosphate (ChEBI: 43474)
磷酸氢
磷酸氢
磷酸
(警察丙(OH)) (2)
无机磷酸基
HYDROGENPHOSPHATE离子
HPO4 (2 -)
[P (OH) O3) (2)
ChEBI
CHEBI: 43474
Reactome数据库ID Release 77
113550
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反应途径
r - - 113550
4
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复合
C00009
限制复杂(水解)
反应DB_ID:77064
1
新生的前体mRNA与水解的5'端
Reactome DB_ID: 111341
Reactome数据库ID Release 77
111341
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反应途径
R-ALL-111341
2
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ChEBI
33697
1
1
Reactome数据库ID Release 77
77064
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77064
反应途径
r - hsa - 77064
1
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激活
activeUnit:#Protein27
基因本体论
去:0004651
细胞功能的基因本体论术语
心肌梗死
小姐:0355
相同的催化剂活性
Reactome数据库ID Release 77
77052
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77052
Reactome数据库ID Release 77
77078
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77078
反应途径
r - hsa - 77078
2
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9512541
Pubmed
1998
人mRNA 5'-capping酶cDNA的分离与鉴定。
Yamada-Okabe,T
Doi R
Shimmi,O.
有泽,男
Yamada-Okabe H
核酸Res 26:1700-6
从左到右
2.7.7.50
CE:GMP中间体复合物的形成
一个高度保守的赖氨酸在mRNA capping酶的guanylytransferase (GT)位点攻击GTP的α -磷酸。形成酶- gmp共价中间体。
作者:Buratowski, S, 2003-10-15 15:18:41
GTP
鸟嘌呤核苷5 '三磷酸
Reactome DB_ID: 113571
三磷酸鸟苷(ChEBI: 15996)
GTP
鸟嘌呤核苷5 '三磷酸
ChEBI
CHEBI: 15996
Reactome数据库ID Release 77
113571
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反应途径
r - - 113571
2
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复合
C00044
国内生产总值
Reactome DB_ID: 111349
国内生产总值(ChEBI: 17552)
国内生产总值
鸟嘌呤核苷5 '磷酸氢盐
鸟苷二磷酸
ChEBI
CHEBI: 17552
Reactome数据库ID Release 77
111349
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反应途径
R-ALL-111349
2
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复合
C00035
限制复杂(中间)
反应DB_ID:77065
1
1
共价CE:GMP中间复杂
Reactome DB_ID: 111343
GMP
鸟嘌呤核苷5 '磷酸氢
5'-鸟苷磷酸
鸟苷酸
鸟苷酸
Reactome DB_ID: 29626
鸟嘌呤核苷5 '一磷酸(ChEBI: 17345)
鸟嘌呤核苷5 '磷酸氢
ChEBI
CHEBI: 17345
Reactome数据库ID Release 77
29626
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反应途径
r - - 29626
4
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复合
C00144
1
1
Reactome数据库ID Release 77
111343
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=111343
反应途径
R-HSA-111343
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-111343.1
1
Reactome数据库ID Release 77
77065
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77065
反应途径
r - hsa - 77065
1
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激活
基因本体论
去:0004484
Reactome数据库ID Release 77
77051
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Reactome数据库ID Release 77
77081
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反应途径
r - hsa - 77081
2
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从左到右
2.7.7.50
GMP从capping酶GT位点转移到mRNA的5'端
mRNA的5'二磷酸端连接到GMP,并将其从酶中释放出来。目前尚不清楚RNA二磷酸端是如何从三磷酸酶活性位点转移到鸟苷转移酶位点的。在没有RNA的情况下,可以形成共价酶- gmp复合物。
guanyylltransferase (GT)催化的第二反应可以表示为:ppN(pN)n + GTP -> GpppN(pN)n + PPi
(Yamada-Okabe et al. 1998)。
作者:Buratowski, S, 2003-10-15 15:18:41
限制复杂(GpppN . .)
反应DB_ID:77066
1
与CE相关的具有5'-GMP的新生前mrna
Reactome DB_ID: 111344
Reactome数据库ID Release 77
111344
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=111344
反应途径
R-ALL-111344
2
Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-all-111344.2
ChEBI
33697
1
1
Reactome数据库ID Release 77
77066
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77066
反应途径
r - hsa - 77066
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-77066.1
激活
Reactome数据库ID Release 77
111348
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=111348
Reactome数据库ID Release 77
77083
数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77083
反应途径
r - hsa - 77083
2
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-77083.2
从左到右
从GT中分离5'-GMP的转录本
GMP帽的mRNA转录本与GT分离以进一步修饰(Yamada-Okabe et al. 1998)。
作者:Buratowski, S, 2003-10-15 15:18:41
封盖复合体(带有释放的5'- GMP)
反应DB_ID:77067
1
从CE分离出具有5'-GMP的新生前mrna
Reactome DB_ID: 111345
Reactome数据库ID Release 77
111345
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=111345
反应途径
R-ALL-111345
2
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-111345.2
ChEBI
33697
1
1
Reactome数据库ID Release 77
77067
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77067
反应途径
r - hsa - 77067
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-77067.1
Reactome数据库ID Release 77
77085
数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77085
反应途径
r - hsa - 77085
3.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-77085.3
从左到右
2.1.1.56.
RNA甲基转移酶对GMP-cap的甲基化作用
在capping反应的最后一步,甲基转移酶将一个甲基从s -腺苷蛋氨酸转移到帽鸟嘌呤的N7位置。n7g甲基转移酶(MT)介导的反应可表示为:
GpppN(pN)n + s -腺苷蛋氨酸(Adomet) ->m7GpppN(pN)n + s -腺苷同型半胱氨酸(adhcy)
作者:Buratowski, S, 2003-10-15 15:18:41
山姆
阿多米特
S-adenosylmethionine
S-腺苷-L-蛋氨酸
Reactome DB_ID: 77087
S-腺苷-1-蛋氨酸[Chebi:15414]
S-腺苷-L-蛋氨酸
ChEBI
CHEBI: 15414
Reactome数据库ID Release 77
77087
数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77087
反应途径
r-all-77087
3.
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复合
C00019
信使rna限制因素
Reactome DB_ID: 113403
1
1
Reactome数据库ID Release 77
113403
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113403
反应途径
r - hsa - 113403
1
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长官
AdoHcy
S-adenosylhomocysteine
S-adenosyl-L-homocysteine
Reactome DB_ID: 77502
S-adenosyl-L-homocysteine (ChEBI: 16680)
S-adenosyl-L-homocysteine
ChEBI
CHEBI: 16680
Reactome数据库ID Release 77
77502
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77502
反应途径
r - - 77502
3.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-77502.3
复合
C00021
RNA聚合酶II(磷酸化):TFIIF:capped pre-mRNA
Reactome DB_ID: 113405
封顶前体mRNA
Reactome DB_ID: 72085
Reactome数据库ID Release 77
72085
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=72085
反应途径
r - - 72085
2
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-72085.2
ChEBI
33697
1
1
Reactome数据库ID Release 77
113405
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113405
反应途径
r - hsa - 113405
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾邮件中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa-113405.1
激活
activeUnit: # Protein15
基因本体论
去:0004482
Reactome数据库ID Release 77
72082
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=72082
Reactome数据库ID Release 77
77090
数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77090
反应途径
r - hsa - 77090
2
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9790902
Pubmed
1998
三种编码mRNA(鸟嘌呤-7-)甲基转移酶(mRNA cap甲基化酶)的人cdna的克隆与鉴定。
冢本T
Shibagaki Y
Niikura,Y.
Mizumoto K
生物化学与生物物理
从左到右
帽结合复合物对mRNA帽的识别和结合
帽结合复合物与新生mRNA转录本上甲基化的GMP帽结合(gonatopouros - pournatzis & Cowling 2014)。
作者:Buratowski, S, 2003-10-15 15:18:41
编辑:Gopinathrao, G, 0000-00-00 00:00
盖结合复合物(CBC)
Reactome DB_ID: 77088
NIP1
NCBP2.
CBP20
20kda核帽结合蛋白(NCBP 20kda亚基)(CBP20) (NCBP相互作用蛋白1)(NIP1)
20 kda核帽结合蛋白
NCBP 20 kDa亚单位
NCBP相互作用蛋白
Reactome DB_ID: 51463
UniProt: P52298 NCBP2
NCBP2.
CBP20
PIG55
cap-binding complex (CBC)是cap-binding complex (CBC)的组成部分,以共转录方式与pre-mRNA的5' cap结合,参与多种过程,如pre-mRNA剪接、翻译调控、无意义介导的mRNA衰减、microrna (mirna)介导的rna介导的基因沉默(RNAi)和mRNA输出。CBC复合物通过与ALYREF/THOC4/ALY的相互作用参与细胞核的mRNA输出,导致mRNA输出机制募集到mRNA的5'端,并使mRNA沿5'到3'方向通过核孔输出。CBC复合物也参与介导U snRNA和无内含子mrna从细胞核输出。CBC复合物对于mRNA的第一轮翻译至关重要,在稳态翻译之前,CBC复合物被细胞质帽结合蛋白eIF4E取代。由CBC复合物介导的mRNA翻译的第一轮在无意义介导的mRNA衰变(NMD)中起着核心作用,NMD只发生在与CBC复合物结合的mRNA中,而不发生在与eif4e结合的mRNA上。CBC复合物通过与UPF1相互作用,增强包含至少一个外显子连接复合物(EJC)的mrna中的NMD,促进UPF1和UPF2相互作用。CBC复合物也参与了“故障安全”NMD,它独立于EJC复合物,但它不参与staufen介导的mRNA衰减(SMD)。在细胞增殖过程中,CBC复合物也通过与SRRT/ARS2的相互作用参与microrna (mirna)的生物发生,因此需要mirna介导的RNA干扰。CBC复合物还作为PARN的负调控因子,从而作为mRNA去烯化的抑制因子。在CBC复合物中,NCBP2/CBP20识别并结合帽状RNA (m7gpppg帽状RNA),但需要NCBP1/CBP80来稳定其n端环的运动,并将CBC与帽状结构锁定为高亲和力的帽状结合状态。 The conventional cap-binding complex with NCBP2 binds both small nuclear RNA (snRNA) and messenger (mRNA) and is involved in their export from the nucleus (PubMed:26382858).SUBUNIT Component of the nuclear cap-binding complex (CBC), a heterodimer composed of NCBP1/CBP80 and NCBP2/CBP20 that interacts with m7GpppG-capped RNA (PubMed:26382858). Found in a U snRNA export complex with PHAX/RNUXA, NCBP1/CBP80, NCBP2/CBP20, RAN, XPO1 and m7G-capped RNA. Interacts with PHAX/RNUXA, EIF4G1, HNRNPF, HNRNPH1 and ALYREF/THOC4/ALY. Interacts with SRRT/ARS2 and KPNA3 (PubMed:26382858).SIMILARITY Belongs to the RRM NCBP2 family.
UniProt
P52298.
1
相等的
156
相等的
Reactome数据库ID Release 77
51463
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反应途径
R-HSA-51463
1
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1
NCBP1.
CBP80
80 kDa的核帽结合蛋白(NCBP 80kDa的亚基)(CBP80)
80 KDA核帽结合蛋白
NCBP 80 kDa亚单位
Reactome DB_ID: 51469
UniProt: Q09161 NCBP1
NCBP1.
CBP80
NCBP
的帽结合复合物(CBC),其cotranscriptionally结合预mRNA的5'-帽和参与的各种处理如前mRNA剪接,翻译调节,无义介导的mRNA降解,RNA介导的功能成分基因沉默(RNAi)技术通过微RNA(miRNA)和mRNA出口。该CBC复杂经由其与ALYREF / THOC4 / ALY相互作用参与mRNA出口从细胞核,从而导致mRNA出口机械募集至mRNA的5'端,并在5' mRNA输出至3' 方向通过核孔。CBC复合物也参与介导U snRNA和无内含子mrna从细胞核输出。CBC复合物对于mRNA的第一轮翻译至关重要,在稳态翻译之前,CBC复合物被细胞质帽结合蛋白eIF4E取代。由CBC复合物介导的mRNA翻译的第一轮在无意义介导的mRNA衰变(NMD)中起着核心作用,NMD只发生在与CBC复合物结合的mRNA中,而不发生在与eif4e结合的mRNA上。CBC复合物通过与UPF1相互作用,增强包含至少一个外显子连接复合物(EJC)的mrna中的NMD,促进UPF1和UPF2相互作用。CBC复合物也参与了“故障安全”NMD,它独立于EJC复合物,但它不参与staufen介导的mRNA衰减(SMD)。在细胞增殖,该CBC复杂也经由其与SRRT / ARS2相互作用参与微RNA(miRNA)的生物合成和所需的miRNA介导的RNA干扰。 The CBC complex also acts as a negative regulator of PARN, thereby acting as an inhibitor of mRNA deadenylation. In the CBC complex, NCBP1/CBP80 does not bind directly capped RNAs (m7GpppG-capped RNA) but is required to stabilize the movement of the N-terminal loop of NCBP2/CBP20 and lock the CBC into a high affinity cap-binding state with the cap structure. Associates with NCBP3 to form an alternative cap-binding complex (CBC) which plays a key role in mRNA export and is particularly important in cellular stress situations such as virus infections. The conventional CBC with NCBP2 binds both small nuclear RNA (snRNA) and messenger (mRNA) and is involved in their export from the nucleus whereas the alternative CBC with NCBP3 does not bind snRNA and associates only with mRNA thereby playing a role only in mRNA export. NCBP1/CBP80 is required for cell growth and viability (PubMed:26382858).SUBUNIT Component of the nuclear cap-binding complex (CBC), a heterodimer composed of NCBP1/CBP80 and NCBP2/CBP20 that interacts with m7GpppG-capped RNA. Found in a U snRNA export complex containing PHAX/RNUXA, NCBP1/CBP80, NCBP2/CBP20, RAN, XPO1 and m7G-capped RNA. Identified in a IGF2BP1-dependent mRNP granule complex containing untranslated mRNAs. Interacts with PHAX/RNUXA, SRRT/ARS2, EIF4G2, IGF2BP1, HNRNPF, HNRNPH1, KIAA0427/CTIF, PARN, DROSHA, UPF1 and ALYREF/THOC4. May interact with EIF4G1; the interaction is however controversial since it is reported by PubMed:11340157, PubMed:15059963 and PubMed:15361857, but is not observed by PubMed:19648179. The large PER complex involved in the repression of transcriptional termination is composed of at least PER2, CDK9, DDX5, DHX9, NCBP1/CBP80 and POLR2A. Component of an alternative nuclear cap-binding complex (CBC) composed of NCBP1/CBP80 and NCBP3 (PubMed:26382858). Interacts with METTL3 (PubMed:27117702). Interacts with ZFC3H1 in a RNase-insensitive manner (PubMed:27871484). Interacts with MTREX (PubMed:30842217). Interacts with TASOR (By similarity).SIMILARITY Belongs to the NCBP1 family.
UniProt
Q09161
1
相等的
790
相等的
Reactome数据库ID Release 77
51469
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反应途径
R-HSA-51469
1
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1
Reactome数据库ID Release 77
77088
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反应途径
r - hsa - 77088
1
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cap pre-mRNA:CBC:RNA Pol II(磷酸化)复合物
Reactome DB_ID: 77089
1
1
Reactome数据库ID Release 77
77089
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反应途径
r - hsa - 77089
1
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Reactome数据库ID Release 77
77095
数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77095
反应途径
r - hsa - 77095
3.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-77095.3
从左到右
帽结合复合物(CBC)的形成
在反应开始时,存在1个CBP80分子和1个CBP20分子。在该反应结束时,存在1个“Cap Binding Complex (CBC)”分子(Glover-Cutter et al., 2008, Görnemann et al., 2005, Narita et al., 2007)。这个反应发生在原子核中。
Reactome数据库ID Release 77
77094
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反应途径
r - hsa - 77094
3.
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28297668
Pubmed
2017
相互排斥的含cbc复合物有助于RNA命运
贾科梅蒂,西蒙
Benbahouche, Nour El Houda
Domanski,米甲
罗伯特,玛丽切尔
Meola,尼古拉
触底,米甲
Bukenborg,雅克布
安德森,JS
Schulze Wiebke米
Verheggen,席琳
Kudla, Grzegorz
Jensen托本Heick
伯特兰,爱德华。
细胞报道18:2635至50年
15989964
Pubmed
2005
共转录剪接体组装以逐步方式发生,需要帽结合复合体
Görnemann,雅尼娜
Kotovic,金伯利M
抗议者越是愤怒,卡佳
Neugebauer,卡拉米
摩尔。细胞19:53 - 63
18157150
Pubmed
2008
RNA聚合酶II的停顿和同伙与前mRNA加工因子在基因的两端
Glover-Cutter,基拉
Kim,Soojin.
埃斯皮诺萨,华金
宾利,大卫L
Nat。结构。15:71-8摩尔。杂志
17499042
Pubmed
2007
nef与CBC相互作用并参与复制依赖组蛋白mrna的3'端加工
成田机场,T
荣德明
山本,Junichi
Tsuboi Y
田边,称
田中,Kiyoji
山口,Y
半田,洋
摩尔。电池26:349-65
从左到右
Pol II的SPT5亚基结合RNA三磷酸酶(RTP)
该capping酶与转录延伸因子DSIF的Spt5亚基相互作用。这种相互作用可能将覆盖反应与启动子逃逸或伸长结合起来,从而作为一个“检查点”,以确保覆盖发生在聚合酶继续生成其余转录本之前(Gonatopoulos-Pournatzis et al.2011)。
作者:Buratowski, S, 2003-10-15 15:18:41
RNA Pol II与磷酸化的CTD: CE复合物与活化的GT
反应DB_ID:77056
1
1
1
1
Reactome数据库ID Release 77
77056
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77056
反应途径
r - hsa - 77056
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa-77056.1
Reactome数据库ID Release 77
77073
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77073
反应途径
r - hsa - 77073
3.
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从左到右
GT的激活
在反应开始时,存在1个“RNA Pol II与磷酸化CTD: CE复合物”的分子。在这个反应的最后,存在1分子的'RNA Pol II与磷酸化的CTD: CE复合物与活化的GT'。
该反应发生在‘细胞核’内。
磷酸化CTD: CE复合物的RNA Pol II
反应DB_ID:77053
1
1
1
1
Reactome数据库ID Release 77
77053
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77053
反应途径
r - hsa - 77053
1
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-77053.1
Reactome数据库ID Release 77
77068
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77068
反应途径
r - hsa - 77068
3.
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从左到右
RNA聚合酶II CTD(磷酸化)与CE结合
在这个反应开始时,有1个分子的'mRNA capping酶'和1个分子的'Pol II转录复合物与(ser5)磷酸化的CTD包含挤压转录到+30'。在这个反应的最后,存在1个“RNA Pol II与磷酸化CTD: CE复合物”的分子。
该反应发生在‘细胞核’内。
含(ser5)磷酸化CTD的Pol II转录复合物,包含+30的挤压转录物
Reactome DB_ID: 157174
1
1
1
Reactome数据库ID Release 77
157174
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=157174
反应途径
r - hsa - 157174
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-157174.1
Reactome数据库ID Release 77
77069
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77069
反应途径
r - hsa - 77069
3.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-77069.3
Reactome数据库ID Release 77
72086
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=72086
反应途径
r - hsa - 72086
3.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-72086.3
11017188
Pubmed
2000
事情的结局:封顶和聚腺苷酸化。
沙特金,AJ
曼利,JL
Nat Struct Biol 7:838-42
11909521
Pubmed
2002
将mRNA加工与转录集成。
Proudfoot, Nicholas J
Furger,
染料,MJ
细胞108:501-12
10395561
Pubmed
1999
耦合RNA聚合酶II转录与前mRNA加工。
宾利,维
Curr Opin细胞生物学11:347-51
3326038
Pubmed
1988
信使RNA从加帽的真核细胞的酶。
Mizumoto K
Kaziro Y
Prog核酸Res Mol Biol 34:1-28
基因本体论
去:0006370
细胞过程的基因本体论术语
心肌梗死
小姐:0359