BioPAX途径由Reactome数据库中的“细胞核和细胞质中的tRNA修饰”转换而来。 tRNA在细胞核和细胞质中的修饰 已经发现了至少92种不同的tRNA核苷酸碱基修饰。这些修饰是由位于细胞核、细胞质和线粒体中的一大群不同的酶在转录后完成的(Boschi-Muller and Motorin 2013, Jackman and Alfonzo 2013, Gu et al. 2014, Helm and Alfonzo 2014, Li and Mason 2014)。反密码子附近和3'端附近的修饰分别影响tRNA与核糖体和tRNA合成酶的相互作用，而tRNA其他区域的修饰影响tRNA的折叠和稳定性(详见Hou et al. 2015)。tRNA修饰酶的突变与人类疾病相关(Sarin and Leidel 2014, Torres et al. 2014综述)。 作者:May, Bruce, 2015-05-30 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-05-30 从左到右 3.5.4 ADAT1脱氨tRNA(Ala)中的腺苷-37 ADAT1脱氨tRNA(Ala)的腺苷-37产生肌苷-37，然后可能甲基化为n1 -甲基亚胺-37 (Maas et al. 1999)。在酵母菌中的同源物Tad1p也能催化相同的反应，这表明腺苷-37的脱胺作用在真核生物中是高度保守的。 作者:May, Bruce, 2015-05-30 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-05-30 水 水 DB_ID: 113518 核浆 基因本体论 去:0005654 水(ChEBI: 15377) 水 ChEBI CHEBI: 15377 Reactome数据库ID发布77 113518 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113518 Reactome r - - 113518 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113518.3 Reactome //www.joaskin.com 复合 C00001 额外的信息 心肌梗死 小姐:0361 含有A-37的tRNA(Ala) 含有腺苷-37的tRNA(Ala) Reactome DB_ID: 6782349 Reactome数据库ID发布77 6782349 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782349 Reactome r - hsa - 6782349 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782349.1 ChEBI 29170 ChEBI 62885 tRNA(Ala)含有I-37 含有肌苷-37的tRNA(Ala) Reactome DB_ID: 6782283 Reactome数据库ID发布77 6782283 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782283 Reactome r - hsa - 6782283 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782283.1 ChEBI 29170 ChEBI 82852 NH3 氨 Reactome DB_ID: 76230 氨(ChEBI: 16134) 氨 ChEBI CHEBI: 16134 Reactome数据库ID发布77 76230 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=76230 Reactome r - - 76230 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-76230.3 复合 C00014 激活 ADAT1 trna特异性腺苷脱氨酶 ADAT1_HUMAN Reactome DB_ID: 6782329 UniProt: Q9BUB4 ADAT1 ADAT1 特异性地将tRNA-Ala中的腺苷-37脱胺为肌苷。组织特异性普遍表达。属于ADAT1家族。 智人 NCBI分类法 9606 UniProt Q9BUB4 1 平等的 502 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782329 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782329 Reactome r - hsa - 6782329 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782329.1 基因本体论 去:0008251 细胞功能的基因本体术语 心肌梗死 小姐:0355 相同的催化剂活性 Reactome数据库ID发布77 6782304 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782304 Reactome数据库ID发布77 6782336 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782336 Reactome r - hsa - 6782336 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782336.2 10430867 Pubmed 1999 与ADAR pre-mRNA编辑酶家族相关的人类trna特异性腺苷脱氨酶的鉴定和表征 Maas,年代 嘉宝,美联社 丰富的, Proc。国家的。学会科学。美国96:8895 - 900 基因本体论 去:0006400 细胞过程的基因本体术语 心肌梗死 小姐:0359 从左到右 3.5.4 ADAT2:ADAT3 (hetADAT)脱氨trna中的腺苷-34 ADAT2:ADAT3异源二聚体(hetADAT)在8种人类tRNA中脱氨腺苷-34:tRNA(Ala-AGC)、tRNA(Arg-ACG)、tRNA(Ile-AAT)、tRNA(leu-AAG)、tRNA(Pro-AGG)、tRNA(Ser-AGA)、tRNA(Thr-AGT)、tRNA(vala - aac) (Torres et al. 2015)。脱氨作用发生在前体trna的细胞核中，其中5'先导和3'尾随体尚未被裂解。在酿酒酵母中相应的同源物是Tad2p和Tad3p。 作者:May, Bruce, 2015-05-30 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-05-30 从Reactome中的EntitySet转换而来 含有A-34的前trna DB_ID: 6782314 含有A-34的tRNA(Ala) 含有腺苷-34的tRNA(Ala) DB_ID: 6782342 Reactome数据库ID发布77 6782342 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782342 Reactome r - hsa - 6782342 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782342.1 ChEBI 29170 ChEBI 62885 含有A-34的tRNA(精氨酸) 含有腺苷-34的tRNA(精氨酸) Reactome DB_ID: 6782265 Reactome数据库ID发布77 6782265 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782265 Reactome r - hsa - 6782265 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782265.1 ChEBI 29171 ChEBI 62885 含有A-34的tRNA(Ile) 含有腺苷-34的tRNA(Ile) Reactome DB_ID: 6782347 Reactome数据库ID发布77 6782347 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782347 Reactome r - hsa - 6782347 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782347.1 ChEBI 29174 ChEBI 62885 含有A-34的tRNA(Leu) 含有腺苷-34的tRNA(Leu) Reactome DB_ID: 6782269 Reactome数据库ID发布77 6782269 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782269 Reactome r - hsa - 6782269 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782269.1 ChEBI 29169 ChEBI 62885 含有A-34的tRNA(Pro) 含有腺苷-34的tRNA(Pro) Reactome DB_ID: 6782316 Reactome数据库ID发布77 6782316 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782316 Reactome r - hsa - 6782316 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782316.1 ChEBI 29177 ChEBI 62885 含有A-34的tRNA(Ser) 含有腺苷-34的tRNA(Ser) DB_ID: 6782246 Reactome数据库ID发布77 6782246 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782246 Reactome r - hsa - 6782246 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782246.1 ChEBI 29179 ChEBI 62885 含有A-34的tRNA(Thr) 含有腺苷-34的tRNA(Thr) Reactome DB_ID: 6782273 Reactome数据库ID发布77 6782273 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782273 Reactome r - hsa - 6782273 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782273.1 ChEBI 29180 ChEBI 62885 含有A-34的tRNA(Val) 含有腺苷-34的tRNA(Val) Reactome DB_ID: 6782268 Reactome数据库ID发布77 6782268 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782268 Reactome r - hsa - 6782268 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782268.1 ChEBI 29183 ChEBI 62885 Reactome数据库ID发布77 6782314 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782314 Reactome r - hsa - 6782314 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782314.1 从Reactome中的EntitySet转换而来 含有I-34的前trna DB_ID: 6782325 含有I-34的tRNA(Ala) tRNA(Ala)含有肌苷-34 Reactome DB_ID: 6782343 Reactome数据库ID发布77 6782343 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782343 Reactome r - hsa - 6782343 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782343.1 ChEBI 29170 ChEBI 82852 含有I-34的tRNA(精氨酸) 含有肌苷-34的tRNA(精氨酸) Reactome DB_ID: 6782282 Reactome数据库ID发布77 6782282 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782282 Reactome r - hsa - 6782282 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782282.1 ChEBI 29171 ChEBI 82852 含有I-34的tRNA(Ile) 含有肌苷-34的tRNA(Ile) Reactome DB_ID: 6782305 Reactome数据库ID发布77 6782305 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782305 Reactome r - hsa - 6782305 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782305.1 ChEBI 29174 ChEBI 82852 含有I-34的tRNA(Leu) 含有肌苷-34的tRNA(Leu) Reactome DB_ID: 6782270 Reactome数据库ID发布77 6782270 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782270 Reactome r - hsa - 6782270 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782270.1 ChEBI 29169 ChEBI 82852 含有I-34的tRNA(Pro) 含有肌苷-34的tRNA(Pro) DB_ID: 6782327 Reactome数据库ID发布77 6782327 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782327 Reactome r - hsa - 6782327 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782327.1 ChEBI 29177 ChEBI 82852 含有I-34的tRNA(Ser) 含有肌苷-34的tRNA(Ser) DB_ID: 6782308 Reactome数据库ID发布77 6782308 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782308 Reactome r - hsa - 6782308 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782308.1 ChEBI 29179 ChEBI 82852 tRNA(Thr)含有I-34 含有肌苷-34的tRNA(Thr) Reactome DB_ID: 6782332 Reactome数据库ID发布77 6782332 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782332 Reactome r - hsa - 6782332 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782332.1 ChEBI 29180 ChEBI 82852 tRNA(Val)含有I-34 tRNA(Val)含有肌苷-34 Reactome DB_ID: 6782252 Reactome数据库ID发布77 6782252 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782252 Reactome r - hsa - 6782252 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782252.1 ChEBI 29183 ChEBI 82852 Reactome数据库ID发布77 6782325 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782325 Reactome r - hsa - 6782325 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782325.1 激活 ADAT2: ADAT3 Reactome DB_ID: 6782302 ADAT2 trna特异性腺苷脱氨酶2 ecnumber3.54 .-/ecNumber ADAT2_HUMAN Reactome DB_ID: 6782318 UniProt: Q7Z6V5 ADAT2 ADAT2 DEADC1 功能可能参与许多trna中腺苷-34到肌苷的脱胺。属于胞苷和脱氧胞苷脱氨酶家族。ADAT2亚科。 UniProt Q7Z6V5 1 平等的 191 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782318 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782318 Reactome r - hsa - 6782318 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782318.1 1 ADAT3 可能失活的trna特异性腺苷脱氨酶样蛋白3 ADAT3_HUMAN Reactome DB_ID: 6782292 UniProt: Q96EY9 ADAT3 ADAT3 TAD3 属于胞苷和脱氧胞苷脱氨酶家族。ADAT3亚科。注意Val-225代替保守的Glu存在，Glu是胞苷和脱氧胞苷脱氨酶家族的活性位点。这表明该蛋白可能作为一个调控亚基。 UniProt Q96EY9 1 平等的 351 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782292 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782292 Reactome r - hsa - 6782292 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782292.1 1 Reactome数据库ID发布77 6782302 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782302 Reactome r - hsa - 6782302 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782302.1 Reactome数据库ID发布77 6782294 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782294 Reactome数据库ID发布77 6782311 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782311 Reactome r - hsa - 6782311 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782311.3 25916855 Pubmed 2015 人类tRNA中的肌苷修饰在前体tRNA水平上被纳入 阿德里安·加布里埃尔·托雷斯 Pineyro,大卫 Rodriguez-Escriba,玛尔塔 卡马乔,Noelia 雷纳,奥斯卡 Saint-Leger,阿德莱德 Filonava, Liudmila 巴特列,爱德华· 波多黎各Ribas de Pouplana 核酸学报。43:5145-57 从左到右 2.1.1 ALKBH8在tRNA(精氨酸)和tRNA(谷氨酸)中甲基化5-羧甲基尿嘧啶-34，生成5-甲氧基羰基甲基尿嘧啶-34 ALKBH8:Fe2+将一个甲基从s -腺苷蛋氨酸(AdoMet)转移到tRNA的5-羧甲基尿嘧啶-34，生成5-甲氧基羰基甲基尿嘧啶-34(5-(2-甲氧基-2-氧乙基)尿嘧啶-34)(Fu et al. 2010, song -m - øller et al. 2010)。在酵母菌中相应的同源物Trm9p也能催化相同的反应。 作者:May, Bruce, 2015-06-30 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-30 从Reactome中的EntitySet转换而来 tRNA(Arg,Glu)含有5-羧基甲基lu -34 Reactome DB_ID: 6786556 tRNA(Arg)(UCU)含有5-羧基甲基lu -34 Reactome DB_ID: 6786613 胞质 基因本体论 去:0005829 Reactome数据库ID发布77 6786613 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786613 Reactome r - hsa - 6786613 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786613.1 ChEBI 29171 ChEBI 74882 tRNA(Glu)(UUC)含有5-羧基甲基lu -34 Reactome DB_ID: 6786510 Reactome数据库ID发布77 6786510 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786510 Reactome r - hsa - 6786510 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786510.1 ChEBI 29175 ChEBI 74882 Reactome数据库ID发布77 6786556 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786556 Reactome r - hsa - 6786556 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786556.1 山姆 AdoMet S-adenosylmethionine S-adenosyl-L-methionine Reactome DB_ID: 71284 S-adenosyl-L-methionine (ChEBI: 15414) S-adenosyl-L-methionine ChEBI CHEBI: 15414 Reactome数据库ID发布77 71284 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=71284 Reactome r - - 71284 4 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-71284.4 复合 C00019 从Reactome中的EntitySet转换而来 tRNA(Arg,Glu)含有5-甲氧基羰基甲基lu -34 Reactome DB_ID: 6786617 含有5-甲氧基羰基甲基lu -34的tRNA(Arg)(UCU) Reactome DB_ID: 6786590 Reactome数据库ID发布77 6786590 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786590 Reactome r - hsa - 6786590 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786590.1 ChEBI 29171 ChEBI 74851 tRNA(Glu)(UUC)含有5-甲氧基羰基甲基lu -34 DB_ID: 6786498 Reactome数据库ID发布77 6786498 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786498 Reactome r - hsa - 6786498 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786498.1 ChEBI 29175 ChEBI 74851 Reactome数据库ID发布77 6786617 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786617 Reactome r - hsa - 6786617 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786617.1 长官 AdoHcy S-adenosylhomocysteine S-adenosyl-L-homocysteine Reactome DB_ID: 71285 S-adenosyl-L-homocysteine (ChEBI: 16680) S-adenosyl-L-homocysteine ChEBI CHEBI: 16680 Reactome数据库ID发布77 71285 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=71285 Reactome r - - 71285 4 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-71285.4 复合 C00021 激活 ALKBH8:价 Reactome DB_ID: 6786518 价 铁(铁) 铁原子 铁(II) 铁+ + 铁 Fe3 + 铁(III) Reactome DB_ID: 71067 铁(2 +)(ChEBI: 29033) 铁(2 +) 铁(ii)离子 价 铁(2 +) 铁离子(2 +) 铁(II) 亚铁离子 ChEBI CHEBI: 29033 Reactome数据库ID发布77 71067 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=71067 Reactome r - - 71067 4 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-71067.4 复合 C00023 1 ALKBH8 烷基化DNA修复蛋白alkB同源物8 ecNumber1.14.11.-/ecNumber ALKB8_HUMAN Reactome DB_ID: 6786537 UniProt: Q96BT7 ALKBH8 ALKBH8 ABH8 通过甲基转移酶结构域在tRNA反密码子环的振荡位置催化5-羧甲基尿嘧啶甲基化为5-甲基羧甲基尿嘧啶(PubMed:20123966, PubMed:20308323, PubMed:31079898)。在目标tRNA反密码子环的摆动位置催化5-甲基羧甲基尿苷形成的最后一步(PubMed:20123966, PubMed:20308323)。对tRNA(Arg)和tRNA(Glu)有偏好，不结合tRNA(Lys)(PubMed:20308323)。结合tRNA，通过其双加氧酶结构域在tRNA反密码子环的摆动位置催化5-甲基羧甲基尿嘧啶依赖铁和α -酮戊二酸羟基化，生成5-(S)-甲氧基羰基羟甲基尿嘧啶;偏爱tRNA(Gly) (PubMed:21285950)。需要在DNA损伤后正常存活(PubMed:20308323)。可能抑制细胞凋亡，促进细胞存活和血管生成(PubMed:19293182)。亚单元与TRMT112相互作用。组织特异性广泛表达，以脾脏表达最高，其次为胰腺和肺。DNA损伤后诱导上调。诱导通过ATM介导。相似性属于alkB家族。 UniProt Q96BT7 1 平等的 664 平等的 Reactome数据库ID发布77 6786537 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786537 Reactome r - hsa - 6786537 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786537.1 1 Reactome数据库ID发布77 6786518 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786518 Reactome r - hsa - 6786518 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786518.1 基因本体论 去:0008175 Reactome数据库ID发布77 6786507 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786507 Reactome数据库ID发布77 6786500 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786500 Reactome r - hsa - 6786500 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786500.2 20123966 Pubmed 2010 哺乳动物ALKBH8具有tRNA甲基转移酶活性，这是涉及翻译解码的多种不稳定尿苷修饰的生物发生所必需的 Songe-Mø我,琳恩 范登伯恩，欧文 Leihne, Vibeke 凯瑟琳 Kristoffersen, Terese 汉斯·E·克洛坎 Kirpekar,芬恩 Falnes, palatl Ø Klungland,阿恩 摩尔。细胞。生物30:1814-27 20308323 Pubmed 2010 人类AlkB同源物ABH8是一种tRNA甲基转移酶，是不稳定尿苷修饰和DNA损伤存活所必需的 傅,Dragony Jennifer A . N . Brophy 陈德义，陈德义 Kyle A 贝格利,Ulrike 理查德·S·保罗斯 彼得·C·迪顿 托马斯·J·贝格利 参孙，利昂娜·D 摩尔。细胞。生物30:2449-59 从左到右 CDKAL1:4Fe-4S在tRNA中甲基硫化n6 -苏酰基氨基氨基腺苷-37，生成2-甲基硫- n6 -苏酰基氨基氨基腺苷-37 CDKAL1:4Fe-4S复合物甲基硫酸化n6 -苏酰基氨基腺苷-37在几个trna中(Arragain et al. 2010)。甲基的来源是s -腺苷蛋氨酸(AdoMet)。硫磺的来源是未知的。枯草芽孢杆菌的同源物mtaB也能催化相同的反应(Arragain et al. 2010)。
CDKAL1位于内质网的细胞质面，因此推测反应发生在细胞质中(Brambillasca et al. 2012)。 作者:May, Bruce, 2015-06-30 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-30 含有苏氨基甲酰la -37的tRNA 含有N(6)-苏酰基氨基腺苷-37的转移RNA Reactome DB_ID: 6786554 Reactome数据库ID发布77 6786554 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786554 Reactome r - hsa - 6786554 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786554.1 ChEBI 17843 ChEBI 74418 含有2-甲基硫代- n6 -苏酰基氨基甲酰-37的tRNA 含有2-甲基硫代- n6 -苏氨酸氨基氨酰基腺苷-37的转移RNA Reactome DB_ID: 6786533 Reactome数据库ID发布77 6786533 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786533 Reactome r - hsa - 6786533 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786533.1 ChEBI 17843 ChEBI 74420 激活 CDKAL1:4Fe-4S Reactome DB_ID: 6786606 内质网膜 基因本体论 去:0005789 4 fe-4s集群 tetra-mu3-sulfido-tetrairon Reactome DB_ID: 6786566 tetra-mu3-sulfido-tetrairon (ChEBI: 49883) tetra-mu3-sulfido-tetrairon [4 fe-4s]集群 (Fe4S4)集群 /铁硫簇 (Fe4S4) ChEBI CHEBI: 49883 Reactome数据库ID发布77 6786566 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786566 Reactome r - - 6786566 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-6786566.3 2 CDKAL1 苏氨氨基腺苷tRNA甲基硫转移酶ecNumber2.8.4.5/ecNumber CDKAL_HUMAN Reactome DB_ID: 6786612 UniProt: Q5VV42 CDKAL1 CDKAL1 催化n6 -苏酰基氨基氨酰基腺苷(t(6)A)的甲基硫化，在读取以腺嘌呤开头的密码子的trna的第37位形成2-甲基硫- n6 -苏酰基氨基氨酰基腺苷(ms(2)t(6)A)。组织特异性在胰岛中表达。属于甲基硫转移酶家族。CDKAL1亚科。 UniProt Q5VV42 1 平等的 579 平等的 Reactome数据库ID发布77 6786612 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786612 Reactome r - hsa - 6786612 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786612.1 1 Reactome数据库ID发布77 6786606 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786606 Reactome r - hsa - 6786606 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786606.1 基因本体论 去:0035598 Reactome数据库ID发布77 6786520 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786520 Reactome数据库ID发布77 6786571 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786571 Reactome r - hsa - 6786571 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786571.3 23048041 Pubmed 2012 CDK5调节亚单位相关蛋白1-样1 (CDKAL1)是胰岛素瘤细胞内质网(ER)中的尾部锚定蛋白 Brambillasca,西尔维亚 Altkrueger, Anke 科伦坡，萨拉·弗朗西斯卡报道 Friederich,安妮 Eickelmann,彼得 马克,迈克尔 Borgese N Solimena米歇尔 生物。化学287:41808-19 20584901 Pubmed 2010 tRNA生物合成2-甲基硫代- n6 -苏酰基氨基腺苷的真核和原核甲基硫代转移酶鉴定 Arragain,西蒙 塞缪尔·汉德尔曼 罗哈,Farhad 魏、Fan-Yan Tomizawa, Kazuhito 约翰·F·亨特 Douki,亨利 Fontecave,马克 由于,艾蒂安 阿塔,默罕默德 生物。化学285:28425-33 从左到右 2.8.1发布 CTU1:CTU2:URM1在trna中硫代尿苷-34 CTU1:CTU2:URM1络合物将一个巯基从URM1的硫基羧基化c端转移到trna的尿嘧啶-34残基上，生成2-硫脲-34 (Schlieker et al. 2008)。同样的反应由线粒体中的TRMU (MTU1)催化。 作者:May, Bruce, 2015-05-30 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-05-30 CTU1: CTU2: thio-URM1 Reactome DB_ID: 6782334 CTU1 fullName证据="1"细胞质tRNA 2-硫代化蛋白1 ecNumber证据="1"2.7.7.-/ecNumber . 1 CTU1_HUMAN DB_ID: 6782266 UniProt: Q7Z7A3 CTU1 CTU1 ATPBD3 NCS6 在tRNA(Lys)， tRNA(Glu)和tRNA(Gln)的tRNA摆动位置上mcm(5)S(2)U的2-硫基化中起核心作用。直接结合trna，可能通过催化trna的腺苷化起作用，这是2-巯基化所需的中间体。目前尚不清楚它是否作为一种硫转移酶，将硫从硫代羧化的URM1转移到trna在摆动位置的尿嘧啶上。通路tRNA修饰;5-methoxycarbonylmethyl-2-thiouridine-tRNA生物合成。SUBUNIT至少由URM1、CTU2/NCS2和CTU1/ATPBD3组成的复合物的组分。可能与CTU2/NCS2形成异源二聚体。SIMILARITY属于TtcA家族。CTU1 / NCS6 ATPBD3亚科。 UniProt Q7Z7A3 1 平等的 348 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782266 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782266 Reactome r - hsa - 6782266 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782266.1 1 CTU2 全名evidence="1"胞质tRNA 2-巯基化蛋白 CTU2_HUMAN Reactome DB_ID: 6782328 UniProt: Q2VPK5 CTU2 CTU2 C16orf84 NCS2 在tRNA(Lys)， tRNA(Glu)和tRNA(Gln)的tRNA摆动位置上mcm(5)S(2)U的2-硫基化中起核心作用。可能通过与CTU1/ATPBD3形成异源二聚体起作用，将硫代羧化URM1中的硫连接到trna的尿嘧啶上。通路tRNA修饰;5-methoxycarbonylmethyl-2-thiouridine-tRNA生物合成。SUBUNIT至少由URM1、CTU2/NCS2和CTU1/ATPBD3组成的复合物的组分。SIMILARITY属于CTU2/NCS2家族。 UniProt Q2VPK5 2 平等的 515 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782328 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782328 Reactome r - hsa - 6782328 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782328.1 1 URM1_HUMAN thioG101-URM1 fullName evidence="1"泛素相关修饰符 Reactome DB_ID: 6782256 UniProt: Q9BTM9 URM1 URM1 C9orf74 在胞质tRNA(Lys)、tRNA(Glu)和tRNA(Gln)的tRNA摆动位置作为mcm(5)S(2)U 2-硫基化所需的硫载体。在tRNA 2-硫基化反应中作为硫供体，在其c端被MOCS3硫代羧化(-COSH)。然后将硫转移到tRNA上形成mcm(5)S(2)U的2-硫基化。也作为泛素样蛋白(UBL)，通过异肽键与靶蛋白的赖氨酸残基共价偶联，如MOCS3、ATPBD3、CTU2、USP15和CAS。硫代羧化形式作为缀合的底物，氧化应激特异性地诱导ubl -蛋白缀合物的形成。通路tRNA修饰;5-methoxycarbonylmethyl-2-thiouridine-tRNA生物合成。SUBUNIT至少由URM1、CTU2/NCS2和CTU1/ATPBD3组成的复合物的组分。PTM c端硫代羧化分为两个步骤，首先通过MOCS3的hesA/moeB/thiF部分进行酰基腺苷化(-COAMP)，然后通过MOCS3的rhodese结构域进行硫代羧化(-COSH)。SIMILARITY属于URM1家族。 UniProt Q9BTM9 101 平等的 1-thioglycine (c端) 国防部 国防部:01623 1 平等的 101 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782256 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782256 Reactome r - hsa - 6782256 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782256.1 1 Reactome数据库ID发布77 6782334 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782334 Reactome r - hsa - 6782334 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782334.1 从Reactome中的EntitySet转换而来 含有U-34的trna Reactome DB_ID: 6782242 含有U-34的tRNA(Gln) 含有尿苷34的tRNA(Gln) Reactome DB_ID: 6782280 Reactome数据库ID发布77 6782280 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782280 Reactome r - hsa - 6782280 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782280.1 ChEBI 29168 ChEBI 73747 tRNA(Glu)含有U-34 含有尿苷的tRNA(Glu) Reactome DB_ID: 6782277 Reactome数据库ID发布77 6782277 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782277 Reactome r - hsa - 6782277 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782277.1 ChEBI 29175 ChEBI 73747 含有U-34的tRNA(Lys) 含有尿苷34的tRNA(Lys) Reactome DB_ID: 6782243 Reactome数据库ID发布77 6782243 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782243 Reactome r - hsa - 6782243 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782243.1 ChEBI 29185 ChEBI 73747 Reactome数据库ID发布77 6782242 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782242 Reactome r - hsa - 6782242 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782242.1 从Reactome中的EntitySet转换而来 含有2-硫ou -34的tRNA(Gln,Glu,Lys) Reactome DB_ID: 6782249 含有2-硫ou -34的tRNA(Gln) 含有2-硫脲-34的tRNA(Gln) DB_ID: 6782271 Reactome数据库ID发布77 6782271 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782271 Reactome r - hsa - 6782271 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782271.1 ChEBI 29168 ChEBI 87170 含有2-硫ou -34的tRNA(Glu) 含有2-硫脲-34的tRNA(Glu) DB_ID: 6782351 Reactome数据库ID发布77 6782351 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782351 Reactome r - hsa - 6782351 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782351.1 ChEBI 29175 ChEBI 87170 含有2-硫ou -34的tRNA(Lys) 含有2-硫脲-34的tRNA(Lys) DB_ID: 6782348 Reactome数据库ID发布77 6782348 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782348 Reactome r - hsa - 6782348 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782348.1 ChEBI 29185 ChEBI 87170 Reactome数据库ID发布77 6782249 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782249 Reactome r - hsa - 6782249 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782249.1 CTU1: CTU2: URM1 DB_ID: 6782330 URM1 fullName evidence="1"泛素相关修饰符 URM1_HUMAN DB_ID: 6782298 1 平等的 101 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782298 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782298 Reactome r - hsa - 6782298 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782298.1 1 1 1 Reactome数据库ID发布77 6782330 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782330 Reactome r - hsa - 6782330 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782330.1 激活 基因本体论 去:0016783 Reactome数据库ID发布77 6782303 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782303 Reactome数据库ID发布77 6782264 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782264 Reactome r - hsa - 6782264 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782264.2 19017811 Pubmed 2008 功能蛋白质组学方法将泛素相关修饰因子Urm1与tRNA修饰途径联系起来 Christian Schlieker, D 范·德·维恩，安妮玛特·G 达蒙，我是杰丁·R 斯普纳,E Ploegh,霍奇金淋巴瘤 Proc。国家的。学会科学。美国105:18255-60 从左到右 DUS2:EPRS在trna中将尿嘧啶还原为二氢尿嘧啶 DUS2催化trna d环中尿嘧啶残基的5,6双键的还原，生成5,6-二氢尿嘧啶(Kato et al. 2005)。从酿酒酵母的同源物推断，Smm1p (Dus2p)、NADH或NADPH是还原剂。 作者:May, Bruce, 2015-05-30 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-05-30 含有U的tRNA 传递含有尿苷的RNA DB_ID: 6782279 Reactome数据库ID发布77 6782279 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782279 Reactome r - hsa - 6782279 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782279.1 ChEBI 17843 ChEBI 73747 从Reactome中的EntitySet转换而来 NAD (P) H NADH、NADPH 还原的吡啶核苷酸 Reactome DB_ID: 428206 NADH Reactome DB_ID: 73473 NADH (2 -) (ChEBI: 57945) NADH (2 -) NADH二阶阴离子 腺苷5'-{3-[1-(3-氨基甲酰-1,4-二氢吡啶-1-基)-1,4-无水-d -核糖醇-5-基]二磷酸} NADH ChEBI CHEBI: 57945 Reactome数据库ID发布77 73473 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=73473 Reactome r - - 73473 4 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-73473.4 复合 C00004 TPNH NADPH Reactome DB_ID: 29364 NADPH (ChEBI: 16474) NADPH TPNH ChEBI CHEBI: 16474 Reactome数据库ID发布77 29364 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29364 Reactome r - - 29364 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29364.2 复合 C00005 Reactome数据库ID发布77 428206 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=428206 Reactome r - - 428206 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-428206.1 从Reactome中的EntitySet转换而来 NAD (P) + NAD +, NADP + 吡啶核苷酸，被氧化 DB_ID: 428218 河畔 NAD + NAD (+) 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 DPN Diphosphopyridine核苷酸 DB_ID: 29360 NAD (1 -) (ChEBI: 57540) NAD (1 -) 腺苷5'-{3-[1-(3-氨基甲酰基吡啶)-1,4-无水- d -核糖醇-5-基]二磷酸} NAD (+) NAD阴离子 ChEBI CHEBI: 57540 Reactome数据库ID发布77 29360 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29360 Reactome r - - 29360 5 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29360.5 复合 C00003 TPN 辅酶ii + 辅酶ii 辅酶ii (+) 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸 -烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸 Triphosphopyridine核苷酸 DB_ID: 29366 辅酶ii (+) (ChEBI: 18009) 辅酶ii (+) ChEBI CHEBI: 18009 Reactome数据库ID发布77 29366 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29366 Reactome r - - 29366 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29366.3 复合 C00006 Reactome数据库ID发布77 428218 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=428218 Reactome r - - 428218 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-428218.1 含有二氢u的tRNA 转移含有二氢吡啶的RNA Reactome DB_ID: 6782353 Reactome数据库ID发布77 6782353 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782353 Reactome r - hsa - 6782353 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782353.1 ChEBI 17843 ChEBI 74443 激活 activeUnit: # Protein11 DUS2: epr DB_ID: 6782346 epr 双功能氨基- trna合成酶 Reactome DB_ID: 379649 UniProt: P07814 EPRS1 EPRS1 epr gln 帕尔斯 加尔省 女王公园巡游者 PIG32 多功能蛋白，主要是氨基酰基-tRNA合成酶多酶复合物的一部分，也称为多合成酶复合物，在两步反应中催化同源氨基酸与相应tRNA的附着:氨基酸首先被ATP激活，与AMP形成共价中间体，然后转移到同源tRNA的受体端(PubMed:1756734, PubMed:24100331, PubMed:23263184)。干扰素- γ诱导的EPRS1磷酸化将该蛋白从氨基酰基- trna合成酶多酶复合物中分离出来，并将其招募到步态复合物中，该复合物与多种炎症mrna(如铜蓝蛋白)的3'-UTR中含有梗环的步态元件结合，抑制其翻译。因此，在特定的细胞中，干扰素- γ可以将EPRS1的功能从蛋白质合成转向翻译抑制(PubMed:15479637, PubMed:23071094)。也作为mTORC1信号通路的效应者，通过SLC27A1促进脂肪细胞对长链脂肪酸的摄取。因此，它也在脂肪代谢中发挥作用，更间接地影响寿命(PubMed:28178239)。活性调控受氟化酮抑制。亚基同二聚体(PubMed:24100331, PubMed:23263184)。部分氨基酰基-tRNA合成酶多酶复合物，也称为多合成酶复合物(MSC)，由Arg (RARS1)、Asp (DARS1)、Gln (QARS1)、Ile (IARS1)、Leu (LARS1)、Lys (KARS1)、Met (MARS1)、Glu和Pro的双功能连接酶(EPRS1)和辅助亚基AIMP1/p43、AIMP2/p38和EEF1E1/p18组成(PubMed:24312579, PubMed:19131329, PubMed:19289464)。形成一个线性复合体，包含MARS1, EEF1E1, EPRS1和AIMP2，这是多亚基复合体的核心(PubMed:26472928)。与TARS3交互(PubMed:24312579)。与DUS2L (PubMed:15994936)相互作用。 Component of the GAIT complex which is composed of EPRS1, RPL13A and GAPDH. For human, the complex assembly seems to be a two-step process in which EPRS1 first associates with SYNCRIP to form a pre-GAIT complex which is deficient in GAIT element binding (PubMed:15479637). Interacts (phosphorylated at Ser-999) with SLC27A1; mediates the translocation of SLC27A1 from the cytoplasm to the plasma membrane thereby increasing the uptake of long-chain fatty acids (PubMed:28178239).DOMAIN The WHEP-TRS domains are involved in RNA binding.PTM Phosphorylated at Ser-886 by CDK5 (PubMed:19647514, PubMed:21220307). Phosphorylated at Ser-999 by RPS6KB1; triggers EPRS1 release from the aminoacyl-tRNA synthetase multienzyme complex (PubMed:19647514, PubMed:21220307, PubMed:28178239). In monocytes, the IFN-gamma-induced sequential phosphorylation at Ser-886 and Ser-999 releases EPRS1 from the aminoacyl-tRNA synthetase multienzyme complex, allowing its association with the GAIT complex. Phosphorylation at Ser-999 is specifically required for the RPL13A-mediated interaction of the GAIT complex with eIF4G (PubMed:19647514, PubMed:21220307). Phosphorylation at Ser-999 by RPS6KB1, is also induced by insulin through activation of the mTORC1 signaling pathway and promotes the interaction of EPRS1 with SLC27A1 (PubMed:28178239).SIMILARITY In the N-terminal section; belongs to the class-I aminoacyl-tRNA synthetase family. Glutamate--tRNA ligase type 2 subfamily.SIMILARITY In the C-terminal section; belongs to the class-II aminoacyl-tRNA synthetase family.CAUTION Was originally thought to be a glutaminyl-tRNA synthetase. UniProt P07814 1 平等的 1512 平等的 Reactome数据库ID发布77 379649 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=379649 Reactome r - hsa - 379649 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-379649.1 1 DUS2 tRNA-dihydrouridine DUS2L_HUMAN DB_ID: 6782261 UniProt: Q9NX74 DUS2 DUS2 DUS2L 功能:二氢嘧啶合酶。催化nadph依赖的二氢吡啶合成，二氢吡啶是大多数trna的d环中发现的修饰碱基(PubMed:15994936, PubMed:26429968, PubMed:30149704)。负调控EIF2AK2/PKR的激活(PubMed:18096616)。亚单元与EPRS1相互作用。通过DRBM结构域与PRKRA和EIF2AK2/PKR(通过DRBM 1结构域)相互作用。组织特异性:心脏、胎盘、骨骼肌弱表达。在大多数肺癌细胞中上调(在蛋白水平上)。高效的二氢吡啶合成需要催化结构域和c端rna结合DRBM结构域的存在。相似性属于杜斯家族。Dus2亚科。 UniProt Q9NX74 1 平等的 493 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782261 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782261 Reactome r - hsa - 6782261 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782261.1 1 Reactome数据库ID发布77 6782346 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782346 Reactome r - hsa - 6782346 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782346.1 基因本体论 去:0017150 Reactome数据库ID发布77 6782306 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782306 Reactome数据库ID发布77 6782296 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782296 Reactome r - hsa - 6782296 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782296.2 15994936 Pubmed 2005 一种新的人trna -二氢吡啶合成酶参与肺癌的发生 加藤,达也 Daigo, Yataro Hayama, Satoshi 石川,Nobuhisa Yamabuki, Takumi 伊藤君还做 宫本茂,正树 近藤,Satoshi 中村,Yusuke 巨蟹座:65:5638-46 从左到右 2.3.1.234 EKC配合物使trna中的A37个苏氨基甲酰化 从酵母的同源物(EKC复合物、KEOPS复合物、BUD32:CGI121:KAE1:PCC1)推断，EKC复合物(LAGE3:OSGEP:TP53RK:TPRKB)将一个苏酰基氨基甲酸酯基从l -苏酰基氨基甲酸酯转移到trna的腺苷-37上，生成苏酰基氨基甲酸酯-37。 作者:May, Bruce, 2015-06-20 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-20 L-threonylcarbamoyladenylate Reactome DB_ID: 6784485 L-threonylcarbamoyladenylate (ChEBI: 73687) L-threonylcarbamoyladenylate TC-AMP (N) - adenyloxycarbonyl -L-threnine L-threonylcarbamoyl-AMP ChEBI CHEBI: 73687 Reactome数据库ID发布77 6784485 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784485 Reactome r - - 6784485 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-6784485.2 含有A-37的tRNA 转移含有腺苷-37的RNA Reactome DB_ID: 6784474 Reactome数据库ID发布77 6784474 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784474 Reactome r - hsa - 6784474 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6784474.1 ChEBI 17843 ChEBI 62885 含有苏氨基甲酰la -37的tRNA 含有N(6)-苏酰基氨基腺苷-37的转移RNA DB_ID: 6784468 Reactome数据库ID发布77 6784468 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784468 Reactome r - hsa - 6784468 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6784468.1 ChEBI 17843 ChEBI 74418 AMP 腺苷5’一磷酸 DB_ID: 164121 5'-单磷酸腺苷[ChEBI:16027] 腺苷5’一磷酸 ChEBI CHEBI: 16027 Reactome数据库ID发布77 164121 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=164121 Reactome r - - 164121 4 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-164121.4 激活 EKC复杂 Reactome DB_ID: 6784495 TP53RK tp53调节激酶ecNumber2.7.11.1/ecNumber PRPK_HUMAN DB_ID: 6784489 UniProt: Q96S44 TP53RK TP53RK C20orf64 PRPK 功能EKC/KEOPS复合物的组成部分，在读取以腺嘌呤开头的密码子的trna中，在37位(t(6)A37)上形成腺苷上的苏氨基氨基基(t(6)A37)是必需的(PubMed:22912744, PubMed:27903914)。该配合物可能参与将苏氨基氨基酰基- amp (TC-AMP)的苏氨基氨基部分转移到A37的N6基团(PubMed:22912744, PubMed:27903914)。TP53RK在EKC/KEOPS复合物中具有atp酶活性，可能对催化亚基OSGEP起支持作用(通过相似性)。非典型蛋白激酶磷酸化p53/TP53蛋白的Ser-15，因此可能参与其激活(PubMed:11546806)。至少由GON7、TP53RK、TPRKB、OSGEP和LAGE3组成的EKC/KEOPS复合物的亚基组分;整个复合体二聚体化。组织特异性在睾丸中高度表达。弱表达于心、肾、脾。该蛋白被认为是一种非典型的丝氨酸/苏氨酸激酶，因为它缺乏识别底物所必需的传统结构元件，以及在所有其他丝氨酸/苏氨酸激酶中参与催化事件的赖氨酸残基。TP53RK在体外具有蛋白激酶活性，但在EKC/KEOPS复合物的背景下，催化亚基OSGEP将TP53RK的活性从激酶转换为atp酶(通过相似性)。属于蛋白激酶超家族。BUD32家庭。 UniProt Q96S44 1 平等的 253 平等的 Reactome数据库ID发布77 6784489 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784489 Reactome r - hsa - 6784489 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6784489.1 2 LAGE3 EKC/KEOPS复合亚基LAGE3 LAGE3_HUMAN DB_ID: 6784525 UniProt: Q14657 LAGE3 LAGE3 DXS9879E ESO3 ITBA2 功能EKC/KEOPS复合体的组成部分，在读取以腺嘌呤开头的密码子的trna中，在37位(t(6)A37)的腺苷上形成苏氨酸氨基。该配合物可能参与了苏氨基氨基酰基amp (TC-AMP)的苏氨基氨基部分向A37的N6基团的转移。LAGE3作为复合体的二聚化模块。至少由GON7、TP53RK、TPRKB、OSGEP和LAGE3组成的EKC/KEOPS复合物的亚基组分;整个复合体二聚体化。组织特异性无处不在。属于CTAG/PCC1家族。 UniProt Q14657 1 平等的 143 平等的 Reactome数据库ID发布77 6784525 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784525 Reactome r - hsa - 6784525 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6784525.1 2 TPRKB EKC/KEOPS复合亚基TPRKB TPRKB_HUMAN Reactome DB_ID: 6784505 UniProt: Q9Y3C4 TPRKB TPRKB cgi - 121 My019 功能EKC/KEOPS复合物的组成部分，在读取以腺嘌呤开头的密码子的trna中，在37位(t(6)A37)上形成腺苷上的苏氨基氨基基(t(6)A37)是必需的(PubMed:22912744, PubMed:28805828)。该配合物可能参与了苏氨基氨基酰基amp (TC-AMP)的苏氨基氨基部分向A37的N6基团的转移(PubMed:22912744, PubMed:28805828)。TPRKB作为一种变构效应因子调节复合物的t(6)A活性。tRNA修改不需要TPRKB (PubMed:22912744, PubMed:28805828)。至少由GON7、TP53RK、TPRKB、OSGEP和LAGE3组成的EKC/KEOPS复合物的亚基组分;整个复合体二聚体(PubMed:22912744, PubMed:28805828)。与TP53RK/PRPK (PubMed:12659830)相互作用。组织特异性广泛表达。属于CGI121/TPRKB家族。 UniProt Q9Y3C4 1 平等的 175 平等的 Reactome数据库ID发布77 6784505 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784505 Reactome r - hsa - 6784505 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6784505.1 2 OSGEP fullName证据="1"可能的tRNA n6 -腺苷苏氨酸氨基甲酰转移酶ecNumber证据="1"2.3.1.234/ecNumber OSGEP_HUMAN Reactome DB_ID: 6784522 UniProt: Q9NPF4 OSGEP OSGEP GCPL1 功能EKC/KEOPS复合体的组成部分，在读取以腺嘌呤开头的密码子的trna中，在37位(t(6)A37)的腺苷上形成苏氨酸氨基。该配合物可能参与了苏氨基氨基酰基amp (TC-AMP)的苏氨基氨基部分向A37的N6基团的转移。OSGEP可能在该反应中起直接催化作用，但需要复合物的其他蛋白质来完成该活性。至少由GON7、TP53RK、TPRKB、OSGEP和LAGE3组成的EKC/KEOPS复合物的亚基组分;整个复合体二聚体化。与PRAME交互。组织特异性:低水平广泛表达。在心脏、胎盘、肝、肾、肺、脑、骨骼肌和胰腺中表达。属于KAE1 / TsaD家族。 UniProt Q9NPF4 1 平等的 335 平等的 Reactome数据库ID发布77 6784522 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784522 Reactome r - hsa - 6784522 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6784522.1 2 Reactome数据库ID发布77 6784495 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784495 Reactome r - hsa - 6784495 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6784495.1 基因本体论 去:0061711 Reactome数据库ID发布77 6784452 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784452 Reactome数据库ID发布77 6784494 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784494 Reactome r - hsa - 6784494 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6784494.2 从左到右 2.1.1 FTSJ1 2'- o -甲基化tRNA中的胞苷-32 (Phe) FTSJ1甲基化tRNA反密码子环(Phe)中胞苷32和鸟苷34的2′羟基，以及其他底物tRNA的C32和N34 (Guy and Phizicky 2015a, Guy et al. 2015b)。根据人类FTSJ1与酵母Trm7的功能和序列同源性推断，该反应发生在细胞质中。基于酵母中trm732突变体的互补作用，THADA与FTSJ1一起参与C32位点的甲基化反应，但THADA的功能尚未在人类细胞中得到直接证实(Guy and Phizicky 2015a)。 作者:May, Bruce, 2016-05-09 审稿:Eric M . Phizicky, 2016-06-20 编辑:May, Bruce, 2016-05-09 tRNA(法) Reactome DB_ID: 379767 Reactome数据库ID发布77 379767 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=379767 Reactome r - hsa - 379767 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-379767.1 ChEBI 29184 2 2 含有2'- o -甲基c -32的tRNA(Phe) Reactome DB_ID: 9024158 Reactome数据库ID发布77 9024158 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9024158 Reactome r - hsa - 9024158 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-9024158.1 ChEBI 29184 ChEBI 74495 激活 FTSJ1 fullName evidence="1"假设的tRNA TRM7_HUMAN Reactome DB_ID: 8870280 UniProt: Q9UET6 FTSJ1 FTSJ1 JM23 作用:甲基化底物tRNA反密码子环32和34位核苷酸的2'- o -核糖。组织特异性发现于胎儿脑、肺、肝和肾。在成人大脑中，在杏仁核、尾状核、胼胝体、海马和丘脑中表达。属于i类sam结合甲基转移酶超家族。RNA甲基转移酶RlmE家族。TRM7亚科。 UniProt Q9UET6 1 平等的 329 平等的 Reactome数据库ID发布77 8870280 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8870280 Reactome r - hsa - 8870280 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-8870280.1 基因本体论 去:0052666 Reactome数据库ID发布77 8870296 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8870296 Reactome数据库ID发布77 9024159 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9024159 Reactome r - hsa - 9024159 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-9024159.3 25404562 Pubmed 2015 真核生物tRNAPhe反密码子环关键修饰的复杂回路的保存 盖伊，迈克尔·P Eric M . Phizicky RNA 21:61 - 74 26310293 Pubmed 2015 tRNA反密码子环2′- o甲基化缺陷与由FTSJ1突变引起的非综合征性x连锁智力残疾有关 盖伊，迈克尔·P 肖,玛丽 凯瑟琳·L·韦纳 霍布森,琳 斯塔克Zornitza 玫瑰,凯瑟琳 Vera M . Kalscheuer Gecz,约瑟夫 Eric M . Phizicky 嗡嗡声。Mutat 36:1176 - 87 激活 Reactome数据库ID发布77 8949093 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8949093 Reactome r - hsa - 8949093 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-8949093.2 THADA 甲状腺腺瘤相关蛋白 THADA_HUMAN DB_ID: 8870282 细胞质 基因本体论 去:0005737 UniProt: Q6YHU6 THADA THADA 吉塔 KIAA1767 组织特异性表达于胰腺、肾上腺髓质、甲状腺、肾上腺皮质、睾丸、胸腺、小肠和胃。在良性甲状腺腺瘤中观察到涉及THADA的染色体畸变。易位t(2;3)(p21;p25)和易位t(2;7)(p21;p15);来自3p25和7p15染色体的序列似乎不包括编码区，融合事件可能导致THADA蛋白截断。相似性属于THADA家族。 UniProt Q6YHU6 1 平等的 1953 平等的 Reactome数据库ID发布77 8870282 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8870282 Reactome r - hsa - 8870282 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-8870282.1 从左到右 2.1.1.34 FTSJ1 2'- o -甲基化tRNA中的鸟苷-34 (Phe) FTSJ1甲基化tRNA反密码子环(Phe)中胞苷32和鸟苷34的2′羟基，以及其他底物tRNA的C32和N34 (Guy and Phizicky 2015a, Guy et al. 2015b)。根据人类FTSJ1与酵母Trm7的功能和序列同源性推断，该反应发生在细胞质中。基于酵母中trm732突变体的互补作用，THADA与FTSJ1一起参与C32位点的甲基化反应，但THADA的功能尚未在人类细胞中得到直接证实(Guy and Phizicky 2015a)。 作者:May, Bruce, 2016-05-09 审稿:Eric M . Phizicky, 2016-06-20 编辑:May, Bruce, 2016-05-09 2 tRNA(Phe)含有2'- o -甲基-34 DB_ID: 9024162 Reactome数据库ID发布77 9024162 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9024162 Reactome r - hsa - 9024162 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-9024162.1 ChEBI 29184 ChEBI 74445 2 激活 基因本体论 去:0009020 Reactome数据库ID发布77 8870298 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8870298 Reactome数据库ID发布77 9024161 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9024161 Reactome r - hsa - 9024161 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-9024161.3 激活 Reactome数据库ID发布77 9024157 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9024157 Reactome r - hsa - 9024157 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-9024157.1 从左到右 2.1.1 KIAA1456 (TRM9L)在tRNA中甲基化5-羧甲基尿嘧啶，生成5-甲氧基羰基甲基尿嘧啶 KIAA1456 (TRM9L, hTRM9L)将tRNA中的一个甲基从s -腺苷蛋氨酸(AdoMet)转移到5-羧甲基尿嘧啶，生成5-甲氧基羰基甲基尿嘧啶(5-(2-甲氧基-2-氧乙基)尿嘧啶(Begley et al. 2013)。该反应的亚细胞位置尚不清楚。 作者:May, Bruce, 2015-06-30 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-30 AdoMet phys-ent-participant99483 S-adenosyl-L-methionine phys-ent-participant82370 phys-ent-participant3284 phys-ent-participant59725 phys-ent-participant33504 phys-ent-participant39327 phys-ent-participant4469 phys-ent-participant36574 phys-ent-participant98911 phys-ent-participant48952 phys-ent-participant45832 phys-ent-participant43333 phys-ent-participant70915 DB_ID: 5279190 Reactome数据库ID发布77 5279190 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5279190 Reactome r - - 5279190 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-5279190.3 含有5-羧基甲基lu -34的tRNA Reactome DB_ID: 6786496 Reactome数据库ID发布77 6786496 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786496 Reactome r - hsa - 6786496 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786496.2 ChEBI 17843 ChEBI 74882 AdoHcy phys-ent-participant82372 S-adenosyl-L-homocysteine phys-ent-participant61891 phys-ent-participant59726 phys-ent-participant64277 phys-ent-participant42389 phys-ent-participant23938 phys-ent-participant63971 phys-ent-participant45838 phys-ent-participant81188 phys-ent-participant91731 phys-ent-participant96003 phys-ent-participant70916 phys-ent-participant100401 phys-ent-participant61567 phys-ent-participant91738 phys-ent-participant49899 phys-ent-participant98918 phys-ent-participant4478 phys-ent-participant61958 phys-ent-participant3470 phys-ent-participant99655 phys-ent-participant49923 phys-ent-participant42676 phys-ent-participant78852 phys-ent-participant43338 phys-ent-participant62115 phys-ent-participant39397 phys-ent-participant91720 phys-ent-participant73252 phys-ent-participant36705 phys-ent-participant12410 phys-ent-participant75621 phys-ent-participant64931 phys-ent-participant68316 phys-ent-participant95478 phys-ent-participant36595 phys-ent-participant69849 phys-ent-participant36610 phys-ent-participant103573 phys-ent-participant81380 phys-ent-participant45869 phys-ent-participant36818 phys-ent-participant96129 phys-ent-participant81868 phys-ent-participant27628 phys-ent-participant49944 phys-ent-participant36583 phys-ent-participant90850 phys-ent-participant65024 phys-ent-participant99491 phys-ent-participant81224 phys-ent-participant95017 phys-ent-participant61974 phys-ent-participant3296 phys-ent-participant45853 phys-ent-participant91803 phys-ent-participant89763 phys-ent-participant39334 phys-ent-participant50505 phys-ent-participant48961 phys-ent-participant78781 phys-ent-participant12226 phys-ent-participant64136 phys-ent-participant59635 phys-ent-participant54576 phys-ent-participant99545 phys-ent-participant64551 phys-ent-participant43483 phys-ent-participant78876 phys-ent-participant89927 phys-ent-participant81846 phys-ent-participant70641 phys-ent-participant91780 phys-ent-participant56402 phys-ent-participant63937 phys-ent-participant65045 phys-ent-participant77229 phys-ent-participant23998 phys-ent-participant81204 phys-ent-participant43965 phys-ent-participant63497 phys-ent-participant97425 phys-ent-participant99332 phys-ent-participant36754 phys-ent-participant91125 phys-ent-participant8434 phys-ent-participant78889 phys-ent-participant61853 phys-ent-participant46703 phys-ent-participant36849 phys-ent-participant43085 phys-ent-participant49961 phys-ent-participant100454 phys-ent-participant36866 phys-ent-participant36654 phys-ent-participant59754 phys-ent-participant36914 phys-ent-participant83129 phys-ent-participant101514 phys-ent-participant61057 phys-ent-participant81822 phys-ent-participant91115 phys-ent-participant64426 phys-ent-participant61926 phys-ent-participant81166 phys-ent-participant42872 phys-ent-participant63959 phys-ent-participant49785 phys-ent-participant46964 phys-ent-participant56130 phys-ent-participant50530 phys-ent-participant96166 phys-ent-participant81326 phys-ent-participant64988 phys-ent-participant90916 phys-ent-participant36726 phys-ent-participant91101 phys-ent-participant76732 phys-ent-participant65231 phys-ent-participant85996 phys-ent-participant43116 DB_ID: 5278409 Reactome数据库ID发布77 5278409 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5278409 Reactome r - - 5278409 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-5278409.3 含有5-甲氧基羰基甲基lu -34的tRNA DB_ID: 6786605 Reactome数据库ID发布77 6786605 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786605 Reactome r - hsa - 6786605 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786605.2 ChEBI 17843 ChEBI 74851 激活 KIAA1456 可能是tRNA甲基转移酶9样蛋白 K1456_HUMAN Reactome DB_ID: 6786575 UniProt: Q9P272 TRMT9B TRMT9B C8orf79 KIAA1456 TRM9L 可修饰特定精氨酸和谷氨酸trna中的不稳定尿苷。通过促进LIN9的表达作为肿瘤抑制因子。组织特异性在乳腺癌、膀胱癌、结直肠癌、宫颈癌和睾丸癌中下调。属于甲基转移酶超家族。 UniProt Q9P272 1 平等的 454 平等的 Reactome数据库ID发布77 6786575 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786575 Reactome r - hsa - 6786575 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786575.1 Reactome数据库ID发布77 6786625 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786625 Reactome数据库ID发布77 6786567 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786567 Reactome r - hsa - 6786567 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786567.3 23381944 Pubmed 2013 人tRNA甲基转移酶9样蛋白通过调节LIN9和HIF1-α来阻止肿瘤生长 贝格利,Ulrike 索萨，我是玛丽亚·索莱达 Avivar-Valderas Alvaro 帕蒂尔、阿施施 Endres,劳伦 埃斯特拉达,Yeriel 陈德义，陈德义 苏,丹 彼得·C·迪顿 Aguirre-Ghiso, Julio A 贝格利,托马斯 EMBO摩尔医学5:366-83 从左到右 2.1.1.33 METTL1:WDR4甲基化tRNA(Phe)的鸟苷-46产生7-甲基鸟苷-46 METTL1:WDR4复合物将一个甲基从s -腺苷蛋氨酸转移到tRNA(Phe)的鸟苷-46，生成7-甲基鸟苷-46 (Alexandrov et al. 2002, Cartlidge et al. 2005)。Trm8p:Trm82p也存在于酿酒酵母中，并催化相同的反应。 作者:May, Bruce, 2015-06-06 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-06 tRNA(Phe)含有G-46 含有鸟苷-46的tRNA(Phe) Reactome DB_ID: 6782309 Reactome数据库ID发布77 6782309 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782309 Reactome r - hsa - 6782309 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782309.1 ChEBI 29184 ChEBI 64654 山姆 AdoMet S-adenosylmethionine S-adenosyl-L-methionine Reactome DB_ID: 77087 Reactome数据库ID发布77 77087 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77087 Reactome r - - 77087 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-77087.3 复合 C00019 tRNA(Phe)含有7-甲基g -46 含有7-甲基鸟苷-46的tRNA(Phe) DB_ID: 6782293 Reactome数据库ID发布77 6782293 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782293 Reactome r - hsa - 6782293 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782293.1 ChEBI 29184 ChEBI 74480 长官 AdoHcy S-adenosylhomocysteine S-adenosyl-L-homocysteine Reactome DB_ID: 77502 Reactome数据库ID发布77 77502 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77502 Reactome r - - 77502 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-77502.3 复合 C00021 激活 METTL1: WDR4 DB_ID: 6782313 WDR4 = " 1 " tRNA fullName证据 WDR4_HUMAN Reactome DB_ID: 6782341 UniProt: P57081 WDR4 WDR4 甲基转移酶复合物的非催化组分，在RNA物种的子集中形成N(7)-甲基鸟嘌呤，如tRNAs, mrna和microRNAs (miRNAs) (PubMed:12403464, PubMed:31031084, PubMed:31031083)。在甲基转移酶复合体中，需要稳定和诱导催化亚基的构象变化(PubMed:12403464)。tRNA中46号位置(m7G46)的N(7)-甲基鸟嘌呤形成所必需的(PubMed:12403464, PubMed:31031084)。在mrna亚群的内部位点形成N(7)-甲基鸟嘌呤也是必需的(PubMed:31031084)。也需要特定mirna子集的甲基化，如let-7 (PubMed:31031083)。独立于METTL1，也在基因组稳定性中发挥作用:定位于DNA复制位点并调节FEN1的核内溶活性(PubMed:26751069)。通路tRNA修饰;N (7) -methylguanine-tRNA生物合成。与催化亚基METTL1形成异二聚体(PubMed:12403464, PubMed:26751069)。与FEN1相互作用;交互是直接的(PubMed:26751069)。SIMILARITY Belongs to the WD repeat TRM82 family. UniProt P57081 2 平等的 412 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782341 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782341 Reactome r - hsa - 6782341 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782341.1 1 METTL1 =“2”tRNA fullName证据 TRMB_HUMAN DB_ID: 6782317 UniProt: Q9UBP6 METTL1 METTL1 C12orf1 甲基转移酶，在一些RNA物种中介导N(7)-甲基鸟嘌呤的形成，如tRNAs、mrna和microRNAs (miRNAs) (PubMed:12403464, PubMed:31031084, PubMed:31031083)。催化tRNA中46位N(7)-甲基鸟嘌呤(m7G46)的形成(PubMed:12403464, PubMed:31031084)。也作为mrna内部N(7)-甲基鸟嘌呤亚群的甲基转移酶(PubMed:31031084)。mrna内部N(7)-甲基鸟嘌呤甲基化调节翻译(PubMed:31031084)。也甲基化特定的mirna子集，如let-7 (PubMed:31031083)。let-7 miRNA的N(7)-甲基鸟嘌呤甲基化通过破坏主要miRNA转录物(pri-miRNA)中的抑制二级结构来促进let-7 miRNA加工(PubMed:31031083)。作为胚胎干细胞自我更新和分化的调节因子。通路tRNA修饰;N (7) -methylguanine-tRNA生物合成。亚基与WDR4形成复合体。组织特异性无处不在。PTM Ser-27位点的磷酸化使其催化活性失活，但不影响与WDR4的相互作用。属于i类sam结合甲基转移酶超家族。TrmB家庭。 UniProt Q9UBP6 2 平等的 276 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782317 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782317 Reactome r - hsa - 6782317 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782317.1 1 Reactome数据库ID发布77 6782313 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782313 Reactome r - hsa - 6782313 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782313.1 基因本体论 去:0008176 Reactome数据库ID发布77 6782321 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782321 Reactome数据库ID发布77 6782286 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782286 Reactome r - hsa - 6782286 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782286.3 12403464 Pubmed 2002 酵母tRNA的7-甲基鸟苷修饰需要两种蛋白质形成复合物 Alexandrov,安德烈 Martzen,奥 Eric M . Phizicky RNA 8:1253 - 66 15861136 Pubmed 2005 tRNA甲基化酶METTL1在体外和细胞中被PKB和RSK磷酸化和失活 罗伯特·卡特里奇 Knebel,阿克塞尔 药,马克 Alexandrov,安德烈 Eric M . Phizicky 科恩,P [j] . 24:1696-705 从左到右 2.1.1 NSUN2甲基化未剪接tRNA(Leu)(CAA)的胞苷-34、胞苷-48 NSUN2将s -腺苷蛋氨酸的一个甲基转移到tRNA(Leu)(CAA)中胞苷-34和胞苷-48的5个位置(Brzezicha等人2006,Auxilien等人2012,Squires等人2012,Khoddami和Cairns 2013)。胞苷-34的甲基化发生在聚合前体tRNA(Leu)(CAA)上(Brzezicha et al. 2006, Auxilien et al. 2012);胞苷-48的甲基化发生在剪接或未剪接的tRNA(Leu)(CAA)上(Auxilien et al. 2012)。 作者:May, Bruce, 2015-06-06 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-06 含有c -34,48的未剪接tRNA(Leu)(CAA) 含有胞苷34、胞苷48的未剪接tRNA(Leu) DB_ID: 6782371 Reactome数据库ID发布77 6782371 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782371 Reactome r - hsa - 6782371 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782371.1 ChEBI 29169 ChEBI 64656 ChEBI 10668 2 2 含有5mc -34,48的未剪接tRNA(Leu)(CAA) 含有5-甲基胞苷- 34,5 -甲基胞苷-48的未剪接tRNA(Leu)(CAA) Reactome DB_ID: 6782369 Reactome数据库ID发布77 6782369 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782369 Reactome r - hsa - 6782369 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782369.1 ChEBI 29169 ChEBI 10668 ChEBI 74483 激活 NSUN2 tRNA甲基转移酶4同源物 NSUN2_HUMAN hTrm4 DB_ID: 6782382 UniProt: Q08J23 NSUN2 NSUN2 日本米酒 TRM4 RNA胞嘧啶C(5)-甲基转移酶，将各种RNA中的胞嘧啶甲基化为5-甲基胞嘧啶(m5C)，如tRNAs, mrna和一些长链非编码RNA (lncRNAs) (PubMed:17071714, PubMed:22995836, PubMed:31358969, PubMed:31199786)。参与多种过程，如表皮干细胞分化、睾丸分化和母系向合子的早期发育过程;通过增加蛋白质合成起作用;胞嘧啶C(5)甲基化促进tRNA稳定并防止mRNA衰变(PubMed:31199786)。在含有内含子的tRNA(Leu)(CAA)前体的第34和48位以及tRNA(Gly)(GCC)前体的第48、49和50位甲基化胞嘧啶为5-甲基胞嘧啶(m5C) (PubMed:17071714, PubMed:22995836, PubMed:31199786)。tRNA甲基化是产生tRNA衍生的RNA片段(tRFs)所必需的(PubMed:31199786)。也介导线粒体trna的C(5)-甲基化(PubMed:31276587)。催化mRNA的胞嘧啶C(5)甲基化，导致它们稳定并防止mRNA衰变:mRNA稳定涉及特异性识别和结合m5c修饰转录本的YBX1 (PubMed:22395603, PubMed:31358969)。胞嘧啶C(5)- mRNA的甲基化也调节mRNA的输出:甲基化转录物被THOC4/ALYREF特异性识别，介导mRNA核质穿梭(PubMed:28418038)。也介导非编码rna，如拱顶rna (vtRNAs)的胞嘧啶C(5)-甲基化，促进它们加工成调节性小rna (PubMed:23871666)。胞嘧啶C(5)-甲基化vtRNA VTRNA1.1促进其加工成小顶RNA4 (svRNA4)并调节表皮分化(PubMed:31186410)。 May act downstream of Myc to regulate epidermal cell growth and proliferation (By similarity). Required for proper spindle assembly and chromosome segregation, independently of its methyltransferase activity (PubMed:19596847).ACTIVITY REGULATION Inhibited by magnesium ions.SUBUNIT Interacts with NPM1 and NCL during interphase; interaction is disrupted following phosphorylation at Ser-139.TISSUE SPECIFICITY Expressed in adult and fetal brain and in lymphoblastoid cells.PTM Phosphorylated at Ser-139 by AURKB during mitosis, leading to abolish methyltransferase activity and the interaction with NPM1.SIMILARITY Belongs to the class I-like SAM-binding methyltransferase superfamily. RsmB/NOP family. TRM4 subfamily. UniProt Q08J23 1 平等的 767 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782382 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782382 Reactome r - hsa - 6782382 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782382.1 基因本体论 去:0016428 Reactome数据库ID发布77 6782357 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782357 Reactome数据库ID发布77 6782388 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782388 Reactome r - hsa - 6782388 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782388.3 23604283 Pubmed 2013 RNA胞嘧啶甲基转移酶的直接靶点和修饰碱基的鉴定 Khoddami,瓦希德 凯恩斯BR 生物科技，31:45 -64 17071714 Pubmed 2006 人tRNA鉴定:m5C甲基转移酶催化前tRNA Leu (CAA)反密码子第1位内含子依赖性m5C的形成 Brzezicha, Bartosz 施密特,戈 Makalowska, Izabela Jarmolowski,阿图尔 Pienkowska,乔安娜 Szweykowska-Kulinska, Zofia 核酸学报，34:6034-43 22995836 Pubmed 2012 人类tRNA m (5) C甲基转移酶Misu具有多位点特异性 Auxilien,西尔维 Guerineau,文森特 Zofia Szweykowska-Kuliń平方公里列阵 Golinelli-Pimpaneau,比阿特丽斯 RNA，生物9:1331-8 22344696 Pubmed 2012 5-甲基胞嘧啶广泛存在于人类编码和非编码RNA中 斯奎尔斯，杰弗里·E 哈迪普·帕特尔R Nousch,马可 Sibbritt, Tennille 大卫·汉弗莱斯 布莱恩·帕克 凯瑟琳·苏特 Preiss,托马斯 核酸学报，40:5023-33 从左到右 2.1.1 NSUN2甲基化tRNA的胞苷-40、胞苷-48、胞苷-49、胞苷-50 (GLY)(GCC) NSUN2将s -腺苷甲硫氨酸的甲基转移到tRNA(Gly)(GCC)的胞苷-40、胞苷-48、胞苷-49和胞苷-50的5个位置(Auxilien et al. 2012, Khoddami and Cairns 2013)。 作者:May, Bruce, 2015-06-27 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-27 tRNA(Gly)(GCC)含有C-40,C-48,C-49,C-50 tRNA(GLY)(GCC)含有胞苷-40、胞苷-48、胞苷-49、胞苷-50 Reactome DB_ID: 6785425 Reactome数据库ID发布77 6785425 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6785425 Reactome r - hsa - 6785425 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6785425.1 ChEBI 29176 ChEBI 64656 4 4 tRNA(Gly)(GCC)含有5mc -40,48,49,50 tRNA(GLY)(GCC)含有5-甲基胞苷-40,5-甲基胞苷-48,5-甲基胞苷-49,5-甲基胞苷-50 Reactome DB_ID: 6785415 Reactome数据库ID发布77 6785415 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6785415 Reactome r - hsa - 6785415 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6785415.1 ChEBI 29176 ChEBI 64656 ChEBI 74483 激活 Reactome数据库ID发布77 6785438 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6785438 Reactome r - hsa - 6785438 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6785438.3 从左到右 2.1.1 NSUN2甲基化tRNA(Asp)(GUC)的胞苷-48和胞苷-49。 NSUN2将s -腺苷甲硫氨酸的甲基转移到tRNA(Asp)(GUC)的胞苷-48和胞苷-49的5个位置(Squires et al. 2012, Khoddami et al. 2013)。 作者:May, Bruce, 2015-06-27 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-27 2 tRNA(Asp)(GUC)含有C-48,C-49 tRNA(Asp)含有胞苷-48，胞苷-49 Reactome DB_ID: 6785426 Reactome数据库ID发布77 6785426 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6785426 Reactome r - hsa - 6785426 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6785426.1 ChEBI 29186 ChEBI 64656 2 tRNA(Asp)(GUC)含5- mc -48,49 tRNA(Asp)(GUC)含5-甲基胞苷- 48,5 -甲基胞苷-49 Reactome DB_ID: 6785430 Reactome数据库ID发布77 6785430 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6785430 Reactome r - hsa - 6785430 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6785430.1 ChEBI 29186 ChEBI 74483 激活 Reactome数据库ID发布77 6785409 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6785409 Reactome r - hsa - 6785409 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6785409.3 从左到右 2.1.1 NSUN6在tRNA(Cys)和tRNA(Thr)中甲基化胞苷-72。 NSUN6甲基化tRNA(Cys)和tRNA(Thr)受体茎中胞苷-72胞嘧啶环的5号位置(Haag et al. 2015)。由于该反应发生在细胞质中，并且需要tRNA底物上的3' CCA，因此被认为发生在tRNA生物发生的后期 作者:May, Bruce, 2016-07-28 review: Bohnsack, Markus T, 2016-08-10 编辑:May, Bruce, 2016-07-28 从Reactome中的EntitySet转换而来 用力推tRNA(半胱氨酸) DB_ID: 8932763 tRNA(半胱氨酸) Reactome DB_ID: 379725 Reactome数据库ID发布77 379725 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=379725 Reactome r - hsa - 379725 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-379725.1 ChEBI 29167 tRNA(刺) Reactome DB_ID: 379749 Reactome数据库ID发布77 379749 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=379749 Reactome r - hsa - 379749 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-379749.1 ChEBI 29180 Reactome数据库ID发布77 8932763 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8932763 Reactome r - hsa - 8932763 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-8932763.1 从Reactome中的EntitySet转换而来 含有5mC72的tRNA(Cys,Thr) DB_ID: 8932759 含有5mC72的tRNA(Cys) DB_ID: 8932758 Reactome数据库ID发布77 8932758 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8932758 Reactome r - hsa - 8932758 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-8932758.1 ChEBI 29167 ChEBI 74483 含有5mC72的tRNA(Thr) DB_ID: 8932760 Reactome数据库ID发布77 8932760 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8932760 Reactome r - hsa - 8932760 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-8932760.1 ChEBI 29180 ChEBI 74483 Reactome数据库ID发布77 8932759 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8932759 Reactome r - hsa - 8932759 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-8932759.1 激活 NSUN6 推定甲基转移酶NSUN6 ecNumber2.1.1.-/ecNumber NSUN6_HUMAN DB_ID: 8932767 UniProt: Q8TEA1 NSUN6 NSUN6 NOPD1 s -腺苷- l-蛋氨酸依赖甲基转移酶，特异性甲基化tRNA(Thr)(TGT)和tRNA(Cys)(GCA)中胞嘧啶72的C5位置(PubMed:26160102, PubMed:27703015, PubMed:28531330)。体外也甲基化tRNA(Thr)(AGT) (PubMed:27703015, PubMed:26160102)。甲基化需要在受体茎区存在3'-CCA末端、靶位C72、鉴别碱基U73以及tRNA底物中的第二和第三碱基对(2:71和3:70)(PubMed:26160102, PubMed:27703015)。PUA结构域通过精确识别tRNA的CCA端和D-stem区域，在tRNA识别中发挥作用。属于i类sam结合甲基转移酶超家族。RsmB / NOP的家庭。 UniProt Q8TEA1 1 平等的 469 平等的 Reactome数据库ID发布77 8932767 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8932767 Reactome r - hsa - 8932767 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-8932767.1 Reactome数据库ID发布77 8932761 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8932761 Reactome数据库ID发布77 8932765 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8932765 Reactome r - hsa - 8932765 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-8932765.2 26160102 Pubmed 2015 NSUN6是一种人RNA甲基转移酶，可催化特定tRNAs中m5C72的形成 Haag,莎拉 瓦尔达，艾哈迈德·S 克雷奇默,Jens 马努埃尔·格尼格曼 Hobartner,克劳迪娅 马库斯·博恩萨克 RNA 21:1532-43 从左到右 5.4.99.12 PUS1异构体2在trna的反密码子茎中将尿嘧啶残基转化为伪尿嘧啶 PUS1较短的同工异构体PUS1-2在细胞核trna的反密码子茎中将尿嘧啶转化为伪尿嘧啶(Fernandez-Vizarra et al. 2007, Sibert et al. 2008)。PUS1较长的同工异构体(PUS1-1)存在于线粒体中;PUS1的较短同工型(PUS1-2)具有不同的n端，存在于细胞核中(Fernandez-Vizarra et al. 2007)。相比之下，酿酒酵母有2个基因:编码核酶的PUS1和编码线粒体酶的PUS2。PUS1及其底物从酵母到人类都是保守的。与酵母菌的同源物Pus1p一样，人类的PUS1也可以作用于其他trna、pre- trna和U2 snRNA。PUS1突变导致线粒体肌病和肾母细胞性贫血(MLASA) (Bykhovskaya et al. 2004, Fernandez-Vizarra et al. 2007)。 作者:May, Bruce, 2015-06-06 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-06 从Reactome中的EntitySet转换而来 含有U的tRNA(Ile,Met,Ser) Reactome DB_ID: 6787570 tRNA(Ile)(AAU)含u -27,30 含有尿苷的tRNA(Ile)(AAU) 27,30 Reactome DB_ID: 6782364 Reactome数据库ID发布77 6782364 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782364 Reactome r - hsa - 6782364 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782364.1 ChEBI 29174 ChEBI 73747 tRNA(Met)(CAU)含U-27 tRNA(Met)(CAU)含尿苷27 Reactome DB_ID: 6787574 Reactome数据库ID发布77 6787574 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6787574 Reactome r - hsa - 6787574 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6787574.1 ChEBI 29173 ChEBI 73747 tRNA(Ser)(UGA)含有U-28 tRNA(Ser)(UGA)含有尿苷-28 DB_ID: 6787576 Reactome数据库ID发布77 6787576 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6787576 Reactome r - hsa - 6787576 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6787576.1 ChEBI 29179 ChEBI 73747 Reactome数据库ID发布77 6787570 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6787570 Reactome r - hsa - 6787570 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6787570.1 从Reactome中的EntitySet转换而来 含有伪ou的tRNA(Ile,Met,Ser) Reactome DB_ID: 6787569 tRNA(Ile)(AAU)含伪ou 27,30 含有假尿嘧啶的tRNA(Ile)(AAU) 27,30 DB_ID: 6782356 Reactome数据库ID发布77 6782356 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782356 Reactome r - hsa - 6782356 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782356.1 ChEBI 29174 ChEBI 65314 tRNA(Met)(CAU)含有伪ou -27 含有假尿嘧啶的tRNA(Met) Reactome DB_ID: 6787565 Reactome数据库ID发布77 6787565 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6787565 Reactome r - hsa - 6787565 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6787565.1 ChEBI 29173 ChEBI 65314 tRNA(Ser)(UGA)含有伪ou -28 tRNA(Ser)(UGA)含有假尿嘧啶-28 Reactome DB_ID: 6787585 Reactome数据库ID发布77 6787585 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6787585 Reactome r - hsa - 6787585 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6787585.1 ChEBI 29179 ChEBI 65314 Reactome数据库ID发布77 6787569 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6787569 Reactome r - hsa - 6787569 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6787569.1 激活 PUS1-2 tRNA假尿嘧啶合成酶A，线粒体ecNumber5.4.99.12/ecNumber TRUA_HUMAN Reactome DB_ID: 6782373 UniProt: Q9Y606-2 PUS1 PUS1 PP8985 将一些tRNA底物中的特定尿苷转化为PSI。作用于反密码子干的27/28位，也作用于含有tRNA的内含子的反密码子的34和36位。通过SRA1 RNA的假尿嘧啶化参与核受体活性的调节。亚单位单体(PubMed:23707380, PubMed:24722331)。在细胞核中与RARG和SRA1 RNA形成复合物(通过相似性)。组织特异性广泛表达。在大脑和骨骼肌中发现高水平的表达。属于tRNA假尿嘧啶合成酶TruA家族。 UniProt同种型 Q9Y606-2 1 平等的 427 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782373 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782373 Reactome r - hsa - 6782373 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782373.1 基因本体论 去:0009982 Reactome数据库ID发布77 6782375 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782375 Reactome数据库ID发布77 6782381 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782381 Reactome r - hsa - 6782381 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782381.3 17056637 Pubmed 2007 假尿苷酸合成酶1 (PUS1)在肌病、乳酸性酸中毒和铁母细胞性贫血(MLASA)两兄弟中的无义突变 Fernandez-Vizarra,艾丽卡 Berardinelli,安琪拉 瓦伦特,露西娅 Tiranti,也好 Zeviani,马西莫 中华医学杂志。44 (4):173-80 15108122 Pubmed 2004 假尿嘧啶合成酶1 (PUS1)错义突变引起线粒体肌病和铁母细胞性贫血(MLASA) Bykhovskaya叶莲娜• 卡萨斯,卡丽 Mengesha, Emebet Inbal, Aida Fischel-Ghodsian,内森 点。j .的嗡嗡声。麝猫。74:1303-8 18648068 Pubmed 2008 人假尿嘧啶合酶1的部分活性与许多高度保守的活性位点残基的取代有关 布莱恩·斯伯特 Fischel-Ghodsian,内森 杰弗里·R·巴顿 RNA 14:1895 - 906 从左到右 5.4.99.12 PUS3在tRNA中将尿嘧啶-39转化为伪尿嘧啶-39 PUS3在trna反密码子环的38和39核苷酸处催化尿嘧啶修饰(异构化)为伪尿嘧啶(Shaheen et al. 2016)。PUS3在小鼠(Chen and Patton 2000)和酵母(Lecointe et al. 1998)中的同源物催化了相同的反应，并且PUS3基因家族和修饰都是高度保守的。在出芽酵母(酿酒酵母)中，编码Pus3p的DEG1缺失导致生长缓慢(Lecointe等人，1998年)，而人类PUS3的截断突变导致假尿嘧啶38和39的减少，从而导致智力残疾(Shaheen等人，2016年)。 作者:May, Bruce, 2016-05-07 审稿:Eric M . Phizicky, 2016-06-20 审定:Alkuraya, Fowzan S, 2016-06-20 编辑:May, Bruce, 2016-05-07 含有U-39的tRNA 转移含有尿苷-39的RNA Reactome DB_ID: 8870284 Reactome数据库ID发布77 8870284 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8870284 Reactome r - hsa - 8870284 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-8870284.1 ChEBI 17843 ChEBI 73747 含有伪39的tRNA 转移含有假尿嘧啶-39的RNA DB_ID: 8870285 Reactome数据库ID发布77 8870285 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8870285 Reactome r - hsa - 8870285 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-8870285.1 ChEBI 17843 ChEBI 65314 激活 PUS3 tRNA假尿苷 PUS3_HUMAN Reactome DB_ID: 8870279 UniProt: Q9BZE2 PUS3 PUS3 FKSG32 在转运rna的反密码子干和环的第39位形成假尿嘧啶。属于tRNA假尿嘧啶合成酶TruA家族。 UniProt Q9BZE2 2 平等的 481 平等的 Reactome数据库ID发布77 8870279 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8870279 Reactome r - hsa - 8870279 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-8870279.1 Reactome数据库ID发布77 8870286 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8870286 Reactome数据库ID发布77 8870289 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8870289 Reactome r - hsa - 8870289 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-8870289.2 9430663 Pubmed 1998 酵母蛋白Deg1作为假尿嘧啶合成酶(Pus3)催化tRNA反密码子环中psi 38和psi 39形成的特性 Lecointe F 极点,G ·绍尔,一 Hurt, E, C Motorin Y Grosjean H 生物。化学273:1316-23 11027153 Pubmed 2000 小鼠假尿嘧啶合成酶3修饰tRNA的反密码子环 陈,我 J·R·巴顿 生物化学39:12723-30 27055666 Pubmed 2016 PUS3的纯合子截断突变扩展了tRNA修饰在正常认知中的作用 夏新,Ranad 汉族,陆 Faqeih, Eissa Ewida,努尔 Alobeid,埃曼 Eric M . Phizicky 阿尔库拉亚，福赞S 嗡嗡声。麝猫。 从左到右 5.4.99.12 PUS7在trna中将尿嘧啶转化为假尿嘧啶 根据Saccharmyces cerivisae的同系物推断，PUS7在细胞质tRNA的第13核苷酸和未剪接tRNA(Tyr)的第35核苷酸上将尿嘧啶转化为假尿嘧啶。PUS7也在U2 snRNA和前trna (Tyr)中合成假尿嘧啶。根据酵母中蛋白质位置的全球分析，Pus7p是一个核蛋白。 作者:May, Bruce, 2015-06-30 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-30 从Reactome中的EntitySet转换而来 含有U-13的tRNA，含有U-35的tRNA前体(Tyr) Reactome DB_ID: 6790218 含有U-13的tRNA 传递含有尿苷的RNA Reactome DB_ID: 6786581 Reactome数据库ID发布77 6786581 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786581 Reactome r - hsa - 6786581 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786581.1 ChEBI 17843 ChEBI 73747 含有U-35的未剪接tRNA(Tyr) 含有尿苷-35的未剪接tRNA(Tyr) Reactome DB_ID: 6790174 Reactome数据库ID发布77 6790174 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6790174 Reactome r - hsa - 6790174 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6790174.1 ChEBI 73747 ChEBI 10668 ChEBI 29182 Reactome数据库ID发布77 6790218 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6790218 Reactome r - hsa - 6790218 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6790218.1 从Reactome中的EntitySet转换而来 含有伪ou -13的tRNA，含有伪ou -35的预tRNA(Tyr) DB_ID: 6790181 含有伪13的tRNA 传递含有假尿嘧啶-13的RNA Reactome DB_ID: 6786494 Reactome数据库ID发布77 6786494 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786494 Reactome r - hsa - 6786494 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786494.1 ChEBI 17843 ChEBI 65314 含有伪ou -35的未剪接tRNA(Tyr) 含有假尿嘧啶-35的未剪接tRNA(Tyr) Reactome DB_ID: 6790176 Reactome数据库ID发布77 6790176 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6790176 Reactome r - hsa - 6790176 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6790176.1 ChEBI 65314 ChEBI 10668 ChEBI 29182 Reactome数据库ID发布77 6790181 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6790181 Reactome r - hsa - 6790181 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6790181.1 激活 PUS7 假尿苷酸合成酶7同源物ecNumber5.4.99.-/ecNumber PUS7_HUMAN Reactome DB_ID: 6786515 UniProt: Q96PZ0 PUS7 PUS7 KIAA1897 功能:催化rna假尿嘧啶化的假尿嘧啶合酶(PubMed:28073919, PubMed:29628141, PubMed:30778726)。通过介导tRNAs (tRFs)衍生的RNA片段的伪尿嘧啶化，作为胚胎干细胞中蛋白质合成的调节剂:伪尿嘧啶化的tRFs通过靶向翻译起始复合物抑制翻译(PubMed:29628141)。也催化mrna的假尿嘧啶化:介导具有共识序列5'-UGUAG-3'的mrna的假尿嘧啶化(PubMed:28073919)。除了mrna和trna，它还结合其他类型的RNA，如snrna、Y RNA和vault RNA，表明它可以催化许多类型的RNA的假尿嘧啶化(PubMed:29628141)。属于假尿嘧啶合成酶TruD家族。 UniProt Q96PZ0 1 平等的 661 平等的 Reactome数据库ID发布77 6786515 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786515 Reactome r - hsa - 6786515 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786515.1 Reactome数据库ID发布77 6786539 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786539 Reactome数据库ID发布77 6786583 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786583 Reactome r - hsa - 6786583 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786583.2 从左到右 2.4.2.29 QTRT1:QTRTD1在tRNA(Tyr)的鸟嘌呤-34位点交换鸟嘌呤 转糖基化酶复合物QTRT1:QTRTD1在tRNA(Tyr)的核苷酸34处交换鸟嘌呤(Chen et al. 2010, Chen et al. 2011)。QTRT1亚基负责转糖基酶的活性。真核生物不能合成排队，必须从食物来源或共生肠道菌群中获取。从小鼠同源物推断，QTRT1:QTRTD1与线粒体外膜有关(Boland et al. 2009)。大肠杆菌的同源酶为tgt。 作者:May, Bruce, 2015-06-07 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-07 含有G-34的tRNA(Tyr) 含有鸟苷-34的tRNA(Tyr) Reactome DB_ID: 6782425 Reactome数据库ID发布77 6782425 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782425 Reactome r - hsa - 6782425 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782425.1 ChEBI 29182 ChEBI 64654 基本问 queuine DB_ID: 6782431 queuine (ChEBI: 17433) queuine ChEBI CHEBI: 17433 Reactome数据库ID发布77 6782431 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782431 Reactome r - - 6782431 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-6782431.2 卦 2-amino-6-hydroxypurine 鸟嘌呤 Reactome DB_ID: 83956 鸟嘌呤(ChEBI: 16235) 鸟嘌呤 2-amino-6-hydroxypurine ChEBI CHEBI: 16235 Reactome数据库ID发布77 83956 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=83956 Reactome r - - 83956 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-83956.3 复合 C00242 含有Q-34的tRNA(Tyr) 含有queue -34的tRNA(Tyr) Reactome DB_ID: 6782458 Reactome数据库ID发布77 6782458 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782458 Reactome r - hsa - 6782458 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782458.1 ChEBI 29182 ChEBI 64299 激活 QTRT1: QTRTD1 Reactome DB_ID: 6782406 线粒体外膜 基因本体论 去:0005741 QTRTD1 fullName证据="1"队列trna -核糖基转移酶亚基QTRTD1 ecNumber证据="1"2.4.2.29/ecNumber QTRD1_HUMAN Reactome DB_ID: 6782421 UniProt: Q9H974 QTRT2 QTRT2 QTRTD1 排队trna -核糖基转移酶(TGT)的非催化亚基，催化鸟嘌呤(G)残基在trna中34位(反密码子抖动位置)与GU(N)反密码子(tRNA-Asp， - asn， - his和- tyr)进行碱基交换，产生超修饰核苷排队苷(7-((4,5-顺式-二羟基-2-环戊烯-1-基)氨基)甲基)-7-去氮鸟苷)。催化亚基QTRT1和辅助亚基QTRT2的异源二聚体。属于排队trna -核糖基转移酶家族。QTRT2亚科。 UniProt Q9H974 1 平等的 415 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782421 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782421 Reactome r - hsa - 6782421 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782421.1 1 QTRT1 排队trna -核糖基转移酶ecNumber2.4.2.29/ecNumber TGT_HUMAN Reactome DB_ID: 6782424 UniProt: Q9BXR0 QTRT1 QTRT1 TGT TGUT 排队trna -核糖基转移酶(TGT)的催化亚基，催化tRNAs中34位(反密码子抖动位置)的鸟嘌呤(G)残基与GU(N)反密码子(tRNA-Asp， - asn， - his和- tyr)的排队(Q)交换碱基，产生超修饰核苷排队苷(7-((4,5-顺式-二羟基-2-环戊烯-1-基)氨基)甲基)-7-去氮鸟苷)(PubMed:11255023, PubMed:20354154)。催化作用通过双位移机制发生。亲核活性位点攻击核苷酸34的C1′，使鸟嘌呤碱基与RNA分离，形成共价酶-RNA中间体。质子受体活性位点使进入的序列去质子化，允许对核糖的C1'进行亲核攻击以形成产物(通过相似性)。催化亚基QTRT1和辅助亚基QTRT2的异源二聚体。属于排队trna -核糖基转移酶家族。 UniProt Q9BXR0 2 平等的 403 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782424 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782424 Reactome r - hsa - 6782424 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782424.1 1 Reactome数据库ID发布77 6782406 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782406 Reactome r - hsa - 6782406 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782406.1 基因本体论 去:0008479 Reactome数据库ID发布77 6782432 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782432 Reactome数据库ID发布77 6782443 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782443 Reactome r - hsa - 6782443 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782443.3 20354154 Pubmed 2010 人trna -鸟嘌呤转糖基酶的表征:异二聚体亚基结构的确认 陈,Yi-Chen 文森特·凯利 斯蒂芬妮·V·斯塔丘拉 乔治·加西亚 RNA 16:958 - 68 21131277 Pubmed 2011 真核trna -鸟嘌呤转糖基化酶的进化:从野生型和突变型人和大肠杆菌trna -鸟嘌呤转糖基化酶对杂环底物的识别中获得的见解 陈,Yi-Chen 艾伦·F·布鲁克斯 迪安·M 杰弗里·基滕多夫 霍利斯·肖沃尔特博士 乔治·加西亚 核酸学报，39:2834-44 19414587 Pubmed 2009 真核tRNA中的队列苷形成是通过线粒体定位的异聚体转糖基化酶发生的 博兰,Coilin 海耶斯,派蒂 圣玛利亚,Ismael Nishimura进 文森特·凯利 生物。化学284:18218-27 tRNA(Phe) G37位点wybutoine的合成 肌苷衍生物是在真核生物tRNA(Phe)核苷酸37上发现的三环碱基。wybutosine的合成途径从模板化的鸟苷残基开始，经过5种酶催化的6个步骤:鸟苷的N1甲基化，1-甲基鸟苷与丙酮酸缩合生成4-去甲基wyosine，添加氨基羧丙基生成yW-86, yW-86甲基化生成yW-72, yW-72甲基化生成yW-58, yW-58甲氧羰基化生成wybutosine(参见Young和Bandarian 2013, perche - letuv等2014)。Wybutosine可以通过羟基化和甲基化进一步修饰。trna第37位的Wyosine衍生物通过稳定密码子-反密码子配对(Konevega et al. 2004)和防止移框(Waas et al. 2007)参与翻译保真度。 作者:May, Bruce, 2015-06-08 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-08 从左到右 2.1.1 TRMT5甲基化鸟苷，在tRNA(Phe)的第37个核苷酸上生成1-甲基鸟苷。 TRMT5将s -腺苷蛋氨酸的一个甲基转移到tRNA(Phe)的鸟苷-37的1位(brul et al. 2004, Christian et al. 2013)。酵母的同源物TRM5也能催化相同的反应。 作者:May, Bruce, 2015-06-08 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-08 tRNA(Phe)含有G-37 含有鸟苷-37的tRNA DB_ID: 6782877 Reactome数据库ID发布77 6782877 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782877 Reactome r - hsa - 6782877 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782877.1 ChEBI 29184 ChEBI 64654 tRNA(Phe)含有1-甲基g -37 含有1-甲基鸟苷-37的tRNA Reactome DB_ID: 6783390 Reactome数据库ID发布77 6783390 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783390 Reactome r - hsa - 6783390 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6783390.1 ChEBI 29184 ChEBI 73542 激活 TRMT5 = " 1 " tRNA fullName证据 TRM5_HUMAN DB_ID: 6782891 UniProt: Q32P41 TRMT5 TRMT5 KIAA1393 TRM5 参与线粒体tRNA甲基化(PubMed:26189817)。特异性甲基化鸟苷-37在各种trna中的N1位置。甲基化不依赖于目标核苷5'的性质。这是wybutosine (yW)生物合成的第一步，wybutosine是trna反密码子附近的修饰碱基，是准确解码所必需的。亚基单体。属于i类sam结合甲基转移酶超家族。TRM5 / TYW2家庭。 UniProt Q32P41 1 平等的 509 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782891 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782891 Reactome r - hsa - 6782891 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782891.1 基因本体论 去:0009019 Reactome数据库ID发布77 6782887 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782887 Reactome数据库ID发布77 6782859 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782859 Reactome r - hsa - 6782859 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782859.2 23887145 Pubmed 2013 Trm5酶对结构和机制的保护 基督徒,托马斯 大伞,霍华德 侯,YM RNA 19:1192-9 15248782 Pubmed 2004 人tRNA-(N1G37)甲基转移酶(TRM5)的分离鉴定及与大肠杆菌TrmD蛋白的比较 火烧后,Herve 艾略特、马克 Redlak,玛丽亚 Zendra E . Zehner W·迈克尔·霍姆斯 生物化学43:9243-55 从左到右 4 TYW1:FMN:4Fe-4S在tRNA(Phe)核苷酸37处转化1-甲基鸟苷，生成yW-187(4-去甲基鸟苷) 从酿酒酵母的同源物推断，TYW1与FMN和铁硫簇的配合物将2个碳原子从丙酮酸转移到tRNA(Phe)的1-甲基鸟苷-37，在核苷酸37处产生yW-187(4-去甲基鸟苷)。 作者:May, Bruce, 2015-06-08 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-08 PYR 丙酮酸 丙酮酸 DB_ID: 1130930 丙酮酸(ChEBI: 15361) 丙酮酸 2-oxopropanoate 2-氧丙酸离子(1-) ChEBI CHEBI: 15361 Reactome数据库ID发布77 1130930 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=1130930 Reactome r - - 1130930 5 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-1130930.5 tRNA(Phe)含有1-甲基g -37 含有1-甲基鸟苷-37的tRNA Reactome DB_ID: 6782902 Reactome数据库ID发布77 6782902 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782902 Reactome r - hsa - 6782902 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782902.1 ChEBI 29184 ChEBI 73542 L-Met phys-ent-participant9846 L-methionine两性离子 L-methionine phys-ent-participant77388 phys-ent-participant77425 phys-ent-participant39680 phys-ent-participant77372 phys-ent-participant77339 phys-ent-participant39665 phys-ent-participant77410 phys-ent-participant77796 phys-ent-participant61111 phys-ent-participant60429 phys-ent-participant95808 phys-ent-participant60418 phys-ent-participant60518 Reactome DB_ID: 1130765 l -蛋氨酸两性离子[ChEBI:57844] L-methionine两性离子 C5H11NO2S (2 s) 2-azaniumyl-4 - butanoate (methylsulfanyl) FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine (2 s) 2-ammonio-4 - butanoate (methylsulfanyl) 149.21100 CSCC [C@H] ([NH3 +]) C = O ([O -]) InChI = 1 s / C5H11NO2S c1-9-3-2-4 (6) 5 (7) 8 / h4H, 2 - 3, 6 h2、h3, (H, 7, 8) / t4 - / mo / s1 ChEBI CHEBI: 57844 Reactome数据库ID发布77 1130765 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=1130765 Reactome r - - 1130765 4 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-1130765.4 二氧化碳 phys-ent-participant87101 二氧化碳 phys-ent-participant14918 phys-ent-participant95764 phys-ent-participant75239 phys-ent-participant33669 phys-ent-participant14926 phys-ent-participant86776 phys-ent-participant86940 phys-ent-participant81195 phys-ent-participant87047 phys-ent-participant87148 phys-ent-participant86718 phys-ent-participant87125 phys-ent-participant76128 phys-ent-participant96571 phys-ent-participant75266 phys-ent-participant95816 phys-ent-participant87279 phys-ent-participant87306 phys-ent-participant14515 phys-ent-participant14887 phys-ent-participant87395 phys-ent-participant14392 phys-ent-participant75228 phys-ent-participant6017 phys-ent-participant95787 phys-ent-participant12456 phys-ent-participant90823 phys-ent-participant14330 phys-ent-participant86957 phys-ent-participant86850 phys-ent-participant100739 phys-ent-participant95717 phys-ent-participant13918 phys-ent-participant86736 phys-ent-participant87031 phys-ent-participant96927 phys-ent-participant87191 phys-ent-participant14719 phys-ent-participant10248 phys-ent-participant94272 phys-ent-participant13998 phys-ent-participant78382 phys-ent-participant86626 phys-ent-participant76020 phys-ent-participant87020 phys-ent-participant75175 phys-ent-participant14124 phys-ent-participant14909 phys-ent-participant14571 phys-ent-participant75158 phys-ent-participant14974 phys-ent-participant62490 phys-ent-participant97995 phys-ent-participant32860 phys-ent-participant75202 phys-ent-participant97187 phys-ent-participant14506 phys-ent-participant14033 phys-ent-participant95796 phys-ent-participant86911 phys-ent-participant6487 phys-ent-participant14797 phys-ent-participant14848 phys-ent-participant75416 phys-ent-participant80553 phys-ent-participant87139 phys-ent-participant92556 phys-ent-participant14403 phys-ent-participant13841 phys-ent-participant14955 phys-ent-participant97204 phys-ent-participant87369 phys-ent-participant86900 phys-ent-participant98102 phys-ent-participant86783 phys-ent-participant32878 phys-ent-participant95099 phys-ent-participant100708 phys-ent-participant87347 phys-ent-participant86923 phys-ent-participant98160 phys-ent-participant14746 phys-ent-participant14645 phys-ent-participant86666 phys-ent-participant86975 phys-ent-participant96001 phys-ent-participant96989 phys-ent-participant90806 phys-ent-participant76223 phys-ent-participant86883 phys-ent-participant86861 phys-ent-participant98759 phys-ent-participant90775 phys-ent-participant96586 phys-ent-participant95874 phys-ent-participant87116 phys-ent-participant77865 phys-ent-participant14660 phys-ent-participant75085 phys-ent-participant87228 phys-ent-participant14061 phys-ent-participant87055 phys-ent-participant13937 phys-ent-participant75350 phys-ent-participant83323 phys-ent-participant85107 phys-ent-participant97083 phys-ent-participant14630 phys-ent-participant98052 phys-ent-participant86755 phys-ent-participant13871 phys-ent-participant82347 phys-ent-participant97210 phys-ent-participant93239 phys-ent-participant92976 phys-ent-participant62847 phys-ent-participant14539 phys-ent-participant87001 phys-ent-participant87176 phys-ent-participant82659 phys-ent-participant93198 phys-ent-participant87039 phys-ent-participant14375 phys-ent-participant86993 phys-ent-participant86645 phys-ent-participant97605 phys-ent-participant14612 phys-ent-participant75710 phys-ent-participant97393 phys-ent-participant87009 phys-ent-participant86203 phys-ent-participant33711 phys-ent-participant33530 phys-ent-participant14962 phys-ent-participant97078 phys-ent-participant97195 phys-ent-participant86833 phys-ent-participant14435 phys-ent-participant11975 phys-ent-participant57836 phys-ent-participant14107 phys-ent-participant76087 phys-ent-participant82981 phys-ent-participant92656 phys-ent-participant94412 phys-ent-participant75029 phys-ent-participant87185 phys-ent-participant87740 phys-ent-participant97954 phys-ent-participant90791 phys-ent-participant86801 phys-ent-participant83587 phys-ent-participant14730 phys-ent-participant83565 phys-ent-participant6480 phys-ent-participant14763 phys-ent-participant14991 phys-ent-participant87294 phys-ent-participant92998 phys-ent-participant14147 phys-ent-participant100704 phys-ent-participant83581 phys-ent-participant86872 phys-ent-participant96847 phys-ent-participant86815 phys-ent-participant75189 phys-ent-participant75254 phys-ent-participant87218 phys-ent-participant87083 phys-ent-participant33107 phys-ent-participant97155 phys-ent-participant14555 phys-ent-participant97424 phys-ent-participant14151 phys-ent-participant75212 phys-ent-participant86891 phys-ent-participant95041 DB_ID: 1132345 二氧化碳[ChEBI:16526] 二氧化碳 ChEBI CHEBI: 16526 Reactome数据库ID发布77 1132345 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=1132345 Reactome r - - 1132345 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-1132345.3 5 '脱氧腺苷 phys-ent-participant39670 phys-ent-participant39679 Reactome DB_ID: 1130791 5 '脱氧腺苷(ChEBI: 17319) 5 '脱氧腺苷 ChEBI CHEBI: 17319 Reactome数据库ID发布77 1130791 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=1130791 Reactome r - - 1130791 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-1130791.2 tRNA(Phe)含有yW-187在37 tRNA含有4-去甲基肌苷-37 DB_ID: 6782898 Reactome数据库ID发布77 6782898 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782898 Reactome r - hsa - 6782898 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782898.1 ChEBI 29184 ChEBI 64315 水 phys-ent-participant97955 水 phys-ent-participant64174 phys-ent-participant47614 phys-ent-participant103055 phys-ent-participant103356 phys-ent-participant75732 phys-ent-participant87879 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Reactome r - - 5278291 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-5278291.3 激活 fe-4s TYW1: FMN: 4 DB_ID: 6782882 FMN phys-ent-participant58660 phys-ent-participant56423 phys-ent-participant83734 DB_ID: 1131104 FMN (ChEBI: 17621) FMN Riboflavin-5-phosphate 黄素单核苷酸 ChEBI CHEBI: 17621 Reactome数据库ID发布77 1131104 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=1131104 Reactome r - - 1131104 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-1131104.2 1 4 fe-4s集群 tetra-mu3-sulfido-tetrairon DB_ID: 6782899 Reactome数据库ID发布77 6782899 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782899 Reactome r - - 6782899 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-6782899.3 1 TYW1 s -腺苷- l-蛋氨酸依赖tRNA 4-去甲基wyosine合成酶ecNumber4.1.3.44/ecNumber TYW1_HUMAN Reactome DB_ID: 6782884 UniProt: Q9NV66 TYW1 TYW1 RSAFD1 功能:可能是wybutosine生物合成途径的组成部分。wybutoine是一种高度修饰的鸟苷，其三环碱基位于真核生物苯丙氨酸tRNA的反密码子附近的3'位置。催化n -甲基鸟嘌呤与丙酮酸酯中的2个碳原子缩合形成三环4-去甲基wyosine，是wybutosine生物合成的中间体(通过相似性)。通路tRNA修饰;wybutosine-tRNA(检)生物合成。属于TYW1家族。 UniProt Q9NV66 1 平等的 732 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782884 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782884 Reactome r - hsa - 6782884 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782884.1 1 Reactome数据库ID发布77 6782882 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782882 Reactome r - hsa - 6782882 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782882.1 基因本体论 去:0016829 Reactome数据库ID发布77 6782866 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782866 Reactome数据库ID发布77 6782895 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782895 Reactome r - hsa - 6782895 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782895.2 从左到右 2．5 2.5.1 TRMT12在tRNA(Phe)核苷酸37处转化yW-187产生yW-86 从酿酒酵母的同源物推断，TRM12在tRNA(Phe)的第37核苷酸上将一个氨基羧基从s -腺苷甲硫氨酸转移到yW-187(4-去甲基wyosine)，生成yW-86 (7-(3S)-3-氨基-3-羧基丙基)-4-去甲基wyosine)和s -甲基-5'-硫腺苷。 作者:May, Bruce, 2015-06-08 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-08 MTAD S-methyl-5”-thioadenosine 5 -S-methyl-5 -thioadenosine phys-ent-participant29688 phys-ent-participant72183 phys-ent-participant55564 phys-ent-participant34531 phys-ent-participant72130 phys-ent-participant8180 phys-ent-participant50279 Reactome DB_ID: 5279412 5‘-S-methyl-5 -thioadenosine (ChEBI: 17509) 5 -S-methyl-5 -thioadenosine ChEBI CHEBI: 17509 Reactome数据库ID发布77 5279412 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5279412 Reactome r - - 5279412 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-5279412.3 tRNA(Phe)含有yW-86在37 含有4-去甲基-7-(3-氨基-3-羧基丙基)肌苷-37的tRNA DB_ID: 6782880 Reactome数据库ID发布77 6782880 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782880 Reactome r - hsa - 6782880 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782880.1 ChEBI 29184 ChEBI 73550 激活 TRMT12 tRNA wybutosin合成蛋白2同源物 TYW2_HUMAN DB_ID: 6782860 UniProt: Q53H54 TRMT12 TRMT12 TRM12 TYW2 s -腺苷- l-蛋氨酸依赖转移酶，作为wybutoine生物合成途径的一个组成部分。wybutoine是一种高度修饰的鸟苷，其三环碱基位于真核生物苯丙氨酸tRNA的反密码子附近的3'位置。催化s -腺苷- l-蛋氨酸α -氨基- α -羧丙基(acp)基团转移到4-去甲基wyosine (imG-14)的C-7位置，生成wybutosin -86。通路tRNA修饰;wybutosine-tRNA(检)生物合成。属于i类sam结合甲基转移酶超家族。TRM5 / TYW2家庭。 UniProt Q53H54 1 平等的 448 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782860 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782860 Reactome r - hsa - 6782860 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782860.1 基因本体论 去:0016765 Reactome数据库ID发布77 6782862 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782862 Reactome数据库ID发布77 6782893 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782893 Reactome r - hsa - 6782893 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782893.3 22761755 Pubmed 2012 苯基丙氨酸- trna生物合成高度修饰wybutoine (yW)碱基所需的TYW2酶的结构-功能分析 罗德里格斯,弗吉尼亚州 Vasudevan, Sona 诺玛,作者 布拉德利·卡尔森 杰弗里·格林 铃木T Chandrasekharappa, Settara C PLoS ONE 7:e39297 从左到右 2.1.1 TYW3甲基化yW-86，在tRNA(Phe)核苷酸37处产生yW-72。 从酿酒酵母的同源物推断，TYW3在tRNA(Phe)的第37核苷酸上将一个甲基从s -腺苷蛋氨酸转移到yW-86 (7-(3S)-(3-氨基-3-羧基丙基))-4-去甲基wyosine)，生成yW-72 (7-(3S)-(3-氨基-3-羧基丙基))和s -腺苷同型半胱氨酸。 作者:May, Bruce, 2015-06-08 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-08 tRNA(Phe)含有yW-72在37 含有7-((3s -氨基)-3-羧基丙基)肌苷-37的tRNA DB_ID: 6782871 Reactome数据库ID发布77 6782871 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782871 Reactome r - hsa - 6782871 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782871.1 ChEBI 29184 ChEBI 73543 激活 TYW3 tRNA wybutosin合成蛋白3同源物 TYW3_HUMAN DB_ID: 6782888 UniProt: Q6IPR3 TYW3 TYW3 C1orf171 可能是s -腺苷- l-蛋氨酸依赖的甲基转移酶，作为wybutosine生物合成途径的一个组成部分。wybutoine是一种高度修饰的鸟苷，其三环碱基位于真核生物苯丙氨酸tRNA的反密码子附近的3'位置(通过相似性)。通路tRNA修饰;wybutosine-tRNA(检)生物合成。属于TYW3家族。 UniProt Q6IPR3 1 平等的 259 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782888 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782888 Reactome r - hsa - 6782888 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782888.1 Reactome数据库ID发布77 6782878 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782878 Reactome数据库ID发布77 6782879 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782879 Reactome r - hsa - 6782879 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782879.2 从左到右 2.1.1 LCMT2甲基化yW-72，在tRNA(Phe)核苷酸37处产生yW-58 从酿酒酵母的同源物推断，LCMT2 (TYW4)在tRNA(Phe)的第37核苷酸上将一个甲基从s -腺苷蛋氨酸转移到yW-72 (7-(3S)-3-氨基-3-羧基丙基)wyosine)，生成yW-58 (7-(3S)-3-氨基-3-(甲氧羰基)丙基)wyosine)和s -腺苷同型半胱氨酸。 作者:May, Bruce, 2015-06-08 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-08 tRNA(Phe)含有yW-58在37 含有7-((3S)-(3-氨基-3-甲氧基羰基)丙基)肌苷-37的tRNA Reactome DB_ID: 6782864 Reactome数据库ID发布77 6782864 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782864 Reactome r - hsa - 6782864 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782864.1 ChEBI 29184 ChEBI 74275 激活 LCMT2 tRNA wybutosin合成蛋白 TYW4_HUMAN DB_ID: 6782869 UniProt: O60294 LCMT2 LCMT2 KIAA0547 TYW4 可能是s -腺苷- l-蛋氨酸依赖的甲基转移酶，作为wybutosine生物合成途径的一个组成部分。wybutoine是一种高度修饰的鸟苷，其三环碱基位于真核生物苯丙氨酸tRNA的反密码子附近的3'位置(通过相似性)。可使亮氨酸残基的羧基甲基化，形成-亮氨酸酯残基。通路tRNA修饰;wybutosine-tRNA(检)生物合成。亚基与RNF144B/IBRDC2相互作用。属于甲基转移酶超家族。LCMT家庭。 UniProt O60294 1 平等的 686 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782869 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782869 Reactome r - hsa - 6782869 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782869.1 Reactome数据库ID发布77 6782876 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782876 Reactome数据库ID发布77 6782881 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782881 Reactome r - hsa - 6782881 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782881.2 从左到右 2.1.1 LCMT2甲氧羰基化yW-58，在tRNA(Phe)的第37核苷酸上生成yW (wybutosine) 从酿酒酵母的同源物推断，LCMT2 (TYW4)在tRNA(Phe)的第37核苷酸上与yW-58 (7-(3S)-3-氨基-3-(甲氧羰基)丙基)wyosine (7-(3S)-3-氨基)3-(甲氧羰基)丙基)产生yW (wybutosine)。在反应过程中加入了一个二氧化碳分子。 作者:May, Bruce, 2015-06-08 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-08 tRNA(Phe)含有yW在37 含有wybutosin -37的tRNA Reactome DB_ID: 6782903 Reactome数据库ID发布77 6782903 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782903 Reactome r - hsa - 6782903 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782903.1 ChEBI 29184 ChEBI 73544 激活 Reactome数据库ID发布77 6782890 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782890 Reactome r - hsa - 6782890 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782890.2 从左到右 1.14.11 TYW5羟基化yW-72，在tRNA(Phe)核苷酸37处生成OHyW-72 TYW5使用2-氧葡萄糖酸盐和分子氧在tRNA(Phe)的核苷酸37上羟基化yW-72(7-(3-氨基-3-羧基丙基)wyosine)，生成OHyW-72(7-(2-羟基-3-氨基-3-羧基丙基)wyosine)、二氧化碳和琥珀酸盐(Noma et al. 2010, Kato et al. 2011)。 作者:May, Bruce, 2015-06-15 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-15 2噩 2-oxoglutarate 2-oxoglutarate (2 -) phys-ent-participant58756 phys-ent-participant15890 phys-ent-participant82158 phys-ent-participant51911 phys-ent-participant77587 phys-ent-participant69325 phys-ent-participant92427 phys-ent-participant9880 phys-ent-participant77403 phys-ent-participant50655 phys-ent-participant88435 phys-ent-participant77804 phys-ent-participant91074 phys-ent-participant64112 phys-ent-participant47131 phys-ent-participant109495 phys-ent-participant77323 phys-ent-participant76894 phys-ent-participant57097 phys-ent-participant77471 phys-ent-participant38853 phys-ent-participant58357 phys-ent-participant99262 phys-ent-participant89777 phys-ent-participant15589 phys-ent-participant16630 phys-ent-participant99366 phys-ent-participant104038 phys-ent-participant37797 phys-ent-participant88591 phys-ent-participant89808 phys-ent-participant81027 phys-ent-participant34508 phys-ent-participant16699 phys-ent-participant87431 phys-ent-participant91493 phys-ent-participant24144 phys-ent-participant25065 phys-ent-participant78818 phys-ent-participant37017 phys-ent-participant24212 phys-ent-participant58270 phys-ent-participant57035 phys-ent-participant12897 phys-ent-participant104066 phys-ent-participant89233 phys-ent-participant6217 phys-ent-participant5407 phys-ent-participant38404 phys-ent-participant82384 phys-ent-participant97738 phys-ent-participant110137 phys-ent-participant77442 phys-ent-participant88875 phys-ent-participant89242 phys-ent-participant91023 phys-ent-participant37075 phys-ent-participant38884 phys-ent-participant38552 phys-ent-participant37814 phys-ent-participant89591 phys-ent-participant47185 phys-ent-participant104452 phys-ent-participant58706 phys-ent-participant89311 phys-ent-participant90988 phys-ent-participant16729 phys-ent-participant97717 phys-ent-participant91031 phys-ent-participant99434 phys-ent-participant38894 phys-ent-participant50363 phys-ent-participant58252 phys-ent-participant33434 phys-ent-participant90008 phys-ent-participant77561 phys-ent-participant26991 phys-ent-participant18115 phys-ent-participant24030 phys-ent-participant28794 phys-ent-participant88507 phys-ent-participant89793 phys-ent-participant5432 phys-ent-participant56418 phys-ent-participant76859 phys-ent-participant91044 phys-ent-participant10994 phys-ent-participant7253 phys-ent-participant77523 phys-ent-participant99135 phys-ent-participant106020 phys-ent-participant34484 phys-ent-participant38445 phys-ent-participant4516 phys-ent-participant77497 phys-ent-participant24197 phys-ent-participant69370 phys-ent-participant87149 phys-ent-participant69436 phys-ent-participant58229 phys-ent-participant83136 phys-ent-participant95965 phys-ent-participant91060 phys-ent-participant45596 Reactome DB_ID: 5278317 2-oxoglutarate (2 -) (ChEBI: 16810) 2-oxoglutarate (2 -) 2-ketoglutarate alpha-ketoglutarate 2-氧戊二酸离子(2-) 2-oxoglutarate ChEBI CHEBI: 16810 Reactome数据库ID发布77 5278317 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5278317 Reactome r - - 5278317 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-5278317.3 O2 phys-ent-participant85083 双氧 phys-ent-participant90299 phys-ent-participant86844 phys-ent-participant87641 phys-ent-participant80004 phys-ent-participant90160 phys-ent-participant87404 phys-ent-participant87303 phys-ent-participant85975 phys-ent-participant82354 phys-ent-participant87145 phys-ent-participant85865 phys-ent-participant87391 phys-ent-participant87762 phys-ent-participant85249 phys-ent-participant86509 phys-ent-participant85119 phys-ent-participant90590 phys-ent-participant86235 phys-ent-participant85673 phys-ent-participant87423 phys-ent-participant85518 phys-ent-participant86065 phys-ent-participant82598 phys-ent-participant87290 phys-ent-participant87714 phys-ent-participant83769 phys-ent-participant80106 phys-ent-participant87709 phys-ent-participant86277 phys-ent-participant85433 phys-ent-participant86312 phys-ent-participant87267 phys-ent-participant85158 phys-ent-participant90142 phys-ent-participant98357 phys-ent-participant85774 phys-ent-participant98164 phys-ent-participant85044 phys-ent-participant87334 phys-ent-participant86530 phys-ent-participant97040 phys-ent-participant84909 phys-ent-participant86123 phys-ent-participant79908 phys-ent-participant86086 phys-ent-participant96325 phys-ent-participant85955 phys-ent-participant87170 phys-ent-participant85467 phys-ent-participant85851 phys-ent-participant96017 phys-ent-participant86780 phys-ent-participant80671 phys-ent-participant86855 phys-ent-participant79873 phys-ent-participant86009 phys-ent-participant87025 phys-ent-participant85622 phys-ent-participant79933 phys-ent-participant86905 phys-ent-participant87329 phys-ent-participant80032 phys-ent-participant96333 phys-ent-participant85338 phys-ent-participant98370 phys-ent-participant86733 phys-ent-participant79306 phys-ent-participant85182 phys-ent-participant86752 phys-ent-participant84928 phys-ent-participant85326 phys-ent-participant87384 phys-ent-participant86154 phys-ent-participant85404 phys-ent-participant84182 phys-ent-participant85224 phys-ent-participant87110 phys-ent-participant80647 phys-ent-participant87080 phys-ent-participant85885 phys-ent-participant85717 phys-ent-participant85501 phys-ent-participant87339 phys-ent-participant85805 phys-ent-participant87483 phys-ent-participant86866 phys-ent-participant85694 phys-ent-participant79895 phys-ent-participant86021 phys-ent-participant90001 phys-ent-participant86620 phys-ent-participant79991 phys-ent-participant86181 phys-ent-participant97858 phys-ent-participant96806 phys-ent-participant86937 phys-ent-participant85602 phys-ent-participant87458 phys-ent-participant96827 phys-ent-participant87365 phys-ent-participant85199 phys-ent-participant80049 phys-ent-participant86336 phys-ent-participant85791 phys-ent-participant85757 phys-ent-participant79922 phys-ent-participant86328 phys-ent-participant96519 phys-ent-participant78361 phys-ent-participant82392 phys-ent-participant85530 phys-ent-participant85925 phys-ent-participant86547 phys-ent-participant14779 phys-ent-participant79976 phys-ent-participant79856 phys-ent-participant86606 phys-ent-participant84954 phys-ent-participant87036 phys-ent-participant86374 phys-ent-participant80093 phys-ent-participant82546 phys-ent-participant86421 phys-ent-participant95458 phys-ent-participant86538 phys-ent-participant95514 phys-ent-participant95728 phys-ent-participant86798 phys-ent-participant14011 phys-ent-participant86954 phys-ent-participant96688 phys-ent-participant98351 phys-ent-participant85915 phys-ent-participant85450 phys-ent-participant86302 phys-ent-participant86812 phys-ent-participant87095 phys-ent-participant84920 phys-ent-participant85636 phys-ent-participant86998 phys-ent-participant87182 phys-ent-participant96207 phys-ent-participant84162 phys-ent-participant95832 phys-ent-participant80685 phys-ent-participant85487 phys-ent-participant95777 phys-ent-participant85063 phys-ent-participant79345 phys-ent-participant90557 phys-ent-participant87776 phys-ent-participant90132 phys-ent-participant84898 phys-ent-participant90076 phys-ent-participant86879 phys-ent-participant86919 phys-ent-participant87189 phys-ent-participant85538 phys-ent-participant85548 phys-ent-participant87014 phys-ent-participant82364 phys-ent-participant85990 phys-ent-participant86642 phys-ent-participant86897 phys-ent-participant87376 phys-ent-participant85665 phys-ent-participant87693 phys-ent-participant82512 phys-ent-participant86097 phys-ent-participant87133 phys-ent-participant82580 phys-ent-participant82472 phys-ent-participant86201 phys-ent-participant87222 phys-ent-participant87412 phys-ent-participant86660 phys-ent-participant85568 phys-ent-participant87006 phys-ent-participant87122 phys-ent-participant86520 phys-ent-participant85818 phys-ent-participant86030 phys-ent-participant80587 phys-ent-participant87276 phys-ent-participant86320 phys-ent-participant87052 phys-ent-participant85099 phys-ent-participant85837 phys-ent-participant85213 phys-ent-participant87344 phys-ent-participant86400 phys-ent-participant90361 phys-ent-participant78068 phys-ent-participant85238 phys-ent-participant85943 phys-ent-participant90551 phys-ent-participant86075 phys-ent-participant87635 phys-ent-participant85681 phys-ent-participant85281 phys-ent-participant95838 phys-ent-participant85294 phys-ent-participant91639 phys-ent-participant85028 phys-ent-participant87469 phys-ent-participant85585 phys-ent-participant90571 phys-ent-participant86193 phys-ent-participant84854 phys-ent-participant96341 phys-ent-participant79884 phys-ent-participant85729 phys-ent-participant85090 phys-ent-participant86146 phys-ent-participant86135 phys-ent-participant86038 phys-ent-participant95887 phys-ent-participant86770 phys-ent-participant85653 phys-ent-participant95551 phys-ent-participant80545 phys-ent-participant86969 phys-ent-participant87445 phys-ent-participant86888 phys-ent-participant79363 phys-ent-participant85317 phys-ent-participant96311 phys-ent-participant87350 phys-ent-participant86985 phys-ent-participant86592 phys-ent-participant97701 phys-ent-participant84890 phys-ent-participant86288 phys-ent-participant85003 phys-ent-participant86260 phys-ent-participant86170 phys-ent-participant82637 phys-ent-participant85903 phys-ent-participant86115 phys-ent-participant95761 phys-ent-participant87044 phys-ent-participant95450 phys-ent-participant86715 phys-ent-participant81997 phys-ent-participant87215 phys-ent-participant86362 phys-ent-participant78380 phys-ent-participant87739 phys-ent-participant86826 phys-ent-participant87259 phys-ent-participant87398 phys-ent-participant84873 phys-ent-participant80081 phys-ent-participant79842 phys-ent-participant95768 phys-ent-participant79960 phys-ent-participant82379 phys-ent-participant84172 phys-ent-participant86388 phys-ent-participant84940 phys-ent-participant95846 phys-ent-participant80065 phys-ent-participant96835 DB_ID: 1131511 分子氧(ChEBI: 15379) 双氧 ChEBI CHEBI: 15379 Reactome数据库ID发布77 1131511 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=1131511 Reactome r - - 1131511 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-1131511.3 tRNA(Phe)含有OHyW-72在37 tRNA(Phe)含有OHyW-72在37 DB_ID: 6783496 Reactome数据库ID发布77 6783496 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783496 Reactome r - hsa - 6783496 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6783496.1 ChEBI 29184 ChEBI 73603 SUCCA 琥珀酸 琥珀酸 琥珀酸(2 -) Reactome DB_ID: 5278787 琥珀酸(2 -)(ChEBI: 30031) 琥珀酸(2 -) (-) OOC-CH2-CH2-COO (-) 琥珀酸 丁二酸离子(2-) butanedioate ChEBI CHEBI: 30031 Reactome数据库ID发布77 5278787 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5278787 Reactome r - - 5278787 4 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-5278787.4 激活 TYW5:价二聚体 DB_ID: 6783460 TYW5:价 Reactome DB_ID: 6783474 TYW5 tRNA wybutosin合成蛋白 TYW5_HUMAN Reactome DB_ID: 6783500 UniProt: A2RUC4 TYW5 TYW5 C2orf60 tRNA羟化酶，作为wybutosine生物合成途径的一个组成部分。wybutoine是一种高度修饰的鸟苷，其三环碱基位于真核生物苯丙氨酸tRNA的反密码子附近的3'位置。催化7-(a-氨基-a-羧基丙基)wyosine (yW-72)羟基化成欠修饰的羟基wybutosine (OHyW*)。通过LCMT2/TYW4进一步将OHyW*转化为羟基wybutosine (OHyW)。OHyW是在高等真核生物中发现的wybutosine的衍生物。通路tRNA修饰;wybutosine-tRNA(检)生物合成。亚基为。属于TYW5家族。 UniProt A2RUC4 1 平等的 315 平等的 Reactome数据库ID发布77 6783500 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783500 Reactome r - hsa - 6783500 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6783500.1 1 价 phys-ent-participant59141 铁(2 +) phys-ent-participant1133 phys-ent-participant1134 phys-ent-participant13101 phys-ent-participant77893 phys-ent-participant30150 phys-ent-participant86319 phys-ent-participant68074 phys-ent-participant7092 phys-ent-participant86349 phys-ent-participant72221 phys-ent-participant67791 phys-ent-participant105157 phys-ent-participant98385 phys-ent-participant67728 phys-ent-participant104306 phys-ent-participant43372 phys-ent-participant64970 phys-ent-participant19254 phys-ent-participant65328 DB_ID: 5278104 Reactome数据库ID发布77 5278104 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5278104 Reactome r - - 5278104 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-5278104.1 1 Reactome数据库ID发布77 6783474 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783474 Reactome r - hsa - 6783474 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6783474.2 2 Reactome数据库ID发布77 6783460 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783460 Reactome r - hsa - 6783460 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6783460.2 基因本体论 去:0016706 Reactome数据库ID发布77 6783464 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783464 Reactome数据库ID发布77 6783455 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783455 Reactome r - hsa - 6783455 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6783455.3 20739293 Pubmed 2010 朱蒙基C结构域作为RNA羟化酶的扩展作用 诺玛,作者 Ishitani R 加藤,而 Nagao, Asuteka 阿,Nureki 铃木T 生物。化学285:34503-7 20972222 Pubmed 2011 参与tRNA修饰的新型含jmjc结构域蛋白TYW5的晶体结构 加藤,而 Araiso, Yuhei 诺玛,作者 Nagao, Asuteka 铃木T Ishitani R 阿,Nureki 核酸学报，39:1576-85 从左到右 2.1.1 LCMT2甲氧羰基化OHyW-72，在tRNA(Phe)的第37核苷酸上生成OHyW(羟基wybutosine) LCMT2 (TYW4)在tRNA(Phe)的第37个核苷酸上与OHyW-72(7-(2-羟基-3-氨基-3-羧基丙基)肌苷进行甲氧羰基化，生成OHyW(羟基肌苷)(Noma等，2010)。 作者:May, Bruce, 2015-06-15 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-15 tRNA(Phe)含有OHyW在37 tRNA(Phe)含有β -羟基wybutoine在37 DB_ID: 6783457 Reactome数据库ID发布77 6783457 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783457 Reactome r - hsa - 6783457 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6783457.1 ChEBI 29184 ChEBI 73602 激活 Reactome数据库ID发布77 6783473 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783473 Reactome r - hsa - 6783473 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6783473.2 Reactome数据库ID发布77 6782861 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782861 Reactome r - hsa - 6782861 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782861.2 17623669 Pubmed 2007 tRNA碱基修饰及其前体在真核生物移框中的作用 威廉。F Druzina, Zhanna 哈难,媚兰 舒密尔P 生物。化学282:26026-34 23856057 Pubmed 2013 超修饰tRNA碱基wybutoine生物合成中自由基介导的环形成 安东尼·杨 Bandarian, Vahe 当代生物化学，17 (6):613-8 14681588 Pubmed 2004 tRNA 37位嘌呤碱基通过堆叠和Mg2+依赖性相互作用稳定核糖体A位点的密码子-反密码子相互作用 安德烈·L·科涅维加 索博列娃，娜塔莉亚·G 马赫诺，瓦伦丁一世 尤里·P·谢门科夫 Wintermeyer,沃尔夫冈 《玛丽娜五号 卡图宁，弗拉基米尔一世 RNA 10:90 - 101 25629788 Pubmed 2014 Wybutosine生物合成:结构和机理综述 Perche-Letuvee, Phanelie Molle是的,鲍特 罗哈,Farhad 由于,艾蒂安 阿塔,默罕默德 RNA，生物，11:1508-18 从左到右 2.1.1 TRDMT1 (DNMT2)甲基化tRNA胞苷-38 (Asp) TRDMT1 (DNMT2)将一个甲基从s -腺苷甲硫氨酸转移到tRNA胞苷-38的5位(Asp) (Goll et al. 2006, Jurkowski et al. 2008, Jurkowski et al. 2012)。TRDMT1使用与DNA甲基转移酶(DNMT1, DNMT3A, DNMT3B)相似的机制(Jurkowski et al. 2008)。 作者:May, Bruce, 2015-06-07 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-07 含有C-38的tRNA(Asp) 含有胞苷-38的tRNA(Asp) DB_ID: 6782393 Reactome数据库ID发布77 6782393 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782393 Reactome r - hsa - 6782393 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782393.1 ChEBI 29186 ChEBI 64656 含有5-mC-38的tRNA(Asp) 含有5-甲基胞苷-38的tRNA(Asp) DB_ID: 6782430 Reactome数据库ID发布77 6782430 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782430 Reactome r - hsa - 6782430 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782430.1 ChEBI 29186 ChEBI 74483 激活 DNMT2 TRDMT1 TRDMT_HUMAN tRNA(胞嘧啶(38)- c(5))甲基转移酶 Reactome DB_ID: 6782441 UniProt: O14717 TRDMT1 TRDMT1 DNMT2 特异性甲基化tRNA(Asp)反密码子环中的胞嘧啶38。组织特异性无处不在。在睾丸、卵巢和胸腺中表达较高，在脾脏、前列腺、结肠、小肠和外周血白细胞中表达较低。属于i类sam结合甲基转移酶超家族。C5-methyltransferase家庭。 UniProt O14717 1 平等的 391 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782441 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782441 Reactome r - hsa - 6782441 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782441.1 Reactome数据库ID发布77 6782398 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782398 Reactome数据库ID发布77 6782419 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782419 Reactome r - hsa - 6782419 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782419.3 18567810 Pubmed 2008 人类DNMT2使用类似DNA甲基转移酶的催化机制甲基化tRNA(Asp)分子 托马兹·尤尔科夫斯基 Meusburger,玛德琳 Phalke, Sameer 舵,马克 Nellen,沃尔夫冈 路透社,甘特 Jeltsch,艾伯特 RNA 14:1663 - 70 22591353 Pubmed 2012 人DNMT2甲基转移酶表面tRNA结合位点的定位 托马兹·尤尔科夫斯基 Shanmugam, Raghuvaran 舵,马克 Jeltsch,艾伯特 生物化学51:4438-44 16424344 Pubmed 2006 DNA甲基转移酶同源物Dnmt2对tRNAAsp的甲基化作用 天啊，玛丽·格蕾丝 Kirpekar,芬恩 基思·马格特 杰弗里·约德 谢长廷,CL 张,小雨 肯特·G·高利克 史蒂文·E·雅各布森 Bestor, Timothy H 科学311:395-8 从左到右 2.7.7 THG1L将GMP转移到tRNA(His)的5'端 THG1L (THG1)在tRNA(His)的5'端添加了一个鸟苷三磷酸残基，这是一个3'-5'的添加，与核苷酸聚合酶通常的5'-3'方向性形成对比(Hyde et al. 2010)。 作者:May, Bruce, 2015-06-07 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-07 三磷酸鸟苷 鸟嘌呤核苷5 '三磷酸 DB_ID: 29438 三磷酸鸟苷(ChEBI: 15996) 三磷酸鸟苷 鸟嘌呤核苷5 '三磷酸 ChEBI CHEBI: 15996 Reactome数据库ID发布77 29438 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29438 Reactome r - - 29438 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29438.3 复合 C00044 三磷酸腺苷 腺苷5 '三磷酸 ATP (4) DB_ID: 113592 ATP (4 -) (ChEBI: 30616) ATP (4) 三磷酸腺苷 三磷酸腺苷 腺苷5 '三磷酸 ChEBI CHEBI: 30616 Reactome数据库ID发布77 113592 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113592 Reactome r - - 113592 5 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113592.5 复合 C00002 tRNA(他的) Reactome DB_ID: 379758 Reactome数据库ID发布77 379758 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=379758 Reactome r - hsa - 379758 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-379758.1 ChEBI 29178 5 ' -pppG-p-tRNA(他的) Reactome DB_ID: 6782455 Reactome数据库ID发布77 6782455 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782455 Reactome r - hsa - 6782455 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782455.1 ChEBI 29178 ChEBI 53100 PPi 焦磷酸 diphosphoric酸 焦磷酸 二磷酸 Reactome DB_ID: 111294 二磷酸[ChEBI:29888] diphosphoric酸 ChEBI CHEBI: 29888 Reactome数据库ID发布77 111294 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=111294 Reactome r - - 111294 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-111294.3 复合 C00013 激活 THG1L 可能的tRNA THG1_HUMAN Reactome DB_ID: 6782438 UniProt: Q9NWX6 THG1L THG1L ICF45 在转录和RNase P切割后，在tRNA(His)的5'端添加一个GMP。这一步对于正确识别tRNA和蛋白质合成的保真度(可能)是必不可少的。也作为MFN1和MFN2有丝分裂蛋白的鸟酰核苷酸交换因子/GEF，从而调节线粒体融合(PubMed:25008184, PubMed:27307223)。通过调节线粒体动力学和生物能量功能，它有助于氧化应激后的细胞存活(PubMed:25008184, PubMed:27307223)。亚基同四聚体(PubMed:21059936)。与MFN1和MFN2相互作用;作为MFN2和MFN1的鸟酰核苷酸交换因子/GEF (PubMed:25008184)。组织特异性:在许多组织中表达。属于tRNA(His)胍基转移酶家族。 UniProt Q9NWX6 1 平等的 298 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782438 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782438 Reactome r - hsa - 6782438 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782438.1 基因本体论 去:0016779 Reactome数据库ID发布77 6782459 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782459 Reactome数据库ID发布77 6782434 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782434 Reactome r - hsa - 6782434 4 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782434.4 21059936 Pubmed 2010 tRNA(His)胍基转移酶(THG1)是一种独特的3'-5'核苷酸转移酶，与典型的5'-3' DNA聚合酶具有意想不到的结构同源性 萨曼莎·海德 布莱恩·埃肯罗斯 布莱恩·史密斯 威廉·艾伯利 尼古拉斯·H·海因茨 简·杰克曼 Doublie,西尔维 Proc。国家的。学会科学。美国107:20305-10 从左到右 2.5.1.75 TRIT1将二甲基烯丙基转移到trna的腺苷-37上 TRIT1将二甲基烯丙基(异戊烯基)从二磷酸二甲基烯丙基转移到tRNA(Ser)中腺苷-37的N6位置，生成N6-二甲基烯丙基腺苷-37 (N6-异戊烯基腺苷-37)(Golovko等人2000年，Spinola等人2005年，Lamichhane等人2013年，Yarham等人2014年，Smaldino等人2015年)。TRIT1修饰细胞质和线粒体trna, TRIT1突变会导致线粒体呼吸缺陷(Yarham et al. 2014)。与正常组织相比，肺腺癌中TRIT1的表达下调(Spinola et al. 2005)。酿酒酵母的同源物MOD5也能催化相同的反应。 作者:May, Bruce, 2015-06-20 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-20 DMAPP Dimethylallyl焦磷酸 prenyl二磷酸 DB_ID: 191324 二磷酸戊烯基[ChEBI:16057] prenyl二磷酸 ChEBI CHEBI: 16057 Reactome数据库ID发布77 191324 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=191324 Reactome r - - 191324 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-191324.3 复合 C00235 含有A-37的tRNA(Ser) 转移含有腺苷-37的RNA(Ser) Reactome DB_ID: 6784467 Reactome数据库ID发布77 6784467 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784467 Reactome r - hsa - 6784467 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6784467.1 ChEBI 17843 ChEBI 62885 含有异戊烯la -37的tRNA(Ser) 含有N(6)-异戊烯腺苷-37的转移RNA(Ser) DB_ID: 6784451 Reactome数据库ID发布77 6784451 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784451 Reactome r - hsa - 6784451 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6784451.1 ChEBI 17843 ChEBI 62884 激活 TRIT1 tRNA二甲基烯丙基转移酶，线粒体ecNumber2.5.1.75/ecNumber MOD5_HUMAN Reactome DB_ID: 6784483 UniProt: Q9H3H1 TRIT1 TRIT1 IPT MOD5 催化二甲基烯丙基转移到细胞质和线粒体trna的37位腺嘌呤上，导致N6-(二甲基烯丙基)腺苷(i(6) a)的形成。属于IPP转移酶家族。 UniProt Q9H3H1 48 平等的 467 平等的 Reactome数据库ID发布77 6784483 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784483 Reactome r - hsa - 6784483 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6784483.1 基因本体论 去:0052381 Reactome数据库ID发布77 6784458 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784458 Reactome数据库ID发布77 6784462 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6784462 Reactome r - hsa - 6784462 4 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6784462.4 11111046 Pubmed 2000 人tRNA异戊烯基转移酶的克隆 Golovko, Hjalm G Sitbon F Nicander B 基因258:85 - 93 15870694 Pubmed 2005 人肺癌候选抑癌基因TRIT1的鉴定及功能表征 Spinola, M 加尔文,Antonella Pignatiello,卡门 孔蒂,芭芭拉 Pastorino,尤格 Nicander,比约恩 Paroni,丽塔 Dragani,助教 致癌基因24:5502-9 24901367 Pubmed 2014 线粒体和细胞质tRNA的i6A37修饰缺陷是由TRIT1及其底物tRNA的致病性突变引起的 约翰·W·亚汉姆著 Tek N . Lamichhane 派尔,安琪拉 Mattijssen,桑迪 Baruffini,恩里科 布吕尼,弗朗西斯科 Donnini,克劳迪娅 Vassilev,亚历克斯 他,Langping 布莱克利，艾玛·L 格里芬,海伦 Santibanez-Koref,毛罗。 劳伦斯·宾多夫著 费列罗,罗丝 Patrick F . Chinnery 麦克法兰,罗伯特 Richard J . Maraia 罗伯特·W·泰勒 科学通报，10:e1004424 25261850 Pubmed 2015 真核生物trna -异戊烯基转移酶的细胞质和细胞核群体在人类癌症中具有不同的功能 Smaldino, P J 读，D ? Pratt-Hyatt, M 霍珀，A K Engelke,博士 基因556:13-8 24126054 Pubmed 2013 人类细胞具有tRNA异戊烯基转移酶TRIT1肿瘤抑制因子的有限tRNA反密码子环底物 Tek N . Lamichhane Mattijssen,桑迪 Richard J . Maraia 摩尔。细胞。生物33:4900-8 从左到右 2.1.1 TRMT1 (hTRM1)二甲基化tRNA -26 (Tyr) TRMT1 (hTRM1)将两个甲基从s -腺苷蛋氨酸的两个分子转移到tRNA(Tyr)的鸟苷-26的2位，生成2-二甲基鸟苷(Liu and Straby 2000)。TRMT1可以将剪接和未剪接的tRNA二甲基化(Liu and Straby 2000)。 作者:May, Bruce, 2015-06-07 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-07 含有G-26的tRNA(Tyr) tRNA(Tyr)含有鸟苷-26 Reactome DB_ID: 6782418 Reactome数据库ID发布77 6782418 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782418 Reactome r - hsa - 6782418 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782418.1 ChEBI 29182 ChEBI 64654 2 含有2,2-二甲基g -26的tRNA(Tyr) 含有2,2-二甲基鸟苷-26的tRNA(Tyr) Reactome DB_ID: 6782408 Reactome数据库ID发布77 6782408 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782408 Reactome r - hsa - 6782408 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782408.1 ChEBI 29182 ChEBI 74513 2 激活 TRMT1 2,2-二甲基鸟苷-26甲基转移酶 TRM1_HUMAN Reactome DB_ID: 6782450 UniProt: Q9NXH9 TRMT1 TRMT1 利用s -腺苷- l-蛋氨酸作为甲基的供体，在大多数trna的26位上对单个鸟嘌呤残基进行二甲基化。属于i类sam结合甲基转移酶超家族。Trm1家庭。 UniProt Q9NXH9 1 平等的 659 平等的 Reactome数据库ID发布77 6782450 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782450 Reactome r - hsa - 6782450 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782450.1 基因本体论 去:0004809 Reactome数据库ID发布77 6782437 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782437 Reactome数据库ID发布77 6782416 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782416 Reactome r - hsa - 6782416 3. 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782416.3 10982862 Pubmed 2000 人tRNA(m(2)(2)G(26))二甲基转移酶:克隆hTRM1基因的功能表达和表征 刘,我 斯特拉斯比 核酸，28:3445-51 从左到右 2.1.1 TRMT10A甲基化tRNA中的鸟苷-9 从酿酒酵母的同源物推断，TRMT10A甲基化tRNAs核苷酸9上鸟苷的1位。TRMT10A位于细胞核内(Igoillo-Esteve et al. 2013)。TRMT10A的无义突变导致糖尿病和小头畸形(Igoillo-Esteve et al. 2013)。 作者:May, Bruce, 2015-06-30 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-30 含有G-9的tRNA 含有鸟苷-9的tRNA Reactome DB_ID: 6786513 Reactome数据库ID发布77 6786513 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786513 Reactome r - hsa - 6786513 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786513.2 ChEBI 17843 ChEBI 64654 含有1-甲基-9的tRNA 含有1-甲基鸟苷-9的tRNA Reactome DB_ID: 6786591 Reactome数据库ID发布77 6786591 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786591 Reactome r - hsa - 6786591 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786591.1 ChEBI 17843 ChEBI 73542 激活 TRMT10A tRNA甲基转移酶10同源物A ecNumber2.1.1.-/ecNumber TM10A_HUMAN Reactome DB_ID: 6786514 UniProt: Q8TBZ6 TRMT10A TRMT10A RG9MTD2 s -腺苷- l-蛋氨酸依赖的鸟嘌呤N(1)-甲基转移酶，催化tRNAs中位置9 (m1G9)上N(1)-甲基鸟嘌呤的形成(PubMed:23042678, PubMed:25053765)。可能不能催化tRNAs中9位N(1)-甲基腺嘌呤(m1A9)的形成(PubMed:23042678)。亚基与tRNA相互作用。组织特异性:在胚胎和胎脑中表达。它在妊娠8周和11周时表达于整个背端脑区，在心室区和边缘区表达量最高。晚期在小脑皮层和核中检测到，但在背端脑中未检测到。属于iv类sam结合甲基转移酶超家族。TRM10家庭。 UniProt Q8TBZ6 1 平等的 339 平等的 Reactome数据库ID发布77 6786514 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786514 Reactome r - hsa - 6786514 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786514.1 Reactome数据库ID发布77 6786532 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786532 Reactome数据库ID发布77 6786621 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786621 Reactome r - hsa - 6786621 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786621.2 23042678 Pubmed 2012 人类线粒体RNase P的亚复合物是一种双功能甲基转移酶-在线粒体tRNA生物发生中广泛的兼职 Vilardo, Elisa Nachbagauer, Christa Buzet, Aurelie Taschner安德烈 Holzmann,约翰 Rossmanith,沃尔特 核酸学报。40:11583-93 24204302 Pubmed 2013 tRNA甲基转移酶同源基因TRMT10A突变与人类年轻发病糖尿病和原发性小头畸形的关系 Igoillo-Esteve,马里亚纳 配基,安妮 兰伯特,内尔 分,朱莉 Pirson,伊莎贝尔 Abdulkarim, Baroj 西摩尼,尼古拉。 Drielsma,阿 Marselli, Lorella 马,皮耶罗 Vanderhaeghen,皮埃尔 Eizirik, dassio L Wuyts Wim 7月,塞西尔 阿里·J·查克拉 Ellard,西安 安德鲁·哈特斯利 Abramowicz,马克 Cnop,米利暗 科学通报。9:e1003888 从左到右 2.1.1 TRMT11:TRMT112甲基化tRNA中的鸟苷-10 从酿酒酵母的同源物推断，TRMT11(催化亚基)和TRMT112(锌结合亚基)形成一个复合物，使tRNA中鸟苷-10的2位甲基化(Purushothaman et al. 2005)。 作者:May, Bruce, 2015-06-30 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-30 含有G-10的tRNA 含有鸟苷-10的tRNA Reactome DB_ID: 6786524 Reactome数据库ID发布77 6786524 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786524 Reactome r - hsa - 6786524 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786524.2 ChEBI 17843 ChEBI 64654 含有2-甲基g -10的tRNA 含有N(2)-甲基鸟苷-10的tRNA Reactome DB_ID: 6786548 Reactome数据库ID发布77 6786548 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786548 Reactome r - hsa - 6786548 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786548.1 ChEBI 17843 ChEBI 74481 激活 activeUnit: # Protein40 TRMT11: TRMT112 Reactome DB_ID: 6786618 TRMT112 多功能甲基转移酶亚基trm112样蛋白 TR112_HUMAN Reactome DB_ID: 6786545 UniProt: Q9UI30 TRMT112 TRMT112 广告- 001 HSPC152 HSPC170 作为rRNA/tRNA和蛋白质甲基转移酶的激活剂(PubMed:25851604, PubMed:18539146, PubMed:20308323, PubMed:25851604, PubMed:31328227, PubMed:31636962, PubMed:31061526)。与甲基转移酶BUD23一起，甲基化18S rRNA中鸟嘌呤的N(7)位置(PubMed:25851604)。含有HEMK2/N6AMT1的异源二聚体以s -腺苷l -蛋氨酸为甲基供体，催化'Gln-185'上ETF1的n5甲基化(PubMed:18539146, PubMed:31636962, PubMed:31061526)。具有HEMK2/N6AMT1的异源二聚体也使组蛋白H4 (H4K12me1)的Lys-12单甲基化(PubMed:31061526)。含有ALKBH8的异源二聚体在目标tRNA物种的反密码子环的振荡位置催化5-羧甲基尿嘧啶甲基化为5-甲基羧甲基尿嘧啶(PubMed:20308323)。参与导致小亚基rRNA产生的pre-rRNA加工步骤(PubMed:25851604)。与甲基转移酶METTL5一起，特异性地甲基化18S rRNA 1832位的第6位腺嘌呤(PubMed:31328227)。与BUD23的亚基异二聚体;这种异源二聚化对于催化亚基BUD23的代谢稳定性和活性是必要的(PubMed:25851604)。含有N6AMT1/HEMK2的异源二聚体;这种异源二聚化是s -腺苷- l-蛋氨酸与N6AMT1/HEMK2结合所必需的(PubMed:20308323, PubMed:25851604, PubMed:31632689, PubMed:31636962, PubMed:31061526)。 Heterodimer with ALKBH8 (PubMed:20308323). Heterodimer with METTL5; this heterodimerization is necessary for the stability of the catalytic subunit METTL5 (PubMed:31328227, PubMed:32217665).SIMILARITY Belongs to the TRM112 family. UniProt Q9UI30 1 平等的 125 平等的 Reactome数据库ID发布77 6786545 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786545 Reactome r - hsa - 6786545 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786545.1 1 tRNA TRMT11 TRM11_HUMAN Reactome DB_ID: 6786497 UniProt: Q7Z4G4 TRMT11 TRMT11 C6orf75 MDS024 s -腺苷- l-蛋氨酸依赖tRNA甲基转移酶复合物的催化亚基，介导tRNA中第10位鸟苷核苷酸(m2G10)的甲基化。属于i类sam结合甲基转移酶超家族。TRM11甲基转移酶家族。 UniProt Q7Z4G4 2 平等的 463 平等的 Reactome数据库ID发布77 6786497 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786497 Reactome r - hsa - 6786497 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786497.1 1 Reactome数据库ID发布77 6786618 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786618 Reactome r - hsa - 6786618 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786618.1 Reactome数据库ID发布77 6786593 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786593 Reactome数据库ID发布77 6786501 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6786501 Reactome r - hsa - 6786501 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6786501.2 从左到右 2.1.1 TRMT6:TRMT61A甲基化腺苷，在tRNA的核苷酸58上产生1-甲基腺苷(Met) TRMT6:TRMT61A复合物将一个甲基从s -腺苷蛋氨酸转移到tRNA的1位腺苷-58 (Met) (Ozanick et al. 2005)。根据同源复合体(GCD10:GCD14)在酵母中的位置(Anderson et al. 1998)，推断TRMT6:TRMT61A复合体的甲基化发生在细胞核中。 作者:May, Bruce, 2015-06-15 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-06-15 tRNA(Met)含有A-58 tRNA(Met)含有腺苷-58 DB_ID: 6783486 Reactome数据库ID发布77 6783486 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783486 Reactome r - hsa - 6783486 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6783486.1 ChEBI 29173 ChEBI 62885 tRNA(Met)含有1-甲基la -58 tRNA(Met)含有1-甲基腺苷 DB_ID: 6783466 Reactome数据库ID发布77 6783466 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783466 Reactome r - hsa - 6783466 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6783466.1 ChEBI 29173 ChEBI 74491 激活 TRMT6: TRMT61A Reactome DB_ID: 6783454 TRMT61A tRNA(m1A58)-甲基转移酶亚基TRMT61A TRM61_HUMAN Reactome DB_ID: 6783477 UniProt: Q96FX7 TRMT61A TRMT61A C14orf172 TRM61 tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase)的催化亚基，催化引发剂methionyl-tRNA中58位(m1A58)的N(1)- methylladenine的形成(PubMed:16043508)。mRNA N(1)-甲基转移酶复合物的催化亚基，介导一小部分mRNA N(1)位置腺苷残基的甲基化:N(1)甲基化发生在mRNA的tRNA t -环样结构中，仅在低化学计量中存在(PubMed:29107537, PubMed:29072297)。亚基Heterotetramer;由TRMT6的两个副本和TRMT61A的两个副本组成。属于i类sam结合甲基转移酶超家族。TRM61家庭。 UniProt Q96FX7 2 平等的 289 平等的 Reactome数据库ID发布77 6783477 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783477 Reactome r - hsa - 6783477 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6783477.1 2 TRMT6 tRNA(m1A58)-甲基转移酶亚基TRM6 TRM6_HUMAN Reactome DB_ID: 6783485 UniProt: Q9UJA5 TRMT6 TRMT6 KIAA1153 TRM6 CGI-09 tRNA(腺嘌呤-N(1)-)-甲基转移酶的底物结合亚基，催化引发剂甲硫基tRNA中58位(m1A58)上N(1)-甲基腺嘌呤的形成(PubMed:16043508)。与TRMT61A催化亚基一起，mRNA N(1)-甲基转移酶复合物的一部分介导一小部分mRNA N(1)位置腺苷残基的甲基化:N(1)甲基化发生在mRNA的tRNA t -环样结构中，仅在低化学计量中存在(PubMed:29107537, PubMed:29072297)。亚基Heterotetramer;由TRMT6的两个副本和TRMT61A的两个副本组成。组织特异性表达于脑、肝、睾丸、卵巢。相似性属于TRM6/GCD10家族。 UniProt Q9UJA5 1 平等的 497 平等的 Reactome数据库ID发布77 6783485 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783485 Reactome r - hsa - 6783485 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6783485.1 2 Reactome数据库ID发布77 6783454 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783454 Reactome r - hsa - 6783454 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6783454.1 基因本体论 去:0016429 Reactome数据库ID发布77 6783452 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783452 Reactome数据库ID发布77 6783492 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6783492 Reactome r - hsa - 6783492 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6783492.2 16043508 Pubmed 2005 酿酒葡萄球菌tRNA m1A58甲基转移酶的两部分结构在人类中是保守的 Ozanick莎拉 Krecic,安妮特 Andersland,约书亚 詹姆斯·安德森 RNA 11:1281 - 90 9851972 Pubmed 1998 必需的Gcd10p-Gcd14p核复合物是1-甲基腺苷修饰和引发剂甲硫基trna成熟所必需的 安德森,J 表象,我 单面山,R 卡尔森，文学学士 Pak, M 浅野K Björk, G R Tamame, M Hinnebusch, g.g 基因发展。12:3650-62 从左到右 2.1.1 TRMT13 2'- o -甲基化tRNA中的胞苷-4 从酵母同源物推断，TRMT13甲基化tRNA(Gly)和tRNA(Pro)受体茎中的胞苷-4的2′羟基。该反应的亚细胞位置尚不清楚。缺乏TRM13的酵母没有明显的生长缺陷。 作者:May, Bruce, 2015-07-23 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-07-23 从Reactome中的EntitySet转换而来 含有C-4的tRNA(Gly,Pro) Reactome DB_ID: 6788700 tRNA(Gly)(GCC)含C-4 含有胞苷-4的tRNA(GLY)(GCC) Reactome DB_ID: 6788690 Reactome数据库ID发布77 6788690 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788690 Reactome r - hsa - 6788690 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788690.2 ChEBI 29176 ChEBI 64656 RNAcentral URS00005AFD62_9606 含有C-4的tRNA(Pro) 含有胞苷-4的tRNA(Pro) DB_ID: 6788709 Reactome数据库ID发布77 6788709 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788709 Reactome r - hsa - 6788709 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788709.1 ChEBI 29177 ChEBI 64656 Reactome数据库ID发布77 6788700 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788700 Reactome r - hsa - 6788700 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788700.2 从Reactome中的EntitySet转换而来 tRNA(Gly,Pro)含有2'- o -甲基c -4 Reactome DB_ID: 6788678 tRNA(Gly)(GCC)含有2'- o -甲基c -4 含有2′- o -甲基胞苷-4的tRNA(GLY)(GCC) DB_ID: 6788688 Reactome数据库ID发布77 6788688 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788688 Reactome r - hsa - 6788688 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788688.1 ChEBI 29176 ChEBI 74495 含有2'- o -甲基c -4的tRNA(Pro) 含有2'- o -甲基胞苷-4的tRNA(Pro) Reactome DB_ID: 6788708 Reactome数据库ID发布77 6788708 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788708 Reactome r - hsa - 6788708 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788708.1 ChEBI 29177 ChEBI 74495 Reactome数据库ID发布77 6788678 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788678 Reactome r - hsa - 6788678 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788678.1 激活 TRMT13 tRNA: m TRM13_HUMAN Reactome DB_ID: 6788716 UniProt: Q9NUP7 TRMT13 TRMT13 CCDC76 tRNA甲基化酶，2'- o -甲基化tRNA(Pro)和tRNA(Gly)(GCC)中的胞苷(4)和tRNA(His)中的腺苷(4)。属于甲基转移酶TRM13家族。 UniProt Q9NUP7 2 平等的 481 平等的 Reactome数据库ID发布77 6788716 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788716 Reactome r - hsa - 6788716 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788716.1 Reactome数据库ID发布77 6788687 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788687 Reactome数据库ID发布77 6788684 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788684 Reactome r - hsa - 6788684 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788684.2 基因本体论 去:0030488 从左到右 2.1.1 TRMT13 2'- o -甲基化tRNA中的腺苷-4 从酵母同源物推断，TRMT13甲基化tRNA(His)受体茎中的腺苷-4的2'羟基。该反应的亚细胞位置尚不清楚。缺乏TRM13的酵母没有明显的生长缺陷。 作者:May, Bruce, 2015-07-23 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-07-23 含有A-4的tRNA(His) 含有腺苷-4的tRNA(His) Reactome DB_ID: 6788711 Reactome数据库ID发布77 6788711 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788711 Reactome r - hsa - 6788711 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788711.1 ChEBI 29178 ChEBI 62885 含有2'- o -甲基-4的tRNA(His) 含有2'- o -甲基腺苷-4的tRNA(His) DB_ID: 6788686 Reactome数据库ID发布77 6788686 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788686 Reactome r - hsa - 6788686 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788686.1 ChEBI 29178 ChEBI 74477 激活 Reactome数据库ID发布77 6788668 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788668 Reactome r - hsa - 6788668 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788668.2 从左到右 2.1.1.34 TRMT44在tRNA(Ser)中2'- o -甲基化尿苷-44 从酵母同源物推断，TRMT44甲基化tRNA(Ser)中尿苷-44的2'羟基。在酵母中，2'- o -甲基尿嘧啶-44和N(4)-乙酰胞苷似乎是维持tRNA(Ser)丰度所必需的。 作者:May, Bruce, 2015-07-23 review: Levinger, Louis, 2015-08-10 review: Motorin, Yuri, 2015-08-25 review: Jarrous, Nayef, 2015-10-24 编辑:May, Bruce, 2015-07-23 含有U-44的tRNA(Ser) 含有尿苷-44的tRNA(Ser) Reactome DB_ID: 6788714 Reactome数据库ID发布77 6788714 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788714 Reactome r - hsa - 6788714 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788714.1 ChEBI 29179 ChEBI 73747 含有2'- o -甲基lu -44的tRNA(Ser) 含有2'- o -甲基尿嘧啶-44的tRNA(Ser) Reactome DB_ID: 6788717 Reactome数据库ID发布77 6788717 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788717 Reactome r - hsa - 6788717 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788717.1 ChEBI 29179 ChEBI 74478 激活 TRMT44 可能的tRNA TRM44_HUMAN Reactome DB_ID: 6788685 UniProt: Q8IYL2 TRMT44 TRMT44 C4orf23 METTL19 可能的腺苷- l-蛋氨酸(AdoMet)依赖tRNA(尿嘧啶- o(2)-)甲基转移酶。属于TRM44家族。 UniProt Q8IYL2 1 平等的 757 平等的 Reactome数据库ID发布77 6788685 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788685 Reactome r - hsa - 6788685 1 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788685.1 基因本体论 去:0052665 Reactome数据库ID发布77 6788676 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788676 Reactome数据库ID发布77 6788707 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6788707 Reactome r - hsa - 6788707 2 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6788707.2 Reactome数据库ID发布77 6782315 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=6782315 Reactome r - hsa - 6782315 5 反应器稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-6782315.5 25692999 Pubmed 2014 改变还是死亡?——后生动物的RNA修饰缺陷 沙林，彼得 塞巴斯蒂安·雷德尔 RNA生物11:15 . 55-67 25780173 Pubmed 2015 tRNA转录后修饰——对遗传密码退化的反应 侯,YM 大伞,霍华德 杨,魏 RNA 21:642-4 24490730 Pubmed 2013 化学进入核酸生物学:RNA修饰的酶机制 Boschi-Muller,年代 Motorin,尤里 生物化学学报。78:1392-404 24581449 Pubmed 2014 tRNA修饰在人类疾病中的作用 阿德里安·加布里埃尔·托雷斯 巴特列,爱德华· 波多黎各Ribas de Pouplana 医学趋势，20:306-14 24315934 Pubmed 2014 转录后RNA修饰:在细胞的化学乐高乐园中玩代谢游戏 舵,马克 胡安·阿方索 化学。生物21:174 - 85 23139145 Pubmed 2013 转移RNA修饰:自然界的组合化学游乐场 简·杰克曼 胡安·阿方索 Wiley跨学科Rev RNA 4:35-48 24898039 Pubmed 2014 RNA修饰的关键调控景观 李,盛 克里斯托弗·梅森 基因工程学报，15:127-50 25304425 Pubmed 2014 tRNA修饰调节细胞应激过程中的翻译 顾,陈 托马斯·J·贝格利 彼得·C·迪顿 医学通讯。588:4287-96