bioax途径由Reactome数据库中的“DT片段A adp -核糖基化靶细胞EEF”转化而来。
左到右
2.4.2.36
DT片段A adp -核糖基靶向细胞EEF
靶细胞延伸因子2 (EEF2)在胞质白喉毒素片段a (DT a)催化的反应中被adp核糖基化,使其失活(Honjo et al. 1971;Van Ness et al. 1980a,b)。EEF2活性的丧失阻碍了靶细胞蛋白质的合成,少量的DT a分子能够使足够的EEF2失活,从而导致靶细胞死亡(Collier 1975)。
作者:D’eustachio, Peter, 2014-03-04
刘世辉,2014-11-18
编辑:D’eustachio, Peter, 2014-03-04
EEF2
diphthamide EEF2
eEF2
Reactome DB_ID: 156901
胞质
基因本体论
去:0005829
UniProt: P13639 EEF2
EEF2
EF2
FUNCTION催化翻译延伸在GTP依赖核糖体易位步骤。在该步骤期间,从所述预translocational(PRE)核糖体更改后translocational(POST)状态作为新形成的A位点结合的肽酰-tRNA和P位结合的脱酰基化的tRNA移动到p和E位点。催化两个tRNA分子的协调运动,所述mRNA和mRNA的监视SURF的ribosome.SUBUNIT组件的构象变化复杂,至少ERF1,虫eRF3(ERF3A或ERF3B),EEF2,UPF1 /租赁1,SMG1,SMG8组成和SMG9(PUBMED:19417104)。与RBPMS2(搜索PubMed:25064856)相互作用.PTM磷酸化通过EF-2完全激酶使其失活EF-2;它要求通过CDK2在Ser-595的有丝分裂前中期期间之前磷酸化。磷酸化CSK促进SUMO化,蛋白水解裂解,和核转位,如果C末端fragment.PTM Diphthamide是2- [3-羧基酰氨基-3-(三甲基铵基)丙基]组氨酸(通过相似性).PTM(微生物感染)Diphthamide可以通过白喉毒素和假单胞菌外毒素A的ADP-核糖基化,从而阻止蛋白质synthesis.PTM ISGylated.PTM蛋白水解加工在下列以下通过CSK磷酸化的磷酸化通过CSK.PTM SUMO化两个位点,促进蛋白水解cleavage.SIMILARITY属于TRAFAC类翻译因子超家族的GTP酶。 Classic translation factor GTPase family. EF-G/EF-2 subfamily.
智人
NCBI分类法
9606
UniProt
P13639
715
平等的
dipthamide
摩擦
MOD:00049
2
平等的
858.
平等的
反应数据库ID版本77
156901
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=156901
反应
r - hsa - 156901
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-156901.1
反应
//www.joaskin.com
n
NAD +
NAD (+)
烟酰胺腺嘌呤二核苷酸
DPN
Diphosphopyridine核苷酸
Reactome DB_ID: 29360
NAD(1-)[飞燕:57540]
NAD (1 -)
腺苷5' - {3- [1-(3- carbamoylpyridinio)-1,4-脱水d核糖醇-5-基]}二磷酸
NAD (+)
NAD阴离子
ChEBI
Chebi:57540.
反应数据库ID版本77
29360
数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29360
反应
r - - 29360
5
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29360.5
复合
C00003
额外的信息
心肌梗死
小姐:0361
ADP-ribo-EEF2
Reactome DB_ID: 5334764
715
平等的
的N- tau-(ADP-核糖基)diphthamide
摩擦
MOD:01145
2
平等的
858.
平等的
反应数据库ID版本77
5334764
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5334764
反应
R-HSA-5334764
1
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纳姆
烟酰胺
Reactome DB_ID: 197277
烟酰胺(ChEBI: 17154)
烟酰胺
ChEBI
CHEBI: 17154
反应数据库ID版本77
197277
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=197277
反应
r - - 197277
3.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-197277.3
复合
C00153
激活
DT (33 - 225)
白喉毒素片段
Reactome DB_ID: 5334080
UniProt的:P00588白喉毒素
白喉毒素
白喉毒素,由噬菌体感染白喉棒状杆菌产生,是一种酶原,激活后催化NAD的ADP核糖部分与真核延伸因子2 (eEF-2)的共价结合。片段A是酶促伸长因子2 adp核糖基化的催化部分,而片段B负责毒素与细胞受体结合和片段A的进入。活性调节被1,8-萘酰亚胺部分抑制。亚基为。
Corynephageβ
NCBI分类法
10703
UniProt
P00588
33
平等的
225.
平等的
反应数据库ID版本77
5334080
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5334080
反应
r - cph - 5334080
7
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-CPH-5334080.7
基因本体论
去:0047286
细胞功能的基因本体论术语
心肌梗死
小姐:0355
相同的催化剂活性
反应数据库ID版本77
5336414
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5336414
反应数据库ID版本77
5336421
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5336421
反应
R-HSA-5336421
3.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-5336421.3
7430147
PubMed.
1980
由白喉毒素延伸因子2的ADP核糖基化。NMR谱和核糖基diphthamide的提出的结构和其水解产物
布莱恩·G·范·内斯
霍华德,詹姆斯科比
牛津大学图书馆,詹姆斯W
生物。化学。255:10710-6
164179
PubMed.
1975
白喉毒素:作用方式和结构
科利尔,R约翰
Bacteriol 39:54牧师- 85
4326212
PubMed.
1971
氨酰转移酶II的二磷酸腺苷核糖基化和由白喉毒素抑制蛋白质的合成
本庄,佑
Nishizuka, Yasutomi
加藤,Iwao
Hayaishi Osamu
生物。化学246:4251-60
7000782
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由白喉毒素延伸因子2的ADP核糖基化。隔离和和新的核糖基的氨基酸的性质及其水解产物
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霍华德,詹姆斯科比
牛津大学图书馆,詹姆斯W
生物。化学。255:10717-20