BioPAX途径从“脂类代谢”的Reactome数据库转换。 脂质代谢 草酰乙酸还原为苹果酸是脂质代谢途径和碳水化合物代谢途径之间的共同反应。鞘脂合成反应的各个方面已经从已知的人类酶的性质中推断出来。 著作:D'Eustachio,P,2008-09-10 19点15分十一秒 鞘脂类代谢 鞘脂是鞘氨醇衍生物(反式-1,3-二羟基-2-氨基-4-十八碳烯),一个18 - 碳不饱和氨基醇。脂肪酸以鞘氨醇的产率神经酰胺的酰胺键。神经酰胺糖基化收益率胆碱神经酰胺产量鞘磷脂的酯化反应,和神经节苷脂。这些分子似乎在神经鞘脂类合成和分解调制过程,包括细胞凋亡的途径细胞膜的基本组分,和中间体

从头合成前进四步:棕榈酰 - 辅酶A和丝氨酸的反应以形成3- dehydrosphinganine,3- dehydrosphinganine来二氢鞘氨醇的减少,二氢鞘氨醇的反应和长链脂肪酰基-CoA至形式的二氢和二氢神经酰胺以形成神经酰胺的去饱和。

参与信令其它​​鞘脂类是从神经酰胺和它的生物合成衍生中间体。这些包括神经鞘氨醇(dihydrosphingosine)-1-磷酸,植物神经,鞘氨醇,和鞘氨醇-1-磷酸。

鞘磷脂是在从内质网(ER)膜中产生神经酰胺在高尔基体的膜的单个步骤中合成,并转移到高尔基体由CERT(神经酰胺转移蛋白),其与ER膜相关联的复合物与PPM1L COL4A3BP的同种型(蛋白质磷酸酶1-等)和VAPA或VAPB(VAMP相关蛋白A或B)。鞘磷脂合成的似乎主要在这个输送过程中通过CERT的可逆的磷酸化水平来调节。

这些方法还没有被实验在鸡中的研究,但与它们的人类对应这里推断。 作者:D’eustachio, P, 2009-08-22 中国海洋大学学报(自然科学版),2009,33 (4):457 - 461 编辑:D’eustachio, P, 2009-08-22 从左到右 2.3.1.50 棕榈酰 - 辅酶A +丝氨酸=> 3-dehydrosphinganine + CoASH + CO2 与内质网膜催化相关的棕榈酰辅酶A和丝氨酸的反应SPTLC(丝氨酸棕榈酰转移酶)复合物,以形成3- dehydrosphinganine。SPTLC2和SPTLC3多肽表现出的酶活性时或者与SPTLC1络合。这些鸡的蛋白质是已知的仅作为从鸡的基因组序列的预测基因的推断的产品;它们的功能性质与他们更好的研究哺乳动物直系同源物的推断。 棕榈酰辅酶A palmitoyl-CoA Reactome DB_ID:200993 胞浆 基因本体论 去:0005829. palmitoyl-CoA (ChEBI: 15525) palmitoyl-CoA Chebi. CHEBI: 15525 Reactome数据库ID版本77 200993 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=200993 反应途径 R-ALL-200993 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-200993.3 反应途径 http://www.reacectome.org. 化合物 C00154 额外的信息 MI. 小姐:0361 Ser L-丝氨酸 L-serine两性离子 L-丝氨酸 Reactome DB_ID:200736 L-丝氨酸两性离子[ChEBI:33384] L-serine两性离子 L-丝氨酸 InChI = 1 s / C3H7NO3 c4-2 (1 - 5) 3 (6) 7 / h2, 5 H, 1、4 h2 (H、6、7)/ t2 - / mo / s1 C3H7NO3. 105.09262 (2) 2-ammonio-3-hydroxypropanoate MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N [NH3 +] [C @@ H](CO)C(〔O - ])= O Chebi. CHEBI:33384 Reactome数据库ID版本77 200736 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=200736 反应途径 R-ALL-200736 5. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-200736.5 3-ketosphinganine 3 dehydrosphinganine Reactome DB_ID: 428182 内质网膜 基因本体论 GO:0005789 3-dehydrosphinganine (ChEBI: 17862) 3 dehydrosphinganine Chebi. CHEBI:17862 Reactome数据库ID版本77 428182 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=428182 反应途径 R-ALL-428182 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-428182.3 辅酶A-SH 辅酶A Reactome DB_ID: 76194 辅酶A [飞燕:15346] 辅酶A Chebi. CHEBI: 15346 Reactome数据库ID版本77 76194 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=76194 反应途径 r - - 76194 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-76194.3 化合物 C00010 二氧化碳 二氧化碳 Reactome DB_ID: 113528 二氧化碳(ChEBI: 16526) 二氧化碳 Chebi. CHEBI:16526 Reactome数据库ID版本77 113528 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113528 反应途径 R-ALL-113528 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113528.3 化合物 C00011 激活 从反垃圾中的EntitySet转换 sptlc2和3配合物 丝氨酸棕榈 Reactome DB_ID: 433539 SPTLC1:SPTLC2 丝氨酸棕榈酰转移酶2复合物 Reactome DB_ID: 433536 PXLP-SPTLC2 丝氨酸palmitoyltransferase 2 RCJMB04_19n23 Reactome DB_ID:433552 UniProt的:Q5ZJ96 RCJMB04_19n23 RCJMB04_19n23 辅助因子磷酸吡哆醛(通过相似性)。相似性属于第二类磷酸吡哆醛依赖性转氨酶家族。 背带吊裤带 NCBI分类法 9031. UniProt Q5ZJ96 N6-吡哆醛磷酸盐-1-赖氨酸 摩擦 国防部:00128 Reactome数据库ID版本77 433552 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433552 反应途径 R-GGA-433552 2. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433552.2 1. SPTLC1 丝氨酸palmitoyltransferase 1 Reactome DB_ID:433563 ENSEMBL:ENSGALP0000021940 SPTLC1 SPTLC1 ENSEMBL ENSGALP00000021940 Reactome数据库ID版本77 433563 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433563 反应途径 R-GGA-433563 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433563.1 1. Reactome数据库ID版本77 433536 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433536 反应途径 R-GGA-433536 7. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433536.7 SPTLC1:SPTLC3 丝氨酸棕榈酰转移3复合物 Reactome DB_ID: 433609 PXLP-SPTLC3 丝氨酸palmitoyltransferase 3 Reactome DB_ID:433620 UniProt的:F1NHR1 SPTLC3 SPTLC3 辅因子:名称=吡哆醛5'-磷酸;外部参照=飞燕:CHEBI:597326;证据= {ECO:0000256 |规则库:RU003693}; UniProt F1NHR1 Reactome数据库ID版本77 433620 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433620 反应途径 R-GGA-433620 2. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433620.2 1. 1. Reactome数据库ID版本77 433609 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433609 反应途径 R-GGA-433609 7. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433609.7 Reactome数据库ID版本77 433539 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433539 反应途径 R-GGA-433539 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433539.1 基因本体论 GO:0004758 细胞功能的基因本体论术语 MI. 小姐:0355 相同的催化剂活性 Reactome数据库ID版本77 433591 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433591 Reactome数据库ID版本77 433550 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433550 反应途径 R-GGA-433550 2. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433550.2 从左到右 1.1.1.102 3- dehydrosphinganine + NADPH + H + =>鞘氨醇+ NADP + KDSR (3-ketodihydrosphingosin reductase)与内质网膜胞质面相关,催化NADPH还原3-脱氢鞘氨酸形成鞘氨酸(dihydrosphingosin)。鸡的KDSR已知只是高通量实验中确定的cDNA的预测产物。这种反应是从它的充分研究的人类对应推断。 TPNH NADPH. Reactome DB_ID:29364 NADPH [飞燕:16474] NADPH. TPNH Chebi. CHEBI:16474 Reactome数据库ID版本77 29364 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29364 反应途径 r - - 29364 2. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29364.2 化合物 C00005 H + 质子 Reactome DB_ID:70106 昌[飞燕:15378] Chebi. CHEBI:15378 Reactome数据库ID版本77 70106 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=70106 反应途径 r - - 70106 4. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-70106.4 化合物 C00080 温泉 dihydrosphingosine 神经鞘氨醇 Reactome DB_ID:428163 sphinganine (ChEBI: 16566) 神经鞘氨醇 Chebi. CHEBI: 16566 Reactome数据库ID版本77 428163 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=428163 反应途径 r - - 428163 3. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-428163.3 TPN. NADP + NADP. NADP(+) 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸盐 的β-烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸 Triphosphopyridine核苷酸 Reactome DB_ID:29366 NADP(+)[飞燕:18009] NADP(+) Chebi. 车比:18009 Reactome数据库ID版本77 29366 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29366 反应途径 r - - 29366 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29366.3 化合物 C00006 激活 KDSR 3 ketodihydrosphingosine还原酶 FVT1 RCJMB04_8j12 Reactome DB_ID: 433580 UniProt: Q5ZKZ6 RCJMB04_8j12 RCJMB04_8j12 属于短链脱氢酶/还原酶(SDR)家族。 UniProt Q5ZKZ6 Reactome数据库ID版本77 433580 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433580 反应途径 r - gga - 433580 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433580.1 基因本体论 GO:0047560 Reactome数据库ID版本77 433540 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433540 Reactome数据库ID版本77 433576 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433576 反应途径 R-GGA-433576 2. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433576.2 从左到右 2.3.1.24 鞘氨酸+硬脂酰辅酶a =>二氢神经酰胺+ CoASH LASS(神经酰胺合酶/“长寿保证同系物”)的酶与内质网膜催化相关的神经鞘氨醇(dihydrosphingosine)的反应和长链脂肪酰基辅酶A如硬脂酰-CoA形成的二氢和CoASH。鸡LASS蛋白只知道从鸡的基因组序列的分析预测的开放阅读框的预测产品。这种反应是从它的充分研究的人类对应推断。 ST辅酶A 硬脂酰辅酶A 硬脂酰辅酶A Reactome DB_ID: 428139 stearoyl-CoA (ChEBI: 15541) 硬脂酰辅酶A Chebi. CHEBI: 15541 Reactome数据库ID版本77 428139 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=428139 反应途径 R-ALL-428139 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-428139.3 DHCE 的二氢 N-二acylsphinganine Reactome DB_ID: 428126 N-acylsphinganine (ChEBI: 31488) N-二acylsphinganine Chebi. 车比:31488 Reactome数据库ID版本77 428126 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=428126 反应途径 R-ALL-428126 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-428126.3 激活 从反垃圾中的EntitySet转换 LASS蛋白 LAG1同源物,神经酰胺合成酶 Reactome DB_ID: 433604 套索3 LAG1同源物,神经酰胺酶3 Reactome DB_ID: 433543 ENSEMBL:ENSGALP00000023528 LASS3 套索3 ENSEMBL ENSGALP00000023528 Reactome数据库ID版本77 433543 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433543 反应途径 R-GGA-433543 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433543.1 套索4 LAG1同源物,神经酰胺合成酶4 Reactome DB_ID: 433527 ENSEMBL:ENSGALP00000000406 LASS4 套索4 ENSEMBL ENSGALP00000000406 Reactome数据库ID版本77 433527 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433527 反应途径 r - gga - 433527 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433527.1 套索5 LAG1同源物,神经酰胺合成酶5 Reactome DB_ID: 433544 ENSEMBL:ENSGALP00000009966 LASS5 套索5 ENSEMBL ENSGALP00000009966 Reactome数据库ID版本77 433544 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433544 反应途径 R-GGA-433544 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433544.1 套索6 LAG1同源物,神经酰胺合成酶6 Reactome DB_ID:433569 ENSEMBL:ENSGALP00000017712 LASS6 套索6 ENSEMBL ENSGALP00000017712 Reactome数据库ID版本77 433569 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433569 反应途径 R-GGA-433569 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433569.1 Reactome数据库ID版本77 433604 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433604 反应途径 R-GGA-433604 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433604.1 基因本体论 GO:0050291 Reactome数据库ID版本77 433613 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433613 Reactome数据库ID版本77 433592 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433592 反应途径 R-GGA-433592 2. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433592.2 从左到右 1.14.19.17 的二氢+ NAD(P)H + H + + O 2 =>神经酰胺+ NAD(P)+ + H 2 O DEGS1(鞘脂增量(4)-desaturase 1 /“退行性精母细胞同系物1”)与内质网的胞质面相关的酶催化的二氢神经酰胺以形成神经酰胺去饱和。鸡DEGS1蛋白是已知的唯一的在高通量调查确定的cDNA的所推断的产物。这种反应是从它的充分研究哺乳动物对口推断。 O2 氧气 二氧 Reactome DB_ID:29368 分子氧(ChEBI: 15379) 二氧 Chebi. CHEBI:15379 Reactome数据库ID版本77 29368 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29368 反应途径 r - - 29368 5. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29368.5 化合物 C00007 从反垃圾中的EntitySet转换 NAD(P)H NADH,NADPH 还原吡啶核苷酸 Reactome DB_ID:428206 NADH. 反应数据库ID:73473 NADH (2 -) (ChEBI: 57945) NADH(2-) NADH二阶阴离子 腺苷5' - {3- [1-(3-氨基甲酰基-1,4-二氢吡啶-1-基)-1,4-脱水d核糖醇-5-基]}二磷酸 NADH. Chebi. 车比:57945 Reactome数据库ID版本77 73473 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=73473 反应途径 R-ALL-73473 4. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-73473.4 化合物 C00004 Reactome数据库ID版本77 428206 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=428206 反应途径 R-ALL-428206 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-428206.1 从反垃圾中的EntitySet转换 全国广告部(P)+ NAD +,NADP + 吡啶核苷酸,氧化 Reactome DB_ID:428218 n nad + NAD(+) 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 DPN. 二磷酸吡啶核苷酸 Reactome DB_ID:29360 NAD (1 -) (ChEBI: 57540) NAD(1-) 腺苷5 ' - {3 - (1 - (3-carbamoylpyridinio) 1, 4-anhydro-D-ribitol-5-yl)二磷酸} NAD(+) NAD阴离子 Chebi. CHEBI: 57540 Reactome数据库ID版本77 29360 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29360 反应途径 R-ALL-29360 5. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29360.5 化合物 C00003 Reactome数据库ID版本77 428218 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=428218 反应途径 R-ALL-428218 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-428218.1 Reactome DB_ID:29356 水[Chebi:15377] Chebi. Chebi:15377 Reactome数据库ID版本77 29356 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29356 反应途径 R-ALL-29356 5. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29356.5 化合物 C00001 塞拉 神经酰胺 Reactome DB_ID: 428256 神经酰胺[飞燕:17761] 神经酰胺 Chebi. CHEBI:17761 Reactome数据库ID版本77 428256 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=428256 反应途径 R-ALL-428256 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-428256.3 激活 DEGS1 鞘脂增量(4)-desaturase 1 Reactome DB_ID: 433587 UniProt的:Q5F3C1 DEGS1 DEGS1 DES1 RCJMB04_22e12 该功能具有鞘脂-δ-4-去饱和酶活性。将D-红-鞘氨醇转化为D-红-鞘氨醇(E-鞘氨醇-4-氨酸)(通过相似性)。催化视黄醇的平衡异构化(PubMed:23143414);这种相互作用通过DEGS1增加生色团前体的合成。组织特异性通过Mueller细胞在视网膜和视网膜色素上皮中表达(蛋白质水平)。相似性属于脂肪酸去饱和酶1型家族。DEGS亚科。 UniProt Q5F3C1 Reactome数据库ID版本77 433587 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433587 反应途径 r - gga - 433587 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433587.1 基因本体论 去:0042284 Reactome数据库ID版本77 433585 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433585 Reactome数据库ID版本77 433599 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433599 反应途径 R-GGA-433599 2. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433599.2 从左到右 的二氢+ NADPH + H + + O 2 =>植物神经+ NADP + + H2O 与内质网的胞质面相关DEGS2(鞘脂C4-羟化酶2 /退行性精母细胞同源物2)酶催化的二氢以形成植物神经羟化。鸡DEGS2已知仅由鸡基因组的分析,鉴定的开放阅读框的推断的蛋白质产物。这种反应是从它的充分研究哺乳动物对口推断。 phytoceramide N-二acylphytosphingosine 植物神经酰胺-II 的PHY-ENT-participant88334 Reactome DB_ID:9025544 N-酰基植磷皂甙[ChEBI:31998] N-二acylphytosphingosine Chebi. CHEBI:31998 Reactome数据库ID版本77 9025544 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9025544 反应途径 R-ALL-9025544 3. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-9025544.3 激活 DEGS2 鞘脂增量(4)-desaturase 2 Reactome DB_ID: 433522 ENSEMBL:ENSGALP0000018264 DEGS2 DEGS2 ENSEMBL ENSGALP00000018264 Reactome数据库ID版本77 433522 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433522 反应途径 r - gga - 433522 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433522.1 基因本体论 GO:0000170 Reactome数据库ID版本77 433616 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433616 Reactome数据库ID版本77 433593 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433593 反应途径 R-GGA-433593 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433593.3 从左到右 3.5.1.23 神经酰胺+ H2O =>硬脂酸+鞘氨醇[内质网] ACER1(碱性神经酰胺1),具有内质网的膜相关,催化神经酰胺的水解产生游离脂肪酸(这里标注为硬脂酸酯)和鞘氨醇。鸡ACER1已知仅通过鸡基因组的ananlysis发现一个开放阅读框推测的蛋白质产物。这种反应是从它的充分研究哺乳动物对口推断。 SPG. 鞘氨醇 Reactome DB_ID: 428193 鞘氨醇[ChEBI:16393] 鞘氨醇 Chebi. CHEBI:16393 Reactome数据库ID版本77 428193 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=428193 反应途径 R-ALL-428193 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-428193.3 牛排 硬脂酸 镁二硬脂酸酯 Reactome DB_ID: 428198 早期核内 基因本体论 去:0005769. 二硬脂酸镁[飞燕:9254] 镁二硬脂酸酯 Chebi. CHEBI:9254 Reactome数据库ID版本77 428198 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=428198 反应途径 R-ALL-428198 3. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-428198.3 激活 ACER1 碱性神经酰胺1 Reactome DB_ID: 433572 ENSEMBL:ENSGALP00000002414 ACER1 ACER1 ENSEMBL ENSGALP00000002414 Reactome数据库ID版本77 433572 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433572 反应途径 R-GGA-433572 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433572.1 基因本体论 去:0017040 Reactome数据库ID版本77 433548 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433548 Reactome数据库ID版本77 433608 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433608 反应途径 R-GGA-433608 2. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433608.2 从左到右 植物神经酰胺+ H2O =>硬脂酸+植物鞘氨醇 ACER3(碱性神经酰胺酶3)催化植物神经酰胺水解生成自由脂肪酸(此处注释为硬脂酸)和植物鞘氨醇。据悉,鸡的ACER3蛋白是通过对鸡基因组进行分析发现的开放阅读框的预测产物。这种反应是从它的充分研究哺乳动物对口推断。 植物鞘氨醇 Reactome DB_ID:428237 植物鞘氨醇[飞燕:46961] 植物鞘氨醇 Chebi. CHEBI:46961 Reactome数据库ID版本77 428237 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=428237 反应途径 R-ALL-428237 2. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-428237.2 激活 ACER3 碱性神经酰胺3 Reactome DB_ID: 433534 运用:ENSGALP00000030736 ACER3 ACER3 ENSEMBL ENSGALP00000030736 Reactome数据库ID版本77 433534 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433534 反应途径 R-GGA-433534 1. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433534.1 基因本体论 去:0070774 Reactome数据库ID版本77 433600 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433600 Reactome数据库ID版本77 433578 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433578 反应途径 r - gga - 433578 3. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433578.3 从左到右 2.7.1.91 鞘氨醇(二氢鞘氨醇)+ATP=>1-磷酸鞘氨醇+ADP SPHK1(鞘氨醇激酶1)催化神经鞘氨醇(dihydrosphingosine)和ATP的形式向1 dihydrosphingosine磷酸和ADP的反应。鸡肉蛋白质SPHK1已知仅通过鸡基因组的分析中发现的开放阅读框的推断的产物。这种反应是从它的充分研究哺乳动物对口推断。 三磷酸腺苷 三磷酸腺苷 ATP (4) Reactome DB_ID: 113592 ATP(4-)[飞燕:30616] ATP (4) 三磷酸腺苷 三磷酸腺苷 三磷酸腺苷 Chebi. CHEBI: 30616 Reactome数据库ID版本77 113592 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=113592 反应途径 r - - 113592 5. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113592.5 化合物 C00002 SPAP dihydrosphingosine -1-磷酸 神经鞘氨醇-1-磷酸 Reactome DB_ID:428275 1-磷酸蝶呤[ChEBI:16893] 神经鞘氨醇-1-磷酸 Chebi. CHEBI:16893 Reactome数据库ID版本77 428275 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=428275 反应途径 R-ALL-428275 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-428275.3 ADP 腺苷二磷酸 ADP(3-) Reactome DB_ID:29370 ADP(3-[ChEBI:456216] ADP(3-) ADP 事情就让它5,- o - [(phosphonatooxy) phosphinato]腺苷 ADP TriaNion. Chebi. CHEBI:456216 Reactome数据库ID版本77 29370 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29370 反应途径 r - - 29370 5. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29370.5 化合物 C00008 激活 SPHK1 鞘氨醇激酶1 Reactome DB_ID:433559 ENSEMBL:ENSGALP00000038332 SPHK1 SPHK1 ENSEMBL ENSGALP00000038332 Reactome数据库ID版本77 433559 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433559 反应途径 R-GGA-433559 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433559.1 基因本体论 GO:0008481 Reactome数据库ID版本77 433565 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433565 Reactome数据库ID版本77 433606 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433606 反应途径 R-GGA-433606 2. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433606.2 Reactome数据库ID版本77 433584 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=433584 反应途径 r - gga - 433584 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-433584.1 基因本体论 GO:0006665 对细胞过程基因本体论术语 MI. 小姐:0359 从左到右 1.1.1.37 草酰乙酸+NADH+H+<=>苹果酸+NAD+ 草酰乙酸被NADH+H+可逆还原,形成苹果酸和NAD+。没有发现能够催化该反应的鸡酶,尽管在ENSEMBL鸡基因集中已经通过计算确定了一个开放阅读框,该阅读框能够编码一种与真正的人类线粒体苹果酸脱氢酶(MDH2)非常相似的蛋白质。这种反应是从人类对应物推断出来的。 著作:D'Eustachio,P,2008-09-10 19点15分十一秒 评论:哈里斯,RA,2008-09-1018:47:12 编辑:D’eustachio, P, 2008-09-10 19:15:11 高龄津贴 草酸乙酸盐 草酰乙酸 草酰乙酸 2-氧代丁二酸 Oxosuccinic酸 Reactome DB_ID: 113587 线粒体矩阵 基因本体论 GO:0005759 草酰乙酸(ChEBI: 30744) 草酰乙酸 Chebi. CHEBI:30744 Reactome数据库ID版本77 113587 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113587 反应途径 R-ALL-113587 4. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113587.4 化合物 C00036 H + Reactome DB_ID: 113529 Reactome数据库ID版本77 113529 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113529 反应途径 R-ALL-113529 4. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113529.4 化合物 C00080 NADH. Reactome DB_ID:29362 Reactome数据库ID版本77 29362 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29362 反应途径 r - - 29362 3. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29362.3 化合物 C00004 mal (S) -苹果酸 (S) -苹果酸 L-苹果 L-苹果酸 L-Malic酸 L-2-羟基丁二酸 Reactome DB_ID:113544 (S) -苹果酸[ChEBI:30797] (S) -苹果酸 Chebi. CHEBI:30797 Reactome数据库ID版本77 113544 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113544 反应途径 R-ALL-113544 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113544.3 化合物 C00149 n nad + NAD(+) 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 DPN. 二磷酸吡啶核苷酸 nad + Reactome DB_ID: 113526 Reactome数据库ID版本77 113526 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113526 反应途径 R-ALL-113526 5. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113526.5 化合物 C00003 激活 MDH2 Reactome DB_ID:372414 运用:ENSGALP00000003012 MDH2 MDH2 苹果酸脱氢酶,线粒体 ENSEMBL ENSGALP00000003012 Reactome数据库ID版本77 372414 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=372414 反应途径 r - gga - 372414 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-372414.1 基因本体论 去:0030060 Reactome数据库ID版本77 372413 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=372413 Reactome数据库ID版本77 372422 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=372422 反应途径 R-GGA-372422 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-372422.1 Reactome数据库ID版本77 372442 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=372442 反应途径 r - gga - 372442 1. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-372442.1 基因本体论 去:0006629.