bioax途径由Reactome数据库中的“(S)-苹果酸酯+ NAD+ <=>草酰乙酸酯+ NADH + H+”转化而来。 左到右 1.1.1.37 (S)-苹果酸+ NAD+ <=>草酰乙酸+ NADH + H+ 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp n NAD + NAD (+) 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 DPN Diphosphopyridine核苷酸 NAD + Reactome DB_ID: 113526 线粒体基质 基因本体论 去:0005759 nad(1-)[Chebi:57540] NAD (1 -) 腺苷5' - {3- [1-(3-氨基酰基吡啶吡啶)-1,4-α-苯基-1核糖酚-5-基]二磷酸} NAD (+) NAD阴离子 ChEBI CHEBI: 57540 Reactome数据库ID Release 77 113526 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113526 Reactome r - - 113526 5 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113526.5 Reactome //www.joaskin.com 复合 C00003. 额外的信息 心肌梗死 小姐:0361 MAL (S)苹果酸 (S)苹果酸 L-Malate L-Apple酸 L-Malic酸 L-2-Hydroxybutanedioic酸 Reactome DB_ID: 113544 (S)苹果酸(ChEBI: 30797) (S)苹果酸 ChEBI CHEBI: 30797 Reactome数据库ID Release 77 113544 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113544 Reactome r - - 113544 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113544.3 复合 C00149 OAA 草酰乙酸 草酰乙酸 丁酮二酸 2-oxobutanedioic酸 Oxosuccinic酸 反应DB_ID:113587 草酰乙酸(ChEBI: 30744) 草酰乙酸 ChEBI CHEBI: 30744 Reactome数据库ID Release 77 113587 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=113587 Reactome r-all-113587 4 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113587.4 复合 C00036 H + 海昌 Reactome DB_ID: 113529 海昌(ChEBI: 15378) 海昌 ChEBI CHEBI: 15378 Reactome数据库ID Release 77 113529 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113529 Reactome r - - 113529 4 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113529.4 复合 C00080 NADH Reactome DB_ID: 29362 NADH (2 -) (ChEBI: 57945) NADH (2 -) NADH二阶阴离子 腺苷5 ' - {3 - (1 - (3-carbamoyl-1 4-dihydropyridin-1-yl) 1, 4-anhydro-D-ribitol-5-yl]二磷酸} NADH ChEBI CHEBI: 57945 Reactome数据库ID Release 77 29362 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29362 Reactome r-all-29362 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29362.3 复合 C00004. 激活 MDH2二聚体 反应DB_ID:10412207 MDH2. MDH2. E1BVT3 反应DB_ID:10412205 UniProt: E1BVT3 MDH2. 背带吊裤带 NCBI分类法 9031 UniProt E1BVT3 25 平等的 338. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10412205. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10412205 Reactome r - gga - 70977 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-gga-70977.1 2 Reactome数据库ID Release 77 10412207 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10412207 Reactome r - gga - 198511 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-gga-198511.1.1 基因本体论 去:0030060 细胞功能的基因本体论术语 心肌梗死 小姐:0355 相同的催化剂活性 Reactome数据库ID Release 77 10412208 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10412208 Reactome数据库ID Release 77 10412210 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10412210 Reactome r - gga - 70979 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-GGA-70979.1 线粒体苹果酸脱氢酶催化苹果酸和NAD+的可逆反应生成草酰乙酸和NADH + H+ (Luo et al. 2006)。这个反应是高度能的,但在三羧酸循环运行时被拉向这里标注的方向。未公布的晶体数据表明该蛋白质是二聚体(PDB 3E04)。 16740313 PubMed. 2006年 nadh -四唑偶联对线粒体和粗组织匀浆中苹果酸脱氢酶的敏感性分析 罗,C. 王,X 长,我 刘,我 J Biochem biophysics Methods 68:101-11 从电子注释推断 证据的代码 生态:0000203