bioax途径由Reactome数据库中的“草酰乙酸酯+ NADH + H+ <=> (S)-苹果酸酯+ NAD+”转化而来。 1.1.1.37 草酰乙酸+ NADH + H+ <=> (S)-苹果酸+ NAD+ 草酰乙酸+ NADH + H+ <=> (S)-苹果酸+ NAD+ 这一事件是从另一物种的事件中计算推断出来的。

这一推断是基于PANTHER的同源映射。简单地说,所有涉及到PhysicalEntities(在输入,输出和催化剂)的反应都有一个映射的正交/类比(对于复合物,至少75%的组件必须有一个映射)被推断为其他物种。还可以推断这些事件的高级事件,以方便导航。

关于PANTHER的详细信息参见:http://www.pantherdb.org/about.jsp Reactome DB_ID: 113587 1 线粒体基质 0005759 草酰乙酸(ChEBI: 30744) 草酰乙酸 Reactome //www.joaskin.com ChEBI 30744 Reactome DB_ID: 113529 1 海昌(ChEBI: 15378) 海昌 ChEBI 15378 Reactome DB_ID: 29362 1 NADH (2 -) (ChEBI: 57945) NADH (2 -) NADH二阶阴离子 腺苷5 ' - {3 - (1 - (3-carbamoyl-1 4-dihydropyridin-1-yl) 1, 4-anhydro-D-ribitol-5-yl]二磷酸} NADH ChEBI 57945 Reactome DB_ID: 113526 1 NAD (1 -) (ChEBI: 57540) NAD (1 -) NAD (+) 腺苷5 ' - {3 - (1 - (3-carbamoylpyridinio) 1, 4-anhydro-D-ribitol-5-yl)二磷酸} NAD阴离子 ChEBI 57540 Reactome DB_ID: 113544 1 (S)苹果酸(ChEBI: 30797) (S)苹果酸 ChEBI 30797 PHYSIOL-LEFT-TO-RIGHT 激活 Reactome DB_ID: 9733003 MDH2二聚体[线粒体基质] MDH2二聚体 Reactome DB_ID: 9733001 2 UniProt: P08249 Mdh2 亩骶 NCBI分类法 10090 UniProt P08249 链坐标 25 平等的 338 平等的 Reactome数据库ID Release 77 9733003 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9733003 Reactome r - mmu - 198511 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-MMU-198511.1 0030060 去分子功能 Reactome数据库ID Release 77 9733004 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9733004 Reactome数据库ID Release 77 9733632 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=9733632 Reactome r - mmu - 71783 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-MMU-71783.1 线粒体苹果酸脱氢酶催化草酰乙酸和NADH + H+的可逆反应生成苹果酸和NAD+ (Luo et al. 2006)。未公布的晶体数据表明该蛋白质是二聚体(PDB 3E04)。 16740313 Pubmed 2006 nadh -四唑偶联对线粒体和粗组织匀浆中苹果酸脱氢酶的敏感性分析 C罗, 王,X 长,我 刘,我 J Biochem biophysics Methods 68:101-11 9792106 Pubmed 1998 线粒体苹果酸脱氢酶的聚集状态 桑切斯,SA Hazlett, TL 深色的,我 詹姆逊,DM 蛋白质科学7:2184 - 2189 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构