在反应数据库中从“从封端酶GT位点转移到mRNA的5'-末端的GMP转移到mRNA”的生物气相转换。 2.7.7.50 将GMP从封端酶GT位点转移到mRNA的5'末端 将GMP从封端酶GT位点转移到mRNA的5'末端 mRNA的二磷酸5'-末端连接到GMP,从酶中释放。此时,尚不清楚RNA二磷酸盐末端从三磷酸酶的活性位点转移到观音酶网站的情况。必须在没有RNA的情况下形成共价酶-MPP复合物。

PPN(PN)N + GTP - > GPPPN(PN)N + PPI

(雅加达-okabe等。1998年)。 撰写:Buratowski,S,2003-10-15 15:18:41 Reactome DB_ID: 77065 1 骨髓 0005654 封盖复合物(中间)[核质] 封盖复杂(中级) 反应DB_ID:29428 1 DNA[核质] 脱氧核糖核酸 脱氧核糖核酸 Reactome //www.joaskin.com Reactome DB_ID: 111341 1 具有水解5'-端[核质]的新生前体mRNA 具有水解5'端的新生前mrna Reactome DB_ID: 111343 1 共价CE:GMP中间复合物[核质] 共价CE:GMP中间体复合物 反应DB_ID:29626 1 鸟嘌呤核苷5 '一磷酸(ChEBI: 17345) 鸟苷酸5'-一磷酸 ChEBI 17345 反应DB_ID:77061 1 CE:Pol II CTD:Spt5 complex[核质] CE:Pol II CTD:Spt5 complex Reactome DB_ID: 113404 1 RNA聚合酶II(磷酸化):TFIIF复合物[核浆] RNA聚合酶II(磷酸化):TFIIF复合物 Reactome DB_ID: 109631 1 TFIIF(核浆) TFIIF Reactome DB_ID: 65565 1 UniProt: P35269 GTF2F1 GTF2F1 GTF2F1 RAP74 功能TFIIF是一种与RNA聚合酶II结合的通用转录起始因子,有助于与TFIIB协同将其招募到起始复合物中。它促进转录延伸。α和β亚单位的亚单位异二聚体。与GTF2F2、CTDP1、TAF6/TAFII80和URI1相互作用。与GTF2B相互作用(通过C末端,优先通过乙酰化形式);这种相互作用阻止了GTF2B与GTF2F2的结合(PubMed:8662660,PubMed:12931194)。肠病毒71(EV71)感染后诱导上调。PTM通过TAF1和酪蛋白激酶II样激酶在Ser和其他残基上磷酸化。相似性属于TFIIFα亚单位家族。据报道,在Ser-385和Thr-389上具有蛋白激酶活性和自磷酸化。 智人 NCBI分类学 9606. uniprot. P35269 链坐标 2 相等的 517 相等的 Reactome DB_ID: 65567 1 UNIPROT:P13984 GTF2F2 GTF2F2 RAP30 GTF2F2 功能TFIIF是与RNA聚合酶II结合的一般转录起​​始因子,并有助于将其募集到与TFIIB合作的引发复合物中。它促进转录伸长率。该亚基显示ATP依赖性DNA-螺旋酶活性。α和β亚基的ubunit异二聚体。与HTATSF1和GPBP1(相似性)进行交互。与Uri1交互。与GTF2B相互作用(通过N-Terminus);在GTF2F1(PubMed:8504927,PubMed:8662660)存在下,这种相互作用受到抑制。纤薄属于TFIIFβ亚基家族。 uniprot. P13984 2 相等的 249. 相等的 Reactome数据库ID Release 77 109631 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=109631 Reactome r - hsa - 109631 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-109631.1 Reactome DB_ID: 113716 1 RNA聚合酶II全酶复合物(磷酸化)[核质] RNA聚合酶II全酶复合物(磷酸化) Reactome DB_ID: 63517 1 UNIPROT:P62487 POLR2G polr2g RPB7 polr2g 功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶II的组成部分,它合成mRNA前体和许多功能非编码RNA。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。它由相互相对移动的可移动元素组成。RPB7是RPB4亚复合物的一部分,它与位于钳位元件底部的由RPB1、RPB2和RPB6组成的口袋结合。RBP4-RPB7亚复合体似乎通过RPB7封闭的构象锁定钳位,从而阻止双链DNA进入活性位点裂隙。RPB4-RPB7亚复合体结合单链DNA和RNA(通过相似性)。结合RNA。亚单位RNA聚合酶II (Pol II)复合物的组成部分,由12个亚单位组成。RPB4和RPB7形成一个从10亚基Pol II核心复合物突出的亚复合物。属于真核生物RPB7/RPC8 RNA聚合酶亚基家族。 uniprot. P62487. 1 相等的 172 相等的 反应DB_ID:63537 1 UniProt: P53803 POLR2K polr2k. polr2k. 功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶I、II和III的共同组分,分别合成核糖体RNA前体、mRNA前体和许多功能性非编码RNA,以及小RNA,如5S rRNA和tRNAs。亚单位RNA聚合酶I (Pol I)、RNA聚合酶II (Pol II)和RNA聚合酶III (Pol III)复合物的组成,分别由至少13、12和17个亚单位组成。属于古菌RpoP/真核生物RPC10 RNA聚合酶亚基家族。 uniprot. P53803 1 相等的 58 相等的 反应DB_ID:83713 1 UniProt: P19388 POLR2E polr2e. polr2e. 功能依赖于DNA的RNA聚合酶使用四种核糖核苷三磷酸作为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶I、II和III的共同成分,分别合成核糖体RNA前体、mRNA前体和许多功能性非编码RNA以及小RNA,如5S rRNA和tRNA。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。POL由相对移动的移动元件组成。在Pol II中,POLR2E/RPB5是中央大裂周围下颚的一部分,被认为可以抓住进入的DNA模板。RNA聚合酶I(Pol I)、RNA聚合酶II(Pol II)和RNA聚合酶III(Pol III)复合物的亚单位成分分别由至少13、12和17个亚单位组成(通过相似性)。在RNA Pol II中,该亚基以2倍摩尔过量存在于其他亚基中。与URI1相互作用。亚单位(微生物感染)与HBV蛋白X相互作用。相似性属于古细菌RpoH/真核RPB5 RNA聚合酶亚单位家族。 uniprot. P19388 1 相等的 210. 相等的 Reactome DB_ID: 63504 1 UNIPROT:P30876 POLR2B polr2b. polr2b. 功能依赖于DNA的RNA聚合酶使用四种核糖核苷三磷酸作为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶II的第二大组成部分,合成mRNA前体和许多功能性非编码RNA。建议有助于聚合酶催化活性,并与最大的亚单位一起形成聚合酶活性中心。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。它由相对移动的可移动元素组成。RPB2是具有中央大裂口的核心元件的一部分,夹钳元件移动以打开和关闭裂口,钳口被认为抓住进入的DNA模板(通过相似性)。RNA聚合酶II(Pol II)复合物的亚单位成分由12个亚单位组成。与WDR82交互。与MEN1相互作用。三磷酸核糖核苷与RNA聚合酶II转录复合物的结合可能涉及两步机制。初始结合似乎发生在入口(E)位置,涉及由两个最大RNA Pol II亚单位的三个保守天冬氨酸残基(通过相似性)协调的镁离子。相似性属于RNA聚合酶β链家族。 uniprot. P30876. 1 相等的 1174 相等的 反应DB_ID:83714 1 UniProt: P61218 POLR2F polr2f. polr2f. POLRF 功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶I、II和III的常见组分,分别合成核糖体RNA前体、mRNA前体和许多功能性非编码RNA,以及小RNA,如5S rRNA和tRNAs。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。Pols是由相互相对移动的可移动元素组成的。在Pol II中,POLR2F/RPB6是钳位元件的一部分,与RPB1和RPB2的部分组成一个口袋,RPB4-RPB7亚复合物与之结合(通过相似性)。亚单位RNA聚合酶I (Pol I)、RNA聚合酶II (Pol II)和RNA聚合酶III (Pol III)复合物的组成,分别由至少13、12和17个亚单位组成。属于古菌RpoK/真核生物RPB6 RNA聚合酶亚基家族。 uniprot. P61218 2 相等的 127. 相等的 Reactome DB_ID: 77100 1 UniProt: P24928 POLR2A polr2a. POLR2 polr2a. 功能依赖于DNA的RNA聚合酶使用四种核糖核苷三磷酸作为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶II的最大催化成分,合成mRNA前体和许多功能性非编码RNA。与第二大亚单位一起形成聚合酶活性中心。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。它由相对移动的可移动元素组成。RPB1是中央大裂口核心元件的一部分,夹钳元件移动以打开和关闭裂口,而颌骨被认为可以抓住进入的DNA模板。在转录开始时,启动子的单链DNA模板链位于Pol II的中心活性位点裂缝内。一条桥连螺旋从RPB1发出并穿过催化位点附近的裂缝,被认为是通过棘轮作用促进Pol II的易位,棘轮通过核苷酸添加的每一步从直构象切换到弯曲构象,使RNA-DNA杂交穿过活性位点。在转录延伸期间,Pol II随着转录物的延伸在模板上移动。延长受Pol II最大亚单位(RPB1)C-末端结构域(CTD)的磷酸化状态影响,该结构域是调节转录起始、延长、终止和mRNA处理的因子组装的平台。基因表达水平的调节取决于tha CTD赖氨酸甲基化和乙酰化水平之间的平衡(通过相似性)。生长因子诱导的即刻早期基因转录的起始或早期延伸步骤由CTD的乙酰化状态调节(PubMed:24207025)。甲基化和二甲基化(通过相似性)对靶基因表达有抑制作用。功能(微生物感染)与肝炎三角洲病毒的小三角洲抗原相关时,作为RNA依赖性RNA聚合酶,作为病毒RNA循环基因组的复制和转录酶。RNA聚合酶II(Pol II)复合物的亚单位成分,由12个亚单位组成。复合物的组分,其至少由HTATSF1/Tat-SF1、P-TEFb复合物组分CDK9和CCNT1、RNA聚合酶II、SUPT5H和NCL/核仁蛋白组成。参与转录终止抑制的大型PER复合物至少由PER2、CDK9、DDX5、DHX9、NCBP1和POLR2A(活性)组成。(通过C末端结构域(CTD))与U2AF2相互作用;将PRPF19和Prp19复合物招募到前mRNA,并可能将转录与前mRNA剪接结合。(通过C-末端结构域(CTD))与SMN1/SMN2相互作用;将SMN1/SMN2招募到RNA Pol II延伸复合物。仅在WDR82存在时,通过磷酸化C端结构域与WDR82以及SETD1A和SETD1B相互作用。当在“Ser-5”磷酸化时,与MEN1相互作用;未磷酸化的形式或在“Ser-2”处磷酸化的形式不相互作用。当在“Ser-2”处磷酸化时,与SUPT6H相互作用(通过SH2结构域)。与RECQL5和TCEA1交互;RECQL5的绑定阻止TCEA1绑定。磷酸化C末端结构域与FNBP3和SYNCRIP相互作用。与ATF7IP交互。与DDX5交互。与WWP2交互。与SETX交互。与PIH1D1相互作用(磷酸化)。与TDRD3相互作用(通过C端域(CTD))。与PRMT5交互。与XRN2交互。与SAFB/SAFB1交互。与CCNL1交互。与CCNL2、MYO1C、PAF1和SFRS19相互作用。与CMTR1、CTDSP1和SCAF8相互作用(通过C-末端)。与CCNT2(PubMed:15563843)交互(通过C-终端域(CTD))。与FUS交互。与MCM3AP亚型GANP相互作用(PubMed:23652018)。与激酶SRPK2相互作用;这种相互作用发生在不适当的R-环(PubMed:28076779)的共转录形成过程中。亚单位(微生物感染)与单纯疱疹病毒1蛋白ICP22相互作用;这种相互作用导致参与转录的pol II的CTD‘Ser-2’磷酸化缺失(PubMed:23029222)。结构域C-末端结构域(CTD)是调节转录起始、延伸、,终止和mRNA处理。PTM C末端结构域(CTD)中的串联七肽重复序列可以高度磷酸化(PubMed:28076779)。磷酸化激活PolⅡ。磷酸化主要发生在七肽重复序列的“Ser-2”和“Ser-5”残基处,至少由CDK7和CDK9介导。与DNA相关的POLR2A的CDK7磷酸化通过触发与DNA的分离来促进转录起始。磷酸化也发生在七肽重复序列的“Ser-7”处,七肽重复序列是snRNA基因高效转录和转录物处理所必需的。磷酸化状态被认为是由位点特异性CTD激酶和磷酸酶的平衡作用以及指定position of Pol II within the transcription cycle has been proposed. Dephosphorylated by the protein phosphatase CTDSP1.PTM Among tandem heptapeptide repeats of the C-terminal domain (CTD) some do not match the Y-S-P-T-S-P-S consensus, the seventh serine residue 'Ser-7' being replaced by a lysine. 'Lys-7' in these non-consensus heptapeptide repeats can be alternatively acetylated, methylated and dimethylated. EP300 is one of the enzyme able to acetylate 'Lys-7'. Acetylation at 'Lys-7' of non-consensus heptapeptide repeats is associated with 'Ser-2' phosphorylation and active transcription. Regulates initiation or early elongation steps of transcription specially for inducible genes.PTM Methylated at Arg-1810 prior to transcription initiation when the CTD is hypophosphorylated, phosphorylation at Ser-1805 and Ser-1808 preventing this methylation. Symmetrically or asymmetrically dimethylated at Arg-1810 by PRMT5 and CARM1 respectively. Symmetric or asymmetric dimethylation modulates interactions with CTD-binding proteins like SMN1/SMN2 and TDRD3. SMN1/SMN2 interacts preferentially with the symmetrically dimethylated form while TDRD3 interacts with the asymmetric form. Through the recruitment of SMN1/SMN2, symmetric dimethylation is required for resolving RNA-DNA hybrids created by RNA polymerase II, that form R-loop in transcription terminal regions, an important step in proper transcription termination. CTD dimethylation may also facilitate the expression of select RNAs. Among tandem heptapeptide repeats of the C-terminal domain (CTD) some do not match the Y-S-P-T-S-P-S consensus, the seventh serine residue 'Ser-7' being replaced by a lysine. 'Lys-7' in these non-consensus heptapeptide repeats can be alternatively acetylated, methylated, dimethylated and trimethylated. Methylation occurs in the earliest transcription stages and precedes or is concomitant to 'Ser-5' and 'Ser-7' phosphorylation. Dimethylation and trimehtylation at 'Lys-7' of non-consensus heptapeptide repeats are exclusively associated with phosphorylated CTD.PTM Ubiquitinated by WWP2 leading to proteasomal degradation (By similarity). Following UV treatment, the elongating form of RNA polymerase II (RNA pol IIo) is ubiquitinated on UV damage sites without leading to degradation: ubiquitination is facilitated by KIAA1530/UVSSA and promotes RNA pol IIo backtracking to allow access to the nucleotide excision repair machinery.MISCELLANEOUS The binding of ribonucleoside triphosphate to the RNA polymerase II transcribing complex probably involves a two-step mechanism. The initial binding seems to occur at the entry (E) site and involves a magnesium ion temporarily coordinated by three conserved aspartate residues of the two largest RNA Pol II subunits. The ribonucleoside triphosphate is transferred by a rotation to the nucleotide addition (A) site for pairing with the template DNA. The catalytic A site involves three conserved aspartate residues of the RNA Pol II largest subunit which permanently coordinate a second magnesium ion.SIMILARITY Belongs to the RNA polymerase beta' chain family. uniprot. P24928 O-phospho-L-serine下午5 5. 相等的 O-磷酸-L-丝氨酸[MOD:00046] 1 相等的 1970 相等的 Reactome DB_ID: 63525 1 UniProt: P36954 POLR2I polr2i. polr2i. 功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶II的组成部分,它合成mRNA前体和许多功能非编码RNA。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。它由相互相对移动的可移动元素组成。RPB9是围绕中心大裂缝的上颌的一部分,并思考抓住进入的DNA模板(按相似性)。RNA聚合酶II(POL II)组成的组分组成,由12个亚基组成。Piemareity属于古代RPOM /真核RPA12 / RPB9 / RPC11 RNA聚合酶家族。 uniprot. P36954 1 相等的 125. 相等的 Reactome DB_ID: 63523 1 UniProt: P52434 POLR2H polr2h polr2h 功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶I、II和III的共同组分,分别合成核糖体RNA前体、mRNA前体和许多功能性非编码RNA,以及小RNA,如5S rRNA和tRNAs。亚单位RNA聚合酶I (Pol I)、RNA聚合酶II (Pol II)和RNA聚合酶III (Pol III)复合物的组成,分别由至少13、12和17个亚单位组成。直接与POLR2A交互。属于真核生物RPB8 RNA聚合酶亚基家族。 uniprot. P52434 2 相等的 150 相等的 Reactome DB_ID: 63506 1 UniProt: P19387 POLR2C polr2c. A-152E5.7 polr2c. 功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶II的组成部分,它合成mRNA前体和许多功能非编码RNA。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。它由相互相对移动的可移动元素组成。RPB3是核心元件的一部分与中央大裂缝和钳位元件的移动打开和关闭的裂缝(通过相似)。亚单位RNA聚合酶II (Pol II)复合物的组成部分,由12个亚单位组成。RPB11/POLR2J和RPB3/POLR2C亚基相互作用。属于古菌RpoD/真核生物RPB3 RNA聚合酶亚基家族。 uniprot. P19387 2 相等的 275 相等的 反应DB_ID:63531 1 UniProt: P52435 POLR2J polr2j. polr2j1. polr2j. 功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶II的组成部分,它合成mRNA前体和许多功能非编码RNA。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。它由相互相对移动的可移动元素组成。RPB11是具有中央大裂缝的核心元素的一部分(通过相似性)。亚单位RNA聚合酶II (Pol II)复合物的组成部分,由12个亚单位组成。与AATF交互。组织特异性广泛表达。在心脏和骨骼肌中有高表达。属于古菌RpoL/真核生物RPB11/RPC19 RNA聚合酶亚基家族。 uniprot. P52435 1 相等的 117. 相等的 Reactome DB_ID: 63508 1 UniProt: O15514 POLR2D polr2d. polr2d. 功能依赖DNA的RNA聚合酶以四种核糖核苷三磷酸为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶II的组成部分,它合成mRNA前体和许多功能非编码RNA。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。它由相互相对移动的可移动元素组成。RPB4是具有RPB7的子拷贝的一部分,其与夹具元件底部的RPB1,RPB2和RPB6形成的袋。RBP4-RPB7亚复合体似乎通过RPB7封闭的构象锁定钳位,从而阻止双链DNA进入活性位点裂隙。RPB4-RPB7子拷贝用与由12个亚基组成的RNA聚合酶II(POL II)复合物结合单链DNA和RNA(通过相似性)。RPB4和RPB7形成了从10分亚极核II核心复合物突出的子拷贝。相似性属于真核RPB4 RNA聚合酶亚基家族。 uniprot. O15514 1 相等的 142 相等的 反应DB_ID:83715 1 UniProt:P62875 POLR2L polr2l. polr2l. 功能依赖于DNA的RNA聚合酶使用四种核糖核苷三磷酸作为底物催化DNA转录成RNA。RNA聚合酶I、II和III的共同成分,分别合成核糖体RNA前体、mRNA前体和许多功能性非编码RNA,以及小RNA,如5S rRNA和tRNA。Pol II是基础RNA聚合酶II转录机制的核心组成部分。POL由相对移动的移动元件组成。在Pol II中,POLR2L/RBP10是具有中央大裂口的核心元件的一部分(通过相似性)。RNA聚合酶I(Pol I)、RNA聚合酶II(Pol II)和RNA聚合酶III(Pol III)复合物的亚单位成分至少由13、12和17个亚单位组成,相似性分别属于古细菌RpoN/真核生物RPB10 RNA聚合酶亚单位家族。 uniprot. P62875 1 相等的 67 相等的 Reactome数据库ID Release 77 113716. 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=113716 Reactome R-HSA-113716 1 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-113716.1 Reactome数据库ID Release 77 113404. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=113404 Reactome r - hsa - 113404 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-113404.1 Reactome DB_ID: 111260 1 模板DNA:30 nt转录本杂交[核质] 模板DNA: 30nt杂交转录本 反应DB_ID:77060 1 UniProt: O43148 RNMT RNMT Kiaa0398. RNMT MRNA封端的甲基转移酶RNMT的功能催化亚基:RAMAC络合物,将添加的鸟嘌呤的N7位置甲基化至MRNA的5'-Cap结构(PubMed:9790902,Pubmed:9705270,PubMed:10347220,PubMed:11114884,PubMed:1111488422099306,PubMed:27422871)。结合含有5'-末端GPPPC的RNA(PubMed:11114884)。动力测定法通过拉姆克(Pubmed:27422871)激活甲基转移酶活性.Subunit与Importinα相互作用,导致刺激RNA结合和甲基转移酶活性(PubMed:11114884)。其核定位需要与Importinα和β的相互作用,响应RangTP分离,允许RNMT-Importinα结合RNA基材(PubMed:11114884)。与聚合酶II和RNGTT的伸长形式相互作用(PUBMED:9705270)。与RAMAC相互作用,该相互作用显着增强了RNA结合和帽甲基转移酶活性(PUBMED:22099306,REF.14)。广泛表达的特异性。脂肪酸属于I类样SAM结合甲基转移酶超家族。mRNA帽0甲基转移酶系列。 uniprot. O43148 1 相等的 476. 相等的 Reactome DB_ID: 109634 1 TFIIH(核浆) TFIIH. Reactome DB_ID: 67439 1 UniProt: P19447 ERCC3 ercc3. XPBC ercc3. XPB. atp依赖的3'-5' DNA解旋酶,是一般转录和DNA修复因子IIH (TFIIH)核心复合物的组成部分,参与受损DNA的一般和转录偶联核苷酸切除修复(NER),当与CAK结合时,通过RNA聚合酶II进行RNA转录。在NER中,TFIIH通过打开病变周围的DNA,使受损的寡核苷酸被切除,并由新的DNA片段取代。DNA开放需要XPB/ERCC3的atp酶活性,而不是解旋酶活性。在转录中,TFIIH在转录起始中具有重要作用(PubMed:8157004, PubMed:30894545)。当预起始复合物(PIC)建立后,启动子开启和逃逸需要TFIIH (PubMed:8157004)。启动子开启和逃逸需要XPB/ERCC3的atp依赖性解旋酶活性。通过激酶模块CAK的RNA聚合酶II的最大亚基(CTD)的C-末端尾(CTD)控制转录的启动。由XPB / ERCC3,XPD / ERCC2,GTF2H1组成的7-亚基TFIIH核心复合物的组分。,GTF2H2,GTF2H3,GTF2H4和GTF2H5,在NER中有效。核心复合物与由CCNH/cyclin H、CDK7和MNAT1组成的3亚基cdk激活激酶(CAK)模块结合,形成10亚基全酶(holo-TFIIH),在转录中活跃(PubMed:9852112)。与PUF60相互作用(PubMed:10882074, PubMed:11239393)。与ATF7IP交互(PubMed:19106100)。 Interacts with KAT2A; leading to KAT2A recruitment to promoters and acetylation of histones (PubMed:30894545).SUBUNIT (Microbial infection) Interacts with Epstein-Barr virus EBNA2.SIMILARITY Belongs to the helicase family. RAD25/XPB subfamily. uniprot. P19447 1 相等的 782 相等的 反应数据库ID:65916 1 UniProt: Q13889 GTF2H3 GTF2H3 GTF2H3 功能一般转录和DNA修复因子IIH (TFIIH)核心复合物的组成部分,参与受损DNA的一般和转录偶联核苷酸切除修复(NER),当与CAK复合物时,在RNA转录中通过RNA聚合酶II进行。在NER中,TFIIH通过打开病变周围的DNA,使受损的寡核苷酸被切除,并由新的DNA片段取代。在转录中,TFIIH在转录起始中具有重要作用。当预起始复合物(PIC)建立后,启动子开启和逃逸需要TFIIH。激酶模块CAK对RNA聚合酶II最大亚基c端尾部(CTD)的磷酸化控制转录的起始。亚基的转录前起始复合物TFIID-containing RNA聚合酶II的一部分由真沸点和至少GTF2A1 GTF2A2, GTF2E1, GTF2E2, GTF2F1, GTF2H2, GTF2H3, GTF2H4, GTF2H5, GTF2B, TCEA1, ERCC2, ERCC3, TAF1, TAF2, TAF3, TAF4, TAF5, TAF6, TAF7, TAF8, TAF9, TAF10, TAF11, TAF12 TAF13 (PubMed: 27193682)。TFIIH核心复合物7亚基组成,由XPB/ERCC3、XPD/ERCC2、GTF2H1、GTF2H2、GTF2H3、GTF2H4、GTF2H5组成,在NER中有活性。核心复合物与由CCNH/cyclin H、CDK7和MNAT1组成的3亚基cdk激活激酶(CAK)模块结合,形成10亚基全酶(holo-TFIIH),在转录中活跃(PubMed:9852112)。与RARA交互;这种相互作用需要RARA在'Ser-369'上预先磷酸化,然后增强RARA与CDK7的相互作用(通过相似性)。属于TFB4家族。 uniprot. Q13889 1 相等的 308 相等的 反应数据库ID:65912 1 UniProt:P32780 GTF2H1 GTF2H1 BTF2 GTF2H1 功能一般转录和DNA修复因子IIH (TFIIH)核心复合物的组成部分,参与受损DNA的一般和转录偶联核苷酸切除修复(NER),当与CAK复合物时,在RNA转录中通过RNA聚合酶II进行。在NER中,TFIIH通过打开病变周围的DNA,使受损的寡核苷酸被切除,并由新的DNA片段取代。在转录中,TFIIH在转录起始中具有重要作用。当预起始复合物(PIC)建立后,启动子开启和逃逸需要TFIIH。通过激酶模块CAK的RNA聚合酶II的最大亚基(CTD)的C-末端尾(CTD)控制转录的启动。由XPB / ERCC3,XPD / ERCC2,GTF2H1组成的7-亚基TFIIH核心复合物的组分。,GTF2H2,GTF2H3,GTF2H4和GTF2H5,在NER中有效。核心复合物与由CCNH/cyclin H、CDK7和MNAT1组成的3亚基cdk激活激酶(CAK)模块结合,形成10亚基全酶(holo-TFIIH),激活转录。与puf60互动。类似于TFB1家族的灵活性。 uniprot. P32780 1 相等的 548 相等的 反应数据库ID:65918 1 UniProt: Q92759 GTF2H4 GTF2H4 GTF2H4 功能一般转录和DNA修复因子IIH (TFIIH)核心复合物的组成部分,参与受损DNA的一般和转录偶联核苷酸切除修复(NER),当与CAK复合物时,在RNA转录中通过RNA聚合酶II进行。在NER中,TFIIH通过打开病变周围的DNA,使受损的寡核苷酸被切除,并由新的DNA片段取代。在转录中,TFIIH在转录起始中具有重要作用。当预起始复合物(PIC)建立后,启动子开启和逃逸需要TFIIH。通过激酶模块CAK的RNA聚合酶II的最大亚基(CTD)的C-末端尾(CTD)控制转录的启动。由XPB / ERCC3,XPD / ERCC2,GTF2H1组成的7-亚基TFIIH核心复合物的组分。,GTF2H2,GTF2H3,GTF2H4和GTF2H5,在NER中有效。核心复合物与由CCNH/cyclin H、CDK7和MNAT1组成的3亚基cdk激活激酶(CAK)模块结合,形成10亚基全酶(holo-TFIIH),激活转录。属于TFB2家族。 uniprot. Q92759 1 相等的 462. 相等的 Reactome DB_ID: 5688446 1 UniProt: Q6ZYL4 GTF2H5 GTF2H5 C6orf175 TTDA GTF2H5 功能一般转录和DNA修复因子IIH (TFIIH)核心复合物的组成部分,参与受损DNA的一般和转录偶联核苷酸切除修复(NER),当与CAK复合物时,在RNA转录中通过RNA聚合酶II进行。在NER中,TFIIH通过打开病变周围的DNA,使受损的寡核苷酸被切除,并由新的DNA片段取代。在转录中,TFIIH在转录起始中具有重要作用。当预起始复合物(PIC)建立后,启动子开启和逃逸需要TFIIH。激酶模块CAK对RNA聚合酶II最大亚基c端尾部(CTD)的磷酸化控制转录的起始。对于TFIIH复合物的稳定性和细胞中正常水平的TFIIH的存在是必要的。亚单位TFIIH核心复合物由XPB/ERCC3、XPD/ERCC2、GTF2H1、GTF2H2、GTF2H3、GTF2H4、GTF2H5组成的7亚单位组成,在NER中有活性。核心复合物与由CCNH/cyclin H、CDK7和MNAT1组成的3亚基cdk激活激酶(CAK)模块结合,形成10亚基全酶(holo-TFIIH),激活转录。属于TFB5家族。 uniprot. Q6ZYL4 1 相等的 71 相等的 Reactome DB_ID: 67443 1 UNIPROT:P18074 ERCC2 ercc2. ercc2. XPD. XPDC atp依赖的5'-3' DNA解旋酶,是一般转录和DNA修复因子IIH (TFIIH)核心复合物的组成部分,参与受损DNA的一般和转录偶联核苷酸切除修复(NER),当与CAK复合物时,在RNA转录中由RNA聚合酶II进行。在NER中,TFIIH通过打开病变周围的DNA,使受损的寡核苷酸被切除,并由新的DNA片段取代。XPD/ERCC2的解旋酶活性依赖于atp,这是DNA开放所必需的。在转录中,TFIIH在转录起始中具有重要作用。当预起始复合物(PIC)建立后,启动子开启和逃逸需要TFIIH。激酶模块CAK对RNA聚合酶II最大亚基c端尾部(CTD)的磷酸化控制转录的起始。XPD/ERCC2的作用是在CAK和核心- tfiih复合物之间形成一座桥。参与维生素d受体活性的调节。作为有丝分裂纺锤体相关的MMXD复合体的一部分,它在染色体分离中发挥作用。可能在衰老过程中发挥作用,并可能在皮肤癌的产生中发挥作用。SUBUNIT Component of the 7-subunit TFIIH core complex composed of XPB/ERCC3, XPD/ERCC2, GTF2H1, GTF2H2, GTF2H3, GTF2H4 and GTF2H5, which is active in NER. The core complex associates with the 3-subunit CDK-activating kinase (CAK) module composed of CCNH/cyclin H, CDK7 and MNAT1 to form the 10-subunit holoenzyme (holo-TFIIH) active in transcription. The interaction with GTF2H2 results in the stimulation of the 5'-->3' helicase activity (PubMed:9771713, PubMed:9852112). Component of the MMXD complex, which includes CIAO1, ERCC2, CIAO2B, MMS19 and SLC25A5 (PubMed:20797633). Interacts with CIAO1 and CIAO2B; the interaction WITH CIAO2B is direct (PubMed:23891004). Interacts with ATF7IP (PubMed:19106100). Interacts directly with MMS19 (PubMed:23585563).SUBUNIT (Microbial infection) Interacts with Epstein-Barr virus EBNA2.PTM ISGylated.SIMILARITY Belongs to the helicase family. RAD3/XPD subfamily. uniprot. P18074 1 相等的 760 相等的 反应数据库ID:65914 1 UNIPROT:Q13888 GTF2H2 GTF2H2 BTF2P44 GTF2H2 功能一般转录和DNA修复因子IIH (TFIIH)核心复合物的组成部分,参与受损DNA的一般和转录偶联核苷酸切除修复(NER),当与CAK复合物时,在RNA转录中通过RNA聚合酶II进行。在NER中,TFIIH通过打开病变周围的DNA,使受损的寡核苷酸被切除,并由新的DNA片段取代。在转录中,TFIIH在转录起始中具有重要作用。当预起始复合物(PIC)建立后,启动子开启和逃逸需要TFIIH。激酶模块CAK对RNA聚合酶II最大亚基c端尾部(CTD)的磷酸化控制转录的起始。GTF2H2的n端与XPD相互作用并调控XPD,而RNAP II成功从启动子逃逸需要一个完整的c端。亚单位含tfiid的RNA聚合酶II预起始复合物的组成部分,由TBP和至少GTF2A1、GTF2A2、GTF2E1、GTF2E2、GTF2F1、GTF2H2、GTF2H3、GTF2H4、GTF2H5、GTF2B、TCEA1、ERCC2和ERCC3组成(PubMed:27193682)。TFIIH核心复合物7亚基组成,由XPB/ERCC3、XPD/ERCC2、GTF2H1、GTF2H2、GTF2H3、GTF2H4、GTF2H5组成,在NER中有活性。核心复合物与由CCNH/cyclin H、CDK7和MNAT1组成的3亚基cdk激活激酶(CAK)模块结合,形成10亚基全酶(holo-TFIIH),在转录中活跃(PubMed:9852112, PubMed:11319235)。与XPB, XPD, GTF2H1和GTF2H3相互作用(PubMed:11319235)。SUBUNIT (Microbial infection) Interacts with varicella-zoster virus IE63 protein.TISSUE SPECIFICITY Widely expressed, with higher expression in skeletal muscle.SIMILARITY Belongs to the GTF2H2 family. uniprot. Q13888 1 相等的 395 相等的 Reactome DB_ID: 69221 1 CAK(核浆) CAK Reactome DB_ID: 69218 1 UniProt:P50613 CDK7 CDK7 STK1 CDK7 MO15 CDKN7 CAK1. CAK 函数丝氨酸/苏氨酸激酶参与细胞周期控制和RNA聚合酶II介导的RNA转录。通过与细胞周期蛋白的结合激活细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)并通过细胞周期介导进展。每个不同的复合物控制在细胞周期中的2个后续相位之间的特定转变。在G2-M转变期间CDK1 / Cyclin-B的活化和复杂形成所需的,并且在G1-S转变期间激活CDK2 / Cyclins(但不复杂地层)。CDK7是CDK活化激酶(CAK)复合物的催化亚基。磷酸化SPT5 / SUPT5H,SF1 / NR5A1,POLR2A,P53 / TP53,CDK1,CDK2,CDK4,CDK6和CDK11B / CDK11。CAK通过苏氨酸磷酸化激活细胞周期蛋白相关的激酶CDK1,CDK2,CDK4和CDK6,从而调节细胞周期进展。与核心tfiih基转录因子结合的CAK通过其大亚基(POLR2A)的重复c末端结构域(CTD)的丝氨酸磷酸化激活RNA聚合酶II,使其从启动子中逃逸并延长转录本的长度。通过DNA复合物中PolR2a的磷酸化通过从DNA触发解离来促进转录起始。其表达和活性在整个细胞周期中是恒定的。 Upon DNA damage, triggers p53/TP53 activation by phosphorylation, but is inactivated in turn by p53/TP53; this feedback loop may lead to an arrest of the cell cycle and of the transcription, helping in cell recovery, or to apoptosis. Required for DNA-bound peptides-mediated transcription and cellular growth inhibition.ACTIVITY REGULATION Inactivated by phosphorylation. Repressed by roscovitine (seliciclib, CYC202), R547 (Ro-4584820) and SNS-032 (BMS-387032). The association of p53/TP53 to the CAK complex in response to DNA damage reduces kinase activity toward CDK2 and RNA polymerase II repetitive C-terminal domain (CTD), thus stopping cell cycle progression. The inactivation by roscovitine promotes caspase-mediated apoptosis in leukemic cells.SUBUNIT Associates primarily with cyclin-H (CCNH) and MAT1 to form the CAK complex. CAK can further associate with the core-TFIIH to form the TFIIH basal transcription factor; this complex is sensitive to UV light. The CAK complex binds to p53/TP53 in response to DNA damage. Interacts with CDK2, SF1/NR5A1, PUF60 and PRKCI.TISSUE SPECIFICITY Ubiquitous.INDUCTION Repressed by DNA-bound peptides.PTM Phosphorylation of Ser-164 during mitosis inactivates the enzyme. Phosphorylation of Thr-170 is required for activity. Phosphorylated at Ser-164 and Thr-170 by CDK2.SIMILARITY Belongs to the protein kinase superfamily. CMGC Ser/Thr protein kinase family. CDC2/CDKX subfamily. uniprot. P50613 1 相等的 346. 相等的 Reactome DB_ID: 69220 1 UniProt: P51946 CCNH CCNH. CCNH. 功能:调节CDK7, cdk活化激酶(CAK)酶复合物的催化亚基。CAK通过苏氨酸磷酸化激活周期蛋白相关激酶CDK1、CDK2、CDK4和CDK6。与核心tfiih基转录因子结合的CAK通过其大亚基(POLR2A)的重复c末端结构域(CTD)的丝氨酸磷酸化激活RNA聚合酶II,使其从启动子中逃逸并延长转录本的长度。通过RNA聚合酶II参与细胞周期控制和RNA转录。其表达和活性在整个细胞周期中是恒定的。亚单位主要与CDK7和MAT1结合形成CAK复合体。CAK可进一步与core-TFIIH结合形成TFIIH基础转录因子。相似性属于周期蛋白家族。细胞周期蛋白C亚科。 uniprot. P51946 1 相等的 323. 相等的 Reactome DB_ID: 59012 1 UNIPROT:P51948 MNAT1 MNAT1 MAT1 RNF66 CAP35 MNAT1 功能稳定细胞周期蛋白H-CDK7复合物以形成功能性CDK活化激酶(CAK)酶络合物。CAK通过苏氨酸磷酸化激活周期蛋白相关激酶CDK1、CDK2、CDK4和CDK6。与核心tfiih基转录因子结合的CAK通过其大亚基(POLR2A)的重复c末端结构域(CTD)的丝氨酸磷酸化激活RNA聚合酶II,使其从启动子中逃逸并延长转录本的长度。通过RNA聚合酶II.subinit acciates涉及细胞周期控制和RNA转录,主要用CDK7和细胞周期蛋白H形成CAK复合物。CAK可以进一步与核心TFIIH相关联,以形成TFIIH基础转录因子。结肠和睾丸的特异性最高水平。适度水平存在胸腺,前列腺,卵巢和小肠。在脾脏和白细胞中发现最低水平。 uniprot. P51948 1 相等的 309 相等的 Reactome数据库ID Release 77 69221 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=69221 Reactome r - hsa - 69221 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa-69221.1 Reactome数据库ID Release 77 109634 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=109634 Reactome r - hsa - 109634 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-109634.1 Reactome DB_ID: 3009372 1 UniProt: O00267 SUPT5H SUPT5H SPT5 SUPT5H spt5h. DRB敏感诱导因子复合物(DSIF复合物)的组成部分,通过RNA聚合酶II调控mRNA的加工和转录伸长。DSIF通过刺激RNGTT/CAP1A的mRNA guanyltransferase活性正调控mRNA capping。DSIF还与负延伸因子复合物(nef复合物)协同作用,增强启动子近端位点的转录暂停。转录暂停可能促进延伸能力RNA聚合酶II复合体的组装。DSIF和nef通过抑制转录延伸因子TFIIS/S-II促进暂停。TFIIS/S-II在转录暂停位点与RNA聚合酶II结合,刺激酶的弱固有核酸酶活性。通过RNA聚合酶II切割被阻断的转录本,可促进从新的3'端恢复转录,并可能允许通过自然暂停位点重复尝试转录。DSIF也能正向调节转录伸长,是HIV-1核转录激活因子Tat有效激活转录伸长所必需的。DSIF作用于抑制来自HIV-1 LTR的转录本的转录暂停,并阻止终止序列上HIV-1转录本的过早释放。亚单位与SUPT4H1相互作用形成DSIF。DSIF与正转录延伸因子b复合物(P-TEFb复合物)相互作用,该复合物由CDK9和cyclin-T (CCNT1或CCNT2)组成。 DSIF interacts with RNA polymerase II, and this interaction is reduced by phosphorylation of the C-terminal domain (CTD) of POLR2A by P-TEFb. DSIF also interacts with the NELF complex, which is composed of NELFA, NELFB, NELFD and NELFE, and this interaction occurs following prior binding of DSIF to RNA polymerase II. DSIF also interacts with PRMT1/HRMT1L2, HTATSF1/TATSF1, RNGTT/CAP1A, PRMT5/SKB1, SUPT6H, and can interact with PIN1. Component of a complex which is at least composed of HTATSF1/Tat-SF1, the P-TEFb complex components CDK9 and CCNT1, RNA polymerase II, SUPT5H, and NCL/nucleolin. Interacts with MCM3AP isoform GANP (PubMed:23652018).TISSUE SPECIFICITY Ubiquitously expressed.PTM Methylated by PRMT1/HRMT1L2 and PRMT5/SKB1. Methylation negatively regulates interaction with P-TEFb and RNA polymerase II.PTM Phosphorylated by CDK7 and CDK9. Phosphorylation by P-TEFb alleviates transcriptional pausing and can stimulate transcriptional elongation from the HIV-1 LTR. P-TEFb dependent phosphorylation is stimulated by the HIV-1 Tat protein. Phosphorylation may also stimulate interaction with PIN1. Bulk phosphorylation occurs predominantly in mitosis.SIMILARITY Belongs to the SPT5 family. uniprot. O00267 位置不明的磷酸化残基 磷酸化残渣(MOD: 00696) 1 相等的 1087 相等的 Reactome DB_ID: 72081 1 UNIPROT:O60942 RNGTT rngtt. rngtt. CAP1A 功能双功能mRNA capping酶,n端RNA 5'-三磷酸酶活性,c端mRNA guanylytransferase活性。催化帽形成的前两个步骤:从新生mRNA的5'-三磷酸端去除-磷酸生成二磷酸端,并将GTP的gmp部分转移到5'-二磷酸端。亚基与POLR2A相互作用(通过c端);这提高了鸟苷转移酶的活性。结合(通过GTase结构域)到RNA聚合酶II的伸长磷酸化形式;可与磷酸化的POLR2A c端结构域直接相互作用,也可通过结合RNA间接相互作用(相似性)。与SUPT5H和RNMT相互作用。与HIV-1 Tat相互作用。亚单位(微生物感染)与HIV-1 Tat相互作用。Isoform 1和Isoform 4(在较小程度上)在大脑、小脑、甲状腺、肺、心脏、肝脏、肾脏、脾脏、大肠、睾丸、皮肤和肌肉中表达。由于GTase结构域的破坏,亚型2到亚型4缺乏mRNA 5'-鸟苷转移酶活性。n端截面的相似性;属于蛋白质酪氨酸磷酸酶家族的非受体类。c端截面相似; belongs to the eukaryotic GTase family. uniprot. O60942 1 相等的 597. 相等的 Reactome数据库ID Release 77 77061 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=77061 Reactome r - hsa - 77061 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-77061.1 Reactome数据库ID Release 77 111343. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=111343 Reactome r - hsa - 111343 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa-111343.1 Reactome数据库ID Release 77 77065 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反应组中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=77065 Reactome r - hsa - 77065 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa-77065.1 Reactome DB_ID: 77066 1 封盖复合物(GPPPN ..)[核质] 限制复杂(GpppN . .) 反应DB_ID:29428 1 Reactome DB_ID: 111344 1 与CE相关的具有5'-GMP的新生前mrna[核质] 用5'-GMP与CE相关的新生儿前mRNA 反应DB_ID:77061 1 Reactome数据库ID Release 77 77066 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reagome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=77066 Reactome r - hsa - 77066 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa-77066.1 PHYSIOL-LEFT-TO-RIGHT 激活 Reactome DB_ID: 77065 0004484 去分子功能 Reactome数据库ID Release 77 111348 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=111348 Reactome数据库ID Release 77 77083 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=77083 Reactome r - hsa - 77083 2 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa-77083.2 9512541 Pubmed 1998 mRNA 5'封装酶的人cDNA的分离与表征。 Yamada-Okabe,T DOI,R. Shimmi,O. Arisawa, M 山田 - 冈比克,H 核酸RES 26:1700-6