在Reactome数据库中,BioPAX途径从“Vamp8相关分泌囊泡到质膜运输”。
Vamp8相关的分泌囊泡到质膜运输
Vamp8相关的分泌囊泡到质膜运输
吸血鬼8相关的囊泡与质膜对接并融合。
作者:吉莱斯皮,ME, 2009-08-27
评论:Rush, MG, 2008-01-11 00:00:00
Reactome DB_ID: 376368
1
分泌颗粒膜
去
0030667
UniProt: Q9BV40 VAMP8
VAMP8
VAMP8
SNAREs是一种可溶性n -乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白受体,是细胞膜融合的重要蛋白。位于相对膜上的诱捕器组装形成一个跨诱捕器复合体,这是一个扩展的、平行的四螺旋束,驱动膜融合。VAMP8是一种参与自噬的SNARE,通过与STX17-SNAP29二元t-SNARE复合物的相互作用,直接控制自噬小体膜与溶酶小体膜融合(PubMed:23217709, PubMed:25686604)。血小板密集颗粒分泌也需要(PubMed:12130530)。在胰腺腺泡细胞中也发挥调节酶分泌的作用(通过相似性)。参与细胞分裂时中体的脱落,导致子细胞完全分离(通过相似性)。参与早期和晚期核内体的同型融合(通过相似性)。还通过trim6依赖机制参与I型干扰素抗病毒反应的激活(PubMed:31694946)。SUBUNIT形成由VAMP8、SNAP29和STX17组成的SNARE复合体,参与自噬小体与溶酶体的融合(PubMed:25686604)。在一些SNARE复合体中发现了NAPA, SNAP23, SNAP25, STX1A, STX4, STX7, STX8和VTI1B (PubMed:12130530)。 Interacts with PICALM (By similarity). SNARE complex formation and binding by PICALM are mutually exclusive processes for VAMP8 (By similarity). Interacts with SBF2/MTMR13 (PubMed:25648148). Interacts with RAB21 (in GTP-bound form) in response to starvation; the interaction probably regulates VAMP8 endolysosomal trafficking (PubMed:25648148). Interacts with STX17; this interaction is increased in the absence of TMEM39A (PubMed:31806350, PubMed:33422265). Interacts with TRIM6 (PubMed:31694946).SUBUNIT (Microbial infection) The interaction with STX17 is decreased in presence of SARS coronavirus-2/SARS-CoV-2 ORF3A protein.TISSUE SPECIFICITY Platelets.SIMILARITY Belongs to the synaptobrevin family.
Reactome
//www.joaskin.com
智人
NCBI分类法
9606
UniProt
Q9BV40
链坐标
1
平等的
One hundred.
平等的
Reactome DB_ID: 376345
1
等离子体膜
去
0005886
UniProt: O00161 SNAP23
SNAP23
SNAP23
功能:一般膜融合机制的高亲和力受体的基本组成部分,运输囊泡对接和融合的重要调控因子。亚基同源四聚体(通过线圈结构域),也与STX4和VAMP3形成异四聚体(PubMed:12556468)。在VAMP8和STX1A复合体中发现(PubMed:12130530)。在胰腺的VAMP8和STX4复合体中发现(相似)。与SNAPIN和SYN4同时交互(通过相似性)。与STX1A交互(通过相似性)。与STX12交互(通过相似性)。与多种syntaxins和synaptobrevins/VAMPs紧密相互作用(通过相似性)。与ZDHHC13相互作用(通过ANK重复)(通过相似性)。与ZDHHC17相互作用(通过ANK重复)(PubMed:28882895)。组织特异性无处不在。在胎盘中含量最高。SIMILARITY Belongs to the SNAP-25 family.
UniProt
O00161
1
平等的
211
平等的
Reactome DB_ID: 181519
1
UniProt: Q12846 STX4
STX4
STX4
STX4A
介导转运囊泡对接的质膜t-SNARE。这是SLC2A4从胞囊转位到质膜的必要条件。与STXB3和VAMP2一起,也可能在脂肪细胞内含glut4的囊泡与细胞表面对接/融合中发挥作用(相似)。也可能在突触前活动区突触泡的对接中起作用。由STX4、SNAP23和VAMP7组成的SNARE复合体的亚单位成分,在溶酶体胞吐过程中与SYT7相互作用。在VAMP8和SNAP23的综合体中发现。在SNAP23和STXBP4的复合物中检测到。与VAMP2交互。与SNAP23和SNAPIN相互作用。与LLGL1交互。 Interacts (via C-terminus) with CENPF. Interacts with DOC2B. Interacts with STXBP6. Interacts with STXBP3; excludes interaction with DOC2B and SNAP25. Interacts with STXBP4; excludes interaction with VAMP2 (By similarity). Interacts with STXBP5L (By similarity).TISSUE SPECIFICITY Expressed in neutrophils and neutrophil-differentiated HL-60 cells. Expression in neutrophils increases with differentiation.SIMILARITY Belongs to the syntaxin family.
UniProt
Q12846
1
平等的
297
平等的
Reactome DB_ID: 376365
1
1
平等的
One hundred.
平等的
Reactome DB_ID: 376345
1
1
平等的
211
平等的
Reactome DB_ID: 181519
1
1
平等的
297
平等的
PHYSIOL-LEFT-TO-RIGHT
激活
Reactome DB_ID: 376367
分泌颗粒对接融合复合物[质膜]
分泌颗粒对接和融合复合物
Reactome DB_ID: 376368
1
1
平等的
One hundred.
平等的
Reactome DB_ID: 376345
1
1
平等的
211
平等的
Reactome DB_ID: 181519
1
1
平等的
297
平等的
Reactome数据库ID Release 77
376367
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=376367
Reactome
r - hsa - 376367
2
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-376367.2
去
0000149
去分子功能
Reactome数据库ID Release 77
376375
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=376375
Reactome数据库ID Release 77
376364
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=376364
Reactome
r - hsa - 376364
4
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-376364.4
18973100
Pubmed
2008
变应原致敏增加肥大细胞内参与组胺分泌的胞外蛋白SNAP-23和syntaxin 4的表达
萨利纳斯,E
Quintanar-Stephano,
科尔多瓦,L E
Ouintanar J L
J调查过敏反应临床免疫18:366-71
16984405
Pubmed
2006
肥大细胞胞吐过程中,三种SNARE复合物在脂筏中富集
宫,镍钛
罗氏,保罗
交通7:1482 - 94
9727496
Pubmed
1998
t-SNARE SNAP-23从片状细胞表面突起的重新定位调节肥大细胞的复合胞吐作用
郭,Z
特纳,C
城堡,维
细胞94:537-48
18692471
Pubmed
2008
IkappaB激酶2磷酸化SNAP-23调节肥大细胞脱颗粒
铃木Kotaro
Verma英德尔米
细胞134:485 - 95
24494924
Pubmed
2014
大肠杆菌暴露抑制肥大细胞胞外snare介导的膜融合
Wesolowski、约旦
Paumet,法
交通15:516-30