bioax途径由Reactome数据库中的“二氧化碳可逆水化”转化而来。
二氧化碳的可逆水合作用
二氧化碳的可逆水合作用
碳酸酐酶可可逆催化二氧化碳的水合作用,直接产生碳酸氢盐和质子,绕过碳酸的形成(Lindskog 1997, Breton 2001, Esbaugh和Tufts 2006,硼2010,Gilmour 2010)。碳酸酐酶将水去质子化,生成锌-羟基和质子,并通过碳酸酐酶中的组氨酸或谷氨酸残基转移到外部缓冲分子。羟基与活性部位的二氧化碳反应生成碳酸氢盐。水分子取代了重碳酸盐,反应循环再次开始。目前已知人类体内有12种活性碳酸酐酶。
作者:May, B, 2011-08-06
评论:Jassal, B, 2012-05-16
审查:西弗曼,DN,2012-05-16
编辑日期:May, B, 2011-08-06
4.2.1.1
碳酸酐酶使二氧化碳水合物(胞质)
碳酸酐酶使二氧化碳水合物(胞质)
碳酸酐酶I (CA1,哈里发1971 Simonsson et al ., 1982年任和Lindskog 1992)、碳酸anyhydrase II(游离钙Tibell et al . 1984年,琼斯和肖1983年Pesando 1975年Ghannam et al . 1986年),碳酸酐酶III (CA3、卡特等。1979年,屠et al . 1990年,图et al . 1994,你等。1998年,西尔弗曼et al . 1993年),第七碳酸酐酶(CA7,Bootorabi et al. 2010, Gitto et al. 2010)水合物二氧化碳生成碳酸氢盐和质子。碳酸酐酶将水去质子化,生成锌-羟基和质子,并通过碳酸酐酶中的组氨酸或谷氨酸残基转移到外部缓冲分子。羟基与活性部位的二氧化碳反应生成碳酸氢盐。一个水分子取代了碳酸氢盐,反应循环再次开始(Lindskog 1997)。取决于反应物的浓度,反应是可逆的。
CA2和CA7具有较高的催化活性,CA1具有较低的催化活性(CA2活性的10%),CA3具有很低的催化活性(CA2活性的1%)。红细胞中存在CA1和CA2。在肾脏、肺和白色肌肉中也发现了CA2,在那里它有助于二氧化碳的扩散。CA3存在于红色肌肉中,参与抗氧化应激。
作者:May, B, 2011-08-06
评论:Jassal, B, 2012-05-16
审查:西弗曼,DN,2012-05-16
编辑日期:May, B, 2011-08-06
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1.
胞浆
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二氧化碳
Reactome
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车比
16526
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1.
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水
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15377
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1.
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碳酸氢
车比
17544
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1.
hydron[ChEBI:15378]
海隆
车比
15378
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激活
从Reactome中的EntitySet转换而来
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CA1、2、3、7、13:锌(胞质)
从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity
去
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Reactome
r - hsa - 1475026
2.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-1475026.2
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碳酸酐酶使碳酸氢盐(细胞质)脱水
碳酸酐酶使碳酸氢盐(细胞质)脱水
碳酸酐酶I(CA1,Khalifah 1971,Simonsson et al.1982,Ren and Lindskog 1992),碳酸酐酶II(CA2,Tibell et al.1984,Jones and Shaw 1983,Pesando 1975,Ghannam et al.1986),碳酸酐酶III(CA3,Carter et al.1979,Tu et al.1990,Tu et al.1994,Tu et al.1998,Silverman et al.1993),碳酸酐酶VII(CA7,Bootorabi et al.2010,Gitto et al.2010)脱水胞质碳酸氢盐以产生水和二氧化碳(在Lindskog 1997中回顾)。根据反应物的浓度,反应是可逆的。
CA2和CA7具有高催化活性,CA1具有低活性(CA2活性的10%),而CA3具有极低的活性(CA2活性的1%)。CA1和CA2存在于红细胞中。CA2也存在于肾、肺和白肌中,促进二氧化碳的扩散。CA3存在于红肌中,参与抗氧化应激。
作者:May, B, 2011-08-06
评论:Jassal, B, 2012-05-16
审查:西弗曼,DN,2012-05-16
编辑日期:May, B, 2011-08-06
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1.
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1.
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激活
从Reactome中的EntitySet转换而来
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Reactome
r - hsa - 1475022
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4.2.1.1
碳酸酐酶使二氧化碳水合物(质膜)
碳酸酐酶使二氧化碳水合物(质膜)
碳酸酐酶IV(CA4,Zhu和Sly 1990,Okuyama et al.1992,Baird et al.1997,Innocenti et al.2004),碳酸酐酶IX(CA9,Wingo et al.2001,Hilvo et al.2008),碳酸酐酶XII(CA12,Ulmasov et al.2000,Pastorekova et al.2008)和碳酸酐酶XIV(Ca14Ozensey et al.2005,Temperini et al.2008)碳酸酐酶是一种膜结合酶,使细胞外二氧化碳水合生成重碳酸盐和质子。碳酸酐酶使水脱质子生成锌羟基和质子,并通过碳酸酐酶中的组氨酸或谷氨酸残基转移到外部缓冲分子。羟基在活性部位与二氧化碳反应生成重碳酸盐。水分子取代碳酸氢盐,反应循环再次开始(Lindskog 1997年回顾)。根据反应物的浓度,反应是可逆的。
CA4具有高催化活性。CA9、CA12和CA14具有中等活性。CA4通过糖基磷脂酰肌醇锚定在质膜的细胞外表面。CA9、CA12和CA14是单程跨膜蛋白。CA4存在于肾、肺和肌肉毛细血管的细胞外表面,在那里它维持组织和血液之间的二氧化碳梯度。CA9和CA12存在于上皮的基底外侧膜上。CA9由缺氧诱导因子1α(HIF1α)诱导,并使肿瘤细胞外环境酸化。在啮齿动物中,CA15是膜锚定的,活性低;在灵长类动物中,CA15是一个假基因。
作者:May, B, 2011-08-06
评论:Jassal, B, 2012-05-16
审查:西弗曼,DN,2012-05-16
编辑日期:May, B, 2011-08-06
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1.
胞外区
去
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质膜
去
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CA4 9 14日12:Zn2 +(质膜)
从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity
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Reactome
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迪菲奥雷,
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帕斯托雷科娃,S
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4.2.1.1
碳酸酐酶使碳酸氢盐脱水(质膜)
碳酸酐酶使碳酸氢盐脱水(质膜)
碳酸酐酶IV(CA4,Zhu和Sly 1990,Okuyama et al.1992,Baird et al.1997,Innocenti et al.2004),碳酸酐酶IX(CA9,Wingo et al.2001,Hilvo et al.2008),碳酸酐酶XII(CA12,Ulmasov et al.2000,Pastorekova et al.2008)和碳酸酐酶XIV(CA14,Ogensoy et al.2005,Temperini et al.2008)是膜结合酶,使碳酸氢盐脱水生成水和二氧化碳。根据反应物的浓度,反应是可逆的。
CA4具有高催化活性。CA9、CA12和CA14具有中等活性。CA4通过糖基磷脂酰肌醇固定在质膜的细胞外表面。CA9、CA1CA4存在于肾、肺和肌肉毛细血管的细胞外表面,维持组织和血液之间的二氧化碳梯度。CA9和CA12存在于上皮的基底外侧膜上。CA9可由缺氧诱导因子1α(HIF1α)诱导在啮齿类动物中,CA15是膜锚定的,活性低;在灵长类动物中,CA15是假基因。
作者:May, B, 2011-08-06
评论:Jassal, B, 2012-05-16
审查:西弗曼,DN,2012-05-16
编辑日期:May, B, 2011-08-06
反应数据库ID:351626
1.
Reactome DB_ID: 425425
1.
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1.
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1.
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Reactome
r - hsa - 1475017
1.
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4.2.1.1
碳酸酐酶水合二氧化碳(线粒体)
碳酸酐酶水合二氧化碳(线粒体)
碳酸酐酶VA (CA5A, Nagao et al. 1993, Franchi et al. 2003, Nishimori et al. 2007)和碳酸酐酶VB (CA5B, Fujikawa-Adachi et al. 1999, Nishimori et al. 2005, Nishimori et al. 2007)在线粒体中水合物二氧化碳,生成碳酸氢盐和一个质子。碳酸酐酶将水去质子化,生成锌-羟基和质子,并通过碳酸酐酶中的组氨酸或谷氨酸残基转移到外部缓冲分子。羟基与活性部位的二氧化碳反应生成碳酸氢盐。一个水分子取代了碳酸氢盐,反应循环再次开始(Lindskog 1997)。取决于反应物的浓度,反应是可逆的。
作者:May, B, 2011-08-06
评论:Jassal, B, 2012-05-16
审查:西弗曼,DN,2012-05-16
编辑日期:May, B, 2011-08-06
Reactome DB_ID: 113521
1.
线粒体基质
去
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Reactome DB_ID: 29376
1.
Reactome DB_ID: 113529
1.
反应数据库ID:29896
1.
PHYSIOL-LEFT-TO-RIGHT
激活
从Reactome中的EntitySet转换而来
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CA5A,B:锌[线粒体基质]
从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity
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1475032
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Reactome
R-HSA-1475032
1.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-1475032.1
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碳酸酐酶使碳酸氢盐(线粒体)脱水
碳酸酐酶使碳酸氢盐(线粒体)脱水
碳酸酐酶VA (CA5A, Nagao et al. 1993, Franchi et al. 2003, Nishimori et al. 2007)和碳酸酐酶VB (CA5B, Fujikawa-Adachi et al. 1999, Nishimori et al. 2005, Nishimori et al. 2007)使线粒体中的碳酸氢盐脱水,产生水和二氧化碳(Lindskog 1997综述)。取决于反应物的浓度,反应是可逆的。
作者:May, B, 2011-08-06
评论:Jassal, B, 2012-05-16
审查:西弗曼,DN,2012-05-16
编辑日期:May, B, 2011-08-06
Reactome DB_ID: 113529
1.
反应数据库ID:29896
1.
Reactome DB_ID: 113521
1.
Reactome DB_ID: 29376
1.
PHYSIOL-LEFT-TO-RIGHT
激活
从Reactome中的EntitySet转换而来
Reactome DB_ID: 1475016
Reactome数据库ID版本77
1475028
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=1475028
Reactome
r - hsa - 1475028
1.
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-1475028.1
4.2.1.1
碳酸酐酶VI将二氧化碳水合物为碳酸氢盐和一个质子
碳酸酐酶VI将二氧化碳水合物为碳酸氢盐和一个质子
H2o + co2 -> h + + hco3 -
碳酸酐酶VI (CA6)使二氧化碳水合物生成碳酸氢盐和质子(Thatcher et al. 1998, Nishimori et al. 2007)。碳酸酐酶将水去质子化,生成锌-羟基和质子,并通过碳酸酐酶中的组氨酸或谷氨酸残基转移到外部缓冲分子。羟基与活性部位的二氧化碳反应生成碳酸氢盐。一个水分子取代了碳酸氢盐,反应循环再次开始(Lindskog 1997)。取决于反应物的浓度,反应是可逆的。CA6是唾液中的一种主要蛋白质,也被称为gustin。
作者:May, B, 2011-03-24
评论:Jassal, B, 2012-05-16
审查:西弗曼,DN,2012-05-16
编辑:May, B, 2011-03-24
Reactome DB_ID: 1237009
1.
反应数据库ID:109276
1.
反应数据库ID:351626
1.
Reactome DB_ID: 425425
1.
PHYSIOL-LEFT-TO-RIGHT
激活
Reactome DB_ID: 1237316
CA6:锌[细胞外区域]
CA6:锌
碳酸酐酶VI:锌
Reactome DB_ID: 1237016
1.
UniProt:P23280 CA6
CA6
CA6
二氧化碳的可逆水合作用。其在唾液中的作用尚不清楚。由香豆素、磺酰胺衍生物(如乙酰唑胺(AZA)、糖精和膦甲酸三钠盐)抑制的活性调节。唾液的组织特异性主要成分。相似性属于α-碳酸酐酶家族。
智人
NCBI分类法
9606
UniProt
P23280
链坐标
18
平等的
308
平等的
Reactome DB_ID: 158417
1.
锌(2 +)(ChEBI: 29105)
锌(2 +)
车比
29105
Reactome数据库ID版本77
1237316
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Reactome
r - hsa - 1237316
1.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-1237316.1
Reactome数据库ID版本77
1237060
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Reactome数据库ID版本77
1237045
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Reactome
r - hsa - 1237045
1.
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-1237045.1
9784398
Pubmed
1998
人腮腺唾液中的Gustin是碳酸酐酶VI
撒切尔,北京
多尔蒂,AE
Orvisky E
马丁,BM
Henkin,国际扶轮
生物化学与生物物理
17228881
Pubmed
2007
碳酸酐酶抑制剂。人分泌亚型VI的DNA克隆、表征和抑制研究,这是磺胺和磺胺酸抑制剂的新靶点
Nishimori,我
Minakuchi T
馆,年代
瓦洛,D
斯科扎法瓦
Supuran, CT
J Med Chem 50:381-8
17499996
Pubmed
2007
碳酸酐酶激活剂:人类分泌型VI亚型与氨基酸和胺的首次激活研究
Nishimori,我
馆,年代
瓦洛,D
Innocenti,
斯科扎法瓦
Supuran, CT
Bioorg Med Chem 15:5351-7
4.2.1.1
碳酸酐酶VI使碳酸氢盐脱水为水和二氧化碳
碳酸酐酶VI使碳酸氢盐脱水为水和二氧化碳
H+ + hco3 - - >h2o + co2
碳酸酐酶VI (CA6)使碳酸氢盐脱水,产生水和二氧化碳(Thatcher et al. 1998, Nishimori et al. 2007)。取决于反应物的浓度,反应是可逆的。CA6是唾液中的一种主要蛋白质,也被称为gustin。
作者:May, B, 2011-03-24
评论:Jassal, B, 2012-05-16
审查:西弗曼,DN,2012-05-16
编辑:May, B, 2011-03-24
反应数据库ID:351626
1.
Reactome DB_ID: 425425
1.
Reactome DB_ID: 1237009
1.
反应数据库ID:109276
1.
PHYSIOL-LEFT-TO-RIGHT
激活
Reactome DB_ID: 1237316
Reactome数据库ID版本77
1237081
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=1237081
Reactome
r - hsa - 1237081
1.
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-1237081.1
Reactome数据库ID版本77
1475029
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=1475029
Reactome
r - hsa - 1475029
1.
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-1475029.1
16679072
Pubmed
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脊椎动物呼吸系统碳酸酐酶同工酶的结构和功能
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Pubmed
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2010
评估碳酸酐酶在HCO3相关物种运输中的作用
硼,WF
生物物理学报1804:410-21
去
0015701
生物过程