BIOPAX途径在反应数据库中从“Neddylation”转换。 Neddylation Neddylation 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: Uchl3,Senp8 Cleave Nedd8 Uchl3,Senp8 Cleave Nedd8 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: 反应DB_ID:10754946 1 cytosol. 0005829 UCHL3,SENP8:NEDD8(1-88)[胞质溶胶] UCHL3 SENP8: NEDD8 (1 - 88) Reactome DB_ID: 10754831 1 UniProt: P35127 yuh1. 反应 http://www.reacectome.org. 酿酒酵母 NCBI分类 4932 UniProt P35127 链坐标 1 平等的 230. 平等的 反应DB_ID:10754944 1 UniProt的:Q03919 RUB1 UniProt Q03919 1 平等的 88 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10754946. 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10754946 反应 r - sce - 6782635 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-6782635.1 反应DB_ID:29356 1 水(ChEBI: 15377) ChEBI 15377 反应DB_ID:10754952 1 77 平等的 88 平等的 反应DB_ID:10754950 1 UCHL3 SENP8: NEDD8(胞质) UCHL3 SENP8: NEDD8 Reactome DB_ID: 10754831 1 1 平等的 230. 平等的 反弹DB_ID:10754948 1 1 平等的 76 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10754950. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10754950 反应 r - sce - 6782643 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-6782643.1 生理学-从左到右 激活 反应DB_ID:10754946 0019784 去分子功能 Reactome数据库ID Release 77 10754953 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10754953 Reactome数据库ID Release 77 10754955 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10754955 反应 R-SCE-5690808 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-5690808.1 UCHL3和SENP8(DEN1)除去NEDD8漏洞的C末端延伸,曝光C-末端Gly残基。Uchl3还可以处理泛素(Wada等人1998)。在NEDD8处理中,UCHL3和SENP8可能在功能上冗余,因为任一酶的缺失不会导致Neddylation缺陷(Chan等,2008,Kurihara等,2000)。 9790970 Pubmed 1998 UCH-L3裂解NEDD8的c端 和田,H 陈宏伟K 卡斯基,L小号 叶,E T 神谷之康T 物化学。Biophys。Commun >, 251:688 - 92 10713173 Pubmed 2000年 Uch-L3在小鼠发育中的表达及功能分析 栗原市,L J Semenova E Levorse J米 Tilghman,S M 摩尔。细胞。生物20:2498 - 504 18782863 Pubmed 2008年 DEN1在体内Deneddylate非Cullin蛋白 Chan Yaru 尹,Jeongsook 吴June-Tai 金亨俊 锅,内门乡观亭 伊米,东滨 简正定 j .细胞。SCI。121:3218-23 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 释放成熟的NEDD8 释放成熟的NEDD8 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: 反应DB_ID:10754950 1 Reactome DB_ID: 10754831 1 1 平等的 230. 平等的 反弹DB_ID:10754948 1 1 平等的 76 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10761395 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10761395 反应 r - sce - 8951644 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-sce-8951644.1 成熟的NEDD8经UCHL3或SENP8加工后释放(Wada et al ., 1998;Wu et al, 2003)。 12759363. Pubmed 2003年 DEN1是一个双功能蛋白酶能够处理NEDD8的C末端和deconjugating超neddylated CUL1的 吴,肯尼斯 Yamoah,Kosj Dolios,格鲁吉亚 Gan-Erdene, Tudeviin Tan Peilin 陈,安格斯 李,Chee-Gun 魏、宁 威尔金森,基思·d 王,荣 锅,Zhen-Qiang 生物。化学278:28882 - 91 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 NEDD8共价结合UBA3的催化半胱氨酸:NAE1 NEDD8共价结合UBA3的催化半胱氨酸:NAE1 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

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有关Panther的详细信息另请参阅: 反弹DB_ID:10754948 1 1 平等的 76 平等的 Reactome DB_ID: 10761402 1 UBA3:NAE1 [cytosol] UBA3: NAE1 Reactome DB_ID: 10761400 1 UniProt: Q12059 ULA1 UniProt Q12059 2 平等的 534. 平等的 Reactome DB_ID: 10746306 1 UniProt: Q99344 UBA3 UniProt Q99344 1 平等的 463. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10761402 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761402 反应 r - sce - 8951642 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-8951642.1 Reactome DB_ID:113592 1 ATP (4 -) (ChEBI: 30616) ATP (4) 腺苷5 '三磷酸 三磷酸腺苷 三磷酸腺苷 ChEBI 30616 反应数据库ID:10761412 1 NEDD8-UBA3: NAE1(胞质) NEDD8-UBA3: NAE1 Reactome DB_ID: 10761400 1 2 平等的 534. 平等的 Reactome DB_ID: 10761410 1 NEDD8-UBA3(胞质) NEDD8-UBA3 Reactome DB_ID: 10761408 1 通过S-(甘氨酸)-L-半胱氨酸(Cys-Gly)在76和237(在Homo Sapiens)中间交联交联剂 76 平等的 S-(甘氨酰)-L-半胱氨酸(Cys-Gly) ChEBI 23511 修改 1 平等的 76 平等的 Reactome DB_ID: 10761405 1 通过S-(甘氨酸)-1-半胱氨酸(Cys-Gly)在237和76(在同型Sapiens)的间交联交联剂 237. 平等的 ChEBI 24411 修改 1 平等的 463. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10761410 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761410 反应 r - sce - 8951643 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-8951643.1 Reactome数据库ID Release 77 10761412 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761412 反应 r - sce - 8951646 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-8951646.1 反应DB_ID:76577 1 腺苷5’一磷酸(ChEBI: 16027) 腺苷5'-单磷酸盐 ChEBI 16027 Reactome DB_ID: 111294 1 diphosphoric酸(ChEBI: 29888) diphosphoric酸 ChEBI 29888 生理学-从左到右 激活 Reactome DB_ID: 10761402 0019788 去分子功能 Reactome数据库ID Release 77 10761413 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761413 Reactome数据库ID Release 77 10761415 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761415 反应 r - sce - 8951648 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-8951648.1 NEDD8通过硫酯键连接到E1的催化半胱氨酸上,作为其转移到底物的第一步(Walden et al ., 2003)。NEDD8 E1是由UBA3和NAE1组成的异源二聚体,将NEDD8从“双重负载”状态转移到E2酶。在第一步中,NEDD8与ATP和Mg2+结合到NAE1亚基上的腺苷酸化位点,生成共价修饰的NEDD8-腺苷酸偶联物。这种结合激活NEDD8 c端,由UBA3亚基催化半胱氨酸的硫醇基团进行化学攻击。催化作用可能是由E1酶的构象变化促进的。催化后,NEDD8在E1催化位点共价结合,在第二步中,NEDD8转移到E2酶之前,腺苷化位点自由结合另一个NEDD8分子(Walden et al ., 2003;Huang et al, 2004;Huang et al, 2005;Huang et al, 2007)。 15694336. Pubmed 2005年 在NEDD8的E1的E2结合域Ubc12的招聘结构基础 黄,丹尼T Paydar,Amir. 庄敏 Waddell, M布雷特 霍尔顿,詹姆斯米 Schulman,Brenda A 摩尔。电池17:341-50 15361859 Pubmed 2004年 需要的泛素样蛋白质NEDD8最佳缀合的唯一E1-E2相互作用 黄,丹尼T 米勒,大卫 马修,玫瑰 卡塞尔,罗伯特 霍尔顿,詹姆斯米 Roussel,Martine F. Schulman,Brenda A NAT。结构。摩尔。BIOL。11:927-35 14690597. Pubmed 2003年 APPBP1-UBA3-NEDD8-ATP复合物的结构揭示了E1选择性激活泛素样蛋白的基础 沃尔登,海伦 Podgorski,迈克尔小号 黄,丹尼T 米勒,大卫 霍华德,丽贝卡j 小调,丹尼尔大号 霍尔顿,詹姆斯米 Schulman,Brenda A 细胞12:1427-37摩尔。 17220875 Pubmed 2007年 基于泛素样蛋白硫酯开关E1-E2亲和力 黄,丹尼T 亨特,哈罗德·W 庄敏 Ohi,梅勒妮D 霍尔顿,詹姆斯米 Schulman,Brenda A 自然445:394-8 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 NEDD8- uba3:NAE1绑定第二个NEDD8 NEDD8- uba3:NAE1绑定第二个NEDD8 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: 反弹DB_ID:10754948 1 1 平等的 76 平等的 反应数据库ID:10761412 1 Reactome DB_ID:113592 1 反应数据库ID:10761417 1 NEDD8-UBA3:NAE1:NEDD8 [Cytosol] NEDD8-UBA3: NAE1: NEDD8 反弹DB_ID:10754948 1 1 平等的 76 平等的 反应数据库ID:10761412 1 Reactome数据库ID Release 77 10761417. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761417 反应 R-SCE-8951658 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-sce-8951658.1.1 反应DB_ID:76577 1 Reactome DB_ID: 111294 1 Reactome数据库ID Release 77 10761419. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761419 反应 R-SCE-8951656 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-8951656.1 在将第一NEDD8分子与催化性半胱氨酸共价附着之后,第二NEDD8与UBA3:NAE1的UBA3亚基的无现在无腺苷酸化位点结合。这种“双重装载”的E1酶被灌注将共价结合的NEDD8转移到下游E2酶(Huang等,2005; Huang等,2007;在Enchev等,2015中审查)。注意,尽管在此描述,第二NEDD8部分在该反应结束时在其C末端甘氨酸残基中共价致腺化。 25531226 Pubmed 2015年 蛋白质类泛素化:超越cullin-RING连接酶 Enchev, Radoslav我 Schulman,Brenda A 彼得,马提亚 奈特,《细胞生物学》16:30-44 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 双泛素化的UBA3:NAE1结合AcM-UBE2M 双泛素化的UBA3:NAE1结合AcM-UBE2M 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: Reactome DB_ID: 10761422 1 UniProt: P52491 UBC12 UniProt P52491. N-乙酰-1-甲硫氨酸,1(在同型Sapiens中) 1 平等的 N-乙酰-1-蛋氨酸[MOD:00058] 1 平等的 183 平等的 反应数据库ID:10761417 1 Reactome DB_ID: 10761424 1 AcM-UBE2M: NEDD8-UBA3: NAE1: NEDD8(胞质) AcM-UBE2M: NEDD8-UBA3: NAE1: NEDD8 Reactome DB_ID: 10761422 1 N-乙酰-1-甲硫氨酸,1(在同型Sapiens中) 1 平等的 1 平等的 183 平等的 反应数据库ID:10761417 1 Reactome数据库ID Release 77 10761424. 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761424 反应 r - sce - 8951749 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-8951749.1 Reactome数据库ID Release 77 10761441. 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761441 反应 r - sce - 8951751 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-sce-8951751.1 当NAE1:UBA3与NEDD8加载双重加载时(共价连接到催化半胱氨酸的一个分子和在腺苷酸位点中的另一个分子),E1酶是胜能与其E2酶,UBE2F和UBE2M中的任一种相互作用(也称为UBC12)。三个结合界面有助于E1和E2酶的相互作用。当双丁基化时,NAE1重新定位的“泛素”折叠结构域和与腺化结构域结合形成隐蔽的E2结合位点。腺苷酸化结构域还与E2酶的氨基末端接触。UBE2M另外与共价连接到E1催化性半胱氨酸的NEDD8分子相互作用(Huang等,2004; Huang等,2007;在Enchev等,2015年审查)。UBE2M是负责将NEDD8转移到含RBX1的E3连接酶复合物的E2,例如用Cullins 1,2,3和4形成的那些。相反,UBE2F是CUL5:含RBX2的E3连接酶的E2(Huang Etal,2009)。 19250909 Pubmed 2009年 的NEDD8级联赋予特异性滞修改E2-RING扩张 黄,丹尼T Ayrault,奥利弗 亨特,哈罗德·W Taherbhoy,Asad M Duda,David M. 斯科特,丹尼尔C. 博格,劳拉 尼尔,G 穆雷,彼得Ĵ Roussel,Martine F. Schulman,Brenda A 摩尔。细胞33:483 - 95 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 将NEDD8转移到ACM-UBE2M 将NEDD8转移到ACM-UBE2M 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: Reactome DB_ID: 10761424 1 反应DB_ID:10761432 1 nedd8-acm-ube2m [cytosol] NEDD8-ACM-UBE2M 反应DB_ID:10761430 1 S-(甘氨酸)- l -半胱氨酸(Cys-Gly)在111和76位点的链间交联(在人类中) 111 平等的 N-乙酰-1-甲硫氨酸,1(在同型Sapiens中) 1 平等的 1 平等的 183 平等的 Reactome DB_ID: 10761427 1 在76和111位点通过S-(甘氨酸)- l -半胱氨酸(Cys-Gly)的链间交联(在人类中) 76 平等的 1 平等的 76 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10761432 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761432 反应 r - sce - 4419896 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-4419896.1 反应数据库ID:10761412 1 生理学-从左到右 激活 Reactome DB_ID: 10761424 Reactome数据库ID Release 77 10761433. 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761433 Reactome数据库ID Release 77 10761435. 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761435 反应 R-SCE-8951661 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-8951661.1 UBA3:NAE1将NEDD8转移到UBE2M的催化半胱氨酸残基上。由于三个E1-E2相互作用界面中有两个是由双neddylated NAE1的构象状态创建的,NEDD8转移到UBE2M被认为减弱了UBA3:NAE1和UBE2M之间的相互作用,促进了UBE2M的释放(Walden et al ., 2003;Huang et al, 2004;Hunag等,2005;Huang et al, 2007)。 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 AcM-UBE2M将NEDD8转移到CRL1 E3泛素连接酶复合物 AcM-UBE2M将NEDD8转移到CRL1 E3泛素连接酶复合物 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: 反应DB_ID:10761467 1 NEDD8-AcM-UBE2M:CRL1 E3泛素连接酶:COMMDs:CCDC22:DCUN1Ds [cytosol] NEDD8-AcM-UBE2M:CRL1 E3泛素连接酶:COMMDs:CCDC22:DCUN1Ds 反应DB_ID:10761432 1 反应DB_ID:10761458 1 CRL1 E3泛素连接酶:COMMDs:CCDC22 [cytosol] E3泛素连接酶:COMMDs:CCDC22 反应DB_ID:10761456 1 COMMDs: CCDC22(胞质) COMMDs: CCDC22 反应DB_ID:10761452 1 CCDC22 [cytosol]的幽灵同源物 CCDC22的幽灵同源物 反应DB_ID:10761454 1 COMMDs的鬼同源物[胞质溶胶] commd的Ghost同源物 Reactome数据库ID Release 77 10761456. 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761456 反应 r - sce - 8955646 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的网页连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-sce-8955646.1 反应数据库ID:10746011 1 SCF E3泛素连接酶 SCF E3泛素连接酶 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10746009 1 F-Box蛋白[Cytosol] 从EntitySet的在Reactome转换。每个同义词是PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity HRT3(胞质) doa1 [cytosol] UFO1 [Cytosol] CLB6(胞质) CLN3(胞质) CLB2(胞质) CLB5(胞质) CLB1 [细胞质] cln1 [cytosol] CLN2(胞质) UniProt Q12347 UniProt P36037 UniProt Q04511 UniProt P32943 UniProt P13365 UniProt P24869 UniProt P30283 UniProt P24868 UniProt P20437 UniProt P20438 Reactome DB_ID: 10741961 1 UniProt: Q12018 CDC53 UniProt Q12018 1 平等的 776. 平等的 Reactome DB_ID: 10741959 1 UniProt: P52286 SKP1 UniProt P52286 2 平等的 163 平等的 Reactome DB_ID: 10741963 1 UniProt:Q08273 HRT1 UniProt Q08273 2 平等的 108 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10746011 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10746011 反应 r - sce - 976110 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的网页连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-sce-976110.1 Reactome数据库ID Release 77 10761458 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761458 反应 r - sce - 8955230 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-8955230.1 反应DB_ID:10761463 1 UNIPROT:Q12395 DCN1 UniProt Q12395 1 平等的 259. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10761467 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761467 反应 R-SCE-8952572 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的网页连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-sce-8952572.1 Reactome DB_ID: 10761422 1 N-乙酰-1-甲硫氨酸,1(在同型Sapiens中) 1 平等的 1 平等的 183 平等的 反应DB_ID:10761479 1 NEDD8-CRL1 E3泛素连接酶:COMMDs:CCDC22:DCUN1Ds[胞质] NEDD8-CRL1 E3泛素连接酶:COMMDs:CCDC22:DCUN1Ds 反应DB_ID:10761456 1 反应DB_ID:10761477 1 NEDD8-CRL1 E3连接酶复合物 NEDD8-CRL1 E3连接酶复合物 反应DB_ID:10761475 1 NEDD8-CUL1 [CETOSOL] NEDD8-CUL1 反应DB_ID:10761470 1 n6 -甘基赖氨酸在76和720位点的链间交联(在智人中) 76 平等的 N6-甘氨酰-L-赖氨酸 ChEBI 30777 修改 1 平等的 76 平等的 反应DB_ID:10761473 1 720和76位点泛素化赖氨酸的链间交联(在人类中) 720. 平等的 Neddylated赖氨酸 1 平等的 776. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10761475 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761475 反应 r - sce - 8952589 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-sce-8952589.1 从Reactome中的EntitySet转换而来 Reactome DB_ID: 10746009 1 Reactome DB_ID: 10741959 1 2 平等的 163 平等的 Reactome DB_ID: 10741963 1 2 平等的 108 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10761477 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761477 反应 r - sce - 8952588 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-8952588.1 反应DB_ID:10761463 1 1 平等的 259. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10761479. 数据库标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761479 反应 r - sce - 8952593 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到该实例的网页中Reactome://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-8952593.1 生理学-从左到右 激活 反应DB_ID:10761467 Reactome数据库ID Release 77 10761480 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761480 Reactome数据库ID Release 77 10761482. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10761482 反应 r - sce - 8952618 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-8952618.1 UBE2M将NEDD8转移到CUL1的CUL1中的赖氨酸720在CRL E3 ubiquitin Ligase复合物(Hori等,1999; Duda等,2008)中。Neddylation增加了E3复合物朝向其靶标的泛素化活性,并防止CUL1复合物与Cand1抑制剂的结合(Hori等,1999; Goldenberg等,2004; Duda等,2008; Kelsall等,2013;斯科特等,2016)。Cul1环复合物的靶标包括各种细胞蛋白,包括转录和细胞周期进展的调节剂,其中(在Lipkowitz和Weissman,2011)中审查。CRL1复合物也被病毒劫持,将遍霉素连接酶复合物重定向到靶向宿主蛋白质(在Mahon等,2014中审查)。 10597293 Pubmed 1999 通过NEDD8共价修改人Cullin家族蛋白的所有成员 霍莉,托 大阪,F 千叶,T. 宫本茂,C Okabayashi K Shimbara,N 加藤,年代 田中,K 致癌基因18:6829-34 25314029 Pubmed 2014年 Cullin E3连接酶及其病毒因素的重新定位 马洪,国泰航空 Krogan,妮娃J Craik,查尔斯年代 选择,以拉 生物分子4:897-930 21863050 Pubmed 2011年 好与坏的环:在肿瘤抑制和肿瘤发生的十字路口无名指泛素连接酶 斯坦利·Lipkowitz 斯曼,艾伦•米 癌症牧师11:629-43 27565346 Pubmed 2016年 两种不同类型的E3连接酶协同调节底物泛素化 斯科特,丹尼尔C. Rhee大卫·Y Duda,David M. Kelsall,伊恩·R 奥三,珍妮弗大号 保罗,若豪A 德容,Annemieke Ovaa, Huib 支队伍,阿诺F 哈珀,J韦德 Schulman,Brenda A 细胞166:1198 e24——1214. 24076655 Pubmed 2013年 Triad1和Hhari与不同的Neddylated Cullin-环形连接酶复合物激活并激活 Kelsall,伊恩·R Duda,David M. 奥三,珍妮弗大号 霍夫曼,凯 Knebel,阿克塞尔 朗之万,弗雷德里克 木头,尼古拉 Wightman,Melanie Schulman,Brenda A 支队伍,阿诺F EMBO J. 32:2848-60 18805092 Pubmed 2008年 Cullin环形连接酶的NEDD8激活的结构见解:共轭的构象控制 Duda,David M. 博格,劳拉 斯科特,丹尼尔C. 亨特,哈罗德·W 哈米尔,米歇尔 Schulman,Brenda A 电池134:995-1006 15537541 Pubmed 2004年 Cand1-Cul1-Roc1复合物的结构揭示了多亚基cullin依赖性泛素连接酶组装的调控机制 戈登伯格,SJ Cascio,Thomas C 沙姆韦,司徒d Garbutt,肯尼斯·C 刘,冀东 熊,Y 郑,宁 电池119:517-28 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 Reactome数据库ID Release 77 10764564 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10764564 反应 R-SCE-8951664 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-SCE-8951664.1 NEDD8是一种小的泛素样分子,通过类似泛素的E1到E3酶级联与底物蛋白结合。neddylation最具特征的靶点是cullin环E3泛素连接酶(CRL)的cullin支架亚单位,其自身靶向许多细胞蛋白,以供蛋白酶体降解(Hori等人,1999;Soucy等人于2010年进行了审查;Lyedeard等人,2013年)。多亚单位CRL复合物的组成多种多样,但每个复合物都包含一个支架cullin蛋白(CUL1、2、3、4A、4B、5、7或9)和一个包含E3连接酶亚单位RBX的环盒,以及其他适配器和底物相互作用亚单位。RBX2(也称为RNF7)优先与CUL5相互作用,而RBX1是大多数其他cullin家族成员的主要E3(Mahon等人,2014年审查)。cullin亚基的去乙酰化增加CRL复合物的泛素化活性(Podust等人,2000;里德等人,2000年;吴等,2000年;Kawakami等人,2001年;Ohh等人,2002年;Yu等人,2015年)。除了CRL复合物外,还发现了许多其他特征不太明确的NEDD8靶点。这些包括其他E3泛素连接酶,如SMURF1和MDM2,受体酪氨酸激酶,如EGFR和TGFβRII,以及有助于转录调节的蛋白质等(Xie等人,2014;沃森等人,2010年;Oved等人,2006年;左等,2013;Xirodimas等人,2004年;Singh等人,2007年;阿比达等人,2007年;刘等人,2010年;沃森等人,2006年;Loftus等人,2012年;青木等,2013年;审查内容见Enchev等人,2015年)<与泛素一样,NEDD8经过翻译后处理以生成成熟形式。UCHL3或SENP8介导的蛋白水解去除NEDD8的C端5个氨基酸,产生新的C端甘氨酸残基,用于与底物蛋白中E1、E2酶或赖氨酸残基(通常为E3 NEDD8连接酶本身)中的半胱氨酸残基结合(Wada等人,1998;审查内容见Enchev等人,2015年)。体内大多数底物似乎在一个或多个赖氨酸残基上单独NEDDY化,但体外cullin底物和DNA损伤后培养的人类细胞中的组蛋白H4上已形成NEDD8链(Jones et al,2008;Ohki等人,2009年;Xirodimas等人,2008年;Jeram等人,2010年;马等人,2013年;审查内容见Enchev等人,2015年)。NEDD8链的意义尚不清楚多亚单位COP9信号体是唯一的cullin去乙酰化酶,而SENP8(也称为DEN1)有助于其他非cullin NEDD8靶点的去乙酰化(Cope等人,2002;Emberley等人,2012年;Chan等人,2008年;吴等,2003年;Wei等人,2008年综述;Enchev等人,2015年)。在去乙酰化状态下,cullins与CAND1(cullin相关NEDD8解离蛋白1)结合,后者取代COP9信号体并促进泛素底物特异性适配器的交换。这使得CRL复合物可以重新配置,以针对泛素化的其他亚速率(Liu等人,2002;施密特等人,2009年;皮尔斯等人,2013年;查阅Mahon等人,2014)。

18247557 Pubmed 2008年 泛素样修饰剂nedd8及其相关蛋白的靶向蛋白质组学分析 琼斯,杰弗里 吴,肯尼斯 杨,迎迎 格雷罗州,Cortnie Nillegoda, Nadinath 锅,Zhen-Qiang 黄,兰 J.蛋白质组。7:1274年至1287年 12183637 Pubmed 2002年 预测的Jab1/Csn5金属蛋白酶基序在Cul1裂解Nedd8中的作用 应对,格雷戈里a Suh, Greg S B aravind,l 施瓦兹,西尔维娅E Zipursky,S劳伦斯 Koonin,尤金·V Deshaies,雷蒙德·J 科学298:608-11 23201271 Pubmed 2013年 哺乳动物NEDD8连接酶家族中独特的n端乙酰化依赖相互作用的结构保守 蒙达,朱莉ķ 斯科特,丹尼尔C. 米勒,Darcie J Lydeard,约翰 王大卫 哈珀,J韦德 班尼特(Eric J Schulman,Brenda A 结构21:42-53 20029837. Pubmed 2010年 一种改进的基于summonen的识别泛素和泛素样蛋白结合位点的方法鉴定了新的泛素样蛋白链连接 斯坦利·帕米 Srikumar,Tharan 张相东 安妮艾森霍尔,H 罗杰斯,理查德 佩德罗里,Patrick G A Matunis,迈克尔 Raught,布赖恩 蛋白质组学10:254 - 65 24821572 Pubmed 2014年 共价修饰物Nedd8对于肿瘤发生中Smurf1泛素连接酶的激活至关重要 谢,平 张,明华 他,山 陆,Kefeng 陈女士 兴,Guichun 陆、翳明 刘,平 李,杨 王,少侠 柴楠 吴,加威 邓海腾 王、人力资源 曹宇 赵,费 崔,玉 王的剑 他,府 张令强 纳特COMMUN 5:3733 16980297 Pubmed 2006年 mdm2介导的NEDD8修饰可调控TAp73的反式激活功能 Watson,Ian R. Blanch,Alvaro. 林,丹C C 喔,迈克尔· 欧文,Meredith年代 生物。化学。281:34096-103 16735510 Pubmed 2006年 与Nedd8结合会引起泛素化和活化受体酪氨酸激酶的下调 Oved,什洛莫 Mosesson Y Zwang,Yaara. 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