BIOPAX途径在反应数据库中从“RNA聚合酶III转录”转换。 RNA聚合酶III转录 RNA聚合酶III转录 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: RNA聚合酶III转录开始 RNA聚合酶III转录开始 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: RNA聚合酶III转录起始于Type 1启动子 RNA聚合酶III转录起始于Type 1启动子 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: TFIIA与1型启动子的结合 TFIIA与1型启动子的结合 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: 反应DB_ID:10211820 1 骨髓 0005654. UniProt: A2BEV2 gtf3aa 反应 //www.joaskin.com 鲐鱼类 NCBI分类学 7955 uniprot. A2Bev2. 链坐标 1 平等的 365. 平等的 反应DB_ID:76050 1 RNA聚合酶III 1型封闭启动子[核质] 具有RNA聚合酶III型1封闭式启动子的DNA 反应DB_ID:10211822 1 TFIIIA:Type 1 Promoter complex[核质] TFIIIA:1型启动子复合物 反应DB_ID:10211820 1 1 平等的 365. 平等的 反应DB_ID:76050 1 Reactome数据库ID Release 77 10211822 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10211822 反应 R-DRE-76051 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-76051.1 Reactome数据库ID Release 77 10211824 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id = 10211824 反应 R-DRE-76052 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-76052.1 TFIIIA含有9个C2H2锌指(Arakawa et al., 1995)。它与5S RNA基因的ICR区域和5S RNA结合,形成7S存储核糖核蛋白颗粒(Pelham和Brown, 1980)。TFIIIA与5S基因结合后,TFIIIA锌指在ICR上对齐,c端锌指靠近ICR的5端,n端锌指靠近ICR的3端。锌指1-3接触ICR内的C区,有报道称它贡献了全长蛋白的大部分结合能量(Clemens et al., 1992)。然而,含有锌指4-9的TFIIIA片段与ICR内的A块和中间元素结合,其亲和力接近全长蛋白。这一发现和其他观察结果表明,所有9个TFIIIA锌指同时结合需要在DNA、蛋白质或两者中进行能量上不利的扭曲(Kehres et al., 1997)。 7001457 PubMed. 1980 一种特异性转录因子,可以结合5S RNA基因或5S RNA Pelham,人力资源 布朗,DD Proc Natl Acad SCI U S A 77:4170-4 1438283 PubMed. 1992年 转录因子IIIA-5S RNA基因复合物中单个锌手指的结合位点的定义 克莱蒙斯,克尔 廖,X. 狼,五 赖特,PE Gottesfeld, JM Proc Natl Acad SCI U S 89:10822-6 7789179. PubMed. 1995年 一种新的人基因(GTF3A)对外交转录因子IIIa高度同源的分子克隆,表征和染色体映射 阿拉克,H. Nagase,H. Hayashi N 小川,M 经营,M 高桥,E Shin年代 Nakamura,Yusuke. 细胞基因70:235-8 9242690. PubMed. 1997年 转录因子IIIA的锌指与5s rRNA基因结合时的能量不良相互作用 kehres,dg Subramanyan, GS 挂,VS 罗杰斯,小瓦 塞策,博士 J Biol Chem 272:20152-61 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 TFIIIC与TFIIIA的结合:I型启动子复合物 TFIIIC与TFIIIA的结合:I型启动子复合物 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: 反应DB_ID:10211822 1 Reactome DB_ID: 10211848 1 TFIIIC(核浆) TFIIIC 反应DB_ID:10211828 1 UniProt: F1Q9E5 gtf3c4 uniprot. F1Q9E5 1 平等的 822 平等的 Reactome DB_ID: 10211846 1 UNIPROT:F1R3R9. gtf3c6 uniprot. F1R3R9 2 平等的 213 平等的 反应DB_ID:10211836 1 UNIPROT:E7EZ29. gtf3c5 uniprot. E7EZ29 2 平等的 519 平等的 Reactome DB_ID: 10211840 1 UNIPROT:F1R215 gtf3c2 uniprot. F1R215 1 平等的 911. 平等的 反应DB_ID:10211832 1 UNIPROT:F1RDA7. gtf3c3 uniprot. F1RDA7 1 平等的 886 平等的 Reactome DB_ID: 10211842 1 GTF3C1 [核质]的幽灵同源物 GTF3C1的Ghost同源物 Reactome数据库ID Release 77 10211848 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10211848 反应 R-DRE-83698 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-83698.1 Reactome DB_ID: 10211850 1 TFIIIC:TFIIA:I型启动子复合体[核质] TFIIIC:TFIIIA: I型启动子复合物 反应DB_ID:10211820 1 1 平等的 365. 平等的 反应DB_ID:76050 1 Reactome DB_ID: 10211848 1 Reactome数据库ID Release 77 10211850. 数据库标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10211850 反应 R-DRE-76053 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-76053.1 Reactome数据库ID Release 77 10211852 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10211852 反应 R-DRE-76054 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-76054.1 蛋白水解和扫描电镜研究表明,s .酵母TFIIIC包含两个球状域由一个灵活的连接器,其中一个,指定τB, B结合强烈的盒子,和其他指定的τ,结合弱一盒,2型启动子(舒尔茨et al ., 1989)。DNA足迹和蛋白质相互作用研究(Hsieh et al., 1999a;谢等,1999b;Kovelman和Roeder, 1992年;Shen et al., 1996;Yoshinaga等人,1989)支持图中所示的模型。Brf1-TFIIIB的组成部分(见TFIIIB项)用灰色表示,TFIIIA用蓝色表示。蛋白质- dna强交联位点用小椭圆形表示。黑色和灰色矩形分别表示在人类和酿酒酵母TFIIIC亚基中观察到的蛋白质-蛋白质接触。TFIIIC亚基在1型和2型启动子上的总体排列惊人地相似(Bartholomew et al., 1990; Braun et al., 1992a).

On type 1 promoters, S. cerevisiae TFIIIA cross-links strongly to the A box and more weakly over most of the gene, suggesting that it extends over most of the gene (Braun et al., 1992a). Tfc3 is shifted downstream as compared to its position in the tRNA gene, with a main cross-link at the 3 end of the C box and another one further downstream. The Tfc6 subunit cross-links at the end of the gene, like in type 2 genes. There is no indication that the Tfc7 subunit contacts DNA in type 1 genes, but the Tfc1 subunit cross-links strongly upstream of the A box. The Tfc4 subunit crosslinks to sites around and upstream of the start site of transcription (Braun et al., 1992a).

Numerous protein-protein contacts between various TFIIIC subunits have been described, which are symbolized by small rectangles in the figure. The black rectangles indicate contacts identified with human TFIIIC subunits, the grey rectangles with S. cerevisiae TFIIIC subunits. Thus, Tfc7 interacts directly with Tfc1 (Manaud et al., 1998). TTFIIIC90 interacts with TFIIIC220, TFIIIC110, and TFIIIC63 (Hsieh et al., 1999). TFIIIC102 interacts with TFIIIC63 (Hsieh et al., 1999). Various TFIIIC subunits also interact directly with Brf1-TFIIIB subunits, as shown in the figure. These protein-protein contacts are discussed below. 2684647 PubMed. 1989 用扫描透射电镜观察了酵母转录因子tau的两个dna结合域 舒尔茨,P Marzouki,N .. 马克,C. Ruet, Oudet P Sentenac, EMBO J 8:3815-24 1447193 PubMed. 1992年 两种形式的人转录因子IIIC的纯化和表征 Kovelman R 罗德尔,rg. J Biol Chem 267:24446-56 10373544 PubMed. 1999年 人TFIIIC的两种进化保守亚基(TFIIC102和TFIIIC63)的克隆与表征及其与TFIIIB和RNA聚合酶III的功能相互作用 谢长廷,YJ 王,Z. Kovelman R 罗德尔,rg. Mol Cell Biol 19:4944-52 10523658 PubMed. 1999年 TFIIC90 TFIIIC亚基与RNA聚合酶III机械的多种组分相互作用,含有组蛋白特异性乙酰转移酶活性。 Kundu,TK. 罗德尔,rg. Mol Cell Biol 19:7697-704 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 TFIIIB与TFIIIC的结合:TFIIIA:Type I Promoter complex TFIIIB与TFIIIC的结合:TFIIIA:Type I Promoter complex 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: Reactome DB_ID: 10211862 1 TFIIIB-Type 1和2启动子选择性复合体[核质] TFIIIB-Type 1和2启动子选择性复合物 Reactome DB_ID: 10211856 1 UNIPROT:F1R9S3. brf1a. uniprot. F1R9S3 1 平等的 677 平等的 反应DB_ID:10211860 1 UNIPROT:I3ISZ0. uniprot. I3ISZ0. 1 平等的 2624 平等的 Reactome DB_ID: 10210095 1 UNIPROT:Q7SXL3. TBP. uniprot. Q7SXL3 1 平等的 339. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10211862 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10211862 反应 r - dre - 83719 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-83719.1 Reactome DB_ID: 10211850 1 Reactome DB_ID: 10211864 1 TFIIIB:TFIIIC:TFIIIA:Type 1 Promoter Complex[核质] TFIIIB:TFIIIC:TFIIIA:1型启动子复合物 Reactome DB_ID: 10211862 1 Reactome DB_ID: 10211850 1 Reactome数据库ID Release 77 10211864 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10211864 反应 R-DRE-76055 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-76055.1 Reactome数据库ID Release 77 10212545. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212545 反应 r - dre - 83723 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-83723.1 在S.Cerevisiae(Joaeaeiro等,1996)中,已经在培训到1型和2型启动子募集到1型和2型启动子。TFIIIC的TFC4亚基,其在转录开始部位(Bartholomew等,1990)上突出,可以与BRF1-TFIIIB的BRF1亚基相互作用(Moir等,1997)。TFC4亚基,其含有11份的四肽重复(TPR),似乎在促进与SCBRF1的结合期间进行构象变化,并适应TFIIIB的可变放置(Moir等,1997)。如图所示,已经描述了许多涉及S.酿酒酵母和人TFIIC和TFIIIB亚基的蛋白质 - 蛋白质联合,其可以参与募集TFIIIB至1型和2型启动子。因此,TFC8已被展示以与BDP1和TBP相互作用,以及具有BRF1的相应的人蛋白TFIIC90(HSIEH等,1999);TFC4具有BRF1和BDP1,以及具有BRF1和TBP的相应的人蛋白TFIIC102(HSIEH等,1999);和BRF1和TBP的人蛋白TFIIC63(HSIEH等,1999)。 11684692 PubMed. 2002年 TFIIIC四肽重复含亚基结合TFIIIB70的自抑制作用 Moir,Rd. 普利亚,KV 威利斯,我 J Biol Chem 277:694-701 2303478 PubMed. 1990 Nascent RNA的RNA聚合酶III转录复合物的光谱分脂 Bartholomew,B. 米尔斯,CF 达马斯,我 J Biol Chem 265:3731-7 8598299. PubMed. 1996年 启动子复合物组装的替代结果:TBP和灵活的连接子在将TFIIIB置于tRNA基因上的作用 Joaazeiro,Claudio A. 凯西斯,乔治A. Geiduschek E彼得 基因Dev 10:725-39 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 RNA聚合酶III募集到TFIIIB:TFIIIC:TFIIIA:1型启动子复合物 RNA聚合酶III募集到TFIIIB:TFIIIC:TFIIIA:1型启动子复合物 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: Reactome DB_ID: 10211864 1 反应DB_ID:10211916 1 RNA聚合酶III全酶[核状] RNA聚合酶III全酶 反应DB_ID:10208346 1 UNIPROT:Q568H8 polr2h uniprot. Q568H8 2 平等的 150. 平等的 反应DB_ID:10211914 1 UNIPROT:Q6DGU0. polr3k. uniprot. Q6DGU0 1 平等的 108. 平等的 反应DB_ID:10208350 1 UniProt: F1RDV9 polr2k uniprot. F1RDV9 1 平等的 58. 平等的 Reactome DB_ID: 10208362 1 UniProt: A5D6S6 polr2l uniprot. A5D6S6 1 平等的 67. 平等的 反应DB_ID:10210194 1 UNIPROT:A2ATX1 polr1c uniprot. A2ATX1 2 平等的 346. 平等的 反应DB_ID:10211868 1 UNIPROT:A0A0R4IV41 polr3a uniprot. A0A0R4IV41. 1 平等的 1390 平等的 反应DB_ID:10211910 1 HSRPC6:HSRPC3:HSRPC7 [Nocleoplasm] HSRPC6:HSRPC3:HSRPC7 反应DB_ID:10211898 1 UniProt: Q6NYQ9 polr3f. uniprot. Q6NYQ9 1 平等的 316 平等的 反弹DB_ID:10211894 1 UniProt: Q7ZUX1 polr3c. uniprot. Q7ZUX1 1 平等的 534 平等的 从Reactome中的EntitySet转换而来 反应DB_ID:10211908 1 RPC7 / RPC7样[核质] 从Reactome中的EntitySet转换而来。每个同义词是一个PhysicalEntity的名称,每个XREF指向一个PhysicalEntity polr3g [nocleoplasm] polr3glb(核浆) uniprot. A0A0R4IMD8 uniprot. F1R2W0. Reactome数据库ID Release 77 10211910 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10211910 反应 r -衣服1964442 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-1964442.1 反应DB_ID:10211872 1 UniProt: F1QQA2 polr3b. uniprot. F1QQA2. 1 平等的 1133. 平等的 反应DB_ID:10211890 1 HSRPC4:HSRPC5 [核质] HsRPC4: HsRPC5 反应DB_ID:10211888 1 UNIPROT:F1R866. polr3e. uniprot. F1R866 1 平等的 708. 平等的 反应DB_ID:10211884 1 polr3d [核质]的鬼材同源物 Polr3d的幽灵同源物 Reactome数据库ID Release 77 10211890 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10211890 反应 r -衣服1964428 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-1964428.1 Reactome DB_ID: 10208354 1 UniProt: Q6DEG5 polr2eb. uniprot. Q6DEG5 1 平等的 210 平等的 反应DB_ID:10210190 1 POLR1D的Ghost同源物[核质] Polr1d的幽灵同源物 反应DB_ID:10211882 1 HsRPC8: HsRPC9(核浆) HSRPC8:HSRPC9. 反应DB_ID:10211876 1 UNIPROT:A0A0R4IQ64. polr3h. uniprot. A0A0R4IQ64 1 平等的 204 平等的 反应DB_ID:10211880 1 UniProt: F1QK38 uniprot. F1QK38 1 平等的 148. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10211882 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10211882 反应 r -衣服1964452 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-1964452.1 Reactome DB_ID: 10208358 1 UniProt: A0A2R8PUZ9 polr2f uniprot. A0A2R8PUZ9 2 平等的 127. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10211916. 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10211916 反应 r - dre - 83716 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-83716.1 反应DB_ID:10211918 1 RNA聚合酶III:TFIIIB:TFIIIC:TFIIIA:Type 1 Promoter Complex[核质] RNA聚合酶III:TFIIIB:TFIIIC:TFIIIA:1型启动子复合物 Reactome DB_ID: 10211864 1 反应DB_ID:10211916 1 Reactome数据库ID Release 77 10211918. 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacodome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10211918 反应 r - dre - 83717 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-83717.1 Reactome数据库ID Release 77 10211920 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10211920 反应 R-DRE-76056 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-76056.1 在酵母系统中进行的交联实验表明,在转录起始复合物中,8个RNA聚合酶III亚基可以与DNA交联(Bartholomew et al., 1993)。众所周知,C34亚基是转录起始而非延伸所必需的(Wang and Roeder, 1997;Werner et al., 1993),绘制了转录起始位点最远的上游,靠近Brf1-TFIIIB (Bartholomew et al., 1993)。事实上,这个亚基与Brf1相互作用(Khoo et al., 1994;Werner et al., 1993)。该图显示了这种蛋白质和其他涉及RNA聚合酶III亚基和TFIIIC或Brf1-TFIIIB亚基的蛋白质-蛋白质接触。点状箭头表示与酿酒酵母蛋白接触的人,实心箭头表示与人蛋白接触的人。酿酒酵母RNA聚合酶III亚基C53和ABC10a都与Tfc4相互作用(1999;Flores et al., 1999), C17和C34都与Brf1相互作用。人类RPC62亚基与TIIIC63相互作用,RPC39与TFIIIC亚基TFIIIC90和TFIIIC63相互作用(Hsieh et al., 1999a)以及Brf1- tfiiib亚基Brf1和TBP相互作用(Wang and Roeder, 1997)。 The contacts between RNA polymerase III and TFIIIC subunits are not absolutely required for transcription in vitro with the S. cerevisiae system, in which TFIIIC can be stripped from the DNA after assembly of TFIIIB without compromising transcription (Kassavetis et al., 1990) or, indeed, where transcription can be performed in the absence of TFIIIC on TATA box-containing promoters (Kassavetis et al., 1995). Nevertheless, they may contribute to the recruitment of RNA polymerase III in vivo. 8407894 PubMed. 1993年 RNA聚合酶III亚基复合物与转录因子IIIB的70-KDA组分之间的相互作用 维尔纳,M Chaussvert,N 威利斯,我 Sentenac, 生物。化学。268:20721-4 1946469 PubMed. 1991. 转录因子IIF的小亚基促进RNA聚合酶II进入后络合物 Flores,O. 鲁,H. Killeen米 Greenblatt,J. 伯顿,Z F Reinberg D Proc。国家的。学会科学。U.S.A. 88:9999-10003 7568218 PubMed. 1995年 TFC5的克隆,表达和功能,编码酿酒酵母RNA聚合酶III转录因子TFIIIB的B“组分的基因 凯西斯,乔治A. 阮,S T Kobayashi,R. 库马尔, 吉迪斯谢克,e p Pisano,M. Proc。国家的。学会科学。美国92:9786 - 90 2404611 PubMed. 1990 S. Cerevisiae TFIIIB是RNA聚合酶III的转录起始因子适当,而TFIIIA和TFIIIC是组装因素 凯西斯,乔治A. 布劳恩,B R nguyen,l h 吉迪斯谢克,e p 细胞60:235-45 19896182 PubMed. 2009年 DNA复制起始许可过程中Mcm2-7双六聚体在DNA周围的协同加载 雷姆斯,德克 Beuron,Fabienne. Tolun,Gökhan. 格里菲斯,杰克d 莫里斯,爱德华P. diffley,约翰f x 细胞139:719-30 7995525. PubMed. 1994年 RNA聚合酶III一般转录因子BRF的保守功能域 邱,B Brophy,B. 杰克逊,斯普里 基因Dev。8:2879 - 90 9171375. PubMed. 1997年 三种人RNA聚合酶III特异性亚基在特定转录开始中形成具有选择性功能的子核糖 王,Z. 罗德尔,rg. 基因Dev 11:1315-26 9312031. 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Durkovich,D 凯西斯,乔治A. 吉迪斯谢克,e p 摩尔。细胞。生物13:942-52 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 Reactome数据库ID Release 77 10321498 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10321498 反应 R-DRE-76061 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-76061.1 1型启动子募集TFIIA,C2H2锌手指DNA结合蛋白的创始成员(Engelke等,1980; Sakonju等,1981)。然后TFIIA的结合允许TFIIC(Lassar等,1983)的结合,该复合物组成的五个亚基(其不同于人体细胞和S.Pombe的六个亚基)。一旦形成DNA / TFIIA / TFIIIC复合物,BRF1-TFIIIB就会加入复合物,反过来允许募集RNA聚合酶III(Bieker等,1985;塞子和棕色,1985)。 3972795 PubMed. 1985 5 S RNA转录复合物的形成和稳定性 塞策,博士 布朗,DD J Biol Chem 260:2483-92 6356356 PubMed. 1983 III类基因的转录:开封复合物的形成 拉索,AB 马丁,PL. 罗德尔,rg. 科学222:740-8 7226225 PubMed. 1981 转录因子与5S核糖体RNA基因缺失突变体的结合 Sakonju,年代 布朗,DD Engelke D Ng, SY Shastry,废话 罗德尔,rg. 电池23:665-9 6153931 PubMed. 1980 纯化的转录因子与5S RNA基因的内部对照区域的特异性相互作用 Engelke,Dr. Ng, SY Shastry,废话 罗德尔,rg. 细胞19:717-28 3967290. PubMed. 1985 5S RNA基因转录限速中间体的形成 Bieker,JJ. 马丁,PL. 罗德尔,rg. 小区40:119-27 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 来自2型启动子的RNA聚合酶III转录开始 来自2型启动子的RNA聚合酶III转录开始 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: TFIIIC与Type 2启动子的结合 TFIIIC与Type 2启动子的结合 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: 反应DB_ID:8374​​7 1 2型封闭启动子[核质]的DNA聚合酶III RNA聚合酶III型2型封闭启动子的DNA Reactome DB_ID: 10211848 1 反应DB_ID:10212547 1 TFIIIC:2型启动子复合物[核质] TFIIIC:2型启动子复合物 反应DB_ID:8374​​7 1 Reactome DB_ID: 10211848 1 Reactome数据库ID Release 77 10212547. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212547 反应 r - dre - 83748 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-83748.1 Reactome数据库ID Release 77 10212549. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212549 反应 r - dre - 83788 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-83788.1 蛋白水解和扫描电镜研究表明,s .酵母TFIIIC包含两个球状域由一个灵活的连接器,其中一个,指定τB, B结合强烈的盒子,和其他指定的τ,结合弱一盒,2型启动子(Marzouki et al ., 1986)。DNA足迹和蛋白质相互作用研究(Hsieh et al., 1999;谢等人,1999;Kovelman和Roeder, 1992年;Shen et al., 1996;Yoshinaga等人,1989)支持图中所示的模型。Brf1-TFIIIB的组成部分(见TFIIIB项)用灰色表示,TFIIIA用蓝色表示。蛋白质- dna强交联位点用小椭圆形表示。黑色和灰色矩形分别表示在人类和酿酒酵母TFIIIC亚基中观察到的蛋白质-蛋白质接触。TFIIIC亚基在1型和2型启动子上的总体排列惊人地相似(Bartholomew et al., 1990; Braun et al., 1992a).

On a type 2 promoter, the S. cerevisiae Tfc3 subunit cross-links primarily just upstream of the B box and Tfc6 cross-links at the end of the gene (Bartholomew et al., 1990). Tfc1 and Tfc7 have strong cross-links within and near the 3 end of the A box, respectively (Bartholomew et al., 1990). Tfc8 does not cross-link to DNA, and after partial protease digestion of TFIIIC, is found in the tB domain. In addition, however, Tfc8 displays genetic interactions with Tfc1, TBP, and ScBdp1, and it associates with TBP in vitro, suggesting that it is also present in the tA domain. The Tfc4 subunit cross-links to sites around and upstream of the transcription start site (Bartholomew et al., 1990) and directly contacts both the ScBrf1 and ScBdp1 subunits of TFIIIB.

Numerous protein-protein contacts between various TFIIIC subunits have been described, which are symbolized by small rectangles in the figure. The black rectangles indicate contacts identified with human TFIIIC subunits, the grey rectangles with S. cerevisiae TFIIIC subunits. Thus, Tfc7 interacts directly with Tfc1. TTFIIIC90 interacts with TFIIIC220, TFIIIC110, and TFIIIC63 (Hsieh et al., 1999). TFIIIC102 interacts with TFIIIC63 (Hsieh et al., 1999). Various TFIIIC subunits also interact directly with Brf1-TFIIIB subunits, as shown in the figure. 2732244 PubMed. 1989 转录因子IIIC2的纯化和表征 Yoshinaga, SK l'etoile,nd 伯克,AJ J Biol Chem 264:10726-31 3528868 PubMed. 1986 选择性蛋白水解在酵母转录因子Tau中定义了两个DNA结合结构域 Marzouki,N .. Camier,S. Ruet, Moenne, Sentenac, 自然323:176-8 8754815 PubMed. 1996年 转录因子II的DNA结合结构域和亚单位相互作用,透析脊髓灰质炎病毒3C蛋白酶释放 沈,Y ,米 Yalamanchili,P 伯克,AJ 达斯古普塔, Mol Cell Biol 16:4163-71 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 TFIIIB与TFIIC的结合:2型启动子复合物 TFIIIB与TFIIC的结合:2型启动子复合物 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: 反应DB_ID:10212547 1 Reactome DB_ID: 10211862 1 反应DB_ID:10212551 1 TFIIIB:TFIIIC:2型启动子复合物[核质] TFIIIB:TFIIIC:2型启动子复合物 反应DB_ID:10212547 1 Reactome DB_ID: 10211862 1 Reactome数据库ID Release 77 10212551. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212551 反应 r - dre - 83749 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-83749.1 Reactome数据库ID Release 77 10212553. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212553 反应 r - dre - 83790 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-83790.1 在S.Cerevisiae(Joaeaeiro等,1996)中,已经在培训到1型和2型启动子募集到1型和2型启动子。TFIIIC的TFC4亚基,其在转录开始部位(Bartholomew等,1990)上突出,可以与BRF1-TFIIIB的BRF1亚基相互作用(Moir等,1997)。TFC4亚基,其含有11份的四肽重复(TPR),似乎在促进与SCBRF1的结合期间进行构象变化,并适应TFIIIB的可变放置(Moir等,1997)。如图所示,已经描述了许多涉及S.酿酒酵母和人TFIIC和TFIIIB亚基的蛋白质 - 蛋白质联合,其可以参与募集TFIIIB至1型和2型启动子。因此,TFC8已被展示以与BDP1和TBP相互作用,以及具有BRF1的相应的人蛋白TFIIC90(HSIEH等,1999);TFC4具有BRF1和BDP1,以及具有BRF1和TBP的相应的人蛋白TFIIC102(HSIEH等,1999);和BRF1和TBP的人蛋白TFIIC63(HSIEH等,1999)。 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 RNA聚合酶III到TFIIIB的招募:TFIIIC: Type 2 Promoter Complex RNA聚合酶III到TFIIIB的招募:TFIIIC: Type 2 Promoter Complex 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: 反应DB_ID:10212551 1 反应DB_ID:10211916 1 反应DB_ID:10212603 1 RNA聚合酶III:TFIIIB:TFIIIC:Type 2 Promoter Complex[核质] RNA聚合酶III:TFIIIB:TFIIIC:2型启动子复合物 反应DB_ID:10212551 1 反应DB_ID:10211916 1 Reactome数据库ID Release 77 10212603 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212603 反应 r - dre - 83750 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-83750.1 Reactome数据库ID Release 77 10212605 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212605 反应 R-DRE-83805 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-83805.1 在该反应开始时,存在1分子的'TFIIIB:TFIIC:2型启动子复合物',以及1分子的'RNA聚合酶III全酶'。在该反应结束时,存在1分子的'RNA聚合酶III:TFIIIB:TFIIIC:2型启动子复合物'。

这种反应发生在“核心”(Hernandez 2002,Geiduschek和Kassavettis 2001中)。
11419933. PubMed. 2001年 RNA聚合酶III转录装置。 Geiduschek E彼得 凯西斯,乔治A. J Mol Biol 310:1-26 12381659 PubMed. 2002年 RNA聚合酶III的募集到它的目标启动子。 埃尔尼亚州埃斯南德斯 基因开发者16:2593-620 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 Reactome数据库ID Release 77 10321560 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10321560 反应 R-DRE-76066 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-76066.1 2型启动子可以在没有TFIIA的帮助下招募TFIIIC,因为TFIIC直接与A和B箱结合。至于1型启动子,然后允许BRF1-TFIIIB和RNA聚合酶III的结合。重要的是,在酵母体系中,一旦募集到1型或2型启动子,可以从具有高盐或肝素处理的DNA中剥离TFIIIa和/或TFIIC。BRF1-TFIIIB保持与DNA相结合,足以指导多轮转录。 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 来自3型启动子的RNA聚合酶III转录开始 来自3型启动子的RNA聚合酶III转录开始 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: SNAPc、Oct-1和Staf与Type 3启动子的结合 SNAPc、Oct-1和Staf与Type 3启动子的结合 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: 反应DB_ID:83752 1 具有RNA聚合酶III型3闭合启动子[核质]的DNA 具有RNA聚合酶III型3封闭启动子的DNA Reactome DB_ID: 10212583 1 UNIPROT:F1QFX7. znf143a uniprot. F1QFX7. 1 平等的 638 平等的 Reactome DB_ID: 10212575 1 Snapc [nocleoplasm] SNAPc 反应DB_ID:10212557 1 UniProt: E7F685 snapc2 uniprot. E7F685. 1 平等的 334. 平等的 反应DB_ID:10212565 1 UniProt: F1QWM0 snapc3 uniprot. F1QWM0. 1 平等的 411 平等的 反应DB_ID:10212569 1 UNIPROT:Q1LXI0. snapc5 uniprot. Q1LXI0. 1 平等的 98. 平等的 Reactome DB_ID: 10212573 1 UNIPROT:F1QVS5. snapc4 uniprot. F1QVS5 1 平等的 1469 平等的 反应DB_ID:10212561 1 UniProt: Q7ZUP7 snapc1b uniprot. Q7ZUP7. 1 平等的 368. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10212575. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212575 反应 r - dre - 83730 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-83730.1 Reactome DB_ID: 10212579 1 UniProt: F1QYS9 pou2f1b. uniprot. F1QYS9. 1 平等的 743. 平等的 Reactome DB_ID: 10212585 1 SNAPc:Oct-1: staff:Type 3 Promoter Complex[核质] SNAPc:Oct-1: staff:Type 3 Promoter Complex 反应DB_ID:83752 1 Reactome DB_ID: 10212583 1 1 平等的 638 平等的 Reactome DB_ID: 10212575 1 Reactome DB_ID: 10212579 1 1 平等的 743. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10212585. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212585 反应 r - dre - 83753 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-83753.1 Reactome数据库ID Release 77 10212587. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212587 反应 r - dre - 83791 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-83791.1 SNAPc专门绑定到PSE。这种结合部分是由SNAP190中不寻常的Myb结构域介导的(Mittal et al., 1999;黄等人,1998)。然而,即使仅由Myb结构域组成的SNAP190片段与DNA结合,在复合物中Myb结构域不足以结合。与DNA特异性结合的最小的具有特征的SNAPc亚基的亚组合包括SNAP190 aa 84-505, SNAP43 aa 1-268和SNAP50 (Ma和Hernandez, 2000)。UV交联实验表明,SNAP190 (Yoon et al., 1995)和SNAP50 (Henry et al., 1996)都与DNA密切接触,这与SNAP190和SNAP50的部分DNA结合要求一致。SNAPc与PSE的结合通过与其他转录起始复合物成员(包括Oct-1、TBP和Brf2)的合作相互作用而稳定。

SNAPc与核心启动子的结合是通过与Oct-1 POU结构域的蛋白-蛋白直接接触而稳定的。

SNAPc本身不能非常有效地绑定到PSE。它包含一个位于SNAP190和/或SNAP45 c端三分之二的DNA结合抑制器,因为缺乏这些序列的SNAPc亚复合物(mini-SNAPc)比完整的SNAPc更有效地与DNA结合(Mittal et al., 1999)。SNAPc内的阻尼器可能通过与Oct-1 POU结构域直接接触的构象变化而失活性。转录起始复合物如图6所示。Oct-1 POU结构域与SNAPc之间的蛋白-蛋白接触涉及到Oct-1 POU结构域内7位的谷氨酸和SNAP190内900位的赖氨酸,在图6中用小三角形表示(Ford et al., 1998; Hovde et al., 2002; Mittal et al., 1999). The octamer sequence within the DSE and the PSE are separated by more than 150 base pairs, but the direct protein-protein contact is rendered possible by the presence of a positioned nucleosome between the DSE and the PSE, which, as shown in the figure, probably brings into close proximity the Oct-1 POU domain and SNAPc (Stunkel et al., 1997; Zhao et al., 2001). 7891697 PubMed. 1995年 近端序列元素结合转录因子(PTF)是RNA聚合酶II-and和RNA聚合酶III依赖性小核RNA基因的转录所需的多管道复合物 yoon,jb. 墨菲,S 巴姨,我 王,Z. 罗德尔,rg. 摩尔。细胞。BIOL。15:2019-27 9234698 PubMed. 1997年 位于远端启动子区域中的核小体激活人U6基因的转录 斯图克尔,W. kber,我 Seifart,Kh. 摩尔。细胞。BIOL。17:4397-405 9003788 PubMed. 1996年 snrna激活蛋白复合物SNAPc的亚基SNAP50的克隆和特性分析 亨利,r w 马,B. Sadowski, CL Kobayashi,R. 埃尔南德斯,N EMBO J.15:7129-36 11056176. PubMed. 2001年 小核rna激活蛋白复合物SNAPc内的蛋白质-蛋白质接触图 马,B. 埃尔尼亚州埃斯南德斯 生物。化学276:5027-35 10421633 PubMed. 1999年 SNAP(c):具有内置dna结合阻尼器的核心启动子因子,由Oct-1 POU结构域失活 米特,五 马,B. 埃尔南德斯,N 基因Dev。13:1807-21 11463379. PubMed. 2001年 人体U6启动子的定位核小体允许在10月1日域招募Snapc 赵,X. PENDERGRAST,PS. 埃尔南德斯,N 细胞7:539-49摩尔。 9418884 PubMed. 1998年 基础转录因子Snapc的大亚基是一种与OCT-1相互作用的MyB结构域蛋白质 黄,M W. 亨利,r w 马,B. Kobayashi,R. klages,n 马蒂亚斯,P Strubin,M. 埃尔南德斯,N 摩尔。细胞。BIOL。18:368-77 11856838. PubMed. 2002年 10 -1/SNAP190肽/DNA复合物的结晶 Hovde,Stacy. 布鲁克斯,艾梅 强,凯蒂 乔兹,詹姆斯H Acta Crystallogr。D生物。Crystallogr。58:511-2 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 TFIIIB与SNAPc的结合:Oct-1: staff:Type 3 Promoter Complex TFIIIB与SNAPc的结合:Oct-1: staff:Type 3 Promoter Complex 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: 反应DB_ID:10212593 1 TFIIIB型3启动子选择性复合物[核质] TFIIIB-Type 3启动子选择性复合物 反应DB_ID:10212591 1 UNIPROT:A8KBY2. BRF2. uniprot. A8KBy2. 1 平等的 419 平等的 反应DB_ID:10211860 1 1 平等的 2624 平等的 Reactome DB_ID: 10210095 1 1 平等的 339. 平等的 Reactome数据库ID Release 77 10212593. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212593 反应 r - dre - 83722 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-83722.1 Reactome DB_ID: 10212585 1 反应DB_ID:10212595 1 TFIIIB:SNAPc:Oct-1: staff:Type 3 Promoter Complex[核浆] TFIIIB:Snapc:10月1:Staf:3型启动子复合物 反应DB_ID:10212593 1 Reactome DB_ID: 10212585 1 Reactome数据库ID Release 77 10212595. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212595 反应 r - dre - 83754 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-83754.1 Reactome数据库ID Release 77 10212597. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212597 反应 r - dre - 83793 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-83793.1 snRNA激活蛋白复合物(SNAPc) (Sadowski et al., 1993)、PSE结合蛋白(PBP) (Waldschmidt et al., 1991)或PSE转录因子(PTF) (Murphy et al., 1992)。该综合体包含五种类型的子单元并绑定到PSE。3型启动子还通过与SNAPc结合的蛋白-蛋白接触以及Brf2-TFIIIB的TBP组分与TATA盒的直接关联来招募Brf2-TFIIIB。这就允许RNA聚合酶III加入复合物。 1535687. PubMed. 1992年 Oct-1和Oct-2增强转录因子与小核RNA基因近端序列元件的功能相互作用 墨菲,S yoon,jb. Gerter,T. 罗德尔,rg. Mol Cell Biol 12:3247-61 1868835. PubMed. 1991. 在体外鉴定哺乳动物U6基因表达所需的转录因子 Waldschmidt R Wanandi,我 Seifart,Kh. EMBO J 10:2595-603 8339931. PubMed. 1993年 靶向TBP到非塔塔盒CIS-COMMILOVY元件:含有TBP的复合物通过PSE激活来自SNRNA启动子的转录 Sadowski, CL 亨利,伦 Lobo,SM. 埃尔尼亚州埃斯南德斯 基因Dev 7:1535-48 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 RNA聚合酶III至TFIIIB的募集:SNAPC:3型启动子复合物 RNA聚合酶III至TFIIIB的募集:SNAPC:3型启动子复合物 该事件已从另一种物种中展示的事件计算地推断出来。

推断是基于豹的同源映射。简而言之,将所有涉及的身体性(进入,输出和催化剂)的反应具有映射的原序/级级蛋黄(用于复合物,至少75%的组分必须具有映射)。还推断出这些事件的高级事件,以便更容易导航。

有关Panther的详细信息另请参阅: 反应DB_ID:10212595 1 反应DB_ID:10211916 1 反应DB_ID:10212599 1 RNA聚合酶III:TFIIIB:Snapc:3型启动子复合物[核质] RNA聚合酶III:TFIIIB:SNAPC:3型启动子复合物 反应DB_ID:10212595 1 反应DB_ID:10211916 1 Reactome数据库ID Release 77 10212599. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212599 反应 r - dre - 83755 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-83755.1 Reactome数据库ID Release 77 10212601 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10212601 反应 R-DRE-83803 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-83803.1 SNAPc与PSE的结合不仅通过与Oct-1 POU域的合作相互作用而稳定下来,还通过与TBP和Brf2的合作相互作用而稳定下来(Hinkley et al., 2003;Ma和Hernandez, 2002年;米塔尔和赫尔南德斯,1997)。此外,不能单独与DNA结合的Brf2能够识别并稳定与TATA盒结合的TBP (Cabart and Murphy, 2001;卡巴特和墨菲,2002年;Ma和Hernandez, 2002)。因此,U6转录起始复合物是由蛋白质-蛋白质和蛋白质- dna相互作用的复杂网络稳定的。然而,关于这一复合体是如何招募RNA聚合酶III的,我们一无所知。 12621023. PubMed. 2003年 小核RNA活化蛋白190 MYB DNA结合结构域刺激塔塔盒结合蛋白 - 塔塔盒识别 欣克利,CS HIRSCH,HA. 顾左 Lamere,B 亨利,伦 J Biol Chem 278:18649-57 12391172 PubMed. 2002年 人类U6转录起始复合物组装的冗余合作相互作用 马,B. 埃尔尼亚州埃斯南德斯 Mol Cell Biol 22:8067-78 9027316 PubMed. 1997年 人TBP氨基末端区域在U6 snRNA转录中的作用 米特,五 埃尔尼亚州埃斯南德斯 科学275:1136-40 11564744 PubMed. 2001年 BRFU是一种tfiib样因子,通过与tata结合蛋白相互作用,直接被招募到聚合酶III小核RNA基因启动子的TATA-box中 Cabart P 墨菲,S J Biol Chem 276:43056-64 12016223. PubMed. 2002年 人类小核RNA基因特异性转录因子IIIB复合物的促进剂 Cabart P 墨菲,S J Biol Chem 277:26831-8 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 Reactome数据库ID Release 77 10321562 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=10321562 反应 R-DRE-76071 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-dre-76071.1 由人U6启动子举例说明的甲卓特异性3型启动子,募集复杂的各种称为SnRNA活化蛋白复合物(SnaRC)(Snawowski等,1993),PSE结合蛋白(PBP)(Waldschmidt等人。,1991),或PSE转录因子(PTF)(Murphy等,1992)。该综合体包含五种类型的子单元并绑定到PSE。3型启动子还通过与SNAPc结合的蛋白-蛋白接触以及Brf2-TFIIIB的TBP组分与TATA盒的直接关联来招募Brf2-TFIIIB。然后允许RNA聚合酶III加入复合物。

型3型启动子的下流元素(DSE),其增强来自核心促进剂的转录,几乎总是含有八大号序列和SPH元素(也称为壬端元素)(Cheung等,1993; Danzeiser等,1993; Kunkel等,1996; Myslinski等,1992)。八次曲线序列招募POU结构域蛋白质OCT-1(Herr等,1988; Sturm等,1988),并且SPH元素促进了已称为STAF或SPH结合因子(SBF)的锌指蛋白质从人类克隆(Myslinski等,1998; Rincon等,1998)。 8979085. PubMed. 1996年 人U6核小RNA基因启动子远端区SPH元件的鉴定及HeLa细胞提取物中SPH结合因子的特性分析 Kunkel, GR 张,TC. miyake,jh. 阿,Urso McNamara-Schroeder, KJ 巧克福,我们 基因Expr 59 - 72 9776743 PubMed. 1998年 编码人SPH结合因子的cDNA的分子克隆,一种与U6小核RNA基因启动子的增强子状区结合的保守蛋白质 林孔,JC 断,SK Hargrove,BW. Kunkel, GR 核酸Res 26:4846-52 8336708 PubMed. 1993年 人U6小核RNA基因远端控制区元件的功能特征 Danzeiser,哒 阿,Urso Kunkel, GR Mol Cell Biol 13:4670-8 2905684 PubMed. 1988 普遍存在的八聚体结合蛋白Oct-1包含一个带有同源盒亚结构域的POU结构域 Sturm,类风湿性关节炎 DAS,G. HERR,WILESHIP. 基因开发2:1582-99 2853685. PubMed. 1988 由八聚体基序激活U2 snRNA启动子定义了一类新的RNA聚合酶II增强子元件 塔塔卡,M. Grossniklaus,U. HERR,WILESHIP. 埃尔尼亚州埃斯南德斯 基因开发2:1764-78 9705341. PubMed. 1998年 ZNF76和ZNF143是转录活化剂Staf的两种人类同源物 Myslinski,E. Krol, 碳,P. J Biol Chem 273:21998-2006 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 Reactome数据库ID Release 77 10321500. 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10321500 反应 R-DRE-76046 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-76046.1 RNA聚合酶III启动子有三种基本类型。三种类型的RNA聚合酶III启动子称为1型,2型和3型启动子。在5S基因中发现1型启动子,并由称为内部对照区域(ICR)的基因内元素组成,该内部元素细分为嵌段,中间元素和C嵌段(Bogenhagen,1985; Sakonju等,1980)。在TRNA基因,腺病毒2 VAI基因和其他基因中发现2型启动子(Galli等,1981; Sharp等,1981)。这些启动子由两个称为A和B盒的基因内部元素组成。3型启动子由远端序列元素(DSE)组成,其用作增强子,近端序列元素(PSE)和Tata框(Baer等,1989; Lobo和Hernandez,1989)。

一些启动子将来自2型和3型启动子的元素组合。例如,S.Cerevisiae U6启动子也显示在图中,含有典型的3型启动子和A和B盒的TATA盒,典型的2型启动子。此外,在S.Pombe中,除了基因内元件之外,几乎所有TRNA和5S基因还含有塔塔盒,并且塔塔盒是转录所必需的。 2308839 PubMed. 1990 H1 RNA的人类基因的结构和转录,人RNase p的RNA成分 百雷,M. Nilsen,Timothy Costigan,C 奥特曼,S. 核酸RES 18:97-103 6947245. PubMed. 1981 用于转录真核TRNA基因的内部控制区域 夏普,年代 DeFranco D Dingermann T Farrell,P Soll,D Proc Natl Acad SCI U S A 78:6657-61 7357599 PubMed. 1980 5S RNA基因中心的控制区域指导特异性开始转录:I。该地区的5'边界。 布朗,DD 细胞19:13-25 7357604 PubMed. 1980 5S RNA基因中心的控制区域指示特异性转录的开始:II。该地区的3'边界。 Bogenhagen,DF. Sakonju,年代 布朗,DD 细胞19:27-35 2752422 PubMed. 1989 7bp突变将人RNA聚合酶II SnRNA启动子转化为RNA聚合酶III启动子 Lobo,SM. 埃尔尼亚州埃斯南德斯 细胞58:55 - 67 7312050 PubMed. 1981 真核生物tRNA基因中的两个保守序列片段是主要启动子元件 Galli,G. Hofstetter,H. Birnstiel,毫升 自然294:626-31 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构 Reactome数据库ID Release 77 10321502 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=10321502 反应 R-DRE-74158 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-DRE-74158.1 0006383. 去生物过程 RNA聚合酶III是真核细胞中存在的三种核RNA聚合酶之一。在细胞分裂过程中,大约10%的转录是由它的活性引起的。它合成了一系列的催化或结构RNA分子,其中一些参与蛋白质合成、pre-mRNA剪接、tRNA加工和RNA聚合酶II伸长的控制,而其他一些仍有未知的功能。与其他RNA聚合酶一样,RNA聚合酶III不能直接识别其靶启动子。相反,它在转录因子的帮助下被招募到特定的启动子序列中。RNA聚合酶III启动子有三种基本类型,分别称为1型、2型和3型(Geiduschek and Kassavetis, 1992)。虽然在体内,RNA聚合酶III可能被招募到这些启动子中,作为包含聚合酶及其起始因子的大型复合物(holo RNA聚合酶III)的一部分(Wang et al., 1997),但在体外,反应可分为几个步骤。首先,启动子元件被DNA结合因子识别,然后召集一个称为TFIIIB的因子。TFIIIB本身然后直接接触RNA聚合酶III。在人类细胞中,但在S中不存在。 cerevisiae, there are at least two versions of TFIIIB. One contains TBP, Bdp1, and Brf1 (Brf1-TFIIIB), and the other TBP, Bdp1, and Brf2 (Brf2-TFIIIB) (Schramm et al., 2000; Teichmann et al., 2000). 9308965 PubMed. 1997年 鉴定含有在蛋白质合成抑制期间选择性灭活的新因子的自主启动RNA聚合酶III全酶 王,Z. 罗,T. 罗德尔,rg. 基因5:2371-82 9780879694258 ISBN. 1992年 RNA聚合酶III转录复合物 凯西斯,乔治A. 转录规则(书籍):247-280 11121026 PubMed. 2000年 新型转录因子IIB相关因子,人TFIIB50和相关蛋白质的稳定复合物介导通过具有上游启动子元素的基因的RNA聚合酶III选择性转录 Teichmann,M. 王,Z. 罗德尔,rg. Proc Natl Acad SCI U S A 97:14200-5 11040218 PubMed. 2000年 不同的人类TFIIIB活性直接RNA聚合酶III转录塔塔和较低的诱导剂 Schramm,L. PENDERGRAST,PS. 太阳,y 埃尔尼亚州埃斯南德斯 基因开发者14:2650-63 通过电子注释推断 国际能源机构 国际能源机构