使用JSBML版本1.5在7/15/21 12:29 PM从Reactome版本77生成SBML。

分枝杆菌中有独特的小硫化合物,以及生成硫氨基酸的独特途径。硫脂和霉硫醇是这些生物体耐寒的病原体性质的重要组成部分。它们的途径成为药物设计者有趣的目标(Bhave et al, 2007)。

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 24 - t00:34:06z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 06 - 17 t00:41:31z

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(P9WNM5, P9WIK1)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

源自一个反应式复合体。下面是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(P9WNE7, 33722,33723)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(P9WNE7, 2x33723)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(29105,P9WHS1)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(2xP9WGB7)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(P9WIK3)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

源自一个反应式复合体。下面是这个复合体的Reactomes嵌套结构:(P71746, 2xP9WQM1, P71745)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是这个复合体的Reactomes嵌套结构:(16189,P71744)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(P9WJ03, 28599)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(2x18420, 2xP9WKJ1)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(2xP9WP55)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。这是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(2xP9WP53)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

PAPS去磷酸化作为APS磷酸化的逆反应,可能在结核分枝杆菌的硫酸盐代谢中发挥调节作用(Hatzios et al, 2008)。

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 24 - t00:34:06z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 08 - 19 - t11:40:59z

硫酸酯首先被添加到ATP中激活,产生APS。虽然硫酸腺苷转移酶和APS激酶的活性存在于同一酶复合物中,但中间的APS并不在复合物中通路。它的可达性确保了半胱氨酸生物合成途径的功能(Pinto et al ., 2004;Sun等人,2005)。

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 24 - t00:34:06z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 06 - 18岁t00:56:44z

APS磷酸化的能量来自于GTP分子的水解。由此产生的PAPS被几种磺基转移酶用于结核分枝杆菌生产磺脂类(Pinto et al ., 2004;Sun等人,2005)。

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 24 - t00:34:06z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 06 - 18岁t00:56:44z

将亚硫酸盐还原为硫化物需要三个还原的铁还蛋白分子。电子在Sir的帮助下转移到亚硫酸盐,Sir是一种以siro血红素和铁硫簇为辅助因子的酶(Schnell et al, 2005;Pinto等人,2007)。

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 24 - t00:34:06z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 06 - 20 - t00:43:17z

pyridoxalphosphate-dependent enzyme MetB不仅能催化半胱氨酸转化为半胱氨酸,还能催化高丝氨酸转化为半胱氨酸,由o -琥珀酰- l-高丝氨酸生成半胱氨酸。这确保了半胱氨酸和蛋氨酸可以在需要时相互转化。(惠勒等人,2005)

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 25 - t14:12:54z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 08 - 19 - t11:40:59z

o -乙酰丝氨酸(OAS)的巯基化是一个四步过程,如CysK1所示,包括1)添加OAS到吡哆醛磷酸,2)脱乙酰,3)巯基化和4)半胱氨酸裂解。有待证实的是,该酶与CysE结合,产生双功能复合物。CysK1的活性对结核分枝杆菌并不是必需的(Schnell et al ., 2007)。

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 24 - t00:34:06z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 06 - 21 - t00:59:02z

另外一种催化o -乙酰丝氨酸巯基化的酶CysK2的表达量因氧化应激而增加(Mehra and Kaushal, 2009;Schnell等人,2007)。

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 24 - t00:34:06z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 06 - 21 - t00:59:02z

当丝氨酸转移到巯基上后,金属肽酶将半胱氨酸分子从硫载体蛋白上切割下来(Burns etal, 2005)。

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 24 - t00:34:06z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 08 - 16 - t00:51:43z

MoeZ似乎催化硫(这里是硫化物)转移到硫载体蛋白CysO上,其中c端羧基变成了硫代羧基。MoeZ的小分子底物以及确切的酶活性尚不清楚(Burns et al, 2005)。

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 24 - t00:34:06z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 08 - 10 - t20:25:06z

结核分枝杆菌的硫酸盐转运蛋白是典型的ABC转运蛋白家族atp酶,是唯一参与硫酸盐同化的膜转运蛋白。它由囊肿/CysW/CysA蛋白组成,化学计量比为1:1:2。牛分枝杆菌中的cysA缺失突变体不能吸收硫酸盐,但可以被cysA结核分枝杆菌挽救(Wooff et al ., 2002)。

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 24 - t00:34:06z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 06 - 17 t00:41:31z

虽然没有直接证据表明CysE催化丝氨酸的乙酰化,但它与谷氨酸棒状杆菌丝氨酸乙酰转移酶的同源性为58%,并且在应激条件下上调(Haitani et al, 2006;Schnell等人,2007;Mehra and Kaushal, 2009)。

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 24 - t00:34:06z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 06 - 24 t10:47:11z

硫酸盐结合蛋白使用脂质锚定在质膜上。它与ATP硫酸盐内流泵有关,并结合来自细胞外空间的硫酸盐和硫代硫酸盐阴离子(Wooff et al, 2002)。

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 24 - t00:34:06z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 06 - 17 t00:41:31z

APS的硫酸盐部分的还原和裂解发生在两个不同的步骤。首先,CysH的c端半胱氨酸与亚硫酸盐结合形成一个酶-硫磺酸中间体,然后被硫氧还蛋白还原(提供两个电子,从而释放两个质子)(Williams et al ., 2002;Carroll等人,2005)。

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 24 - t00:34:06z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 06 - 20 - t00:43:17z

类似于硫胺或蝶呤的生物合成,硫化物载体蛋白CysO作为底物与磷酸吡啶醛依赖的二聚体CysM,它将o -磷酸丝氨酸转移到硫上(OLeary et al ., 2008;Agren等人,2008)。

Jassal Bijay OICR 斯蒂芬 拉尔夫 帕尔多 奥古斯汀• 2010 - 08 - 24 - t00:34:06z 2019 - 02 - 06 - t15:08:18z 2010 - 08 - 12 - t19:56:21z