使用JSBML版本1.5在7/15/21 12:37 PM从Reactome版本77生成SBML。

过氧化物酶体是一种小的细胞器,由一个单一的膜包围,包含不同的蛋白质成分,取决于细胞类型。过氧化物酶体在脂肪酸氧化、乙醛酸脱毒和血浆生成素、含有乙烯基醚键的醇的甘油磷脂合成中起作用(Lohdi和Semenkovich 2014年综述)。过氧化物酶体基质中包含的大约46种蛋白质都是通过一种独特的机制从细胞质中导入的,这种机制不要求导入的蛋白质在穿过膜时展开(Walton et al.1995,在Ma et al.2011、Fujiki et al.2014、Baker et al.2016、Dias et al.2016、Emmanulidis et al.2016、Erdmann 2016、Francisco et al.2017中进行了审查)。未完全表征的过程似乎涉及蛋白质通过膜中大小不同的孔的运输,该孔至少包含PEX5和PEX14(根据Meinecke et al.2010中的酵母同系物推断,Meinecke et al.2016中对酵母孔进行了审查)。还观察到低聚物蛋白质穿过过氧化物酶体膜(Otera和Fujiki 2012),但其运输效率似乎低于单体蛋白质(Freitas et al.2011,根据Freitas et al.2015中的小鼠同源物推断,在Dias et al.2016中审查)。在细胞质中,受体蛋白PEX5和PEX7与货物蛋白中的特定序列基序结合(Dodt et al.1995,Wiemer et al.1995,Braverman et al.1997)。PEX5的长和短异构体(PEX5L和PEX5S)结合过氧化物酶体靶向序列1(PTS1,最初由Gould等人1989年在萤火虫荧光素酶中鉴定),发现于大多数过氧化物酶体基质蛋白;PEX7结合PTS2(最初由Swinkels等人1991年在大鼠3-酮酰-CoA硫酶中鉴定)到目前为止,在人类的3种进口蛋白质上发现。PEX5的长异构体PEX5L然后结合PEX7:cargo蛋白复合物(Braverman等人1998,Otera等人2000)。PEX5S,L结合到cargo蛋白或PEX5L结合到PEX7:cargo蛋白,然后在过氧化物酶体膜上与包含PEX13、PEX14、PEX2、PEX10和PEX12的复合物相互作用(Gould et al.1996,Fransen et al.1998,根据Reguenga et al.2001中的大鼠同系物推断)。货物蛋白跨膜转运的后续步骤还不完全清楚。在转运过程中,PEX5和PEX7插入膜中(Wiemer et al.1995,Dodt et al.1995,Oliveira et al.2003)并将部分多肽链暴露于细胞器基质中(Rodrigues等人,2015年)。目前的一种模型设想PEX5作为柱塞插入由PEX14、PEX13、PEX2、PEX10和PEX12(对接易位模块)形成的跨膜筒中(Francisco等人,2017年).将货物运送至基质后,PEX5和PEX7通过需要PEX5的单泛素化和ATP水解的过程再循环回细胞质(Imanaka等人1987年,Thoms和Erdmann 2006年,Carvalho等人2007年).PEX7不是泛素化的,但其循环需要PEX5单泛素化。包含环指蛋白PEX2、PEX10和PEX12的对接易位模块的亚复合体将单个泛素与PEX5的半胱氨酸残基结合(Carvalho等人,2007年,Platta等人,2016年审查)单泛素化的PEX5和相关的PEX7然后由由PEX1、PEX6、PEX26和ZFAND6组成的输出体复合物提取(根据Miyata等人2012年的大鼠同源物推断)。PEX1和PEX6是与多种细胞活动(AAA)相关的ATP酶的成员家族,一组利用ATP水解能量重塑分子复合物的蛋白质。PEX1和PEX6形成一个杂六聚环,最好描述为PEX1/PEX6二聚体的三聚体(根据Platta等人2005年的酵母推断,Schwerter等人2017年审查的酵母同源物).关于酵母PEX1:PEX6复合物的数据表明,这些ATP酶利用底物穿线机制破坏蛋白质-蛋白质相互作用(Gardner等人,2018)。PEX7随后也返回到细胞质中(Rodrigues等人,2014)。泛素化PEX5一旦进入胞质溶胶中,通过USP9X酶促去泛素化,也可能通过谷胱甘肽等小代谢物对泛素和PEX5半胱氨酸残基之间的硫酯键进行亲核攻击而非酶促去泛素化(Grou et al.2012)过氧化物酶体输入缺陷导致人类疾病:Zellweger综合征、新生儿肾上腺脑白质营养不良、婴儿Refsum病和1型和5型点状根茎软骨发育不良(Barøy等人2015年,Nagotu等人2012年、Braverman等人2013年、Wanders 2014年、Fujiki 2016年、Waterham等人2016年审查)。

五月 布鲁斯 CSHL. 五月 布鲁斯 CSHL. 肖尔斯 所罗门 OIDR. 2017-12-20T03:39:51Z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2017 - 12 - 15 - t07:46:39z

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(O60683, O75381, P28328, Q92968, O00623)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

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源自一个反应式复合体。Reactomes嵌套结构为该复合物:(O60683, 3xP0CG47, P28328, P62987, Q92968, P51668, P62979, P61077, O00623, O75381, P50542, P50542, P62837, 9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

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源自一个反应式复合体。下面是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(O00116, P50542, O14832, O00628, P09110)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

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源于简单的反应。这是一种小化合物

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源自一个反应式复合体。以下是该复合物的嵌套结构的反射:(O00116,O14832,O00628,P09110)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

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源自一个反应式复合体。这里是Reactomes对这个复杂的嵌套结构:(Q7Z412, 3xO43933, 3xQ13608)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对这个复合体的嵌套结构:(O60683, O75381, P50542, P28328, O00628, Q92968, O00623)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

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源于简单的反应。这是一种小化合物

源自一个反应式复合体。以下是该复合物的Reactomes嵌套结构:(3xP0CG47, P62987, P51668, P62979, P61077, P62837, 9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

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源自一个反应式复合体。以下是该复合物的Reactomes嵌套结构:(3xP0CG47, P50542, P62987, P62979, 9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对该复合物的嵌套结构:(O60683, 3xP0CG47, O75381, P50542, P28328, P62987, O00628, Q92968, P62979, O00623, 9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

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源自一个反应式复合体。以下是Reactomes对该复合物的嵌套结构:(6xP0CG47, O60683, P28328, 2xP62987, Q92968, 2xP62979, O00623, Q7Z412, O75381, P50542, P50542, 3xO43933, Q6FIF0, 3xQ13608, 18xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

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源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对该复合体的嵌套结构:(6xP0CG47, O60683, O75381, P50542, P50542, P28328, 2xP62987, Q92968, 2xP62979, 18xP0CG48, O00623)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

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源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对这个复合体的嵌套结构:(O60683, O75381, P50542, P28328, P50542, Q92968, O00623)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

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源自一个反应式复合体。这里是该复合物的嵌套结构的反射:(O60683,3xP0CG47,P62987,Q92968,P62979,O00623,Q7Z412,O75381,P50542,30381,P50542,3XO43933,O00628,Q6FIF0,3XQ13608,9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。这里是该复合体嵌套结构的反射:(3xp0cg47,p50542,q93008,p62987,p62979,9xp0cg48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

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源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对该复合物的嵌套结构:(3xP0CG47, O60683, P28328, P62987, P51668, Q92968, P62979, P61077, O00623, O75381, P50542, O00628, P62837, 9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

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源自一个反应式复合体。以下是该复合体嵌套结构的反射:(Q9NUI1,P35228,A8MXV4,Q86WA,P34913,P28328,P35914,P28328,P35914,P39210,Q6QHF9,Q9BTZ2,O00623,Q9BY49,P04040,O75381,O95822,P50542,Q2T9J0,Q9UJ83,Q13011,Q9UJM8,P21549,P0C024,Q9UKG9,Q99424,O15228,O75874,O60683,P22307,Q92968,P14735,P49753,P51659,Q9UHK6,O14975,Q15067,Q9P0Z9,O15254,O14734,P43155,P50542,P14920,Q14032,Q9NYQ3,O75521,Q8N9L9,Q9Y2Q3)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源于简单的反应。这是一种小化合物

源自一个反应式复合体。这是该复合体嵌套结构的反射:(3xP0CG47,Q93008,P50542,P62987,P62979,9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。这里是该复合物的嵌套结构的反射:(O00116,O60683,O75381,P50542,O14832,P28328,O00628,Q92968,O00623,P09110)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。以下是该复合体嵌套结构的反射:(Q9NUI1,P35228,A8MXV4,Q86WA8,P34913,P35914,P39210,Q65914,Q9BTZ2,Q9By49,P04040,Q2T9J0,Q9UJ8,Q13011,Q9UJ8,P21549,P0C024,Q9UKG9,Q99424,O15228,O75874,P22307,P14735,P49753,P51659,Q9UHK6,O14975,Q15067,Q9P0Z9,O15254,O14734,P43155,P50542,P14920,Q14032,Q9NYQ3,O75521,Q8N9L9,Q9Y2Q3)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

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源自一个反应式复合体。以下是该复合物的Reactomes嵌套结构:(3xP0CG47, P50542, P62987, P62979, 9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

环型E3泛素连接酶亚复合物PEX2:PEX10:PEX12催化泛素从e2 -泛素结合物(Ub:UBE2D1, Ub:UBE2D2,或Ub:UBE2D3之一)转移到过氧化物酶体基质蛋白流动受体底物PEX5L的半胱氨酸-11残基(Carvalho et al. 2007;grouu et al. 2008, Okumoto et al. 2011, Sargent et al. 2016,源自Dodt and Gould 1996)。与PEX5相反,与对接和易位模块瞬时相关联的PEEX7(包括PEX14,PEX13,PEX2,PEX10和PEX10)不是普遍存在的。泛素与PEX5的半胱氨酸残基之间的硫醇酯键在泛素底物中很少见,泛素底物通常与赖氨酸残基之间有异肽键。在PEX5介导的过氧化物酶体蛋白运输途径中,PEX5在半胱氨酸-11位点的单倍基化是必不可少的步骤;在缺乏的情况下,Pex5和Pex7不能从过氧血清膜对接 - 转移机制(过氧硅蛋白蛋白转运膜)中提取,从而将新合成的过氧缩体基质蛋白转运到细胞石基质终端(GROU等人。2009)。除了在过氧血清蛋白质进口期间的单胞质蛋白化Pex5之外,Pex2:Pex110:Pex12亚络合物也涉及Pexophagy,一种靶向过氧缺体的选择性自噬。Pexophagy似乎触发PEX5主要是通过泛素化,而在这种情况下,可以发生在cysteine-11或赖氨酸- 209残留物,但ABCD3泛素化酶(也称为PMP70)和其他膜蛋白也可能涉及(Zhang et al . 2015年,推断出从鼠标Nordgren et al . 2015年,萨金特et al . 2016年)。

五月 布鲁斯 CSHL. 五月 布鲁斯 CSHL. 肖尔斯 所罗门 OIDR. 2017-12-22T08:02:46Z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2017 - 01 - 01 - t22:41:42z

去泛素化酶USP9X水解泛素羧基端与PEX5L的半胱氨酸-11之间的硫酯键(grouu et al. 2012)。硫酯键是不稳定的,而且似乎也会自发(非酶性)被小代谢物(如还原型谷胱甘肽)的亲核攻击破坏(grouu et al. 2009)。

五月 布鲁斯 CSHL. 五月 布鲁斯 CSHL. 肖尔斯 所罗门 OIDR. 2017-12-22T08:02:46Z 2021-05-22T02:46:22Z 2017 - 12 - 20 - t03:25:30z

胰蛋白酶样丝氨酸型内肽酶TYSND1切割58和59氨基酸残基之间的AGPS,得到AGPS(1-58)和AGPS(59-658)(从小鼠同源物推断)。在小鼠中,敲除TYSND1导致AGPS对过氧化物酶体的定位降低。

五月 布鲁斯 CSHL. 五月 布鲁斯 CSHL. 关明 CSHL. 2017-12-22T08:02:46Z 2019-04-04T17:05:17Z 2017 - 12 - 22 - t06:04:28z

胰蛋白酶样丝氨酸型内肽酶TYSND1在438和439氨基酸残基之间切割ACOX1,得到ACOX1(1-438)和ACOX1(439-660) (Okumoto等,2011年,也从小鼠和大鼠同源物推断)。

五月 布鲁斯 CSHL. 五月 布鲁斯 CSHL. 关明 CSHL. 2017-12-22T08:02:46Z 2019-04-04T17:05:17Z 2017 - 12 - 22 - t06:04:28z

胰蛋白酶样丝氨酸内肽酶TYSND1在110和111氨基酸残基之间切割TYSND1,得到TYSND1(1-110)和TYSND1(111-566) (Okumoto et al. 2011)。TYSND1的自裂解降低了其蛋白水解活性。

五月 布鲁斯 CSHL. 五月 布鲁斯 CSHL. 肖尔斯 所罗门 OIDR. 2017-12-22T08:02:46Z 2021-05-22T02:46:22Z 2017 - 12 - 22 - t06:04:28z

胰蛋白酶样丝氨酸型内肽酶TYSND1在424和425氨基酸残基之间切割SCP2(也称为SCPX),生成SCP2(1-424)和SCP2(425-547) (Okumoto等人,2011年,也从小鼠同源物中推断)。

五月 布鲁斯 CSHL. 五月 布鲁斯 CSHL. 关明 CSHL. 2017-12-22T08:02:46Z 2019-04-04T17:05:17Z 2017 - 12 - 22 - t06:04:28z

去泛素化酶USP9X水解泛素羧基端与PEX5S的半胱氨酸-11之间的硫酯键(从Grou等人2012年的PEX5L大亚型推断)。硫酯键是不稳定的,而且似乎也会被小代谢物(如还原型谷胱甘肽)的亲核攻击自发破坏(Grou et al. 2009)。

五月 布鲁斯 CSHL. 五月 布鲁斯 CSHL. 关明 CSHL. 2017-12-22T08:02:46Z 2019-04-04T17:05:17Z 2017 - 12 - 20 - t03:25:30z

胰蛋白酶样丝氨酸型内肽酶Tysnd1在氨基酸残基311和312之间切割HSD17B4(过氧缩体多官能酶2,MFP-2),得到HSD17B4(1-311)和HSD17B4(312-736)(Okumoto等,2011,也从小鼠同源物中推断出来)。HSD17B4(1-311)脱氢3-羟基乙基-COA;HSD17B4(312-736)充当Enoyl-CoA水解酶(Jianget Al.1997,在Huyghe等人审查2006年)。(体外,HSD17B4(312-736)促进膜之间的7-脱羟基醇和磷脂酰胆碱的转移。)未切割的蛋白质(HSD17B4)也催化这些反应。

五月 布鲁斯 CSHL. 五月 布鲁斯 CSHL. 关明 CSHL. 2017-12-22T08:02:46Z 2019-04-04T17:05:17Z 2017 - 12 - 22 - t06:04:28z

胰蛋白酶样丝氨酸内肽酶TYSND1在26和27氨基酸残基之间切割ACAA1,生成ACAA1(1-26)和ACAA1(27-424) (Okumoto et al. 2011)。在小鼠中,敲除Tysnd1会减少Acaa1对过氧化物酶体的定位。

五月 布鲁斯 CSHL. 五月 布鲁斯 CSHL. 关明 CSHL. 2017-12-22T08:02:46Z 2019-04-04T17:05:17Z 2017 - 12 - 22 - t06:04:28z

环型E3泛素连接酶亚复合物PEX2:PEX10:PEX12催化泛素从e2 -泛素结合物(Ub:UBE2D1, Ub:UBE2D2,或Ub:UBE2D3之一)转移到过氧化物酶体基质蛋白流动受体底物PEX5L的半胱氨酸-11残基(Carvalho et al. 2007;grouu et al. 2008, Okumoto et al. 2011, Sargent et al. 2016,源自Dodt and Gould 1996)。泛素与PEX5的半胱氨酸残基之间的硫醇酯键在泛素底物中很少见,泛素底物通常与赖氨酸残基之间有异肽键。在PEX5介导的过氧化物酶体蛋白运输途径中,PEX5在半胱氨酸-11位点的单倍基化是必不可少的步骤;在缺乏PEX5的情况下,无法从过氧化物酶体膜对接/转运机制(过氧化物酶体蛋白转位)中提取PEX5,因此新合成的过氧化物酶体基质蛋白运输到细胞器基质的过程将停止(grouu et al. 2009)。除了在过氧化物酶体蛋白导入过程中对PEX5进行单倍化外,PEX2:PEX10:PEX12复合物也与过氧化物酶体选择性自噬有关。Pexophagy似乎触发PEX5主要是通过泛素化,而在这种情况下,可以发生在cysteine-11或赖氨酸- 209残留物,但ABCD3泛素化酶(也称为PMP70)和其他膜蛋白也可能涉及(Zhang et al . 2015年,推断出从鼠标Nordgren et al . 2015年,萨金特et al . 2016年)。

五月 布鲁斯 CSHL. 五月 布鲁斯 CSHL. 肖尔斯 所罗门 OIDR. 2017-01-01T23:17:14Z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2017 - 01 - 01 - t22:41:42z

PEX5L绑定到PEX7:货物与过氧化物酶病膜相互作用复杂PEX13: PEX14: PEX2: PEX10: PEX12 (Docking-Translocation复杂)从而使PEX7及其货物码头的酶膜(古尔德等。1996年,Fransen et al . 1998年,等。1999年,Dodt et al . 2001年,罗德里格斯等。2014年,罗德里格斯等。2015年,也从仓鼠和老鼠的同源词推断)。

五月 布鲁斯 CSHL. 五月 布鲁斯 CSHL. 五月 布鲁斯 CSHL. 2017-12-20T03:39:51Z 2018-03-12T11:40:42z 2017-12-19T03:56:46Z

类胰蛋白酶丝氨酸内肽酶TYSND1切割氨基酸残基30和31之间的PHYH,得到PHYH(1-30)和PHYH(31-338)。在小鼠中,敲除Tysnd1会减少Phyh对过氧化物酶体的定位。

五月 布鲁斯 CSHL. 五月 布鲁斯 CSHL. 关明 CSHL. 2017-12-22T08:02:46Z 2019-04-04T17:05:17Z 2017 - 12 - 22 - t06:04:28z

与PEX7结合的货物蛋白在不需要ATP的反应中从PEX7释放到过氧化物酶体基质中(Purdue et al. 1997, Dodt et al. 2001, Rodrigues et al. 2014, Rodrigues et al. 2015)。PEX7也可能被释放到基质中(从Nair等人2004年的酵母中推断),但后来的研究表明,PEX7与PEX5L一起存在于过氧化物酶体膜中(Rodrigues等人2015年),显然是在蛋白腔中(Dias等人2017年)。PEX5突变会导致含pts1蛋白或含pts2蛋白进口缺陷(Eberrink et al. 2009, Barøy et al. 2015)。

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去泛素化酶USP9X结合泛素化的PEX5L(泛素结合到PEX5的大亚型上,Ub:PEX5L),然后水解泛素羧基端和PEX5L的半胱氨酸-11之间的硫酯键(Grou et al. 2012)。

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在结合由PEX14、PEX13、PEX2、PEX10和PEX12组成的对接和转运模块后,与货物蛋白结合的PEX5S或PEX5L将定位于膜上(Dodt et al. 1995, Wiemer et al. 1995, Alencastre et al. 2009, Francisco et al. 2013, Dias et al. 2017)。在一种尚未完全确定的反应中,转运蛋白被释放到过氧化物酶体基质中,而PEX5S或PEX5L仍停留在膜中(Dodt et al. 1995, Wiemer et al. 1995, Alencastre et al. 2009, francisco et al. 2013)。其中一个反应模型假设PEX13:PEX14(与PEX2:PEX10:PEX12相关)在过氧化物酶体膜中形成一个桶,而PEX5S或PEX5L作为柱塞引导货物通过桶(Dias et al. 2017, Francisco et al. 2017)。值得注意的是,该反应不需要ATP等能量来源(Oliveira et al. 2003)。PEX5突变会导致含pts1蛋白或含pts2蛋白进口缺陷(Eberrink et al. 2009, Barøy et al. 2015)。

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目前还不清楚PEX5长亚型(PEX5L)和短亚型(PEX5S)是如何产生的。目前的一种假说认为信使rna的剪接是可选择的。两亚型可以绑定过氧物酶体目标信号1 (PTS1)位于大多数蛋白质的糖基酶的目标矩阵(Dodt et al . 1995年,Fransen et al . 1995年,Wiemer et al . 1995年,与et al . 2000 Brocard et al . 2003年,与et al . 2003年,哈珀et al . 2003年,Ghosh和伯格2010年,Freitas et al . 2011年,Okumoto et al. 2011)。PTS1通常在c端含有Ser-Lys-Leu (SKL),但观察到PEX5的序列和亲和性有很大变化,上游残基可以调节与PEX5的结合(Lametschwandtner et al. 1998, Ghosh和Berg 2010, Brocard和Hartig 2006综述)。少数过氧化物酶体基质蛋白含有PTS2。PEX5S亚型结合包含PTS1的蛋白,而PEX5L亚型结合包含PTS1或PEX7的蛋白与包含PTS2的蛋白(Braverman et al. 1998)。一些蛋白质似乎以低聚体的形式输入,但这是相当低效的,因为PEX5似乎偏爱单体底物(Otera和Fujiki 2012, Freitas et al. 2011, Freitas et al. 2015,也从小鼠同源物推断)。PEX5突变导致过氧化物酶体导入缺陷,并构成过氧化物酶体生物发生紊乱(也称为齐薇格谱紊乱)的互补组2 (Dodt et al. 1995, Wiemer et al. 1995)。一种只影响PEX5L亚型的特定突变是根茎型点状软骨发育不良5型的原因(bary øy等人2015)。

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PEX5S或PEX5L绑定到货物蛋白质包含PTS1与对接和易位模块交互(PEX13: PEX14: PEX2: PEX10: PEX12)(古尔德等。1996年,Fransen et al . 1998年,等。1999年,这本书et al . 2009年,Shiozawa et al . 2009年,Freitas et al . 2011年,旧金山等。2013年,这本书et al . 2014年,迪亚斯et al . 2017年)。

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PEX5的长异构体PEX5L与PEX7结合,PEX7已与含PTS2的货物蛋白结合(Braverman等人,1998年,Dodt等人,2001年,Kunze等人,2015年,Rodrigues等人,2015年)。PEX5L与PEX7的结合增加了PEX7对货物蛋白的亲和力(Kunze et al.2015)。影响额外序列的突变仅存在于PEX5的长亚型中,导致根茎状点状软骨发育不良5型(Baroy等人,2015)。

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去泛素化酶USP9X与胞浆泛素化的PEX5S (Ub:PEX5S)结合,然后水解泛素羧基端与PEX5S的半胱氨酸-11之间的硫酯键(从Grou等人2012年的PEX5大亚型推断)。

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胞质PEX7绑定过氧物酶体目标信号2 (PTS2), 9个氨基酸残基序列中确定功能3人过氧化物酶病矩阵蛋白(布雷弗曼et al . 1997年,马特里等。1997年,普渡et al . 1997年布雷弗曼et al . 2000年,Ghys et al . 2002年,马特里等。2002年,Kunze et al . 2011年,Kunze et al . 2015年)。根据分子模型,PTS2共识序列与PEX7中的沟槽结合(Kunze et al. 2011)。PEX7突变导致根茎型点状软骨发育不良1型(Braverman et al. 1997, Motley et al. 1997, Purdue et al. 1997)。

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通过PEX1:PEX6:PEX6:PEX26(过氧化血剂AAA ATP酶复合体,受体出口模块)(Tamura等,2014,Law等,2017,Law等,2017,Lawet等,2017年,Pex6:Pex6:Pex6:Pex6:Pex6:Pex6:Pex6:Pex6:Pex6:Pex6:Pex6:Pex6:PEX6:PEX26(坦苏拉等,2014年,也是从酵母同源物中推断出来)。PEX1和PEX6形成细胞溶质六聚体环,其通过PEX26锚定到过氧异甲烷。通过pex1和pex6的ATP水解似乎导致PEX1:PEX6:PEX26中的构象变化,其从过氧异素膜中除去UB:PEX5L和进入胞嘧啶(Saffert等人)。ZFAND6可能绑定了泛素化的PEX5和PEX6,并作为出口因子(Miyata等,2012)。Pex7返回胞浆溶胶的导出需要出口PEX5L,但PEX7和PEX5L似乎单独导出(RODRIGUES等,2014)。

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一个包含PEX10, PEX12和PEX2的RING E3泛素连接酶复合物将PEX5L泛素化。PEX2:PEX10:PEX12复合物被认为结合了激活的e2 -泛素结合物(Ub:UBE2D1, Ub:UBE2D2, Ub:UBE2D3之一)和PEX5L,该复合物也包含PEX13和PEX14 (Chang et al. 1999, Carvalho et al. 2007, Grou et al. 2008, Grou et al. 2009, Okumoto et al. 2011)。推测PEX5的短亚型PEX5S也发生了相同的反应。

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从过氧血清膜释放出泛素化的PEX5同种型S或同种型L(UB:PEX5S,L)并通过PEX1:PEX6:PEX26:ZFAND6(过氧化硅AAA ATP酶复合体,受体出口模块)(Tamura等al。2014,Law等人2017年,也从酵母同源物中推断出来)。PEX1和PEX6形成细胞溶质六聚体环,其通过PEX26锚定到过氧异甲烷。通过Pex1和Pex6的ATP水解似乎在PEX1:PEX6:PEX6:PEX26:ZFAND6中的构象变化,其从过氧硅膜和胞嘧啶中释放UB:PEX5S,L(在Saffert等,2017年审查)。

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一个包含PEX10、PEX12和PEX2的RING E3泛素连接酶亚复合物将PEX5L泛素化。PEX10:PEX12:PEX2被认为结合了激活的e2 -泛素结合物(Ub:UBE2D1, Ub:UBE2D2, Ub:UBE2D3之一)和PEX5L,该复合物也包含PEX13和PEX14 (Chang et al. 1999, Carvalho et al. 2007, Grou et al. 2008, Grou et al. 2009, Okumoto et al. 2011)。

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PEX1:PEX6:PEX26(称为受体出口模块)从过氧硅烷膜对接和易位模块中提取泛素键合的PEX5L(Tamura等,2006,Tamura等,2014)。Pex1和Pex6是可溶性蛋白质,其在过氧血清膜中形成与Pex26结合的六大环(Matsumoto等人2003,Welle等人2005)。Zfand6(AWP1)可能与泛素定期的PEX5和PEX6绑定,并作为出口因子(Miyata等,2012)。

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PEX1:PEX6:PEX26(也称为受体输出模块或过氧化物酶体AAA ATP酶复合物)在过氧化物酶体膜中提取泛素化PEX5S或PEX5L(Tamura等人,2006年,Tamura等人,2014年)。PEX1和PEX6是可溶性蛋白质,在过氧化物酶体膜中形成与PEX26结合的六聚环(Matsumoto等人,2003年,Weller等人,2005年)。ZFAND6(AWP1)可能与泛素化PEX5和PEX6结合,并作为一种输出因子(Miyata et al.2012)。

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