使用JSBML版本1.5在7/14/21下午4:59从Reactome版本77生成SBML。

泛素单体由较大的前体加工而成,然后通过泛素和E1激活酶的半胱氨酸残基之间形成硫醇酯键而被激活(UBA1或UBA6, Jin等人,2007)。泛素然后转移到E2结合酶的活性位点半胱氨酸残基(van Wijk and Timmers 2010, Kleiger and Mayor 2014, Stewart et al. 2016)。含有多泛素单体的前体蛋白由UBB和UBC基因产生。由UBA52和RPS27A基因合成的含有单一泛素和核糖体蛋白的前体。OTULIN和USP5蛋白酶在泛素加工中非常活跃,而UCHL3、USP7和USP9X蛋白酶切割泛素-核糖体蛋白前体,产生泛素单体(grouu et al. 2015)。其他酶也可以处理泛素前体。合成泛素单体是激活腺苷酸的糖基c端甘氨酸结合紧随其后的半胱氨酸残基的E1通过硫醇酯酶UBA1或UBA6债券(金et al . 2007年,推断出从兔子同系物在哈斯et al。1982年,Hershko et al . 1983年)。泛素随后从E1酶转移到几种E2酶的半胱氨酸残基(van Wijk and Timmers 2010, Stewart et al. 2016)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 04 - 02 - t08:40:07z 2021 - 05 - 31 - t23:13:58z 2016 - 04 - 02 - t07:29:35z

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对这个复合物的嵌套结构:(3xP0CG47, P62987, P22314, P62979, 9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自Reactome DefinedSet。这是可选实体的列表,其中任何一个都可以执行给定的功能

源自一个反应式复合体。Reactomes的嵌套结构为该复合物:(Q9H832, P60604, 3xP0CG47, Q969T4, P62987, P51668, Q16763, P68036, P62979, P62837, 9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对该复合物的嵌套结构:(3xP0CG47, P62987, Q969T4, P49427, Q16763, P62979, P68036, O00762, P49459, Q96B02, P63146, Q9NPD8, P51965, 9xP0CG48, P62837)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(6xP0CG47, 2xP62987, P22314, 2xP62979, 18xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对这个复合物的嵌套结构:(A0AVT1, 3xP0CG47, P62987, P62979, 9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes针对这个复杂结构的嵌套结构:(A0AVT1, 6xP0CG47, 2xP62987, 2xP62979, 18xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自Reactome DefinedSet。这是可选实体的列表,其中任何一个都可以执行给定的功能

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对这个复合物的嵌套结构:(3xP0CG47, P62987, P22314, P62979, 9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自Reactome DefinedSet。这是可选实体的列表,其中任何一个都可以执行给定的功能

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对这个复合物的嵌套结构:(3xP0CG47, P62987, P22314, P62979, 9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自Reactome DefinedSet。这是可选实体的列表,其中任何一个都可以执行给定的功能

派生自Reactome DefinedSet。这是可选实体的列表,其中任何一个都可以执行给定的功能

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(6xP0CG47, 2xP62987, P22314, 2xP62979, 18xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对这个复合物的嵌套结构:(3xP0CG47, P22314, P62987, P62979, 9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对这个复合物的嵌套结构:(A0AVT1, 3xP0CG47, P62987, P62979, 9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自Reactome DefinedSet。这是可选实体的列表,其中任何一个都可以执行给定的功能

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自Reactome DefinedSet。这是可选实体的列表,其中任何一个都可以执行给定的功能

源自一个反应式复合体。Reactomes嵌套结构为该复合物:(P60604, 3xP0CG47, Q969T4, P62987, P51668, P49427, Q16763, P68036, P62979, P61086, P62253, O00762, Q712K3, P62256, Q8WVN8, P62837, 9xP0CG48)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

UBA1激活泛素的过程分为3个步骤:泛素腺苷化,从腺嘌呤-泛素到UBA1内部半胱氨酸残基的泛素结合,以及泛素第二分子的腺苷化。在第二步中,内部的硫醇基半胱氨酸残基UBA1攻击acyl-adenyl债券的腺苷酸c端甘氨酸的泛素,导致半胱氨酸残基之间的硫酯键和c端甘氨酸的泛素(et al。2007年,兔子同系物的推断哈斯et al . 1982年,Hershko et al . 1983年,在Groettrup等人2008年进行了综述)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 13 t06:21:30z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2016 - 01 - 12 t03:59:20z

UBA1激活泛素的过程分为3个步骤:泛素腺苷化,从腺嘌呤-泛素到UBA1内部半胱氨酸残基的泛素结合,以及泛素第二分子的腺苷化。在第一步中,UBA1的腺苷化模块催化泛素c端甘氨酸的酰基-腺苷化(Jin等人2007,从Haas等人1982年的兔子同源物推断,Hershko等人1983年,Groettrup等人2008年的综述)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 13 t06:21:30z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2016 - 01 - 12 t03:59:20z

细胞溶质,UBA6-ubiquitin硫醇酯从UBA6共轭泛素转移到一个内部E2酶的半胱氨酸残基,形成硫醇酯共轭泛素和半胱氨酸残基之间的E2(金et al . 2007年,兔子同系物的推断Hershko et al . 1983年,回顾Groettrup et al . 2008年)。从UBA1推断,E2与UBA6分离(Eletr et al. 2005)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 13 t06:21:30z 2021 - 05 - 22 - t02:46:22z 2016 - 01 - 12 t03:59:20z

UBC多聚蛋白包含9个泛素单体,由蛋白质水解释放。USP5 (Falquet et al. 1995)或OTULIN都可以进行蛋白水解裂解反应(Grou et al. 2015)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 25 - t08:22:14z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2016 - 01 - 15 - t03:33:17z

UBA1位于细胞质和细胞核中(Grenfell et al. 1994)。UBA1激活泛素的过程分为3个步骤:泛素腺苷化,从腺嘌呤-泛素到UBA1内部半胱氨酸残基的泛素结合,以及泛素第二分子的腺苷化。在第三步,uba1 -泛素结合腺苷酸第二泛素分子的c端甘氨酸。这导致UBA1装满2泛素分子,其中一个是共轭UBA1内部半胱氨酸残基,其中一个是腺苷酸和非共价UBA1(金et al . 2007年,兔子同系物的推断哈斯et al . 1982年,Hershko et al . 1983年,回顾Groettrup et al . 2008年)

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 13 t06:21:30z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2016 - 01 - 12 t03:59:20z

从同源的UBA1推断,UBA6 (UBE1L1)激活泛素的过程分为3个步骤:泛素腺苷化,泛素从腺嘌呤-泛素结合到UBA6的一个内部半胱氨酸残基,以及第二分子泛素腺苷化。在第三步,uba6 -泛素结合腺苷酸第二泛素分子的c端甘氨酸。这导致UBA6负载2个泛素分子,其中一个与UBA6的内部半胱氨酸残基结合,另一个被腺苷化并与UBA6非共价结合(Jin et al. 2007, Pelzer et al. 2007,在Groettrup et al. 2008综述)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2016 - 03 - 20 - t13:39:08z 2016 - 08 - 11 - t05:21:47z 2016 - 01 - 12 t03:59:20z

UBB多聚蛋白包含3个泛素单体,由蛋白质水解释放。USP5 (Falquet et al. 1995)或OTULIN都可以进行蛋白水解裂解反应(Grou et al. 2015)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 25 - t08:22:14z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2016 - 01 - 15 - t03:33:17z

从同源的UBA1推断,UBA6 (UBE1L1)激活泛素的过程分为3个步骤:泛素腺苷化,泛素从腺嘌呤-泛素结合到UBA6的一个内部半胱氨酸残基,以及第二分子泛素腺苷化。在第二步中,内部的硫醇基半胱氨酸残基UBA6攻击acyl-adenyl债券的腺苷酸c端甘氨酸的泛素,导致半胱氨酸残基之间的硫酯键和c端甘氨酸的泛素(et al。2007年,Pelzer et al . 2007年,回顾Groettrup et al . 2008年)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2016 - 03 - 20 - t13:39:08z 2016 - 10 - 29 - t08:34:28z 2016 - 01 - 12 t03:59:20z

从同源的UBA1推断,UBA6 (UBE1L1)激活泛素的过程分为3个步骤:泛素腺苷化,泛素从腺嘌呤-泛素结合到UBA6的一个内部半胱氨酸残基,以及第二分子泛素腺苷化。第一步,UBA6的腺苷化模块催化泛素c端甘氨酸的酰基-腺苷化(Jin et al. 2007, Pelzer et al. 2007, Groettrup et al. 2008)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2016 - 03 - 20 - t13:39:08z 2016 - 08 - 11 - t05:21:47z 2016 - 01 - 12 t03:59:20z

在胞质中,UBA1-泛素硫醇酯结合物将泛素从UBA1转移到E2酶的一个内部半胱氨酸残基上,形成泛素和E2半胱氨酸残基之间的硫醇酯结合物(Jin et al. 2007,推断自Hershko et al. 1983的兔子同源物)。E2随后与UBA1分离(Eletr et al. 2005)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 13 t06:21:30z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2016 - 01 - 12 t03:59:20z

RPS27A前体蛋白含有蛋白质水解释放的核糖体蛋白L40和泛素(RPS27A残基1 ~ 76)。任何一种蛋白酶UCHL3、USP7或USP9X都可以催化蛋白质水解反应(Larsen et al. 1998, grouu et al. 2015)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 25 - t08:22:14z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2016 - 01 - 15 - t03:33:17z

在细胞核(Grenfell et al . 1994年),从UBA1 UBA1-ubiquitin硫醇酯共轭泛素转移到一个内部E2酶的半胱氨酸残基,形成硫醇酯共轭泛素和半胱氨酸残基之间的E2(金et al . 2007年,兔子同系物的推断Hershko et al . 1983年,在Groettrup等人2008年进行了综述)。E2随后与UBA1分离(Eletr et al. 2005)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 13 t06:21:30z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2016 - 01 - 12 t03:59:20z

UBA1激活泛素的过程分为3个步骤:泛素腺苷化,从腺嘌呤-泛素到UBA1内部半胱氨酸残基的泛素结合,以及泛素第二分子的腺苷化。在第三步,uba1 -泛素结合腺苷酸第二泛素分子的c端甘氨酸。这导致UBA1装满2泛素分子,其中一个是共轭UBA1内部半胱氨酸残基,其中一个是腺苷酸和非共价UBA1(金et al . 2007年,兔子同系物的推断哈斯et al . 1982年,Hershko et al . 1983年,回顾Groettrup et al . 2008年)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 13 t06:21:30z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2016 - 01 - 12 t03:59:20z

UBA1位于细胞核和细胞质中(Grenfell 1994)。UBA1激活泛素的过程分为3个步骤:泛素腺苷化,从腺嘌呤-泛素到UBA1内部半胱氨酸残基的泛素结合,以及泛素第二分子的腺苷化。在第二步中,内部的硫醇基半胱氨酸残基UBA1攻击acyl-adenyl债券的腺苷酸c端甘氨酸的泛素,导致半胱氨酸残基之间的硫酯键和c端甘氨酸的泛素(et al。2007年,兔子同系物的推断哈斯et al . 1982年,Hershko et al . 1983年,在Groettrup等人2008年进行了综述)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 13 t06:21:30z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2016 - 01 - 12 t03:59:20z

UBA1存在于细胞质和核浆中(Grenfell et al. 1994)。UBA1激活泛素的过程分为3个步骤:泛素腺苷化,从腺嘌呤-泛素到UBA1内部半胱氨酸残基的泛素结合,以及泛素第二分子的腺苷化。在第一步中,UBA1的腺苷化模块催化泛素c端甘氨酸的酰基-腺苷化(Jin等人2007,从Haas等人1982年的兔子同源物推断,Hershko等人1983年,Groettrup等人2008年的综述)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 13 t06:21:30z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2016 - 01 - 12 t03:59:20z

UBA52前体蛋白含有蛋白质水解释放的核糖体蛋白L40和泛素(UBA52残基1 ~ 76)。任何一种蛋白酶UCHL3、USP7或USP9X都可以催化蛋白质水解反应(Larsen et al. 1998, grouu et al. 2015)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 25 - t08:22:14z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2016 - 01 - 15 - t03:33:17z