SBML从Reactome版本77生成的关于使用JSBML版本1.5 21年7月15日12:25 PM。

目前研究的所有真核生物pre- mrna的5'端均转化为cap结构。帽被认为影响了第一个内含子的剪接,并被细胞核中的“帽结合”蛋白CBP80和CBP20结合。帽对翻译起始非常重要,它还通过蛋白质与poly(A)端相互作用,导致mRNA的循环,从而促进多轮翻译。帽对mRNA的稳定性也很重要,保护其免受5'到3'核酸酶的侵袭,并且是mRNA输出到细胞质所必需的。盖顶反应通常在初期转录本上非常迅速地发生;在RNA聚合酶II只合成了几个核苷酸之后。该capping反应涉及到新生转录本的5'端由RNA 5'-三磷酸酶转化为二磷酸,随后mRNA guanylytransferase添加一个单磷酸鸟苷,形成一个5'-5'-三磷酸键。然后这个帽被2'- o -甲基转移酶甲基化。

Buratowski 斯蒂芬。 哈佛大学医学院生物化学和分子药理学学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2003-10-15T19:18:41Z 2021-05-22T05:11:21Z

源自一个反应式复合体。下面是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(O43148, O60942)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes嵌套结构对于这种复杂的:(Q13889,P52435,P51946,P50613,Q92759,Q6ZYL4,P35269,P36954,O00267,P18074,P19387,O60942,P62875,P53803,P32780,P61218,P13984,Q13888,P24928,O15514,O43148,P30876,P51948,P19388,P52434,P19447,P62487)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

从Reactome SimpleEntity的。这是一个小化合物

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源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对该复合体的嵌套结构:(P61218, P13984, P24928, O15514, P52435, P35269, P36954, Q09161, P30876, P19388, P52434, P19387, P52298, P62875, P53803, P62487)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

源自反垃圾突破序列。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes嵌套结构对于这种复杂的:(Q13889,P52435,P51946,P50613,Q92759,Q6ZYL4,P35269,P36954,O00267,P18074,P19387,O60942,P62875,P53803,P32780,P61218,P13984,Q13888,P24928,O15514,O43148,P30876,P51948,P19388,P52434,P19447,P62487)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

从Reactome SimpleEntity的。这是一个小化合物

从Reactome SimpleEntity的。这是一个小化合物

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes嵌套结构对于这种复杂的:(Q13889,P52435,P51946,P50613,Q92759,Q6ZYL4,P35269,P36954,O00267,P18074,P19387,O60942,P62875,P53803,P32780,P61218,P13984,Q13888,P24928,O15514,O43148,P30876,P51948,P19388,P52434,P19447,P62487)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

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源自反垃圾突破序列。这是一种蛋白质

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源自一个反应式复合体。下面是Reactomes嵌套结构对于这种复杂的:(Q13889,P52435,P51946,P50613,Q92759,Q6ZYL4,P35269,P36954,O00267,P18074,P19387,O60942,P62875,P53803,P32780,P61218,P13984,Q13888,P24928,O15514,O43148,P30876,P51948,P19388,P52434,P19447,P62487,17345)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

源自反垃圾突破序列。这是一种蛋白质

从Reactome OtherEntity的。实体,我们无法或不愿意在化学详细描述,不能放在任何其他类。可以用来表示在细胞中复杂的结构,其参与反应,但我们不能或不想分子限定,例如细胞膜,霍利迪结构

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes嵌套结构对于这种复杂的:(Q13889,P52435,P51946,P50613,Q92759,Q6ZYL4,P35269,P36954,O00267,P18074,P19387,O60942,P62875,P53803,P32780,P61218,P13984,Q13888,P24928,O15514,O43148,P30876,P51948,P19388,P52434,P19447,P62487)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

Spt5与capping酶(CE)的Guanyl Transferase (GT)反应。

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从Reactome OtherEntity的。实体,我们无法或不愿意在化学详细描述,不能放在任何其他类。可以用来表示在细胞中复杂的结构,其参与反应,但我们不能或不想分子限定,例如细胞膜,霍利迪结构

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes嵌套结构对于这种复杂的:(P61218,P13984,P24928,Q13888,Q13889,O15514,P52435,P51946,P50613,Q92759,Q6ZYL4,P35269,P36954,P30876,P51948,P19388,P52434,P19387,P19447,P18074,P62875,P53803,P62487,P32780)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

源自一个反应式复合体。下面是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(P52298, Q09161)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes嵌套结构对于这种复杂的:(P61218,P13984,P24928,Q13888,Q13889,O15514,P52435,P51946,P50613,Q92759,Q6ZYL4,P35269,P36954,P30876,P51948,P19388,P52434,P19387,P19447,P18074,O60942,P62875,P53803,P62487,P32780)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

源自反垃圾突破序列。这是一种蛋白质

源自反垃圾突破序列。这是一种蛋白质

在这个反应开始时,有1个分子的'mRNA capping酶'和1个分子的'Pol II转录复合物与(ser5)磷酸化的CTD包含挤压转录到+30'。在这个反应的最后,存在1个“RNA Pol II与磷酸化CTD: CE复合物”的分子。这种反应发生在“核”。

Buratowski 斯蒂芬。 哈佛大学医学院生物化学和分子药理学学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2003-10-15T19:18:41Z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z

二磷酸的5'末端的mRNA的结合到GMP,从酶释放它。这时,目前还不清楚如何RNA磷酸端从三磷酸酶的鸟嘌呤部位的活性位点转移。在催化第二反应没有RNA.Guanylyltransferase(GT)的共价酶-GMP复杂可以形成可以被表示为:PPN(PN)的n + GTP - > GpppN(PN)的n +的PPi(山田冈部等人1998。)。

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该capping酶与转录延伸因子DSIF的Spt5亚基相互作用。这种相互作用可能将覆盖反应与启动子逃逸或伸长结合起来,从而作为一个“检查点”,以确保覆盖发生在聚合酶继续生成其余转录本之前(Gonatopoulos-Pournatzis et al.2011)。

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在该反应中,1个分子的开始“与磷酸化CTD RNA聚合酶II:CE复合物”是存在的。在该反应结束时,1个分子的“RNA聚合酶II与磷酸化CTD:CE复合物与活化的GT”是存在的。这种反应发生在“核”。

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在封端反应的最后步骤中,将甲基需要从S-腺苷甲硫氨酸的甲基到盖鸟嘌呤的N7位。N7G甲基转移(MT)介导的反应可以表示为:GpppN(PN)的n + S-腺苷甲硫氨酸(的AdoMet) - > m7GpppN(PN)的n + S-腺苷高半胱氨酸(Adohcy)。

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GMP帽的mRNA转录本与GT分离以进一步修饰(Yamada-Okabe et al. 1998)。

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所述封盖酶结合它是在DNA模板合成后不久新生转录物的5'末端,并且导致所述封盖复合物的形成与RNA的C末端结构域沿聚合酶II,和SPT5(海德曼等人2013,2009年Buratowski勋伯格和MAQUAT 2009)。

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盖帽复合体形成后,盖帽酶的RNA三磷酸酶活性将新生mRNA转录本的5'端磷酸基水解为二磷酸。哺乳动物capping酶的RNA三磷酸酶(RTP)结构域是包括蛋白酪氨酸磷酸酶、一些脂质磷酸酶和几种核酸磷酸酶在内的磷酸酶超家族中的一员。这个家族使用保守的亲核半胱氨酸残基攻击目标磷酸。瞬时磷酸半胱氨酸酶中间体被水解以再生酶活性部位。值得注意的是,虽然高级真核capping酶使用类似ptp的三磷酸酶结构域,但酵母三磷酸酶是完全不同的一类酶。酵母rtp是金属依赖的磷酸酶。RNA 5'-三磷酸酶(RTP)催化的第一反应可以表示为:pppN(pN)n + GTP -> ppN(pN)n + Pi;(n = 20 - 25)

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帽结合复合物与新生mRNA转录本上甲基化的GMP帽结合(gonatopouros - pournatzis and Cowling 2014)。

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一个高度保守的赖氨酸在mRNA capping酶的guanylytransferase (GT)位点攻击GTP的α -磷酸。形成酶- gmp共价中间体。

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在反应开始时,存在1个CBP80分子和1个CBP20分子。在该反应结束时,存在1个“Cap Binding Complex (CBC)”分子(Glover-Cutter et al., 2008, Görnemann et al., 2005, Narita et al., 2007)。这个反应发生在原子核中。

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