SBML从Reactome版本77生成的关于使用JSBML版本1.5 21年7月15日下午1点18分。

在G1期,有两种类型的DNA损伤的反应中,p53依赖性和不依赖p53的通路。的p53依赖性应答的CDK抑制通过编码由p53蛋白介导的抑制因子的基因的上调,而依赖p53的机制,通过Cdk2的的抑制T14Y15磷酸化抑制的CDK。在G1导致的损坏模板和其他复制缺陷突变复制的DNA损伤检查点的故障。

Walworth 南希 Umdnj-Robert Wood Johnson Medical School 卡纳 咕咕 昆士兰医学研究所,信号转导实验室 霍夫曼 英格丽 德国癌症研究中心(DKFZ) sh 所罗门 OICR O'Donnell. 迈克尔 洛克菲勒大学 2003 - 06 - 05 - t00:03:09z 2021-05-22T05:11:21Z 2003 - 06 - 05 - t00:03:42z

源自反垃圾突破序列。这是一种蛋白质

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源自一个反应式复合体。这里是该复合物的嵌套结构的反射:(4xp04637)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

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源自一个反应式复合体。下面是这个复合体的Reactomes嵌套结构:(P24941, O96020, P24864)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

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源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(4xP04637,3xQ00987,O15151)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

源自一个反应式复合体。这里是该复合物的嵌套结构的反射:(4xp04637)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

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从Reactome DefinedSet的。这是替代实体的名单,其中任何一个可以执行给定功能

源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(P57723,ENST00000244741)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

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源自一个反应式复合体。这里是该复合物的反射嵌套结构:(4xp04637,Q96PM9)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

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源自反应族基因统称性。其序列未知的肽或多核苷酸,因此不能与外部序列数据库连接或用于陈述或用于陈述

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源自一个反应式复合体。以下是该复合物的嵌套结构的反射:(P24941,P78396,P20248,P46527,P38936)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

源自一个反应式复合体。这里是该复合物的反射嵌套结构:( P24941,O96020,P46527,P38936,P24864)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

源自一个反应式复合体。这里是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(Q8N726, 3xQ00987, O15151)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

源自一个反应式复合体。这里是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(Q00987, O15151)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

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源自一个反应式复合体。这里是该复合体嵌套结构的反射:(12xp0cg47,4xp62987,q8nhy2,4xp62979,36xp0cg48)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

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源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(p62195, o14818, a5lhx3, p40306, p17980, p51665, o00232, o00231, o75832, p49721, o4342, p35998, p28062, p25787, o00233, p62191, o00487, q13200, p25789, p20618, p28072, q06323, p48556, q15008, q99436, q99460, p28065, q9ul46, p55036, p28066, q14997, p25788, p28070, p25786, p60896, q92530, p60900, p28074, q16401, q8taa3, p49720, q9unm6, p62333,)P61289 P43686)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

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源自一个反应式复合体。这里是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(Q00987, O15151)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

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从Reactome DefinedSet的。这是替代实体的名单,其中任何一个可以执行给定功能

源自一个反应式复合体。这里是该复合物的反射嵌套结构:(4xP04637,ENSG00000124762,Q96PM9)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

源自一个反应式复合体。这里是该复合物的嵌套结构的反射:(4xp04637)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

从Reactome DefinedSet的。这是替代实体的名单,其中任何一个可以执行给定功能

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对这个复合物的嵌套结构:(3xP0CG47, P62987, P30304, P62979, 9xP0CG48)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

一些泛素moeities的共价添加到CDC25A,这标志着其蛋白水解降解。

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

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从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

源自一个反应式复合体。这里是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(Q00987, O15151)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

从Reactome DefinedSet的。这是替代实体的名单,其中任何一个可以执行给定功能

从Reactome DefinedSet的。这是替代实体的名单,其中任何一个可以执行给定功能

源自一个反应式复合体。这里是Reactomes为这个复杂的嵌套结构:(4xP04637, Q8NHY2)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表

通过CHK2通过CHK2导致电离辐射引起的DNA损伤导致CDC25a的磷酸化(MailAnd等,2001)。

霍夫曼 英格丽 德国癌症研究中心(DKFZ) sh 所罗门 OICR 2003 - 06 - 05 - t00:03:42z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z

MDM2是一个泛素连接酶,其表达由TP53(p53基因)(Wu等人,1993)的正调控。MDM2结合四聚体TP53(1999希)并促进其泛素化和随后的降解(Fuchs等人,1998)。需要用于TP53的高效泛素化MDM2同二聚体(Cheng等2011)或异源二聚体与MDM4(MDMX)的形成(利纳雷斯等人,2003)。而MDM2-TP53结合发生在TP53的氨基末端,MDM2泛素化TP53赖氨酸残基在羧基末端。这些赖氨酸的乙酰化可以抑制MDM2依赖的泛素化(Li等,2002)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR sh 所罗门 OICR 2015 - 10 - 15 - t21:57:44z 2021-05-21T21:46:55Z 2013-07-15T18:44:46Z

这描述了调节剂负调节的事件/催化剂活性(例如,构建抑制,竞争性抑制

在G1,细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的活性是由CDK抑制剂控制(抑制因子)CDKN1A(p21蛋白)和CDKN1B(p27蛋白),从而防止过早进入S期(Guardavaccaro和Pagano的,2006)。

马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 Pagano 米歇尔 纽约大学医学院病理科 sh 所罗门 OICR 2006-09-29T17:54:26Z 2021-05-22T01:47:23Z 2006-09-19T00:23:10Z

ATM磷酸化在三个丝氨酸残基(S386,S395,S407)和一个苏氨酸残基(T419)的附近,以RING结构域MDM2。响应于DNA损伤(DNA双链断裂)MDM2的ATM介导的磷酸防止MDM2二聚化,TP53(p53蛋白)和TP53的MDM2介导的泛素化(Cheng等人,2009年,Cheng等人2011)的结合。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR sh 所罗门 OICR 2015 - 10 - 16 - t18:40:31z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2015-10-14T19:01:11Z

PCBP4与CDKN1A (p21) mRNA的3'-UTR结合降低了CDKN1A mRNA的半衰期和CDKN1A蛋白的数量。在DNA损伤时,tp53介导的CDKN1A的诱导是快速的,而PCBP4的诱导是渐进的。据推测,在长时间应激下,pcbp4介导的CDKN1A下调可能从G1细胞周期阻滞转变为G2阻滞,这可能先于细胞凋亡(Scoumanne et al. 2011)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR 冠明 3 2015-10-07T00:30:50Z 2019-04-04T17:04:21z 2015-10-14T19:01:11Z

这描述了调节剂负调节的事件/催化剂活性(例如,构建抑制,竞争性抑制

在这个反应开始时,1分子的'泛素'和1分子的'磷酸化cdc25a '存在。在这个反应的最后,1个“泛素化Phospho-Cdc25A”分子存在。该反应发生在“胞质”中,并由“泛素连接酶”的“泛素-蛋白连接酶活性”介导(Bernardi et al. 2000)。

霍夫曼 英格丽 德国癌症研究中心(DKFZ) 女仆 2003 - 06 - 05 - t00:03:42z 2017-04-10T15:12:07z

在该反应开始时,存在1分子的“普遍磷酸磷酸Cdc25a”。在该反应结束时,存在1分子的'氨基酸'。该反应发生在“细胞溶胶”中进行,并由“26s蛋白酶体”(Bernardi等,2000)的“内肽酶活性”介导。

霍夫曼 英格丽 德国癌症研究中心(DKFZ) sh 所罗门 OICR 2003 - 06 - 05 - t00:03:42z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z

通过蛋白酶体降解自动取出的COP1。在该反应中所示的泛素分子的数量任意设定为4.(Dornan等,2006)。

马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 sh 所罗门 OICR 2008-03-31T16:27:17Z 2021 - 05 - 22 - t02:46:22z 2008 - 06 - 13 - t01:09:06z

CHEK2(Chk2的)磷酸化TP53(p53基因)在丝氨酸残基S20(平尾等人,2000,Shieh等人2000,Chehab等人,2000)。在丝氨酸残基S20 TP53的磷酸化是必要的DNA损伤诱导的TP53稳定,因为它损害了与泛素连接酶MDM2(Chehab等人1999,Chehab等人,2000)TP53的相互作用。还需要S20磷酸化对于TP53依赖性转录的诱导响应于DNA损伤(平尾等人,2000)。

sh 所罗门 OICR Orlic-Milacic Marija OICR 2021-05-22T00:46:54z 2015-10-14T19:01:11Z

MDM2的N-末端部分结合TP53(P53)的N-末端转移域,并通过TP53抑制转录转基因(MOMAND等人,Oliner等,1992,Oliner等,1993,Chen等,1993)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR sh 所罗门 OICR 2014 - 10 - 31 - t22:37:11z 2021-05-21T21:46:55Z 2015-10-14T19:01:11Z

这描述了调节剂负调节的事件/催化剂活性(例如,构建抑制,竞争性抑制

atm依赖的COP1对Ser的磷酸化(387)导致COP1-p53复合物的破坏(Dornan等人,2006)

马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 sh 所罗门 OICR 2008-03-31T15:49:44Z 2021-05-21T21:46:55Z 2008 - 06 - 13 - t01:09:06z

人MDM4(MDMX)通过ATM磷酸化。该网站对MDM2介导的MDM4介导的MDM4介导的MDM4是重要的(Pereg等人2005,Chen等人2005)。

马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 sh 所罗门 OICR 2008-05-08T02:49:21Z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2008 - 03 - 31 - t14:45:58z

为了有效地用作E3泛素连接酶,MDM2必须形成二聚体或更高阶的低聚物。MDM2可以同性恋(Cheng等,2011)或用MDM4(MDMX)(Sharp等人)的异二聚体(Sharp等人.1999,Huang等人2011,Pant等人2011)。二聚化涉及MDM2和/或MDM4的环形结构域。MDM2和MDM4的异二聚体在胚胎发育过程中可能尤为重要(PANT等人2011)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR sh 所罗门 OICR 2015 - 10 - 14 - t21:45:30z 2021-05-22T05:11:21Z 2015-10-14T19:01:11Z

这描述了调节剂负调节的事件/催化剂活性(例如,构建抑制,竞争性抑制

TP53 (p53)结合CDKN1A (p21, WAF1)基因启动子中的至少两个p53应答元件(El-Deiry et al. 1993, Espinosa et al. 2003)。TP53和ZNF385A (HZF)复合物的形成促进了TP53与CDKN1A启动子的结合(Das et al. 2007)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR 2015-10-07T18:53:31z 2016-02-10T23:51:57Z 2013-07-15T18:44:46Z 2015-10-14T19:01:11Z 2015-10-07T18:45:14Z

响应于DNA双链断裂,丝氨酸在TP53(p53基因)肿瘤抑制蛋白的位置15被快速磷酸化由ATM激酶。这有助于稳定p53蛋白。在p53蛋白的水平的上升引起的p21细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂的表达。这防止从G1期向S期的正常进展,从而提供对受损的DNA复制的检查(Banin等人,1998,1998 Canman等人,卡纳等人,1998)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR 卡纳 咕咕 昆士兰医学研究所,信号转导实验室 sh 所罗门 OICR 2015-05-16T10:55:28Z 2021-05-22T00:46:54z 2003 - 06 - 05 - t00:03:38z 2015 - 05 - 12 - t22:54:01z

一旦MDM4被ATM和CHEK2磷酸化,响应DNA损伤,MDM2就会泛素化MDM4并将其降解(Chen et al. 2005, Pereg et al. 2005)。MDM4的存在刺激了MDM2的自动泛素化(Linares et al. 2003)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR sh 所罗门 OICR 2015-10-14T19:17:54Z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2015-10-14T19:01:11Z

在G1,细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的活性是由CDK抑制剂控制(抑制因子)CDKN1A(p21蛋白)和CDKN1B(p27蛋白),从而防止过早进入S期(参见Guardavaccaro和Pagano的,2006)。有效识别和p27泛素化由SCF(Skp2蛋白)复合物,需要三聚复合物含有p27蛋白和细胞周期蛋白E / A的形成:Cdk2的。

卡纳 咕咕 昆士兰医学研究所,信号转导实验室 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 sh 所罗门 OICR 2003 - 06 - 05 - t00:03:38z 2021-05-22T01:47:23Z 2006 - 10 - 02 - t10:19:16z

CHEK2 (Chk2)激酶是MDM4在体内S342和S367位点磷酸化所必需的。chek2介导的磷酸化通过MDM2刺激MDM4泛素化和随后的降解(Chen et al. 2005)。

马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 sh 所罗门 OICR 2008-05-08T02:49:21Z 2021-05-22T05:11:21Z 2008 - 03 - 31 - t14:45:58z

电离辐射导致COP1从细胞核向细胞质的atm依赖性移动(Dornan等,2006)。

马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 sh 所罗门 OICR 2008-03-31T15:49:44Z 2021 - 05 - 22 - t02:46:22z 2008 - 06 - 13 - t01:09:06z

ATM在响应DNA损伤时磷酸化了Ser387上的COP1 (Dornan et al., 2006)。

马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 sh 所罗门 OICR 2008-05-08T02:49:21Z 2021 - 05 - 22 - t02:46:22z 2008 - 06 - 13 - t01:09:06z

ATM磷酸化可促进体外COP1的自biquitination (Dornan et al., 2006)。在这个反应中显示的泛素分子的数量被任意设定为4。

马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 sh 所罗门 OICR 2008-03-31T15:53:02Z 2021 - 05 - 22 - t02:46:22z 2008 - 06 - 13 - t01:09:06z

PCBP4绑定CDKN1A(P21)mRNA的3'-UTR,并降低其稳定性(Scoumanne等,2011)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR 2015-10-07T00:08:44z 2018-10-31T19:05:56Z 2015-10-14T19:01:11Z

DNA损伤的检测所造成的在Ser-123由Chk1的电离CDC25A的磷酸化辐射的结果,抑制CDC25A。

霍夫曼 英格丽 德国癌症研究中心(DKFZ) sh 所罗门 OICR 2003 - 06 - 05 - t00:03:42z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z

ZnF385A(HZF)与TP53(P53)形成复合物,与TP53的DNA结合结构域相互作用。TP53和ZNF385A的复合物与细胞周期骤停基因的P53响应元素相关联,例如CDKN1A(P21)并刺激其转录。在长时间应激下,ZnF385A经历泛素化和蛋白酶体介导的降解,其与TP53调节的促凋亡基因的表达一致(Das等,2007)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR sh 所罗门 OICR 2015年10月- 07 - t18:34:04z 2021-05-21T21:46:55Z 2015-10-14T19:01:11Z

在MDM2介导的泛素中,TP53从细胞核输出到胞嘧啶。TP53核导出需要TP53的核出口序列(NES),但不是MDM2的NES(Boyd等人2000.Geyer等,2000)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR sh 所罗门 OICR 2015 - 09 - 03 - t23:49:14z 2021-05-22T00:46:54z 2015-10-14T19:01:11Z

在CDKN1A (p21)基因启动子中,TP53 (p53)与其响应元件的结合会刺激CDKN1A的转录(El-Deiry et al. 1993)。ZNF385A (HZF)与TP53的DNA结合区域的结合促进了CDKN1A的诱导和随后的细胞周期阻滞(Das et al. 2007)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 冠明 3 2015-10-06T23:21:02Z 2019-04-04T17:04:21z 2006-09-29T17:54:26Z 2015-10-14T19:01:11Z 2015-10-06T22:40:36Z

这描述事件/ CatalystActivity中时带正由调节器(例如,变构活化)调节