SBML从Reactome版本77生成的关于使用JSBML版本1.5 21年7月15日下午1点18分。
在G1期,有两种类型的DNA损伤的反应中,p53依赖性和不依赖p53的通路。的p53依赖性应答的CDK抑制通过编码由p53蛋白介导的抑制因子的基因的上调,而依赖p53的机制,通过Cdk2的的抑制T14Y15磷酸化抑制的CDK。在G1导致的损坏模板和其他复制缺陷突变复制的DNA损伤检查点的故障。
源自反垃圾突破序列。这是一种蛋白质
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源自一个反应式复合体。这里是该复合物的嵌套结构的反射:(4xp04637)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
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源自一个反应式复合体。下面是这个复合体的Reactomes嵌套结构:(P24941, O96020, P24864)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
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源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(4xP04637,3xQ00987,O15151)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
源自一个反应式复合体。这里是该复合物的嵌套结构的反射:(4xp04637)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
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从Reactome DefinedSet的。这是替代实体的名单,其中任何一个可以执行给定功能
源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(P57723,ENST00000244741)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
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源自一个反应式复合体。这里是该复合物的反射嵌套结构:(4xp04637,Q96PM9)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
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源自反应族基因统称性。其序列未知的肽或多核苷酸,因此不能与外部序列数据库连接或用于陈述或用于陈述
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源自一个反应式复合体。以下是该复合物的嵌套结构的反射:(P24941,P78396,P20248,P46527,P38936)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
源自一个反应式复合体。这里是该复合物的反射嵌套结构:( P24941,O96020,P46527,P38936,P24864)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
源自一个反应式复合体。这里是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(Q8N726, 3xQ00987, O15151)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
源自一个反应式复合体。这里是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(Q00987, O15151)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
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源自一个反应式复合体。这里是该复合物的嵌套结构的反射:(4xp04637)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
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源自一个反应式复合体。这里是该复合体嵌套结构的反射:(12xp0cg47,4xp62987,q8nhy2,4xp62979,36xp0cg48)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
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源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(p62195, o14818, a5lhx3, p40306, p17980, p51665, o00232, o00231, o75832, p49721, o4342, p35998, p28062, p25787, o00233, p62191, o00487, q13200, p25789, p20618, p28072, q06323, p48556, q15008, q99436, q99460, p28065, q9ul46, p55036, p28066, q14997, p25788, p28070, p25786, p60896, q92530, p60900, p28074, q16401, q8taa3, p49720, q9unm6, p62333,)P61289 P43686)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
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源自一个反应式复合体。这里是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(Q00987, O15151)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
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从Reactome DefinedSet的。这是替代实体的名单,其中任何一个可以执行给定功能
源自一个反应式复合体。这里是该复合物的反射嵌套结构:(4xP04637,ENSG00000124762,Q96PM9)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
源自一个反应式复合体。这里是该复合物的嵌套结构的反射:(4xp04637)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
从Reactome DefinedSet的。这是替代实体的名单,其中任何一个可以执行给定功能
源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对这个复合物的嵌套结构:(3xP0CG47, P62987, P30304, P62979, 9xP0CG48)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
一些泛素moeities的共价添加到CDC25A,这标志着其蛋白水解降解。
从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物
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从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物
源自一个反应式复合体。这里是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(Q00987, O15151)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
从Reactome DefinedSet的。这是替代实体的名单,其中任何一个可以执行给定功能
从Reactome DefinedSet的。这是替代实体的名单,其中任何一个可以执行给定功能
源自一个反应式复合体。这里是Reactomes为这个复杂的嵌套结构:(4xP04637, Q8NHY2)。extome使用嵌套结构进行复合物,其不能在SBML级别3版本1核中完全代表
通过CHK2通过CHK2导致电离辐射引起的DNA损伤导致CDC25a的磷酸化(MailAnd等,2001)。
MDM2是一个泛素连接酶,其表达由TP53(p53基因)(Wu等人,1993)的正调控。MDM2结合四聚体TP53(1999希)并促进其泛素化和随后的降解(Fuchs等人,1998)。需要用于TP53的高效泛素化MDM2同二聚体(Cheng等2011)或异源二聚体与MDM4(MDMX)的形成(利纳雷斯等人,2003)。而MDM2-TP53结合发生在TP53的氨基末端,MDM2泛素化TP53赖氨酸残基在羧基末端。这些赖氨酸的乙酰化可以抑制MDM2依赖的泛素化(Li等,2002)。
这描述了调节剂负调节的事件/催化剂活性(例如,构建抑制,竞争性抑制
在G1,细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的活性是由CDK抑制剂控制(抑制因子)CDKN1A(p21蛋白)和CDKN1B(p27蛋白),从而防止过早进入S期(Guardavaccaro和Pagano的,2006)。
ATM磷酸化在三个丝氨酸残基(S386,S395,S407)和一个苏氨酸残基(T419)的附近,以RING结构域MDM2。响应于DNA损伤(DNA双链断裂)MDM2的ATM介导的磷酸防止MDM2二聚化,TP53(p53蛋白)和TP53的MDM2介导的泛素化(Cheng等人,2009年,Cheng等人2011)的结合。
PCBP4与CDKN1A (p21) mRNA的3'-UTR结合降低了CDKN1A mRNA的半衰期和CDKN1A蛋白的数量。在DNA损伤时,tp53介导的CDKN1A的诱导是快速的,而PCBP4的诱导是渐进的。据推测,在长时间应激下,pcbp4介导的CDKN1A下调可能从G1细胞周期阻滞转变为G2阻滞,这可能先于细胞凋亡(Scoumanne et al. 2011)。
这描述了调节剂负调节的事件/催化剂活性(例如,构建抑制,竞争性抑制
在这个反应开始时,1分子的'泛素'和1分子的'磷酸化cdc25a '存在。在这个反应的最后,1个“泛素化Phospho-Cdc25A”分子存在。该反应发生在“胞质”中,并由“泛素连接酶”的“泛素-蛋白连接酶活性”介导(Bernardi et al. 2000)。
在该反应开始时,存在1分子的“普遍磷酸磷酸Cdc25a”。在该反应结束时,存在1分子的'氨基酸'。该反应发生在“细胞溶胶”中进行,并由“26s蛋白酶体”(Bernardi等,2000)的“内肽酶活性”介导。
通过蛋白酶体降解自动取出的COP1。在该反应中所示的泛素分子的数量任意设定为4.(Dornan等,2006)。
CHEK2(Chk2的)磷酸化TP53(p53基因)在丝氨酸残基S20(平尾等人,2000,Shieh等人2000,Chehab等人,2000)。在丝氨酸残基S20 TP53的磷酸化是必要的DNA损伤诱导的TP53稳定,因为它损害了与泛素连接酶MDM2(Chehab等人1999,Chehab等人,2000)TP53的相互作用。还需要S20磷酸化对于TP53依赖性转录的诱导响应于DNA损伤(平尾等人,2000)。
MDM2的N-末端部分结合TP53(P53)的N-末端转移域,并通过TP53抑制转录转基因(MOMAND等人,Oliner等,1992,Oliner等,1993,Chen等,1993)。
这描述了调节剂负调节的事件/催化剂活性(例如,构建抑制,竞争性抑制
atm依赖的COP1对Ser的磷酸化(387)导致COP1-p53复合物的破坏(Dornan等人,2006)
人MDM4(MDMX)通过ATM磷酸化。该网站对MDM2介导的MDM4介导的MDM4介导的MDM4是重要的(Pereg等人2005,Chen等人2005)。
为了有效地用作E3泛素连接酶,MDM2必须形成二聚体或更高阶的低聚物。MDM2可以同性恋(Cheng等,2011)或用MDM4(MDMX)(Sharp等人)的异二聚体(Sharp等人.1999,Huang等人2011,Pant等人2011)。二聚化涉及MDM2和/或MDM4的环形结构域。MDM2和MDM4的异二聚体在胚胎发育过程中可能尤为重要(PANT等人2011)。
这描述了调节剂负调节的事件/催化剂活性(例如,构建抑制,竞争性抑制
TP53 (p53)结合CDKN1A (p21, WAF1)基因启动子中的至少两个p53应答元件(El-Deiry et al. 1993, Espinosa et al. 2003)。TP53和ZNF385A (HZF)复合物的形成促进了TP53与CDKN1A启动子的结合(Das et al. 2007)。
响应于DNA双链断裂,丝氨酸在TP53(p53基因)肿瘤抑制蛋白的位置15被快速磷酸化由ATM激酶。这有助于稳定p53蛋白。在p53蛋白的水平的上升引起的p21细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂的表达。这防止从G1期向S期的正常进展,从而提供对受损的DNA复制的检查(Banin等人,1998,1998 Canman等人,卡纳等人,1998)。
一旦MDM4被ATM和CHEK2磷酸化,响应DNA损伤,MDM2就会泛素化MDM4并将其降解(Chen et al. 2005, Pereg et al. 2005)。MDM4的存在刺激了MDM2的自动泛素化(Linares et al. 2003)。
在G1,细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的活性是由CDK抑制剂控制(抑制因子)CDKN1A(p21蛋白)和CDKN1B(p27蛋白),从而防止过早进入S期(参见Guardavaccaro和Pagano的,2006)。有效识别和p27泛素化由SCF(Skp2蛋白)复合物,需要三聚复合物含有p27蛋白和细胞周期蛋白E / A的形成:Cdk2的。
CHEK2 (Chk2)激酶是MDM4在体内S342和S367位点磷酸化所必需的。chek2介导的磷酸化通过MDM2刺激MDM4泛素化和随后的降解(Chen et al. 2005)。
电离辐射导致COP1从细胞核向细胞质的atm依赖性移动(Dornan等,2006)。
ATM在响应DNA损伤时磷酸化了Ser387上的COP1 (Dornan et al., 2006)。
ATM磷酸化可促进体外COP1的自biquitination (Dornan et al., 2006)。在这个反应中显示的泛素分子的数量被任意设定为4。
PCBP4绑定CDKN1A(P21)mRNA的3'-UTR,并降低其稳定性(Scoumanne等,2011)。
DNA损伤的检测所造成的在Ser-123由Chk1的电离CDC25A的磷酸化辐射的结果,抑制CDC25A。
ZnF385A(HZF)与TP53(P53)形成复合物,与TP53的DNA结合结构域相互作用。TP53和ZNF385A的复合物与细胞周期骤停基因的P53响应元素相关联,例如CDKN1A(P21)并刺激其转录。在长时间应激下,ZnF385A经历泛素化和蛋白酶体介导的降解,其与TP53调节的促凋亡基因的表达一致(Das等,2007)。
在MDM2介导的泛素中,TP53从细胞核输出到胞嘧啶。TP53核导出需要TP53的核出口序列(NES),但不是MDM2的NES(Boyd等人2000.Geyer等,2000)。
在CDKN1A (p21)基因启动子中,TP53 (p53)与其响应元件的结合会刺激CDKN1A的转录(El-Deiry et al. 1993)。ZNF385A (HZF)与TP53的DNA结合区域的结合促进了CDKN1A的诱导和随后的细胞周期阻滞(Das et al. 2007)。
这描述事件/ CatalystActivity中时带正由调节器(例如,变构活化)调节