使用JSBML版本1.5在7/15/21下午1:19从Reactome版本77生成SBML。

G2/M检查点包括对受损DNA、未复制DNA的检查,以及确保基因组在每个细胞周期中只复制一次的检查。如果细胞通过这些检查点,它们就会正常过渡到M期。然而,如果这些检查点中的任何一个失败,有丝分裂进入会被特定的G2/M检查点事件阻止。由于存在未复制的DNA或受损的DNA, G2/M检查点可能会失败。在这种情况下,周期蛋白依赖的激酶Cdc2(Cdk1)维持在其非活性、磷酸化状态,并阻止有丝分裂进入。确保DNA复制起始点在每个细胞周期触发一次且仅一次的事件也是G2/M检查点的一个例子。在高水平的DNA损伤的情况下,细胞也可能被引导进行凋亡(未涵盖)。

Walworth 南希 UMDNJ罗伯特伍德约翰逊医学院 肖尔斯 所罗门 OICR 奥唐纳 迈克尔 洛克菲勒大学 2003 - 06 - 05 - t00:03:09z 2021-05-22T05:11:21Z

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

从已定义的反应集派生。这是可选实体的列表,其中任何一个都可以执行给定的功能

源自一个反应式复合体。这里是这个复杂的Reactomes嵌套结构:(4xP04637)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自反应体复合体。这是这个复合体的Reactomes嵌套结构:(P06493,P14635)。Reactome对复合体使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1 core中无法完全表示

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

源自反应体复合体。这是这个复合体的Reactomes嵌套结构:(P06493,P14635)。Reactome对复合体使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1 core中无法完全表示

源自反应体复合体。这是这个复合体的反应体嵌套结构:(P27694,P35244,P15927)。Reactome对复合体使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1 core中无法完全表示

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(P27694, P35250, O75943, P40937, P35244, P15927, P40938, P35249)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

Rad17 RFC复合物与含有单链DNA区域的DNA底物结合,包括在ATP非依赖性反应中的间隙或引物DNA。Rad9-Hus1-Rad1(9-1-1)复合物的负载优先发生在含有5'凹端的DNA底物上。这与RFC对PCNA的装载形成对比,RFC优先在3'凹端的DNA上装载PCNA。

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。这里是这个复杂的Reactomes嵌套结构:(Q9NYZ3, 4xP04637)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自反应体复合体。这是这个复合体的反应体嵌套结构:(P06493,O95067,P14635)。Reactome对复合体使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1 core中无法完全表示

源自一个反应式复合体。这里是这个复杂的Reactomes嵌套结构:(4xP04637)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(Q9NWV8、Q8IYW5、P61088、2xP62807、2xQ96A08、2x60814、Q12888、2xQ93079、2xP33778、P46736、P49959、2xQ14676、Q9NXR7、2xP23527、Q13315、2xQ99877、O96017、O96028、2xQ16695、P63165、Q15819、2x29105、2xP38398、2xQ99879、Q92993、2xP16104、2xQ99728、Q96RL1、O95714、O60934、Q6UWZ7、2xP06899、2xQ8N257、2xP58876、Q8N2W9、2xP57053、2xQ99880、2xP62805、2 xq16778 2 xo76064 Q92878)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(p62195, o14818, a5lhx3, p40306, p17980, p51665, o00232, o00231, o75832, p49721, o4342, p35998, p28062, p25787, o00233, p62191, o00487, q13200, p25789, p20618, p28072, q06323, p48556, q15008, q99436, q99460, p28065, q9ul46, p55036, p28066, q14997, p25788, p28070, p25786, p60896, q92530, p60900, p28074, q16401, q8taa3, p49720, q9unm6, p62333,)P61289 P43686)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是这个复合体的Reactomes嵌套结构:(O95067, P06493, P14635)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自反应体复合体。这是这个复合体的反应体嵌套结构:(O60921,O60671,Q6WBX8,Q99638)。Reactome对复合体使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1 core中无法完全表示

Rad9-Hus1-Rad1(9-1-1)复合物是一种环状异三聚体复合物。在基因毒性应激条件下,它可以通过Rad17复合物在损伤部位或停滞的分叉处装载到DNA上。

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对这个复合体的嵌套结构:(Q8WXE1, Q13535, P27694, P35244, P15927)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

虽然ATR-ATRIP复合物与长度为30或50 nt的ssDNA复合物的结合很差,但在存在75 nt ssDNA分子时结合显著增强。复杂的形成主要是由ATRIP和RPA之间的物理相互作用介导的。ATRIP分子中的多个元素可以与RPA-ssDNA复合物结合,包括残基1-107(最高亲和力)、218-390和390-791(最低亲和力)。虽然全长ATRIP不能结合ssDNA,但当存在于兔网织红细胞裂解物时,内部区域(108-390)可以弱结合ssDNA。ATR可以独立于RPA直接与ssDNA结合,但这种结合被ATRIP抑制。在结合后,ATR激酶被激活,并可以直接磷酸化底物,如Rad17。

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(2xO96017)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从已定义的反应集派生。这是可选实体的列表,其中任何一个都可以执行给定的功能

源自反应体复合体。这是该复合物的反应体嵌套结构:(P25205,Q7L590,Q9UBD5,P33991,Q9HAW4,O00311,Q9UJA3,Q13415,Q9Y5N6,P24941,Q13416,Q14566,O43929,O75419,P33992,P33993,Q9UBU7,Q99741,O43913,P49736)。Reactome对复合体使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1 core中无法完全表示

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

源自反应体复合体。这是这个复合体的反应体嵌套结构:(P27694,P35244,P15927)。Reactome对复合体使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1 core中无法完全表示

RPA与单链DNA在不同的复合物中结合,可以通过每个RPA分子封闭的单链DNA的长度来区分。这些复合物反映了RPA异源三聚体结构中不同DNA结合域的渐进关联。结合与RPA内的显著构象变化相耦合,这在微观水平上是可以观察到的。据推测,游离和单链DNA结合的RPA的不同构象允许蛋白质在与DNA结合时选择性地与ATR-ATRIP等因子相互作用。

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

源自一个反应的其他实体。我们无法或不愿在化学中详细描述的实体,也不能放在任何其他类别中。可以用来表示细胞中参与反应但我们不能或不想定义分子的复杂结构,例如细胞膜、Holliday结构

源自一个反应式复合体。这里是这个复杂的Reactomes嵌套结构:(4xP04637)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(Q8WXE1, Q13535)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

ATR (ATM-和rad3相关)激酶是人类细胞中重要的检查点因子。在对复制应激(即导致复制叉停止的应激)或紫外线辐射的反应中,ATR变得活跃并磷酸化许多参与检查点反应的因子,包括检查点激酶Chk1。在人类细胞中,ATR总是与ATRIP (ATR相互作用蛋白)相关。siRNA耗尽ATRIP导致ATR的损失,但不影响ATR mRNA水平,表明复杂的形成稳定ATR。ATRIP也是ATR激酶的底物,但这种修饰在ATR-ATRIP募集到损伤部位、Chk1的激活或p53的修饰中不起重要作用。

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(Q9NWV8、Q8IYW5、P61088、2xP62807、2xQ96A08、2x60814、Q12888、2xQ93079、2xP33778、P46736、P49959、2xQ14676、Q9NXR7、2xP23527、Q13315、2xQ99877、O96028、2xQ16695、P63165、Q15819、2x29105、2xP38398、2xQ99879、Q92993、2xP16104、2xQ99728、Q96RL1、O95714、O60934、Q6UWZ7、2xP06899、2xQ8N257、2xP58876、Q8N2W9、2xP57053、2xQ99880、2xP62805、2xQ16778、2 xo76064 Q92878)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自反应体复合体。这是这个复合体的反应体嵌套结构:(O60921,P27694,P35250,O75943,P40937,O60671,P35244,P15927,Q6WBX8,P40938,P35249,Q99638)。Reactome对复合体使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1 core中无法完全表示

9-1-1复合物的一个主要已知功能是将Chk1召集到停止复制的分叉上,由ATR激活。然而,9-1-1复合物的存在也改变了Rad17的磷酸化能力,这可能表明9-1-1也可能招募ATR底物的子集。9-1-1复合物还被发现与碱基切除修复因子人类DNA聚合酶beta、瓣内切酶FEN1和S. pombe MutY同源物(SpMYH)相互作用,表明9-1-1也在DNA修复中发挥直接作用。

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

从带有AccessionedSequence的Reactome实体派生。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。这里是这个复杂的Reactomes嵌套结构:(4xP04637)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对这个复合物的嵌套结构:(P25205, Q7L590, Q9UBD5, P33991, O00311, Q9UJA3, Q13415, Q9Y5N6, P24941, Q13416, Q14566, O43929, O75419, P33992, P33993, Q9UBU7, Q99741, O43913, P49736)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自反应体复合体。这是该复合物的反应体嵌套结构:(P25205,Q7L590,Q9UBD5,P33991,Q9HAW4,O00311,Q9UJA3,Q13415,Q9Y5N6,P24941,Q13416,Q14566,O43929,O75419,P33992,P33993,Q9UBU7,Q99741,O43913,P49736)。Reactome对复合体使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1 core中无法完全表示

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

源自一个反应式复合体。这里是Reactomes的嵌套结构这个复杂:(2xP62258, P30307, 2xP31947, 2xP61981, 2xP31946, 2xP27348, 2xP63104, 2xQ04917)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。这里是这个复杂的Reactomes嵌套结构:(Q9NYZ3, 4xP04637)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。以下是这个复合体的Reactomes嵌套结构:(P35250, O75943, P40937, P40938, P35249)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

Rad17 RFC复合物是一种结构类似于RFC的异五聚体。Rad17 RFC复合物包含四个较小的RFC亚单位(Rfc2[p37]、Rfc3[p36]、Rfc4[p40]和Rfc5[p38]),以及取代Rfc1[p140]亚单位的75 kDa Rad17亚单位。Rad17复合物含有一种弱ATP酶,受引物DNA刺激性差。除了结合9-1-1复合物和RPA外,Rad17 RFC复合物还与人MCM7蛋白相互作用。这些相互作用对Chk1活化都是至关重要的。Rad17亚基在进化上是保守的,蛋白质在氨基酸水平上与粟酒链球菌Rad17蛋白具有49%的同源性。有针对性地删除小鼠Rad17的N-末端区域会导致胚胎死亡,这强烈表明人类Rad17对长期存活也至关重要。

源自一个反应式复合体。这是Reactomes的嵌套结构,该复杂:(Q9UQ84, Q9H9A7, P40937, 2xP51530, P49959, Q6WBX8, Q13315, Q9BX63, 2xP54132, P27694, Q92547, Q9BSD3, P15927, P40938, Q99638, 2xP38398, Q13535, P35250, O60671, Q92993, 2xQ99728, P35249, 4xQ99708, O60934, O60921, Q8WXE1, 2xQ14191, Q96E14, O75943, Q13472, Q92878, P35244)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

9-1-1复合物是一种异源三聚体环状结构,由Rad17 RFC复合物装载到DNA上。体外研究表明,加载到含有单链DNA缺口的DNA底物上是首选的,这种缺口可能类似于复制叉停滞和DNA聚合酶/螺旋酶解偶联时发现的结构。Rad17 RFC和9-1-1复合物在结构上分别与RFC(复制因子C)钳位器和PCNA滑动钳相似,并且认为在9-1-1复合物和PCNA的加载过程中使用类似的机制。加载后,9-1-1复合物可将Chk1招募到复制叉解偶联或DNA损伤的位点。纯化的Rad17和Rad9-Hus1-Rad1(9-1-1)复合物可利用Rad17-Rad9相互作用在ATP存在下形成稳定的共复合物。通过计算机模拟研究,还提出复合物的Rad17亚基与Rad1的C-末端相互作用,p36与Hus1的C-末端相互作用,p38与Rad9的C-末端相互作用。9-1-1复合体的一个主要已知功能是将Chk1招募到停滞的复制分叉,以供ATR激活。然而,9-1-1复合物的存在也改变了Rad17磷酸化的能力,这可能表明9-1-1可能调节额外ATR底物的再合成。还发现9-1-1复合物与碱基切除修复因子人类DNA聚合酶β、瓣内切酶FEN1和粟酒链球菌突变同源物(SpMYH)相互作用,表明9-1-1也在DNA修复中起直接作用。

D 'Eustachio 彼得 纽约大学医学院生物化学系 博罗威茨 詹姆斯一 纽约大学医学院生物化学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2006-03-03T21:44:08Z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2006 - 02 - 25 - t22:40:15z

Chk1是一种在基因毒性应激中激活的检查点激酶。与ATR一样,Chk1对哺乳动物的生存至关重要。小鼠的靶向基因破坏表明Chk1的缺失导致着床周胚胎的死亡。尽管ATR-ATRIP不与ssDNA结合可以使Chk1磷酸化,但Chk1的激活在被引入到停滞的复制叉时,通过与改进的claspin形式和Rad9-Hus1-Rad1滑动钳的物理相互作用大大增强。Chk1的激活发生在两个位点(丝氨酸317和丝氨酸345)磷酸化之后。突变分析表明,这两个位点的修饰对于最大激酶活性是必不可少的,而仅一个位点的磷酸化只会导致Chk1的微弱激活。磷酸化后,Chk1可以从复合物扩散出去,进一步放大检查点信号。ATR似乎是激活Chk1的主要激酶,因为激活ATR的条件(紫外线照射或羟基脲处理)也激活Chk1。激活ATM的应力,例如电离辐照,不会引起显著的Chk1激活。虽然ATR和ATM途径不同,但两者之间存在相互作用。 For example, double-strand DNA breaks can be processed in an ATM-dependent manner to generate structures that can cause ATR and hence Chk1 activation. The ATR and ATM pathways also have mechanistic similarities. Analogous to the Chk1 kinase existing downstream of ATR, the Chk2 checkpoint kinase is modified and activated by ATM. Although having distinct structures, Chk1 and Chk2 also have overlapping targets with some substrate sites phosphorylatable by both kinases (e.g., serine 20 of p53).

D 'Eustachio 彼得 纽约大学医学院生物化学系 博罗威茨 詹姆斯一 纽约大学医学院生物化学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2006-03-03T21:44:08Z 2021 - 05 - 22 - t00:46:54z 2006 - 02 - 25 - t22:40:15z

由ATR介导的磷酸化激活的CHEK1可在丝氨酸残基S20处磷酸化TP53,导致TP53的半衰期延长(Shieh等人,2000年)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR 肖尔斯 所罗门 OICR 2015-09-22T20:31:36Z 2021 - 05 - 22 - t00:46:54z 2015-10-14T19:01:11Z

CHK1在ser216位点磷酸化CDC25C (Blasina et al.,1999),从而抑制CDC25磷酸酶活性并产生14-3-3停靠位点(Peng et al., 1997)。14-3-3蛋白与磷酸化的CDC25C (p-S216-CDC25C)的关联被认为是导致该复合物在细胞质内保留的结果(Dalal et al., 1999;Graves等人,2001)。

马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2003 - 08 - 05 - t05:10:00z 2021-05-22T02:46:22Z 2003 - 08 - 05 - t05:10:00z

Chk1磷酸化Wee1刺激Wee1激酶活性。

马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 2003 - 08 - 05 - t05:10:00z 2020 - 12 - 07 - t14:35:56z 2003 - 08年- 08 - t06:54:00z

atm介导的CHEK2 (CHK2, Cds1)在苏氨酸残基T68上的磷酸化主要通过两个CHEK2原体的FHA结构域和磷酸化T68残基的分子间相互作用促进过渡CHEK2同源二聚体的形成(Cai et al. 2009)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR 肖尔斯 所罗门 OICR 2015 - 03 - 17 - t07:43:41z 2021-05-22T05:11:21Z 2015 - 05 - 12 - t22:54:01z

卡环蛋白是一种复制叉相关蛋白,对Chk1激活非常重要。卡环蛋白在复制起始点激发期间装载到叉上,并在DNA合成期间随叉移动。在分叉解偶联和ATR-ATRIP与持久性单链DNA结合后,激活的ATR激酶在两个主要位点磷酸化卡环蛋白。修饰增加了卡环蛋白对Chk1的亲和力。对人类或非洲爪蟾扣蛋白的研究表明,这两个位点的磷酸化对于扣蛋白-Chk1的显著结合至关重要。在通过ATR修饰卡环蛋白后,Chk1可以短暂地被招募到停滞的复制叉,以便随后通过ATR进行磷酸化和激活。Chk1的激活允许修改额外的下游目标,从而放大检查点信号。虽然已使用非洲爪蟾卵提取物和非洲爪蟾钩蛋白获得了许多关于钩蛋白作用的机制信息,但在包括酿酒酵母(MRC1)、波姆酵母(MRC1)和人类在内的各种真核物种中发现了具有类似活性的因子。激活的ATR使人类钩蛋白在两个位点磷酸化,苏氨酸916和丝氨酸945。

D 'Eustachio 彼得 纽约大学医学院生物化学系 博罗威茨 詹姆斯一 纽约大学医学院生物化学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2006-03-03T21:44:08Z 2021 - 05 - 22 - t00:46:54z 2006 - 02 - 25 - t22:40:15z

WEE1是一种核激酶,在酪氨酸15(Y15)上磷酸化细胞周期蛋白B1:Cdc2(CCNB1:CDK1),使复合物失活(Parker和Piwnica Worms 1992,McGowan和Russell 1993)。细胞周期蛋白B2和Cdc2(CCNB2:CDK1)的复合物也在Y15上磷酸化(Galaktionov和Beach 1991)。

马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2005-12-23T18:22:34Z 2021 - 05 - 22 - t00:46:54z

自从MDM2-mediated TP53的泛素化促进了TP53的易位细胞溶质,既然GTSE1-facilitated易位TP53的胞质取决于功能MDM2(没有报道GTSE1和MDM2)之间的相互作用(蒙特et al . 2004年),它是合理的,GTSE1结合TP53 polyubiquitinated MDM2。TP53和GTSE1之间的相互作用涉及到TP53和GTSE1的c端调控域(Monte et al. 2003)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 16 t00:19:48z 2021-05-21T21:46:55Z 2016-01-15T22:40:47Z

Cdc25C受14-3-3结合位点Ser 216的磷酸化负调控。这是细胞在正常条件下和DNA损伤后用来阻止有丝分裂进入的重要调节机制(Chaturvedi等,1999;Bulavin等,2003)。

马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 桑切斯 尤兰达 达特茅斯医学院药理学和毒理学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2003-09-01T08:23:00Z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2004 - 02 - 11 - t02:59:11z 2008-01-15T18:54:21Z

Cdc25C在216位点的磷酸化既会抑制Cdc25C磷酸酶活性,又会产生14-3-3对接位点(Peng et al. 1997)。

马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2003 - 08 - 05 - t05:10:00z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2003 - 08 - 05 - t05:10:00z

GTSE1以蛋白酶体依赖的方式促进TP53的下调。GTSE1和MDM2促进TP53的核输出可能使泛素化TP53可用于蛋白酶体机制。GTSE1介导的TP53水平降低是G2检查点恢复(DNA损伤诱导G2期阻滞后的细胞周期重新进入)和拯救S/G2期DNA损伤诱导的细胞凋亡所必需的(Monte et al.2003,Monte et al.2004)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 16 t00:45:38z 2021-05-21T21:46:55Z 2016-01-15T22:40:47Z

ATR与DNA损伤位点结合,在丝氨酸残基S15磷酸化TP53 (p53)。S15磷酸化通过抑制TP53与泛素连接酶MDM2的结合来稳定TP53 (Tibbetts et al. 1999, Lakin et al. 1999)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR 肖尔斯 所罗门 OICR 2015 - 09 - 24 - t06:15:31z 2021 - 05 - 22 - t00:46:54z 2015-10-14T19:01:11Z

在复制起始期间,卡环蛋白被加载到DNA复制源上。对非洲爪蟾卵提取物的研究表明,卡环蛋白负载需要Cdc45的存在,Cdc45是一种在Cdk2存在的情况下促进原始DNA初始解旋的因子。这个步骤之后是RPA结合,这是招募PCNA和DNA聚合酶α和δ的先决条件。由于卡环蛋白结合不需要RPA,因此假定卡环蛋白在初始起始解旋时结合,但在DNA合成开始之前结合。然后,clapin将继续与复制叉机制相关联,在那里它可以作为检查点传感器蛋白。即使与复制叉相关,卡环蛋白也不是一种重要的DNA复制因子。对非洲爪蟾卡环蛋白的研究表明,它可以在染色质上与同源Cdc45、DNA聚合酶ε、RPA、RFC和Rad17 RFC物理关联。对纯化的人类卡环蛋白的研究表明,它以高亲和力与类似停滞复制叉的分支(或分叉)DNA结构结合。这些复合物的电子显微镜显示卡环蛋白在分支附近以环状结构结合。假设该蛋白质在这些位点包围着DNA。

D 'Eustachio 彼得 纽约大学医学院生物化学系 博罗威茨 詹姆斯一 纽约大学医学院生物化学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2006-03-03T21:44:08Z 2021 - 05 - 22 - t03:56:21z 2006 - 02 - 25 - t22:40:15z

当DNA复制叉遇到DNA损伤(如环丁烷嘧啶二聚体或烷基化碱基)时,复制DNA聚合酶可能发生停滞。这可以导致DNA聚合酶与DNA解旋酶的分离或“解耦”,并产生长区域的持久性ssDNA。解偶联也可能发生在对其他基因毒性胁迫的反应中,例如羟基脲处理抑制细胞核糖核酸二磷酸还原酶引起的dNTP池减少。暴露的ssDNA与单链DNA结合蛋白RPA结合。这种RPA-ssDNA复合物的持久性(相对于活跃复制叉上发现的更短暂的复合物)允许它作为复制压力的信号,可以被ATR-ATRIP和Rad17-Rfc2-5复合物识别。RPA与ssDNA结合在不同的复合物中,可以通过每个RPA分子阻断的ssDNA长度来区分。这些复合物反映了RPA异质三聚体结构中不同的dna结合域的逐渐关联。结合与RPA内显著的构象变化耦合在微观水平上可观察到。据推测,游离RPA和ssdna结合RPA的不同构象允许蛋白质在与DNA结合时选择性地与ATR-ATRIP等因子相互作用。

D 'Eustachio 彼得 纽约大学医学院生物化学系 博罗威茨 詹姆斯一 纽约大学医学院生物化学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2006-03-03T21:44:08Z 2021 - 05 - 22 - t03:56:21z 2006 - 02 - 25 - t22:40:15z

Myt1优先定位于内质网和高尔基复合物,在苏氨酸14上磷酸化Cdc2 (Liu et al., 1997)。

马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2005-12-23T18:22:34Z 2021 - 05 - 22 - t01:47:23z

检测电离辐射引起的DNA损伤导致Chk1使Ser-123处的Cdc25A磷酸化,从而抑制Cdc25A。

霍夫曼 英格丽德 德国癌症研究中心(DKFZ) 肖尔斯 所罗门 OICR 2003 - 06 - 05 - t00:03:42z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z

Rad17 RFC复合体参与了基因毒性应激反应的早期阶段。蛋白质复合物的主要功能是将Rad9-Hus1-Rad1(9-1-1)复合物装载到损伤和/或停滞复制叉处的DNA上。这种反应在概念上类似于RFC将PCNA滑动钳加载到DNA上。RPA显著刺激Rad17 RFC复合物与单链DNA或间隙或引物DNA的结合,但异源大肠杆菌SSB不刺激。将人类9-1-1复合物装载到此类DNA模板上也受到同源RPA的强烈刺激,但不受酵母RPA的刺激。尽管Rad17和Rad9是ATR激酶活性的底物,但Rad17和9-1-1复合物在DNA上的负载与ATR无关。Rad17 RFC复合物是一种结构类似于RFC的异五聚体。该复合物包含四个较小的RFC亚单位(Rfc2[p37]、Rfc3[p36]、Rfc4[p40]和Rfc5[p38])以及取代Rfc1[p140]亚单位的75 kDa Rad17亚单位。Rad17复合物包含一种弱ATP酶,该酶受到引物DNA的轻微刺激。除了结合9-1-1复合物和RPA外,Rad17 RFC复合物还与人MCM7蛋白相互作用。这些相互作用对Chk1活化都是至关重要的。Rad17亚基在进化上是保守的,蛋白质在氨基酸水平上与粟酒链球菌Rad17蛋白具有49%的同源性。靶向缺失小鼠Rad17的N末端区域会导致胚胎死亡,这强烈表明人类Rad17对长期生存能力也至关重要。Rad17-RFC复合物与含有单链DNA区域的DNA底物相关,包括ATP非依赖性反应中的间隙或引物DNA。Rad9-Hus1-Rad1(9-1-1)复合物的负载优先发生在含有5'凹端的DNA底物上。这与RFC对PCNA的装载形成对比,RFC优先在3'凹端的DNA上装载PCNA。

D 'Eustachio 彼得 纽约大学医学院生物化学系 博罗威茨 詹姆斯一 纽约大学医学院生物化学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2006-03-03T21:44:08Z 2021 - 05 - 22 - t03:56:21z 2006 - 02 - 25 - t22:40:15z

激活的ATM在苏氨酸残基T68上磷酸化CHEK2 (CHK2, Cds1) (Matsuoka et al. 2000, Melchionna et al. 2000)。BRCA1和TP53BP1的存在正调控atm介导的CHEK2磷酸化(Wang et al. 2002, Foray et al. 2003)。atm介导的磷酸化导致CHEK2二聚体的形成和CHEK2从染色质分离(Li和Stern 2005)。

肖尔斯 所罗门 OICR Orlic-Milacic Marija OICR 2021-05-21T23:50:09Z 2015 - 05 - 12 - t22:54:01z

二聚后,p-T68-CHEK2原聚体在丝氨酸残基S379(Lovly等人,2008年)和苏氨酸残基T383和T387(Lee等人,2001年)上反式自身磷酸化。自磷酸化导致CHEK2二聚体分解为活性CHEK2单体(Cai等人,2009)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR 肖尔斯 所罗门 OICR 2015 - 03 - 17 - t08:01:42z 2021-05-22T05:11:21Z 2015 - 05 - 12 - t22:54:01z

ATR激酶活性在ATR-ATRIP复合物与RPA单链DNA复合物结合时受到刺激。ATR随后可以磷酸化并激活检查点激酶Chk1,从而进一步放大检查点信号。ATR和Chk1激酶随后修饰多种因子,这些因子可导致停滞的DNA复制叉的稳定、起源放电的抑制、细胞周期进程的抑制、DNA修复因子的动员和凋亡的诱导。这种检查点信号机制在真核生物中高度保守,在酿酒酵母(分别为Mec1和Ddc2)、波姆酵母(分别为rad3和rad26)和X.laevis(分别为Xatr和Xatrip)等生物体中发现ATR和ATRIP的同系物激酶是人体细胞中一种重要的检查点因子。在对复制应激(即导致复制分叉停滞的应激)或紫外线辐射的反应中,ATR变得活跃,并磷酸化参与检查点反应的许多因素,包括检查点激酶Chk1。在人类细胞中,ATR总是与ATRP(ATR相互作用蛋白)相关。通过siRNA耗竭ATRP可导致ATR蛋白的丢失,而不影响ATR mRNA水平,这表明复合物的形成可稳定ATR蛋白。ATRIP也是ATR激酶的底物,但ATRIP的修饰并不能显著调节ATR-ATRIP向损伤部位的募集、Chk1的激活或p53的修饰。虽然ATR-ATRIP复合物仅与ssDNA长度为30或50 nt的RPA复合物结合不良,当存在75 nt单链DNA分子时,结合显著增强。复合物的形成主要由ATRIP和RPA之间的物理相互作用介导。ATRIP分子内的多个元件可与RPA ssDNA复合物结合,包括残基1-107(最高亲和力)、218-390和390-791(最低亲和力)。尽管全长ATRIP不能结合单链DNA,但当存在于兔网织红细胞裂解物中时,内部区域(108-390)可以弱结合单链DNA。ATR可以不依赖于RPA直接与单链DNA结合,但这种结合被ATRIP抑制。结合后,ATR激酶被激活,并可直接磷酸化底物,如Rad17。

D 'Eustachio 彼得 纽约大学医学院生物化学系 博罗威茨 詹姆斯一 纽约大学医学院生物化学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2006-03-03T21:44:08Z 2021 - 05 - 22 - t00:46:54z 2006 - 02 - 25 - t22:40:15z

在细胞核中,GTSE1与TP53 (p53)的结合促进了TP53向细胞质的易位。这一过程依赖于GTSE1的核输出信号(NES) (Monte et al. 2004)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR 肖尔斯 所罗门 OICR 2016 - 01 - 16 t00:34:18z 2021-05-21T21:46:55Z 2016-01-15T22:40:47Z

磷酸化的CDC25C易位到细胞质。丝氨酸残基S216的磷酸化并不是细胞质转位的先决条件(Dalal et al., 1999)。

Orlic-Milacic Marija OICR 马修斯 丽莎 纽约大学医学院生物化学系 肖尔斯 所罗门 OICR 2017 - 11 - 24 - t01:50:52z 2021 - 05 - 22 - t04:33:36z 2003 - 08 - 05 - t05:10:00z

CHEK2(CHK2,Cds1)主要通过与TP53BP1(53BP1)的相互作用被招募到DNA双链断裂(DSB)(Wang等人,2002年),但BRCA1也有助于CHEK2的招募(Wilson和Stern,2008年)。

Orlic-Milacic Marija OICR Orlic-Milacic Marija OICR 肖尔斯 所罗门 OICR 2015 - 03 - 16 - t21:15:26z 2021-05-21T23:50:09Z 2015 - 05 - 12 - t22:54:01z