在6/19/21 7:19 PM使用JSBML版本1.5从Reactome版本77生成SBML。

虽然锌、铜和铁等金属是细胞酶的辅助因子,但如果它们不被隔离,它们也可以催化破坏性的金属取代或非特异性的氧化还原反应。转录因子MTF1指导细胞对锌、镉和铜的主要反应。MTF1激活基因表达,上调金属隔离蛋白的编码基因,如金属硫蛋白和谷氨酸-半胱氨酸连接酶(GCLC)。MTF1通过抑制基因表达下调金属导入细胞的转运蛋白编码基因(Laity and Andrews 2007, Jackson etal . 2008, Günther etal . 2012, Dong etal . 2015)。在激活过程中,细胞质中的MTF1与锌离子结合并易位到细胞核中,在细胞核中它与靶基因启动子中的金属反应元件结合。镉和铜对MTF1的激活似乎是间接的,因为这些金属取代了金属硫蛋白中的锌,然后取代的锌与MTF1结合。金属硫蛋白结合金属并参与重金属的解毒、锌的储存和运输以及氧化还原生物化学。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2015 - 01 - 05 - t03:27:03z 2021 - 05 - 21 - t23:50:09z 2014 - 12 - 28 - t00:32:20z

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(P04732, 7x48775)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(7x29105, P80297)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(7x29105, P13640)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是这个复杂的Reactomes嵌套结构:(7x29105, P07438)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(P80297, 7x48775)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

源自一个反应式复合体。下面是这个复杂的Reactomes嵌套结构:(12x29105, ENSG00000074317, 2xQ14872)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(10x49552, P02795)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(P04731, 6x35828)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(P04733, 7x48775)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(7x48775, Q8N339)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(12x29105, 2xQ14872)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(7x29105, Q8N339)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(10x49552, P47944)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(7x29105, P47944)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(7x29105, P04731)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(7x29105, P25713)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是这个复杂的Reactomes嵌套结构:(7x48775, P07438)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(P25713, 7x48775)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(12x49552, P25713)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(7x48775, P13640)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(P04731, 7x48775)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(7x48775, P47944)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(7x29105, P02795)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(12x29105, ENSG00000159176, 2xQ14872)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(P80294, 7x48775)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(7x29105, P04732)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(P02795, 7x48775)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构(7x29105, P80294)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物

源自一个反应式复合体。这里是这个复杂的Reactomes嵌套结构:(4x29105, 49552, P25713)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

源自一个反应式复合体。下面是Reactomes的嵌套结构:(7x29105, P04733)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

从MT1A推断,金属硫蛋白MT1G与锌(II)的7个原子非合作结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

MTF1:锌复合物结合beta-synuclein (SNCB)基因启动子中的金属反应元件,并激活锌反应的转录(McHugh等,2011)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 05 - t03:27:03z 2017 - 01 - 12 t00:13:43z 2014 - 12 - 28 - t00:32:20z

从小鼠同源物推断,MT4结合10个铜原子(I)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t03:57:20z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 13 t02:18:39z

从MT1A推断,金属硫蛋白MT1G与镉(II)的7个原子非合作结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

SNCB (beta-synuclein)基因被转录产生mRNA, mRNA被翻译成蛋白质(Lavedan et al. 1998)。SNCB的转录被铜通过与MTF1结合的5'启动子中的金属反应结合元件上调(McHugh等,2011)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 Guanming 3 2015 - 01 - 05 - t03:27:03z 2019 - 04 - 04 - t17:04:21z 2014 - 12 - 28 - t00:32:20z

这描述了一种由调节器正调控的事件/催化剂活性(例如,变构活化)

金属硫蛋白MT2A结合镉(II)的7个原子,在c端alpha结构域的4个原子簇和在n端beta结构域的3个原子簇(Pan etal . 1999)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2021 - 05 - 21 - t23:50:09z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

从小鼠同源物推断,CSRP1基因的启动子包含3个共识金属响应元件,其中至少有一个与MTF1结合。镉通过MTF1激活CSRP1的表达。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 05 - t03:27:03z 2017 - 01 - 27 t13:46:06z 2014 - 12 - 28 - t00:32:20z

根据MT1A推断,金属硫蛋白MT1X与7个镉(II)原子非合作结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

从MT1A推断,金属硫蛋白MT1M与镉(II)的7个原子非合作结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

从小鼠同源物推断,MT4与7个镉(II)原子结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t03:57:20z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 13 t02:18:39z

金属硫蛋白MT1A结合6个砷原子(III), 3个在n端β结构域和3个在c端α结构域(Ngu and Stillman 2006, Irvine etal . 2013)。每个砷原子结合3个半胱氨酸硫醇(Ngu and Stillman 2006, Irvine et al. 2013)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2015 - 01 - 10 - t02:36:21z 2021 - 05 - 21 - t23:50:09z 2015 - 01 - 07 - t22:02:50z

金属硫蛋白的MT3结合7锌(II)原子2集群,集群之一4原子3 c端α域和一个集群的原子在氨基β域(Eriste et al . 2003年,Knipp et al . 2005年,梅洛尼et al . 2007年,梅洛尼et al . 2008年,梅洛尼et al . 2009年,吴et al . 2014年)。虽然MT3对锌的整体亲和力低于MT2A (Palumaa et al. 2005),但MT3能够结合一个额外的锌原子,其结合常数为100微摩尔(Eriste et al. 2003, Palumaa et al. 2005, Meloni et al. 2009)。已经观察到MT3:11Zn2+的化学计量,但MT3:7Zn2+形式更稳定,并占主导地位(Palumaa等人2002,Eriste等人2003,Palumaa等人)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2021 - 05 - 21 - t23:50:09z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

根据MT1A推断,金属硫蛋白MT1F与镉(II)的7个原子非合作结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

从MT1A推断,金属硫蛋白MT1F与锌(II)的7个原子非合作结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

金属硫蛋白MT2A以两个簇状结合7个锌原子,一个在n端β结构域,另一个在c端α结构域(Stillman etal . 2000, Yang etal . 2007)。在alpha区域的簇比在beta区域的簇更稳定,使得beta区域成为更好的锌供体(Jiang et al. 2000)。每个簇独立组装(Jiang et al. 2000)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

从MT1A推断,金属硫蛋白MT1X与锌(II)的7个原子非合作结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

从MT1A推断,金属硫蛋白MT1B与镉(II)的7个原子非合作结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

从MT1A推断,金属硫蛋白MT1M与7个锌(II)原子非合作结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

从MT1A推断,金属硫蛋白MT1H与7个镉(II)原子非合作结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

从MT1A推断,金属硫蛋白MT1B与7个锌(II)原子非合作结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

金属硫蛋白与镉(II)的7个原子以2簇形式结合,其中4个原子位于c端α结构域,3个原子位于n端β结构域(Palumaa etal . 2002, Palumaa etal . 2005, Wu etal . 2014)。与MT2A相比,MT3与镉的结合亲和力较低(Palumaa et al. 2005)。MT3可以结合超过7个镉原子,但MT3: 7cd2 +复合物是最普遍的(Palumaa et al. 2002, Palumaa et al. 2005)。MT3:7Cd2+暴露于一氧化氮会导致镉的释放(Wang et al. 2008)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2021 - 05 - 21 - t23:50:09z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

从小鼠同源物推断,MT4结合7个锌(II)原子。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t03:57:20z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 13 t02:18:39z

MT1A金属硫蛋白结合7个锌(II)原子,3个在n端β结构域,4个在c端α结构域(Sunderland etal . 2012)。结合是非协同的(Sunderland等,2012),通过锌和蛋白质半胱氨酸残基之间的硫代酸键发生。在锌发生聚类之前,MT1A与5个锌原子结合(Summers et al. 2013)。其余2个锌原子与MT1A结合的亲和力明显降低(Summers et al. 2013)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2015 - 01 - 10 - t02:36:21z 2021 - 05 - 21 - t23:50:09z 2015 - 01 - 07 - t22:02:50z

根据MT1A推断,金属硫蛋白MT1E与镉(II)的7个原子非合作结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

CSRP1基因被转录产生mRNA, mRNA被翻译成蛋白质。锌通过MTF1激活CSRP1的表达(Hardyman et al. 2016)。从小鼠同源物推断,CSRP1的表达被镉通过MTF1激活。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 Guanming 3 2015 - 01 - 05 - t03:27:03z 2019 - 04 - 04 - t17:04:21z 2014 - 12 - 28 - t00:32:20z

这描述了一种由调节器正调控的事件/催化剂活性(例如,变构活化)

从MT1A推断,金属硫蛋白MT1H与锌(II)的7个原子非合作结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

从MT1A推断,金属硫蛋白MT1E与锌(II)的7个原子非合作结合。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

金属硫蛋白MT3在完全饱和时能够结合12个铜(I)原子(Roschitzki etal . 2002)。最初,4个铜(I)原子结合到每个和域,然后再结合4个铜(I)原子。从小鼠同源物推断,MT3表现出比MT1和MT2亚型更强的铜硫蛋白特征,并且它具有高的结合Cu+的能力,前提是这发生在非氧化环境中。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 14 t21:46:19z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 13 t03:59:43z

MT1A结合了7个镉(II)原子,3个原子在n端β结构域,4个原子在c端α结构域(Rigby Duncan et al. 2008, Sunderland and Stillman 2008, Sutherland et al. 2012)。结合在α结构域上的第五个镉原子可能是金属交换过程中形成的中间产物(Rigby Duncan etal . 2008)。镉的结合是不合作的(Rigby Duncan and Stillman 2007, Sunderland and Stillman 2008)。从小鼠Mt1推断,与镉相比,MT1A可能对锌表现出较少的偏好,因此可能比其他金属硫蛋白亚型更能解毒镉。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 2015 - 01 - 10 - t02:36:21z 2016 - 03 - 12 - t00:39:20z 2015 - 01 - 07 - t22:02:50z

7zn2 +释放3个锌离子并在n端β结构域与4个铜离子结合(roschitzi et al. 2003, Meloni et al. 2007, Meloni et al. 2008)。通过这种机制MT3能够清除自由铜离子和交换金属聚合淀粉样β蛋白:铜(II)复杂和α-突触核蛋白:铜(II)复杂,从而消除活性氧的生产(梅洛尼et al . 2008年,梅洛尼2011年Vasak,皮德森et al . 2012年,罗et al . 2013年)。铜离子在结合前是二价(铜(II), Cu2+),结合后是一价(铜(I), Cu1+) (Meloni et al. 2008)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2015 - 01 - 13 t02:16:45z 2021 - 05 - 21 - t23:50:09z 2015 - 01 - 10 - t03:48:11z

金属硫蛋白MT2A与10个铜原子结合(I)。观察到最多12个Cu+原子的配合物,但主要形式似乎是MT2A:10Cu+ (Banci et al. 2010, Chung et al. 2010)。金属硫蛋白和CuZn-SOD对铜的亲和力最高(I),但金属硫蛋白不能从其他细胞酶中去除铜(Banci etal . 2010)。

五月 布鲁斯 3 五月 布鲁斯 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2015 - 01 - 14 t21:46:19z 2021 - 05 - 21 - t23:50:09z 2015 - 01 - 13 t03:59:43z