使用JSBML版本1.5于9月2日下午9:51从Reactome版本77生成SBML。

派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质

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MED1是各种中介复合物的组成部分,作为转录辅助激活因子。含med1的配合物包括DRIP、ARC、TRIP和CRSP配合物。

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源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对这个复合物的嵌套结构:(Q9ULK4, Q96HR3, Q9Y3C7, O75448, Q9BTT4, Q9NVC6, Q15648, Q9UHV7, Q9NPJ6, Q9Y2X0, O60244, P24863, O43513, Q93074, O75586, P49336, Q9H944, Q6P2C8)。Reactome对复合物使用嵌套结构,这在SBML Level 3 Version 1核心中不能完全表示

点滴共激活剂复合物和装配点滴共激活剂复合物是从至少31个中介蛋白中14个蛋白的子集,以不同的组合形成“适配器”复合物。适配器复合物连接基础转录因子(包括Pol II)和组织特异性转录因子(TFs),连接上游近端启动子区域或远端增强子区域的位点(Maston, 2006年和Naar, 2001年综述)。DRIP复合物最初被识别并命名为与转录因子核受体家族中的维生素D受体成员相关的共激活复合物(Rachez, 1998)。随后确定,所有的DRIP配合物成分都在TRAP配合物和ARC配合物中。DRIP复合物含有ARC和TRAP复合物所共有的14种蛋白质:MED1、MED4、MED6、MED7、MED10、MED12、MED13、MED14、MED16、MED17、MED23、MED24、CDK8、CycC。所有的DRIP适配器复合组件都存在于ARC适配器复合中,但ARC复合还有4个额外的组件(Rachez, 1999)。这些特定于arc的组件现在在统一命名方案中被称为:MED8、MED15、MED25和MED 26 (Bourbon, 2004)。类似地,所有14个DRIP适配器复杂组件都在TRAP适配器复杂组件中,但TRAP复杂组件也有4个额外的组件(Bourbon, 2004),这些特定于TRAP的组件现在被称为:MED20、MED27、MED30和MED 31,在统一的命名方案中。此外,这些在哺乳动物细胞中鉴定的各种转录共激活蛋白被发现是在酵母中鉴定的中介复合物的同源物或同系物,最先由Kornberg和同事鉴定(Kelleher, 1990)。

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在不同的组合和不同的情况下,在人类细胞中形成特定的共激活物或“适配器”复合物,TRAP共激活物复合物是一组至少31个中介蛋白中的18个蛋白的子集。这些复合物连接着基础转录因子(包括Pol II)和组织特异性转录因子(TFs),这些转录因子与上游近端启动子区域或远端增强子区域的位点相结合(Maston, 2006和Naar, 2001)。TRAP复合物最初被识别并命名为与转录因子核受体家族中的甲状腺激素受体成员相关的共激活复合物(Yuan, 1998)。后来确定,TRAP复合物的许多组分也在DRIP复合物和ARC复合物中。TRAP复合物包含以下14种蛋白质,它们也是DRIP和ARC复合物所共有的:MED1、MED4、MED6、MED7、MED10、MED12、MED13、MED14、MED16、MED17、MED23、MED24、CDK8、CycC。TRAP复合体还包含4个额外的成分,按照统一命名方案,它们现在被称为:MED20、MED27、MED30和MED 31 (Bourbon, 2004)。此外,这些在哺乳动物细胞中鉴定的各种转录共激活蛋白被发现是酵母中中介复合物蛋白的同源物或同系物,这是Kornberg和他的同事首先鉴定的(Kelleher, 1990)。这些适配器/共激活蛋白的统一命名系统现在将它们标记为Mediator 1至Mediator 31 (Bourbon, 2004)。在复杂装配过程中,TRAP蛋白的添加顺序尚未完全确定,并且在不同的细胞环境中可能有所不同。因此,TRAP共活化剂复合物组装被表示为一个单一的反应事件,其中所有18个组分同时组装成TRAP共活化剂复合物。

Caudy 迈克尔 3 肖尔斯 所罗门 OICR 2008 - 02 - 09 - t03:45:45z 2021 - 05 - 21 - t23:50:09z