SBML从Reactome版本77生成的关于使用JSBML版本1.5 21年7月15日下午1点11。
该β-连环蛋白降解复合物的戏剧在经典Wnt信号途径中的关键作用。在不存在Wnt信号传导的,这复杂的控制细胞质β-连环蛋白的水平。与和β-catenin的同伙被破坏复杂的磷酸化。磷酸化的β-连环蛋白识别和SCF-βTRCP泛素连接酶复合物泛素化和随后被蛋白酶体(在Kimelman和徐,2006年审查)降解。
源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(P35222,P30153,P30154,P62714,Q13362,P67775,Q16537,O15169,Q15173,Q14738,P25054,Q5JTC6,P48729,P49841,Q15172)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
从Reactome候选集的。实体,其中一个或多个的列表可能会执行给定的功能
从Reactome GenomeEncodedEntity的。肽或多核苷酸,其序列是未知的,因此不能被链接到外部序列数据库或用于直向推理
源自一个反应式复合体。下面是Reactomes对这个复合物的嵌套结构:(Q9NQB0, P56545, Q13363, Q9HCS4)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(P30153,P30154,P62714,Q13362,P67775,Q16537,O15169,Q15173,Q14738,P25054,Q5JTC6,P48729,P49841,Q15172)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质
派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质
源自一个反应式复合体。下面是Reactomes嵌套结构这一复杂:(4xQ04725,4xQ04727,4xQ04726,ENSG00000168646,Q9NQB0,4xQ04724,P36402,Q9UJU2,Q9HCS4,ENSG00000136997)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
源自一个反应式复合体。下面是Reactomes嵌套结构对于这种复杂的:(P35222,Q13616,P30153,P30154,12xP0CG47,P62714,Q13362,P67775,Q16537,4xP62987,O15169,Q15173,Q14738,4xP62979,Q9Y297,P63208,P25054,Q5JTC6,P48729,P49841,P62877,Q15172,36xP0CG48)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
从Reactome候选集的。实体,其中一个或多个的列表可能会执行给定的功能
从Reactome候选集的。实体,其中一个或多个的列表可能会执行给定的功能
从Reactome聚合物的。是由重复单元数量不确定的分子。包括配合其化学计量是可变的或未知的。重复单元(S)的(被)在repeatedUnit时隙识别
派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质
派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质
源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(P30153,P30154,P62714,Q13362,P67775,Q16537,Q15173,Q14738,Q15172)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(P35222,P30153,P30154,P62714,Q13362,P67775,Q16537,O15169,Q15173,Q14738,P25054,Q5JTC6,P48729,P49841,Q15172)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
在这种破坏复合物的形式下,-连环蛋白不再与轴蛋白相结合,而是与磷酸-(20aa) APC相结合。
源自一个反应式复合体。这里是该复合物的反射嵌套结构:(Q9UGI0,P25054)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质
派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质
源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(P35222,P30153,P30154,P62714,Q13362,P67775,Q16537,O15169,Q15173,Q14738,P25054,Q5JTC6,P48729,P49841,Q15172)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(P35222,P30153,P30154,P62714,Q13362,P67775,Q16537,O15169,Q15173,Q14738,P25054,Q5JTC6,P48729,P49841,Q15172)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
从Reactome候选集的。实体,其中一个或多个的列表可能会执行给定的功能
源自一个反应式复合体。下面是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(P49841, Q92837, O75474)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质
源自一个反应式复合体。下面是Reactomes嵌套结构对于这种复杂的:(P62195,O14818,A5LHX3,P40306,P17980,P51665,O00232,O00231,O75832,P49721,O43242,P35998,P28062,P25787,O00233,P62191,O00487,Q13200,P25789,P20618,P28072,Q06323,P48556,Q15008,Q99436,Q99460,P28065,Q9UL46,P55036,P28066,Q14997,P25788,P28070,P25786,P60896,Q92530,P60900,P28074,Q16401,Q8TAA3,P49720,Q9UNM6,P62333,P61289,P43686)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
源自一个反应式复合体。以下是Reactomes对该复合物的嵌套结构:(P35222、Q13616、P30153、P30154、P62714、Q13362、P67775、Q16537、O15169、Q15173、Q14738、Q9Y297、P63208、P25054、Q5JTC6、P48729、P49841、P62877、Q15172)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
B-TRCP与通过B-TRCP WD40重复区磷酸化的β-连环蛋白相关联。目前,还不清楚的泛素连接酶结合β-连环蛋白是否离开后复杂。同样可能的是,它结合β-连环蛋白,而β-连环蛋白仍然与阿信。
从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物
源自一个反应式复合体。这里是该复合体嵌套结构的反射:(Q13616,P63208,P62877,Q9Y297)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(Q04725,Q04727,Q04726,Q04724,Q08117)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(P35222,P30153,P30154,P62714,Q13362,P67775,Q16537,O15169,Q15173,Q14738,P25054,Q5JTC6,P48729,P49841,Q15172)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
从一个简单实体派生而来。这是一个小化合物
派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质
源自反应遗迹。这是替代实体列表,其中任何一个都可以执行给定函数
从Reactome候选集的。实体,其中一个或多个的列表可能会执行给定的功能
源自一个反应式复合体。以下是该复合体嵌套结构的反射:(4xQ04725,4xQ04727,4xQ04726,ENSG00000168646,Q9NQB0,4XQ04724,P36402,Q9UJU2,Q13547,Q9HCS4,ENSG00000136997)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
源自一个反应式复合体。这里是这个复合物的Reactomes嵌套结构:(ENSG00000168646, Q9NQB0, P36402, Q9UJU2, Q9HCS4, ENSG00000136997)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质
源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(P30153,P30154,P62714,Q13362,P67775,Q16537,O15169,Q15173,Q14738,P25054,Q5JTC6,P48729,P49841,Q15172)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质
源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(P30153,P30154,P62714,Q13362,P67775,Q16537,O15169,Q15173,Q14738,P25054,Q5JTC6,P48729,P49841,Q15172)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
在这种复杂的轴上与β-连环蛋白结合。
源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(P35222,P30153,P30154,P62714,Q13362,P67775,Q16537,O15169,Q15173,Q14738,P25054,Q5JTC6,P48729,P49841,Q15172)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
在这种复杂的轴上与β-连环蛋白结合。
源自一个反应式复合体。下面是这种复杂Reactomes嵌套结构:(P35222,P30153,P30154,P62714,Q13362,P67775,Q16537,O15169,Q15173,Q14738,P25054,Q5JTC6,P48729,P49841,Q15172)。Reactome使用嵌套结构的复合物,不能在SBML级别3版本1芯完全表示
派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质
派生自一个Reactome EntityWithAccessionedSequence。这是一种蛋白质
源自反应遗迹。这是替代实体列表,其中任何一个都可以执行给定函数
源自反应遗迹。这是替代实体列表,其中任何一个都可以执行给定函数
Groucho/TLE通过向启动子招募组蛋白脱乙酰酶介导WNT靶基因的抑制。Groucho/TLE的弱保守中心GP结构域已被证明与组蛋白去乙酰化酶RPD3/HDAC1相互作用(Brantjes et al ., 2001;Chen et al, 1999)。击倒的rpd3果蝇细胞,或治疗人类或果蝇细胞组蛋白脱乙酰酶抑制剂Trichostatin显著减少镇压格劳乔/框架相关的报告基因,和格劳乔rpd3已被证明硝唑染色质的目标基因芯片导致H3K9的脱乙酰作用,H3K14, K4K5,H4K8和H4K12 (Chen et al, 1999;Choi等人1999年;Winkler等,2010)。
APC中20个aa重复位点的磷酸化导致对-连环蛋白的亲和力增加(Ha et al., 2004, Xing et al., 2004;Liu et al., 2006)。phospho -(20aa) APC在-连环蛋白上的结合位点与轴蛋白在-连环蛋白上的结合位点重叠。此外,磷酸化的APC可阻止轴蛋白与-连环蛋白的关联(Ha et al., 2004, Xing et al., 2004)。在这个模型中,磷酸化的APC可能与轴蛋白竞争-连环蛋白的结合,导致轴蛋白的解离:破坏复合物中-连环蛋白的相互作用(见Kimelman和Xu 2006)。
WNT基因的转录是在不存在WNT信号的由TLE压抑:HDAC复合物(在肉桂和Paroush,2008综述;齐藤-Diaz等人,2013年)。Represssion也可以通过CTBP蛋白结合TCF7L1和TCF7L3来介导(杜瓦尔等人,2000; Cuilliere-Dartigues等人,2006; Tang等,2008)。
这描述事件/ CatalystActivity带负由调节器(例如,变构抑制,竞争性抑制调节
这描述事件/ CatalystActivity带负由调节器(例如,变构抑制,竞争性抑制调节
β-连环蛋白,然后在Ser33磷酸化。磷酸化的S37与邻近残基S33共同构成的β-TRCP识别基序。
这描述事件/ CatalystActivity带负由调节器(例如,变构抑制,竞争性抑制调节
APC在20个aa重复序列上被CK1和GSK-3磷酸化。这显著增加了APC 20 aa重复序列与-连环蛋白的结合亲和力,导致其中一个重复序列与b-连环蛋白结合在同一区域,与-连环蛋白结合在同一区域,从而取代了-连环蛋白与轴蛋白的结合(上述第5步)(在Kimelman, 2006年综述)。
除了通过格劳乔/ TLE蛋白抑制Wnt-依赖性的目标,一些TCF / LEF转录因子也可以通过募集的CTBP1和CTBP2阻遏(杜瓦尔等人,2000)的工作。CTBP结合区存在于“E型”剪接TCF7L2的和在TCF7L1和体外的相互作用在非洲爪蟾和哺乳动物已经被证实变体,尽管在体内这些相互作用的相关性是不明确(布兰农等人,1999;瓦伦塔等,2003; Cuilliere-Dartigues等,2006; Tang等,2008;滨田和Bienz安,2004年)。在TCF-CTBP共定位的损失的交互界面结果废除和TCF依赖性报告基因的表达增加(Cuilliere-Dartigues等人,2006; Tang等,2008)。
在没有Wnt信号的情况下,轴是磷蛋白;候选激酶包括GSK3Beta和CK1(Ikeda等,1998; Willert等,1999; Jho等,1999; Yamamoto等,1999; Luo等,2007)。施工的磷酸化被认为增加对β-连环蛋白和GSK3Beta的结合亲和力,稳定破坏复合物并促进β-catenin的有效降解(Willert等,1999; Jho等,1999; Luo等,2007)。更新的模型表明,轴磷酸化可能破坏其Dix结构域和β-连环蛋白结合区域之间的分子内相互作用,否则将在“闭合”的非活动状态(Kim等,2013)中保持轴。通过灭活激酶并允许候选磷酸酶Pp2a和pp1偏移稳定状态去磷酸化术后激活轴的双磷酸化的活化途径对轴磷酸酯进行去磷酸化(Willert等,1999; Luo等,2007;在Saito-Diaz等人审查,2013)。
首先被鉴定为融合的小鼠基因的产物,并且已被证明在β-连环蛋白的降解通过破坏复合物(Zeng等人,1997;在Saito-diaz等,2013)中具有关键作用。。在人类癌症的轴突1基因中鉴定了导致活化的Wnt信号传导的缺失,畸形和非义突变,使AXIN1成为肿瘤抑制基因(在Salahshor和Woodgett,2005中审查)。
ZRANB1(Trabid)结合并切割K63连接的遍在蛋白链。它需要在具有高的Wnt途径活性,包括结肠直肠癌细胞系细胞中有效TCF介导的转录。ZRANB1可以deubiquitinate的APC肿瘤抑制蛋白,Wnt信号介导的转录的(Tran等人2008)的负调节物。
β-连环蛋白是由SCF-B-TRCP1复杂的泛素化。
Phospho-(Ser45, Thr41) -连环蛋白可被GSK3在Ser37位点磷酸化。
这描述事件/ CatalystActivity带负由调节器(例如,变构抑制,竞争性抑制调节
CK1a结合于轴蛋白和磷酸化的β-连环蛋白在SER45在多个N-末端残基吸GSK3介导的磷酸(Amit等人,2002; Liu等人,2002;柳川等人,2002)。
TCF1,LEF1,TCF3和TCF4是HMG识别在Wnt靶基因的启动子WNT响应元件(WRES)DNA结合蛋白包含盒(在Brantjes等人,2002中综述)。在不存在WNT信号时,启动子结合的TCF / LEF通过四个格鲁乔同源物之一,TLE1,2,3或4个结合的(Levanon等人,1998; Brantjes等人,2001;丹尼尔斯和韦斯,2005)。格劳乔/ TLE蛋白质是共阻遏用于各种DNA结合转录因子和居间抑制至少在通过它们与组蛋白相互作用部分脱乙酰如RPD3 / HDAC1(阿尔塞等人,2009; Brantjes等人,2001; Chen等人,1999;陈和Courey,2000综述)。格鲁乔蛋白已通过在N-末端谷氨酰胺丰富的Q结构域显示出同源tetramerize,并且需要抑制这种低聚。将q域也足以与TCF / LEF蛋白的相互作用(Brantjes等人,2001; Chen等人,1998; Pinto的和叶,1996; Song等,2004)。已用纯化的蛋白质研究显示,人类TLE1和2结合的LEF1氨基末端截短形式(69-397)与全长LEF1(丹尼尔斯和韦斯,2005)的亲和媲美。
TCF7(TCF1),LEF1,TCF7L1(TCF3)和TCF7L2(TCF4)是含HMG盒的DNA结合蛋白,其在WNT靶基因的启动子中识别WNT响应元件(WRES)。WRE共识序列是CCTTTGWW,其中W表示T或A(在Brantjes等,2002中审核)。在不存在WNT信号时,启动子结合的TCF / LEF通过四个格鲁乔同源物之一,TLE1,2,3或4个结合的(Levanon等人,1998; Brantjes等人,2001;丹尼尔斯和韦斯,2005)。格劳乔/ TLE蛋白质是共阻遏用于各种DNA结合转录因子和居间抑制至少在通过它们与组蛋白相互作用部分脱乙酰如RPD3 / HDAC1(阿尔塞等人,2009; Brantjes等人,2001; Chen等人,1999;陈和Courey,2000综述)。
在Ser45中的CKI介导的磷酸化之后,β-连环蛋白在THR41上通过GSK3磷酸化。
这描述事件/ CatalystActivity带负由调节器(例如,变构抑制,竞争性抑制调节
AMER1被确定为Wilms肿瘤亚群中突变的基因(Rivera等,2007),该蛋白已被证明是β -连环蛋白破坏复合物的组成部分(Major等,2007)。
Beta-Catenin通过与轴和或APC的互动的销毁复合物联系起来。该关联还可以涉及与APC(Spink等,2001)或第三APC 20AA重复及其N末端侧翼残留物中的15AA重复的相互作用(HA等,2004,xing等,2004;刘等等,2006)。
在未刺激的细胞,APC是K63以依赖于它与AXIN关联的方式多泛素化。尽管APC多泛素化的精确定时是不清楚的,它是由GSK3激酶活性的废除和β-连环蛋白的突变体phosphodegron的存在破坏,这表明功能性破坏复合物的形成是必需的。破坏复合物的形成还取决于AXIN水平,这可能至少部分地由它的泛素化和SUMO化的平衡来调节(Kim等人,2008).Upon WNT3A刺激,APC K63多泛素化是与APC-破坏丢失的重合AXIN相互作用(Tran和Polakis,2012)。有趣的是,另一项研究表明,DVL是K63在WNT信号多泛素化(Tauriello等人,2010),这表明在该WNT信号促进多聚泛蛋白结合伴侣在AXIN-K63的变化动摇破坏复合和促进途径活化的可能模式。可替换地,APC K63多泛素化可以保护β-连环蛋白从PP2A介导的去磷酸化,因此有利于它的降解(Su等人,2008)。
B-TRCP与通过B-TRCP WD40重复区磷酸化的β-连环蛋白相关联。目前,还不清楚的泛素连接酶结合β-连环蛋白是否离开后复杂。同样可能的是,它结合β-连环蛋白,而β-连环蛋白仍然与阿信。
目前尚不清楚这个破坏复合体的确切组成。一些成分似乎形成一个核心复合物,而当Wnt信号存在时,其他成分可能暂时与复合物相关联(Kimelman和Xu, 2006)。核心成分包括轴蛋白、糖原合成酶激酶3 (GSK-3)、酪蛋白激酶1 (CKI) α、-连环蛋白、蛋白磷酸酶2A (PP2A)和腺瘤性大肠杆菌Polyposis (APC)。CK1 epsilon、Diversin和PP1也可能是复合物的组成部分。
AES是一个自然发生的截断形式的TLE,只包含Q和GP域。AES已被证明对tle介导的抑制具有主要的负作用(Miyasaka等,1993;卢斯等人,1998;Ren et al, 1999;Swingler等人,2004)。AES被认为与Q结构域介导的全长TLE蛋白形成低聚体;因为AES不能与HDAC1相互作用,这些低聚物被认为是无功能的(Muhr et al ., 2001;Brantjes等人,2001)。
在不存在WNT信号时,启动子结合的TCF / LEF通过四个格鲁乔同源物之一,TLE1,2,3或4个结合的(Levanon等人,1998; Brantjes等人,2001;丹尼尔斯和韦斯,2005)。格劳乔/ TLE蛋白质是共阻遏用于各种DNA结合转录因子和居间抑制至少在通过它们与组蛋白相互作用部分脱乙酰如RPD3 / HDAC1(阿尔塞等人,2009; Brantjes等人,2001; Chen等人,1999;陈和Courey,2000综述)。格鲁乔蛋白已通过在N-末端谷氨酰胺丰富的Q结构域显示出同源tetramerize,并且需要抑制这种低聚。将q域也足以与TCF / LEF蛋白的相互作用(Brantjes等人,2001; Chen等人,1998; Pinto的和叶,1996; Song等,2004)。已用纯化的蛋白质研究显示,人类TLE1和2结合的LEF1氨基末端截短形式(69-397)与全长LEF1(丹尼尔斯和韦斯,2005)的亲和比得上
泛素化的β-连环蛋白被蛋白酶体降解。